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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00409



RNA: ASE_00409
Rfam family: -

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.(((.(((((...(((..(((((.((((((....))))))..((((((....))))))....((((.......((((((((...))))))))..................(((((((((....))))))))).......)))).))))).))))))))..((((.....(((((.......(((.....)))..)))))......))))...(((((((....)))))))(((((.....)))))...........................)))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((((((..(.............)((((((....))))))..((((((....))))))....)))).......((((((((...))))))))..................((((((((((..)))))))))).......))))..)))))..........((((.....(((((.......((.......))..)))))......))))((((((((((....)))))))(((((.....)))))............................)))...
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((...((((..............((((((....))))))..(((((......)))))...............((((((((...))))))))...................((((((((....))))))))))))....))))..)))))...(((((............((((....................))))...............((........[[[[)).(((((.....))))).....]]]].................)))))...
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((((((..............)))))))...(((((......(((...(((((((((((......((((((.((((((((...)))))))).......(((........((((((((((..))))))))))))).....(((.......((((..((((((((((...)))........)))))))..(((..))).......)))).)))((((((((..))))))))))))))..)))))..............)))))).......)))))))).
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((................((((.((((((....))))))..((((((....))))))....)))).......((((((((...))))))))..................(((((((((....))))))))).......))))..)))))...(((((..((((.....(((((....................)))))......))))......((((....((((...(((((.....))))).....))))..))))...........)))))...
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((...((((.....((.......((((((....))))))..((((((....))))))...............((((((((...))))))))...))..............((((((((....))))))))))))....))))..)))))...(((((..(((....((((((.((((..................................(((((((....)))))))(((((.....))))).......)))).))).)))..)))..)))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((...((((.....((...(((.((((((....))))))..((((((....))))))..........)))..((((((((...))))))))...))..............((((((((....))))))))))))....))))..)))))...(((((..(((((....(((((.......(((.....)))..)))))...((((.....))))((((....((((...(((((.....))))).....))))..)))).)))...))..)))))...
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((...((((.........))))(((((....)))))...((((((....))))))...........))))(((((((.....))))))).(((((...((((.....(((((((((....)))))))))......((((......))))........)))).....(((((....................)))))...((((.....))))..))))).((((...(((((.....))))).....)))).((((............))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((......(((....((((.........))))(((((....)))))...((((((.{{{))))))........}}}.)))[[[[[[[)))..]]]]]]].(((((...............((((((....)))))).(((.((..(((.....)))..)))))(((((((......<<<<<......))))))).......>>>>>...((((.....))))..))))).((((...(((((.....))))).....)))).((((............))))....