RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00012

RNA: CRW_00012
Rfam family: -

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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((........))))))).....((((......)))).((((.(((..................))).))))..........(((((.((((((((......)))))))).)))))....................................((((..((((((.((((((((((((.....)))).....((....((((((.....))))))))......................................(((...(((((..(((((((......))))))))))))..))).....((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).....((((((....)))))).......................................................)))))))))))))).))))((...........)).........................(((((((........))))))).((....))................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((...(((((((((...((.....((....(((((((.(((((.(((((...(...........((((((((((....(((.((((((.(((((((......))))))))..(((((((........))))))).....((((((....(((((............((.((((.(((.....))))))))).....(((((....(((((.........(....).........((((.((((.....))))..(((...(((((..(((((((......))))))))))))..))).....((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).))))((((((....))))))((((........))))))))).)))))........))))).....)))))).......))))).)))....)))))))))).......)))))).))))...).))))))).....))......))....))))))))).))))))...............
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((........)))))))).((.((((......))))(((((.(((..................))).))))).....))..(((((.((((((((......)))))))).))))).......((.......))(((((((...........((((.(((((((.((((((((((((.....)))).....(....((((((((...))))))))).......................((((.....)))).((((...(((((..(((((((......))))))))))))..)))).((.((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).))..((((((....)))))).(((........))).((((.(((...........)))))))((.......))..)))))))))))))))))))((.((....))..))(((((())))))...)))))))...(((((((........)))))))(((....)))...............
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((........))))))))....((((......))))(((((.(((..................))).)))))(((.[[[[[(((((.((((((((......)))))))).)))))....))).....]]]]]......((((((.....((((((.........))))))...(((.....))).))))))....((((((((...))))))))((((........))))...(((...[[[[[[..))).........(((((..(((((((......)))))))))))).]]]]]]...((((((...[[[[.((((((((((....)))))))))).....)))))).....((((((....))))))]]]].(((........[[[[.[[[)))........]]]]]]]...(((((((((.((((.[[[[[[)))).)))))))))..........]]]]]]........((((.[[[[[(((((((........)))))))))))...(((.....))).]]]]].
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IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((...((((.....(((......((((......))))((((((((.....................................(((((.(((((((........))))))).))))).....(((((((((.....................(((((.........)))))...((((.....))))..........(((((((.....))))))).......................................(((...(((((..(((((((......))))))))))))..))).....((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).....((((((....)))))).....)))))))))..((((.(((...........)))))))...))))))))......((((((((...((((((...........))))))))))))))..))).........((((((........)))))))))).))))))...............
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((........))))))).....((((......)))).(((((((.......................(((.......))).(((((.((((((((......)))))))).)))))....(((((((((..(((((....(((((.....((((((.........))))))..((((.....))))))))).....((((((((...)))))))).(((........)))....((((.((((.....)))).((((...(((((..(((((((......))))))))))))..))))....((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).))))((((((....))))))))))).))))))))).((((.(((...........)))))))...))))))).((((((((((((((...((((((...........))))))))))))))....))))))...(((((((........)))))))....((.(((.....))).))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((........))))))))...((((..........(((((((((........................(((((.........(((((((((((((......)))))))....((((...((((((((((.(((((....(((((.....((((((.........))))))...........(((((((..(((((((...........)))))))........................(((((..{{{{{{(......(((((..(((((((......)))))))))))).{{{{{{{{.((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))))))))))))))).)))))...)))))))))))))))...)))))))))).....))))).......)))))))))...((((((((((...((((((...)}}}}}}.)))))))))))))))))))).(((((((((((((........)))))))..}}}}}}}}.........))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((........))))))))))).((((......))))..((((.(((((....((......((.((((((((((....(((.(((((.((((((((......)))))))).)))))....(((((.......)))))...)))..............((((((.(((((((((((((.....))))........(((((((((.....)))..((((.((((..((......((((...((.((((..(((.(((((...(((((..(((((((......))))))))))))..((......((((((........(((..(((((....)))))..))).....)))))).....((((((....))))))..)).))).)).))))))).))...))))....)).))))))))....)))))).))))))))))))))).)))))))))))).))...))))).))))..(((..(((((((.(((((((........)))))))(((....))).)))))))..)))..
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((........))))))))))).((((......))))((((((((.......................(((.......))).(((((.((((((((.(...))))))))).)))))....((((((((((.(((((..............((((((.........))))))..((((.....))))..........((((((((...))))))))((((........))))...((((.((((.....)))).((((...(((((..(((((((......))))))))))))..))))....((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).))))((((((....))))))))))))))))))))).((((.(((...........)))))))...))))))))((((((((((((((...(((((((((....))).))))))))))))))))....))))...(((((((.(.....))))))))...(((.(((.....))).)))...
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((..........)))))))(((((((((....)))))..((.(((........)).)))....((.(.(......).))...((.(((((((((((((...))))(..)....((((((((((((((((......)))))....((((...(((((.(((((((.((((((((.........(((...)))..((((((((((.....))((.((((.(((.(((((.((((((..)))(((((((..(((.(..(...((((((((((((..........))))))))))))((((......))))..)))))..)))))))..(((((..)))))......)))).((((((..(((((((..)))))))((((........))))........))))))...)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))..)))).)))).)))))))......((..))((((.(((((..))))))))))))))))))))((..)))))))(((..)))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((............))))).....((((......))))....((.((((..................................(((((.(((((((........))))))).))))).............................................((..(((((((..(((.....)))............((((((.....))))))........................................(((...(((((..(((((((......))))))))))))..))).....((((((........((((((((((....)))))))))).....)))))).....((((((....))))))........................................................))))))).))........................)))).))............((((.(((((((........)))))))(((....))).))))..........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((((........))))))))))).((((......))))..((((.(((((............((.((((..((((....(((..((((......(((((....(((((((((((.((((((((((((((...(((((....(((((.....((((((.........))))))...........(((((((..((...(((((((.....)))))))...))..............((((.((((.....)))).((((...(((((..(((((((......))))))))))))..))))....((((((.........((..(((((....)))))..))......)))))).))))))))))).)))))...)))))..))))).)))))).))).)))......(((....)))..)))))))))))))))))..)))....))))..))))))......))))).))))..((((..((((((.(((((((........)))))))(((....))).))))))..))))..

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