|
|
|
AAAUAACGAAGAGUUUGAUCCUGGCUUAGAACUAACGCUGGCAGUGCGUCUUAAGCAUGCAAGUCAAACGGGAUGUAGCAAUACAUUCAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUGGAUGAUCUACCUAUGAGAUGGGGAUAACUAUUAGAAAUAGUAGCUAAUACCGAAUAAGGUCAGUUAAUUUGUUAAUUGAUGAAAGGAAGCCUUUAAAGCUUCGCUUGUAGAUGAGUCUGCGUCUUAUUAGCUAGUUGGUAGGGUAAAUGCCUACCAAGGCAAUGAUAAGUAACCGGCCUGAGAGGGUGAACGGUCACACUGGAACUGAGAUACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGCUAAGAAUCUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCGACACUGCGUGAAUGAAGAAGGUCGAAAGAUUGUAAAAUUCUUUUAUAAAUGAGGAAUAAGCUUUGUAGGAAAUGACAAAGUGAUGACGUUAAUUUAUGAAUAAGCCCCGGCUAAUUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAAGGGGCGAGCGUUGUUCGGGAUUAUUGGGCGUAAAGGGUGAGUAGGCGGAUAUAUAAGUCUAUGCAUAAAAUACCACAGCUCAACUGUGGACCUAUGUUGGAAACUAUAUGUCUAGAGUCUGAUAGAGGAAGUUAGAAUUUCUGGUGUAAGGGUGGAAUCUGUUGAUAUCAGAAAGAAUACCGGAGGCGAAGGCGAACUUCUGGGUCAAGACUGACGCUGAGUCACGAAAGCGUAGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCUACGCUGUAAACGAUGCACACUUGGUGUUAACUAAAAGUUAGUACCGAAGCUAACGUGUUAAGUGUGCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGAUACGCGAGGAACCUUACCAGGGCUUGACAUAUAUAGGAUAUAGUUAGAGAUAAUUAUUCCCCGUUUGGGGUCUAUAUACAGGUGCUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUAUCUGUUACCAGCAUGUAAUGGUGGGGACUCAGAUAAGACUGCCGGUGAUAAGUCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGGCCCUUAUGUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCCUGUACAAAGCGAAGCGAAACAGUGAUGUGAAGCAAAACGCAUAAAGCAGGUCUCAGUCCGGAUUGAAGUCUGAAACUCGACUUCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGUAUAUCAGAAUGAUACGGUGAAUACGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACCCGAGUUGAGGAUACCCGAAGCUAUUAUUCUAACCCGUAAGGGAGGAAGGUAUUUAAGGUAUGUUUAGUGAGGGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAAGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
..........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((....)))))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((((((((....)))))))))....(.((((.......))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).a.(((((((...(.....(((((((((....))))))))).....)....))))))..A)..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.((((((.(((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((...))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((....(((...(((((((((((((((.((((.((((((.(((((((((((((.((.(((..((((....(((((((....)))))))..)))).....(((.(((((.(((..(((.((((((........(((...((.((((((....)))))).))...)))......(((((((((....)))))))))..((((((((.......))))).)))))))))..)))..))).))))).)))..((((((((.......)))))))).((........((.((((((((....))))...)))).))..((((.(((.....)))))))..((((....)))))).))))))))))....((((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((((.(.....(((((((........))))))).....).)).)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))...........((((.....((((.(.((((((((((((..((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((..(((.....)))....))))))))))...........((....)).)))))))..))).)))))..)))).).))))....))))...))))...)))))))))))...((((((((((.((((.........(((((((((((((((((.....)))))))))...((....))...))))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))..(((.(((((((((((((..((((((((((.(((.(((......))).))).((((.((.((....(((.(((((...(((((((...(((((((....))))))).((((....)))).)))))))))))).)))...)))).))))..)))).))))))...))).)))))....))))))))..))))...((((..((((.(((.....))).))))..).)))..........)))))))))).......))).((((.(((((..(((((............((((((.........)))))).....(((.(((((.((((((.....(((((.((...(((....)))...)).............((((..(((((....)))))..))))....(((((((....)))))))..))))).((((((((((.........)))))))...))).....))))))))))))))........((((.((.(((..((((((.(((((..(((.(((..((((..(((....)))))))..))))))..))))).))))))..))))))))).))))).......((((((((((....))))))))))..))))))))))) |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((((........................(((((((....))))))).....................((((((((.......(((((((..........((((((....))))))............................................................)))))))....)))))))).................................................((((((((....))))...))))....(((((............))))).((((....))))...............................................))))))................................................................................................(((((......(((((((................)))))))))))).........................................(((((((((.......(((((.....((((((.....))))))...))))).......))))))))).............(((((((....((((((((((.................))))))))))....................)))))))...........................((((((((.......((((.........))))....))))))))........(((((((((((((((((((...)))))))))))).......)).....)))))..............(((((....)))))...................((((((((............((((((((..............................(((((((................(((((((....)))))))............................................((((((............................))))))..........(((((((.........................))))))).....(((((.....))))).......................................)))))))......)))))))).....(((((((...............(((....))).................)))))))...........(((((((........)))))))