RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00350

RNA: ASE_00350
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.........((((((..................................((((((....))))))(((((....))))).....(((((((.....................(((((((((((....))))))))))).................)))))))..))))))....(((((((((((.......)))))))).)))....................((((((......))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(..(((...((((((........((((..((((((......))))))))))..((....)).((((((((....))))))))..(((((((((......(((.(((((((((((..(.(((((....))))).)..))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))......)))...........((((((......)))))).)
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............((((...(((((((((.(((...((....(((((((((.((((....)))))))....))))))........(((((((((..........((((((((((((...(((((....)))))...))))))))))))......))))))))).))..)))........(((((((.......))))))).))))).))))(((..(((((.......)))))..)))..)))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((..............((((((......))))))...(((((....)))))((((((....))))))....(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......))))))).).))....................((((((......))))))..
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................(....)......((((....))))......(((((((............((((((((((........................))))))))))........)))))))............(((.((((((.........)))))).).))........................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((....................(((((........)))))..((((((....))))))(((((....))))))))).(((((((............((((((((((((...(((((....)))))...))))))))))))........)))))))..((..(((((((.(.(((((((.......)))))))..)(((((...........))))).)))))))...))........
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((...........((.((((((......)))))))..(((((....)))))((((((....))))))...)(((((((((......(((.((((((((((((.(.(((((....))))).).)))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......))))))).).))....................((((((......))))))..
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((((...........(((((((((......))))))...(((((....)))))((((((....)))))).)))(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..)))))).))))...(((((((.[[[[[[))))))).....]]]]]].(((..........[[[[[[)))...]]]]]]..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((...........((.((((((......))))))....((((....)))).((((((....))))))..))(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..))).((((....)))).......((((((......))))))..
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((..............((((((......))))))...(((((....)))))((((((....))))))....(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))....................((((((......))))))..
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.........(((..((((((......))))))))).((((....)))).((((((....))))))....(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))....................((((((......))))))..
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((((((...........(((((((((......))))))..((((((....))))))(((((....)))))..)))(((((((((..........((((((((((((...((((((..))))))...))))))))))))......)))))))))..))))))........(((((((.......)))))))...))))).................((((((......))))))..
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.((((((((((.dddddd.dddd(.((((((<<....))))))ee(((((((aa(.....bbb)))))))(((([[))))(((((((((....(((((.ggggggggggg(..{{{{{(ffffff.))))))FFFFFF}}}}}]]....)))))))))..)))))).))))ccc(((((((.)BB>>.))))))).)DDDD))))GGGGG...CCC..BAA...DDDDDD.EE.GGGGGG
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((((...........((.((((((......))))))....((((....)))).((((((....))))))..))(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..)))))).))))...(((((((.[[[[[[))))))).....]]]]]]..............((((((......))))))..
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((((........((((..((((((......))))))))))((((....)))).((((((....))))))....(((((((((......(((.((((((((((((.(((((((....))))).)))))))))))))).)))..)))))))))..)))))).)))(((.(((((((.......)))))))..)))....................((((((......))))))..
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((((.................((((((......))))))...))))).......((((((((....))))))))..(((((((((..........((((((((((((...(((((....)))))...))))))))))))......))))))))).(((((.((((((((((((((((.......))))))).....)))))))))..)))))....((((((......))))))..
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((...((((((...........(((((((((......))))))....((((....)))).((((((....)))))).)))(((((((((......(((.(((((((((((..(.(((((....))))).)..))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))......)))...........((((((......))))))..
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...((((((((((.........(((..((((((......))))))))).((((....)))).((((((....))))))....(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..)))))).))))...(((((((.......)))))))...)).((((....)))).......((((((......))))))..
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((...((((((...........(((((((((......))))))...(((((....)))))((((((....)))))).)))(((((((((......(((.(((((((((((..(.(((((....))))).)..))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))......)))...........((((((......))))))..
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((....(((((...((((((.((.(((((((......)))))))...((((....)))).))(((((..))))).))))..(((((((..((..))((.(((((((((((...((((((....))))))...))))))))))).))....))))))))).)))))((..))((.(((((((((..)).)))))))))..)))))(..(...)..).....(((((((...).))))))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.....((.......((((((......))))))....((((....)))).((((((....)))))).)).(((((((((......(((.(((((((((((..(.(((((....))))).)..))))))))))).)))..)))))))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))....................((((((......))))))..
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((...((((((...........(((((((((......))))))....((((....)))).((((((....)))))).)))(((((..((......(((.((((((((((.(..((((((....)))).))..))))))))))).)))..))..)))))..))))))....(((.(((((((.......)))))))..)))......)))...........((((((......))))))..
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................(((((..((((.((((((......))))))....(((......))).((((((....)))))).....((((...........))))..)))).((((((((...((.......))...)))))))).))))).((((((...........))))))....(((((((.......)))))))...((((..((......)).)))).((((((......))))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.........(((((((((((......))))))....((((....)))).((((((....)))))).....((((.......[[[[))))...]]]]{{{{{{{{.(((....)))))))).}}}}}}}}(((.............))).))))))........(((((((.......)))))))...((((..((......)).)))).((((((......))))))..

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