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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00453



RNA: ASE_00453
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ........((((((.........................................................................((((((....)))))).((((((....)))))).........(((((((...........((((((((((....)))))))))).......)))))))....))))))...((((((((((....))))))).)))....................(((((((...)))))))..
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CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................................(((....)))....((((((....))))))..........((((((............((((((.((....)).))))))........))))))................(((((..........))))).......................((((((.....))))))..
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..(((((((((...((((((((((.....))))))))).......).)))(((.((..((.(((....))).))..)).))).(((((....)))))..((((((....)))))).(.((((((((((..............(((((((.((....)).))))))).......)))))))))).)))))))....((((((((....))))))))((((.((((......)))).))))..........))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((((.((..((((((((((.....))))))))))..))......((((.((..((.(((....))).))..)).)))).((((....))))((.((((((....)))))))).((((((((((.((........((((((((((.((....)).))))))).))))).)))))))))).)))))))).(((((((((((()))))))))).))(...((......))...)..(((((((...)))))))..
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((((.((...(((((((((.....)))))))))...))......((((.((..((.(((....))).))..)).)))).((((....))))((.((((((....)))))))).((((((((((............(((((((((.((....)).))))))).))....)))))))))).)))))))....(([[[[[[...[[[....))..]]]...]]]]]].........(((((((...)))))))..
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((((.((..((((((((((.....))))))))))..))......((((.((..((.(((....))).))..)).))))..(((....))).((.((((((....)))))))).((((((((((.((........((((((((((.((....)).))))))).))))).)))))))))).)))))))).).((((((((....)))))))).(((.((((......)))).)))(((((((...)))))))..
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((.........))))))...(((((((.((((..........)))).....((((((((........(((((((..(((((........((((((....))))))...)))))..((((((...........(((((((..........))))))).......))))))...)))))))......))))))))))))))).......)))))))))............(((((((...)))))))..
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((((.....(((((((((((...))))))))))).........((((.((((..(((((...(((((...(((((....)))))..........((((((....)))))).....))))))))))............(((((((..........)))))))......)))).))))...))))))))...((((((((....))))))))((((.((((......)))).))))..................
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(((((((((((((((..((((((((((.....))))))))))..))((((((((((.((..((.(((....))).))..)).)))).((((....))))((.((((((....))))))))....)))))))))).(((((.....(((((((.((....)).))))))).(((((..((....))...))))))))))((((((((....))))))))..))))))))).)..((....))((((((.....))))))..
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((((((((....((((.(......)))))..(((..(...)))).((.(((((.(((((((((((((...)))).))))..))))))))))))).(((((..)))))(((((..)))))((((((.((..(.(.(.(((((((((((..))))))))))))).))).))))))))).)))))))).)))(((.(((((..))))).))).(((.(((..(...)..))))))(((((((...)))))))..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((........(((((((((((...)))))))))))........((.(((.((..((.(((....))).))..)).)))...(((....))).((.((((((....))))))))....))...................(((((((.((....)).))))))).............................((((((((....))))))))..)))))))))............(((((((...)))))))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((((.((..((..((((((.....))))))..))..))..((((.(((.((..((.(((....))).))..)).)))...(((....))).((.((((((....))))))))....))))((((((.((.....((((((((((.((....)).))))))).))))).)))))).....)))))....((((((((((....)))))))).)).)))))))....((....))((((((.....))))))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((....((((((.........)))))).((((....((((.......))))...((((((..((....))..))..))))....((((.......))))...(((....))).((((....))))...)))).((((.....(((((((.((....)).)))))))...(((..((........))))).)))).((((((((....)))))))).((((.(((......))).((((....)))).))))..))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((....[[[.....)))...((((]]]..))))...((((.......))))...((((((..((....))..))..))))...(((((....)))))....((((....)))).(((....))).((((((..{{{{.....((((((..((....))..))))))...{{{{))))))......}}}}.}}}}.((((((((....)))))))).....((((......))))....((((((.....))))))..