....................(((((((.........)))))))...........))))))))....................................................................................................................((((((((((....))))))))))............. |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.........)))).((((.((((((.(((((((((....(((......(((..((..((((((....))))))..)))))................(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....((((((((((..)))))))))).......................)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((.........................................))))).......(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........)))))...)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........(((((.((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((.......(.(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)...((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((.........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..((......)).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).............. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.........)))).((((..(((((.((((((.......(((......(((...(.(((((((....))))))).).)))...............((((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....((((((((((..)))))))))).......................)))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))....))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((.........................................)))))))))...(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).))))).)))).......(((((((......((((...(((((((((((...((((.(((((...((((((((.....)))))))).)))))))))....)))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........(((((.((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((......((.(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).))..((.(((...((((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))..........(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).))...........)))).).)))))....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((((..((((..((..((((....))))..))....))))..))))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((.........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..((......)).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).............. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((((.....................((..(((.......))).))..))))))).(((((((....))))))).((((...(((((((......((((((((.((((((.................((((((....))))))...............(((((((((....)))))))))....((((((.......))))).)..))))))..))))))))((((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))).....(((((((((................(((..............)))..((((....)))).................((((...(((((....))))).))))......................((((....))))..........(((((((((.........(((((((.(....).)))))))..........)))))))))...(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).........................................(((((((((.((((..(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..))))))))))..((((((((...(((((((.(..((((((((((.................))))))))))..................).)))))))..))).)))))................((((((((...(...((((.........))))...))))))))).........(((((((((((((((((.....)))))))))..............))))))))........((((.(((((....)))))..))))..................((((....))))....((((((..........(((((...........(((((((...........((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))............(((((......((((((.............(((......)))...)))))).)))))....(((((((...(((.(.......).))).....))))))).....(((((.....))))).....)))))))...........)))))..(((((.........)))))....))))))......(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...((....))(((((((........)))))))....................(((((((.........)))))))........)))))))))..........)))))))....))))...........(((((......((((.((((..(((....))).)))))))).....))))).......(((((((((((..((.......))((((((((((....))))))))))..))))))))))) |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((.....((((.......))))..((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((((....))))))).)))))......(((......((((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((((((((....))))))))).....(((((.......))))).)))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).)....((.(((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.....(((((((........))))))).....)....))))))..)...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))....))))).(((.....(.((((.(.(((.(((((((.((((....((((.....((((((.....))))))...))))...))..)))))))))...(((((.((...((((((.(...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....))..))))))..))..)))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((.....)))))))))...((....)).....)))))))))).(((......((((....))))....))).(((((..(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((.....(((........))).........(((((((......((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((...((((.(((..((((((.(((((.......(...((((..(((....))).))))....)....))))).))))))..))).))))....))...)..)..(((((((((....)))))))))........))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((((....