RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00322

RNA: ASE_00322
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	..........((((((..............................................((((....)))).....(((((....)))))...(((((((.............................(((((((((((.....)))))))))))........))))))).))))))...(((((((((((((....)))))))))))))....................((...))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.........(((((((.(....))))))))((((((((((.....)))))))))).........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(((((((........))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......))))).........((((((((.......))).)))))..((((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(((((((........))))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((.........(((((((.......)))))))(((((((((.......))))))))).........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(((((((........))))))).
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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.(((..........(((....))).....(((((((((((.....))))))))))).)))....))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(((((((........))))))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((..........((((((.......)))))).((((((((((.....)))))))))).........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((.........(((((((.......)))))))(((((((((.......))))))))).........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((..........((((((.......)))))).((((((((((.....)))))))))).........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.(((((((((((((..))))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........)))))))))))))).((((((((((((((((..))))))))))))))))....(((((((........))))))).
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..))))))).(((((((...).))))).)((((....)))).....(((((....)))))..((((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((..........((((......)))).....(((((((((((.....)))))))))))........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))).
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.........(((((((.(....))))))))((((((((((.....)))))))))).........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(..((((........))))..).
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((..(((((((..((((((..))))))((.(((((...(((((......)))))....))))).))(((((((.((((..).(((((((........).)))).))(((((((((..)).)))))))...(((((((.....)))))))))).))))).))((((((....))))))(((((((((((((((..)))))))))))))))....))))))..)..)))).).((..))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).....(((((....)))))..((((((((..........((((((.......)))))).((((((((((.....)))))))))).........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(..((((........))))..).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.........(((((((.......)))))))((((((((((.....)))))))))).........))))))))))))))..((((((..((((((....))))))..)))))).....(..((((........))))..).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.(((((((.((((....))))...)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....))))))..(((((((..........((((......)))).....(((((((((((.....)))))))))))........))))))).))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).............(((.......)))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((.(((((((.((((....))))...)))))))..(((((......)))))..((((....))))<<<<.(((((....)))))))))..(((.............))).(((..[[[)))..(((((((((((.....))))))))))).]]]>....(((>>>.....))).((((((((((((((....)))))))))))))).....{{{{{{{....))).}}}}}}}.

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