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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00019



RNA: CRW_00019
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .................((((.((((...(((.((((..((((((.(((((((((..............)))))))))...((((((((((......)))))))))).(((((((((((.............)))))))).)))..(((((.((..(((((((...(((((((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...)))))))..)).)))))....((((...(((((((((...)))))))))..))))..((((....))))...)).))))).(((((((.....)))))))......)))))).....))))(((((.((((.((((((((....((((......))))....))))).(((((((((..((((((....))))))..)))))))))..))).)))))))))..)))...))))..(((((.......))))))))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................((((((.......)))))).(((((....)))))...............((((((((((......)))))))))).(((((((((((.((.......)).))))))).)))).............((((.....(((((((....(((.(((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...))))))).....)))).....((((...(((((((((...)))))))))..))))..........(((((..((((.....(((((((.....)))))))....)))))))))......(((((....)))))(((((((....((((......))))....)))))))(((((((((.((((((....)))))).))))))))).........................((..((((((.(....))))))).)).
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .............................(((((((((.......))))))((((((....))))))(((....)))....((((((((((......)))))))))).(((((((((((.((.......)).))))))).)))).............((((((...(((((((....(((.(((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...)))))))..)).))))((...((((.(.(((((((((...))))))))).))))))).(((....(((((..((((.....(((((((.....)))))))....))))))))).)))..(((((....)))))(((((((.(..((((.(()).))))..).)))))))(((((((((.((((((....)))))).)))))))))..................)))...(((..((((((.((())))))))).)))
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .................(((..(((....(((((((((.......))))))((((((....)))))).((...........((((((((((......)))))))))).(((((((((((.............))))))).))))..(((((.((...((((((...(((((((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...)))))))..)).)))).....((((...(((((((((...)))))))))..)))).................)).))))).(((((((.....)))))))...................(((((....)))))(((((((....((((......))))....)))))))(((((((((.((((((....)))))).)))))))))......[[.....))]].)))....))).((((((.......))))))))).
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .................(((((((((.((((.((((((.......)))))).(((((....)))))..((.....))....((((((((((......)))))))))).(((((((((((.............)))))).)))))....)))).....((((((...(((((((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...)))))))..)).)))).((..((((...(((((((((...)))))))))..))))...((((...(((((..((((.....(((((((.....)))))))....)))))))))))))..(((((....)))))(((((((....((((......))))....)))))))(((((((((.((((((....)))))).))))))))).))..))))))..(((((......)))))((((((.......))))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((...........)))((((((...(((((............(((((((((..............)))))))))...((((((((((......))))))))))....((((((((......[[[[[[[))))))))........)))))...(((((.....(((((((....(((((...(((((.(((((((((....)))))))))..((((...))))...))))).......)))))...))))))).....)))))((((((((...(((((((((...)))))))))................(((((...........(((((((.....)))))))........)))))))))(((((......)))))(((((((.......]]]]]]]........))))))).((((((((.((((((....)))))).))))))))))))..))))))..(((((......)))))((((((.......))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((......))).......(((((((.((((.(((((((....).))))))((((((....))))))(((.....)))...((((((((((......)))))))))).(((((((((((.............)))))).)))))....))))....(((((((...(((((((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...)))))))..)).)))))(((.((((.(.(((((((((...))))))))).)))))...((((...(((((..((((.....(((((((.....)))))))....)))))))))))))..(((((....)))))(((((((....((((......))))....)))))))(((((((((.((((((....)))))).))))))))))))..))))))).(((((......)))))((((((.(....)))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .................((((((((....(((((............(((((((((..............)))))))))...((((((((((......)))))))))).(((((((((((.............))))).))))))....)))))....((((((...(((..((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...))..)))..)).)))))))..((((...((((((((.....))))))))..)))).....((((.(((((..((((.....(((((((.....)))))))....))))))))).(((..(((((....)))))(((((((....((((......))))....)))))))..(((((((.((((((....)))))).)))))))(((((..(((.(....)))).)))))......))).........))))))))).
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .................((((.((((...(((((((((.......))))))...(((....))).................((((((((((......)))))))))).......(((((.............))))).........(((((.(....((((((...(((..((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...))..)))..)).)))).....((((...(((((((((...)))))))))..))))..................).))))).(((((((.....)))))))............................(((..(((((((....((((......))))....)))))))(((((((((.((((((....)))))).))))))))).......)))........)))...))))..((((.........)))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .................((((.((((...(((((((((.......))))))..............((((((.((((((...((((((((((......)))))))))).(((............((((((..((((((........)))))).....(((((((...(((..((....((((.((((((((.((((((..(....)..)))))).(((((....))))).)))).....))))))))...))..)))..)).)))))....((((...((((((((.....))))))))..))))))))))....(((((..((((.....(((((((.....)))))))....))))))))).)))))))))...(((((..(((((((....((((......))))....))))))).(((((((..((((((....))))))..)))))))........))))))))))))))...))))..(((((.......))))))))).