((((((.((..((.......))..)).))))))......))))))).(((((((....))))))).((((...(((((((.(....((((((((.(((((((........((...((.((((((....)))))).))...))......)(((((((((....)))))))))..((((((((.......))))).)))))))))..))))))))((((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))).....((((((((((.((((....)))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...((((........((((((...(((((....))))).))))).)...))))........((((((((....))))......))))(((((((((..(......(((((((.(....).))))))).....)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).........................................(((((((((.(((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))))))))))..((((((((...(((((((.(..((((((((((..........((((.......))))....))))))))))......).)))))))..))).)))))(((.....))).....((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).........((((((((((((((((((...))))))))))..............))))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).............((((....)))).(.((((((((.........((((((...((.....(((((((((.(((((...(((((((((.(((((((....))))))))((((....))))))))))))))))).))....((((((.....((((((..(((........(((......))))))))))))))))))....(((((((.(.(((.((.....)).))).)...)))))))..((.(((((.....))))).))..)))))))....))....)))))).((((((.........))))))..)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))..((((()))))((((((........))))))()...................(((((((..(.....)))))))).......)))))))))).....)....)))))))....))))....((((((.(((((...((.((((.((((..(((....))).))))))))))...))))).))))))(((((((((((..((.......))((((((((((....))))))))))..))))))))))) |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.............((((....)))).........................((((((...((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).)......((((((((....))))))))........................)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(.......(................).......)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))).)))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........((((((((((((....((((((..((((((((((......((........))..........(((((((......((.((((....((((((....))))))..((........)).)))).)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).))....)))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((.........)))))))...........))))))............)))))).((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((......)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..((((..(.(((.(((....))).))).)))))................(((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).).....(((((((((....))))))))).......................)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(.......((...............))......)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.((((((.(((((...(.((((((.....)))))).).)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))).)))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((....((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((......((.((((....((((((....))))))...(........)..)))).)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((.........)))))))...........))))))............)))))))((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((......)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................((((((((.......((((((((((...((((...(((((..((((....(((((((....)))))))..)))).....((((.....((((((((..........((((((((.((((..((((((....))))))(((............(((((((((....)))))))))..((((((((.......))))).))).)))....)))).))))))))(((((..((((((((.......))))))))..............((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).....))))).......)))))...((((....))))......))).)))))))))....)))).((((....)))).....(((((((.......)))))))..(((((((........))))))).....(((......)))......(((((....(((((((((..........(((((((..(((((((((..((((((..((((((.(((((((((.((((((.((((((..........)))))).)))......((((((.....)))))).))).((((((((((((((((((((.((((((((...(((((((.....(((((((((.....(((.(((....))).)))......))))))))).........)))))))..))).)))))...(((..((((....((((((((.......((((.........))))....)))))))).........((((((((((((((((((...))))))))))..(((......)))))))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...))))...)))((((....)))))))).)))))))))...))))))).)))))(((....))).))))((((..(((((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))).....(((.(((((((((....)))).))))).)))..))))..)))).))))))))))))..)))..)))))).....))))))).)))))))))..)))))...........)))))))))).)))))))).......(((.[[[[[..)))..]]]]].((((((...[[[...))))))..........]]]..(((((((....[[[[[.(((..(((....))).........))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))).]]]]]..............((((((....[[[[....))))))(((((............)))))...]]]].......(((.[[[[[[[)))........((((..(((....))).))))]]]]]]]..............(((((((((((..............(((((((((....)))))))))...))))))))))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((..((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((.((.(((..((((....(((((((....)))))))..)))).........(((((.((((((((.((((((((((...))))).....((((((....)))))).....(((......)))(((((((....)))))))....((((((((.......))))).))).)))))..)))))))).))))).(((..((((((((.......)))))))))))