RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00291

RNA: ASE_00291
Rfam family: -

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((......................(((((..(((..........(((((((.....)))))))..((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))).......((.(((((((((((((((......)))))))).................((((..(((....))))))).................))))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))))))))...))))........)))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((.(((.((((((...)))))).)))..(((((..(((..........(((((((.....)))))))((((...((((.(((...(((((........(.(((((((((...........))))))))))......)))))..(((((((((((......))))))))..)))...)))..(((.((((..(((....))))))).)))...........))))....)))).)))...))))).....(((((((((....))))))))).......)))))........)))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.....(((.(((((.....))))).)))......................(((((((.....)))))))..(((((((((((((((((.((...............)).)))))).....)))))))))))................(((((((((......)))))))))................(((..((((....)))))))....((................))....................(((((((((....)))))))))...................))))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((................................((((..............(((((((.....)))))))(((....)))...........................................................................................................................................................................................................))))......))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((....(((.((((((...)))))).)))(((.((((((((......(((((((((((.....)))))...............((...(((.............((((((((...........))))))))...............(.(((((((((......))))))))).))..))))))))))))).............................(....).........................(.(((((((((....))))))))).)......)))))))).).))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((.(((.(((((.....))))).)))..)))()...............(((((((.....))))))).((((((((((((((((((.(((.............))).)))))).....))))))))))))..............((((((((((......)))))))))............(((.(((..((((....))))))).)((((((...(....)...))))))..))..............(((((((((....))))))))))((.....)))........))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((.((((((...))))))......(((((..(((..........(((((((.....))))))).((((((((((((......((((((((((............)))))))))))))))))))))).........(((((((((((((((......)))))))).............(((.((((..(((....))))))).))).............)))))))....)))...))))).....(((((((((....)))))))))))))...))))........))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((.((((((...))))))......(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))))......((.(((((((.(((((((......))))))).((((........)))).((((..(((....))))))).................))))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))))))))...))))........)))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.........(((((.....)))))........(((((.............(((((((.....)))))))..(((((((((((((((((.(((.............))).))))))).....))))))))))...............(((((((([[[[[[[[..)))))).................((((..(((....)))))))...(((((............)))))....................((((((]]]]]]]])))))))).......)))))......))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((((.(((.((((((...)))))).)....(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))))......((.(((((((.(((((((......))))))).((((........)))).((((..(((....))))))).................))))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))).))....)))))........)))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..(((((((((((((..............((((..))))...........(((((((.....))))))).((((((((((......((((((((((((............))))))))))))))))))))))........)))))))(((((((((......)))))))))...........((((((((((..........)))))..((((((............)))))))))))....))))))...(((((((((....)))))))))(((.....)))........))))))))))
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((..((((((...))))))......(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............)))))))))))))))))))))).........(((((((((((((((......))))))))((((........)))).((((..(((....))))))).................)))))))....)))...))))).....(((((((((....))))))))).)))...)))))........)))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..(((((((((((((...)))))).(((((((((...((((.........(((((((.....))))))).((((((((((......((((((((((((............))))))))))))))))))))))...............(((((((((......)))))))))..............))))...((((....))))....................))))).)))).......)))))))...(((((((((....)))))))))...................))))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((......................(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))))......((.(((((((((((((((......)))))))).................((((..(((....))))))).................))))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))))))))...))))........)))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((((.(((.((((((...)))))).)))..(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))))......((.(((((((((((((((......)))))))).................((((..(((....))))))).................))))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))).......))))........))))))).))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((......................(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))))......((.(((((((((((((((......)))))))))................((((..(((....)))))))..................)))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))))))))...))))........)))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((.((((((...))))))))..(((.(((((((.....((..))(((((((.....)))))))...((((((((((((((((((((.((.......)).))))))))))).(..))))))))))(..)((........))(((((((((((((((((..((((((.((.(((((..((...))...((((....))))(((.(((((((...((..))...)))))))))).))))).)).)).))))...))))))))))))))))).....))))))))))...))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.....((..((((((...))))))..))..(.(((((.............(((((((.....)))))))..((((((((((........................................))))))))))....................(..............)....................((((..(((....)))))))...........(....).........................................................)))))).....))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((......................(((((..(((..........(((((((.....))))))).(((((((((((......(((((((((((............))))))))))))))))))))))......((.(((((((((((((((......)))))))).................((((..(((....))))))).................))))))).)).)))...))))).....(((((((((....))))))))))))))...))))........)))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.((((....)))).(((.....)))..(((....)))))))).(((.....)))((((((.....)))))).(((....)))........(((((.....)))))....(((((...........))))).((((....)))).....(((.(((((((......))))))).((((........)))).((((..(((....))))))).................))).((((...........)))).......((((((....)))))).((((...........))))............
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((...((((....)))).(((.....))).((((....)))).....))))....(((((((((.....)))))).(((....))).(((....(((((.....)))))....(((((...........))))).((((....)))).....))).(((((((......))))))).((((........)))).(((...(((....)))(((.............)))...(((((((...........))).....(((((((((....)))))))))......))))..))).........)))..

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