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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00018



RNA: CRW_00018
Rfam family: -

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................(((((((..(....)..))))))).........................................((((........((((..(((((((((....((........(((((....))))).............))...)))))))))...))))........))))....(((((((........)))))))...............((((....)))).((((((((((....))))))))))...((((...((((((((((((((((....)))).((((((....))))))..).........((((........)))).....((........))..................................((..((((((.((((.........)))).)))))).)).((((((....))))))..((((((.........(((....)))......)))))).......((((....)))).(((((((.....(((((.........))))).....)))))))((((((......)))))).................)))))))))))...))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.....((.(((((((((((.........(((.(((.(.(((........(((((.................................))))).....))).).))).))))))))))))))((..(((((((((.(((((....((((......(((.......))).((((((.(.......(((((((........)))))))...............((((....)))).((((((((((....))))))))))...)..........((((((..((((....)))).((((((....))))))...........((((((......)))))).............(((.......)))....)))).))...))))))))))((..((((((.((((.........)))).)))))).))))))).).....(((((..........)))))(((((....)))).)))))))))....))..((((....)))).(((((((.(.(.(((((.........))))).).).)))))))((((((......)))))).........))....))).................
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((..........(((((((..........))))))).(((......)))....................))))))).(((((.((..((((((..(((((((((...(((....(((.(((((....))))))))..........)))..)))))))))...)))).))..)))))))....(((((((........)))))))...............((((....)))).((((((((((....))))))))))...((((..((((((((((((.((((....)))).((((((....))))))...((((....)))).(((.(((((...((((.(((...(((.((......)))))..(((....)))..(((...(((((((.(((((.((((.........)))).))))))))))))...))).)))))))...))))).)))...(((((....))))).(((....)))......((((....)))).(((((((.....(((((.........))))).....)))))))((((((......))))))(((.......)))....))))))))))))..))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((......((((..(((((((.....{{{{{)))))))(((......................................((((........((((..(((((((((...(((.....((.(((((....)))))....)).......)))..)))))))))...))))........))))....(((((((........)))))))...............((((....)))).((((((((((....)))))))))).....((((((.((((.<<.((((((....)))..((((((....)))))).)))........(((((......))))).....))))......))))))....................(([[..))(((((.((((((.((((.........)))).)))))))))))((((]]....))))...((((((.......(((((....)))))....)))))).......((((....)))).aaaaa)))....((((}}}}}......)))).....((AAAAA((((((......))))))................)).>>))))....))))..
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((..........(((((((..........))))))).(((......)))....................))))))).(((((..(....((((..(((((((((...(((....(((.(((((....))))))))..........)))..)))))))))...)))).....).)))))....(((((((........)))))))...............((((....)))).((((((((((....))))))))))...((((..((((((((((((.((((....)))).((((((....))))))........(((.(((.....))).)))......(((......))).......((....))(....)....(((...((((((.((((((.((((.........)))).))))))))))))...)))..........((((((.......(((((....)))))....)))))).......((((....)))).(((((((.....(((((.........))))).....)))))))((((((......))))))(((.......)))....))))))))))))..))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....(((((((((((......{{{{{{{{{{{{{{{{..........{{{{{{............(((........)))..{{{{{{{{{{.{{{{{{{{{{{{{.))))))))))).....}}}}}}.....................}}}}}}}.......((((....((((((..(((((((........))))))).............))))))....)))).((((((((((....)))))))))).}}}}}}}}}}[[[[[[[[[......}}}}}}...((((((....)))))).((((.......(((((......)))))(((((...........(((((((((.....(((((....................)))))....)))))))))...(((((...))))).((((((....))))))..((((((.......(((((....)))))....))))))..)))))((((....)))))))).}}}}}}.}}}}}}}}}}..))))).....))))).((((((((((......))))))..................]]]]]]]]].))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((.((((......(((((.((((.((.....((((((((((((((((....((.((((..((...(((((((.......(((.((((.(((((...((((..(((((((((...(((....(((.(((((....)))))....)))......)))..)))))))))...)))).((((((.........(((((((........))))))).............(((.((((...((((((((((((((....))))))))).....(((((((((((((((...((((....)))).((((((....))))))....))).(((.(((.....))).)))......)))).....)))))))).)))))..)))))))....)))))).......))))).)))).)))))))))))).)))).)).....((((((....))))))..((((((.......(((((....)))))....)))))).......((((....)))).....)))))).)))))))))).....)))))).((.((((...((((((......))))))(((.......))).)))))))))))....))))))
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((.((((.((.(.((((..(((((((..(....)..))))))).(((.((........((((.....(((....((.......))...)))((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((......)))).)..)))..)))))))))))))))))).)...(.(((((.((((((((..((((((((((..)))))))))).............))))))))).)))))((((((((((....)))))))))).))))))))))..(((..))).(((((..))))))))).((((....))))...)).)))...((..))...((((((.((((..(....(((.((......))))).((((((((..(.((...).).)(((.((((((((((((.......)))))))))))))))(((.((.(((((((((.(...(((((...((((((((.(..(.(......))))))))))).((((((..)))))).).))))....))).))))))))))))(((..))).)))))))((((((......))))))....)..)..))))))).)))))))).))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((.((((......(((((.((((.((.....((((((((((((((((.....................................((((..((....((((..(((((((((...(((........(((((....))))).............)))..)))))))))...)))).....)).))))....(((((((........)))))))...............((((....))))..(((((((((....))))))))).....((((((((((((...(((((((....)))..((((((....)))))).))))...(((.(((.....))).)))......)))).....))))))))...........................((((..((((((.((((.........)))).)))))).))))((((......))))................(((((....))))).................((((....)))).....)))))).)))))))))).....)))))).((.((((...((((((......))))))(((.......))).)))))))))))....))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((.((((......(((((.((((.((.....((((((((((((((((..((((...((((((((........(((......)))(((((.((..((((((..(((((((((...(((....(((.(((((....)))))....)))......)))..)))))))))...)))).))..))))))).))))).)))....)))).((((......((((((......(((.(((..((((((((((((((....))))))))).....(((((((((((((((...((((....)))).((((((....))))))....)))....((((((......))))))....)))).....)))))))).)))))..)))..((((...(((...(((((((.(((((.((((.........)))).))))))))))))...)))..))))....)))......)))))).((....))....))))............((((....)))).....)))))).)))))))))).....)))))).((.((((...((((((......))))))(((.......))).)))))))))))....))))))