........((.((((((((....))))...)))).)).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))))))....((((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((.........(((((((........)))))))..........)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))(((((..((.(((((((((.((.(((.((((((..........)))))).)))......((((((.....)))))).((......))...)).)))))))))..((((((.......)))))).((((((((((((.((......)).)).)))))))))).))..))))).((....))....)))))))))).((((.......)))).....((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).....((..((((((((((((((((((...))))))))))...((......)).))))))))))(((...((((.(((((....)))))..))))..)))......(((((((((((....))))((.((((((((.........((((((..(((.....(((((((.(.(((((...((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))))))).).(((((((((....)))).)))))...((((.((((.(((..((......)).))).)))))))).(((((((...(((.(((...))).))).....)))))))..((.((((.......))))))...)))))))....)))...)))))).((((((.........))))))..)))))))).))..(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))).(((((.(((.((((........))))))))))))....))))))).(((((((((.((((.(((.((((...........((((.(((((..(((.(((..((((..(((....))).)))).))))))..))))).)))))))).))))))).....)).)))))))(((((((((....))))))))))))))).))).))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................(((..((((((...(((..((......((((....(((((((....)))))))..))))...............((((((((.((((((.........((......((((((....))))))......)).......(((((((((....)))))))))...(((((((.......))))).)).))))))..))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)).))).....((((...(((((....))))).))))....))))))............((((....)))).....(((((((..bbbb.)))))))..(((((((........)))))))...........BBBB........((((..((..((((((((..........(((((.....((((((((..(((((..(((((((..((((((......((((.((cccccccccccc....)).(((((.....((((((.....))))))...))))).......CCCCCCCC...((((((((...(((((((....((((((((((.................)))))))))).....aa....((....)).)))))))AA))).)))))..CCCC...))))...((((((((.......((((.........))))....)))))))).........((((((((((((((((((...))))))))))...((....))...))))))))))))))..((((.(((((....)))))..))))...............<<<<<.((...........[[[[[[........(((........)))..............(((((...(((((((...(((((((....))))))).((((....)))).)))))))))))).................................))........))))))))))))..)))..))))).ddddddd))))).)))))))).)).))))...DDDDDDD......{{)))......}}.(((..(((((..((((.......))))...(((((.........)))))....]]]]]]......(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....))))))).....((....(((((((........))))))).......))...........(((((((.........)))))))............>>>>>...................((((.(((..((((((.(((((......((((.((((..(((....))))))).)))).....))))).))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))...))))).))).. |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((.(..((((((((...)).......................................((.((.(((((..)))))))..))...................(((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))......(((((.((....)).)))))......((.............)))))))))).))))))))))..(((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...)))))...((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).................((((...(((((....))))).)))).....(((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((...(...((((((((..........)))))).))..)....)))))))))...))).))))...(((((((((.((....)))))...))))))....................................((((.(.((((((((((((.(((((.(((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...))).).)))).....((((((..((...((((.........))))))..))))))..((.......(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....))......((((....))))..........(((((..((((...(...))))))))))....((((((......((((((((..(((((((....)))))))...((....))..)))))))).................(((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....(((....((((((.(((((((.......)))).)))..))))))...((.(((((.....))))).)).....)))))))).......................)))))).....................((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))....)))))).............((((((........)))))).....................(((((((.........)))))))............((((..((....))..)))).....(((.(((..(((((((((((((...((((((.((((..(((....))).))))))))))..)))))))))))))..))).)))................(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((.(..((((((((...)))......................................((.((.(.((....)).).)).))...................(((((((..((.(.((((((((((((.(((.((((((....)))))).)).).)))).....((((((((((..)))))))))).....(((((.......))))))))))))).)))))))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...)))).((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......)).........((((...(((((....))))).)))).............(((....((((((....))))))...)))..(((.(((((...(..((.((.((..((.......)))))).))..)....))))).)))....((((......(((((((((.((....)))))...)))))))))).................................(((.(.(((.((((((((.(((((.(((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...))).).))).....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))...........((((((.(((((((((((.)))))))))))....(....).....))))))...(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..............(((....)))...........(((((..((((...(...))))))))))....((((((.......(((((((..(((((((....))))))).((((....)))))))))))..................(((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....(((...(((((((.(((((((.......))).))))..)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))))))).......................))))))....................(((((((....((((((((..((((....))))..)))..)))))....))))))).....((((..(((((((........))))))).....))))...........(((((((.........)))))))............((((..((....))..))))....((((.(((..(((((((((((((..((.((((.((((..((......)))))).))))))..)))))))))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((..((((((.(((...........))).(((.(((.......))))))..((((....(((((((....)))))))..))))..(((((((.((...((((((((.((((((((.......))......((((((....))))))......((......))((((((((....))))))))...((((((((.......))))).)))))))))..)))))))).(((((.(((..((((((((.......)))))))))))...)))))(((...((((((((((.(((..(((((...(((((.(((.....)))))))).((((....))))((....)).........((((...(((((....))))).)))).((((.((.............))))))...)))))....(((((((.......)))))))..(((((((........)))))))..((((((((.(((((.......((((((((.(((((..(...(.....(((......)))((((((((..(((((..(((((((..((((((((.((.(((.((((((..........)))))).)))......((((((.....)))))).((......))...)).))))))))...((((((.......)))))).((((((((((...((......))....)))))))))).....((((((((....)....))))))).........(((.....))).....((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).........(((((((.((((((((((...))))))))))..(((......))).)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))..........(((((((((..(((((.((((.(((.(((......))).))).((((.(.(((....(((.(((((...(((((((...(((((((....))))))).((((....)))).)))))))))))).)))...)))).))))..))))..)))))...)))).))))).))))))))))))..)))..))))).(((((((...(((.(((...))).))).....)))))))..)..)..))))).)))))).))...)))))..))))))))........((((((.........))))))...............(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))).(((((.((.(((((........)))))))))))).))).))))))))))...)))..)))))))))..((((.(((..((((((.(((((..(((.((((.((((..(((....))).)))))))))))..))))).))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))).))).)). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((.((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((.((((....)))).)).)))((......(((..((..((((((((..((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....))))............(((..)))...........((..............)).)))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((................................).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..(((((.....((((...(((((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((....(...)))))...)))))))).....)....(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.((((((..((((((((((....((((........))))...(....(((((((..(...((.(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..((.(....).))))....)))))))..((.(((((.....)))))))......))))..)))).).)).)..)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))....)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).))...((((((.......))))))).(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((......)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))..)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((.((((....)))).)).)))((......(((......((((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))............(((..)))...........((..............)).)))))))..))))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((...(................................)....))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))..........((((......((((...(((((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((....(...)))))))..)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((..(...((.(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))...)(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((.........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((......)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((.((((....)))).)).)))((......(((..((...(((((((..((...(((((((.((((.(.(.((((((....)))))).)..).))))............(((..)))...........((..............)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((................................).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......).(((((......((((...(((((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))......)...(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..(((((((((((...((((..(...).)))).).(....(((((((..(...((.(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))(((.(((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..((........))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).((((((((.......))))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((......)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((.((((....)))).)).)))((......(((......((((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))............(((..)))...........((..............)).)))))))..))))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((...(................................)....))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))..........((((......((((...(((((((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((....(...)))))))..)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((..(...((.(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((((((((((((....)))((.(((......))))).))))))(...)((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))).))))).).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))...)(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((.........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((......)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((((....((((((.....((((.......)))).))))))......))))))).(((((((....)))))))..((((...((((((.((.....(((((.(((((....((((((((.((((..((((((....))))))(((............(((((((((....)))))))))..((((((((.......))))).))).)))....)))).))))))))((((...((((((((.......)))))))).((........((.((((((((....))))...)))).)).((((.((((.....)))))))).((((....))))...)).))))))).)).)))))...((((....))))(((((.(((.......(((.((((.((.((((....)))).....(((((((.......)))))))..(((((((........)))))))..((((((((.(((....((...((((((((.(((....(((.((((..(((......)))((((((((..(((((..(((((((.(((((((......((((...((((((((((((..((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((......((((((((.....(((.(((....))).)))......)))))))).((....)).)))))))..)))).))))..))))...))))...((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).........(((((((((((((((((.....)))))))))...((....))...))))))))))))))).((((..((((....))))...))))...............(((((((((..((((((((((.(((.(((......))).))).((((.((.((....(((.(((((...(((((((...(((((((....))))))).((((....)))).)))))))))))).)))...)))).))))..)))).))))))...)))).))))).))))))))))))..)))..))))).(((((((...(((.(((...))).))).....)))))))..)))).)))))).)))))).))...)).))).))))))))..)).)))).((((.........))))..)))..(((.(((((.((((((.((..(((((.((...(((....)))...)).............((((..(((((....)))))..))))....(((((((....)))))))..)))))....(((((((.........)))))))......))...))))))))))))))..))))))))..))))))))..(((((.(((((..(((.(((..((((..(((....)))))))..))))))..))))).))))).[[[[[[[[[[[.))))........((((((((((....))))))))))..]]]]]]]]]]] |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((..((((((.((((((....))).))).(((.(((.......))))))..((((....(((((((....)))))))..))))..(((((((.((...((((((((.((((((((((...))))..(((.((((((....)))))).)).)...........((((((((....))))))))...((((((((.(....)))))).)))))))))..)))))))).(((((((((..((((((((.(....))))))))))))..))))))(((...((((((((((.(((.((((((...(((((.(((.....)))))))).((((....))))................(((((...(((((....))))).)))))((((.((.[[[[........))))))...))))))...(((((((.......)))))))..(((((((........)))))))..((((((((.(((((.......((((((((.(((((......((((..(((......)))((((((((..(((((..(((((((.(((((((((....(((.((((((..........)))))).)))......((((((.....)))))).................)))))))))..((((((.......)))))).((((((((((((............)).)))))))))).....(((((((..........))))))).........(((.....))).....((((((((.......((((.........))))....)))))))).........((((((((((((((((((...))))))))))..(((......)))))))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..........(((((((((..((((((((((.(((.(((......))).))).((((.(.(((....(((.(((((...(((((((((.(((((((....))))))))((((....))))))))))))))))).)))...)))).))))..)))).))))))...)))).))))).))))))))))))..)))..))))).(((((((...(((.(((...))).))).....)))))))..))))..))))).)))))).))...)))))..))))))))........((((((.........))))))..]]]].........(((((((.....(((.......(((....))).........))).....)))))))....(((((.((((((((.((...)))))))))....)))))).(((((.((.(((((........)))))))))))).))).))))))))))...)))..)))))))))..((((.(((..((((((.(((((..(((.((((.((((..(((....))).)))))))))))..))))).))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))).))).))) |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((...(((((....)))))...)).((......(((.......((((((...((...(((((((...((.....((((((....))))))......))..............(((..)))..............................)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(.........)))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((.........................................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((......(((((......((((...(((((((((((.(((((..(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((.......((((.........))))....))))))).....((((.(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....))))))).((((((((((((.((((....)))).....((...........(((....))).((.(((((((.((((((((((......((........))..........(((((((......((.(((((...((((((....))))))....((....))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((.........))))))))).))).))))))))).))))......)))))(((.((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((.............))).)))).)...))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))))))....)))... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..((((......(((((....)))))....))))......(((.......(((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).).....((((((.(((..))).)))))).......................)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((.........................................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(..((((......((((...(((((((((((...(((..(((((.....((((((.....))))))...))))).)))....)))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))..)(((((((((((....))))...........((..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((.........(((((...((.(((....))).))....((....))..)))))....(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((.........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..(.......)..))).)))).)...))))..))))))..))).))))...)))))......((((((((((....))))))))))......))))... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((...(((((((((((((((.((((.((((((.(((((((((((((.((.(((..((((....(((((((....)))))))..)))).....(((.(((((.(((..(((.((((((........(((...((.((((((....)))))).))...)))......(((((((((....)))))))))..((((((((.......))))).)))))))))..)))..))).))))).)))..((((((((.......)))))))).((........((.((((((((....))))...)))).)).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))))))....((((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((((.(.....(((((((........))))))).....).)).)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))...........((((.....((((.(.((((((((((((..((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((......((((((((.....(((.(((....))).)))......)))))))).((....)).)))))))..))).)))))..)))).).))))....))))...))))...)))))))))))...((((((((((..((((..((((..(((((((((((((((((.....)))))))))...((....))...))))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((..(((....((......)).((((((((((((((((....(....)..(((((((.((.(((((...(((((((...(((((((....))))))).((((....)))).)))))))))))).))(((((((((....)))).))))).))))))))))))))))))..)))))....)))...)))))))))..))))..))))......(((.(....))))....)))))))))).......))).((((.(((((..(((((............((((((.........)))))).....(((.(((((.((((((.((..(((((.((...(((....)))...)).............((((..(((((....)))))..))))....(((((((....)))))))..)))))....(((((((.........)))))))......))...))))))))))))))........((((.((.(((..((((((.(((((..(((.(((..((((..(((....)))))))..))))))..))))).))))))..))))))))).))))).......((((((((((....))))))))))..))))))))).. |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................((..(.(.(((((.....((.(.(.(....(...((..(.(.....(...........).....).)...(.((....((...(.(..((.....(....)............(...)..).).)....)....))..((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....)))))))).))......)....)).....)..)....((((((....(((....))).).)))))..).).))...((((.(.((...(.....).)).)...)))).(((..((((...(.(...........................).....).))))..)))...(((((......((((((.((.((....))))....)))))))))))..))))).................((.....(((....(((((((((((.(.((((((..((.....((((((.....))))))...))))).)))...))))))))...(((.((((...(((((((.(..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....).....((....)).)))))))..))))..)))..))))....)))....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((((((.(((((((((.....)))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......((.(........(.(((....)))....)..............)...)).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).)))))))))(...((.(..(((((((...((...((......)).))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))).)).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(...).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((.(....((((....(..(((....)))..)..)))).)...))))..))))))..)...))))..))))).....)))(((((((((....))))))))).........)).)) |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........................................................................................((.(....(.(..(.(((..((...((.(.(.(....(...((..........(((.......)))...........(..((..(((...((.(.....(..(.....)..)........(...).)........))....))..((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....))))))))..).))...)....)).....)..)....((((((....(((....))).).)))))..).).))...((((.(.((...(.....).)).)...)))).(((((((...(........................................))))))))...(((((......((((((.((.((....))))....)))))))))))..)))))...)..........).)((.....((((...((((((((((((..((((((..((.....((((((.....))))))...))))).)))...))))))))...(((.((((...(((((((.(..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....).....((....)).)))))))..))))..)))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((((((.(((((((((.....)))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......((..........(.(((....)))....)..................)).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.(((......))))))))))))(...((.(..(((((((...((...((......)).))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))).)).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(...).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((.(....(((...(((...((.....)).)))..))).)...))))..))))))..)...))))..))))).....)))(((((((((....)))))))))..........).)) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................(((((.......................(((.......))).............(((((((....)))))))........(((((((.((...(((..(((.((((((.........((...((.((((((....)))))).))...)).......(((((((((....)))))))))...(((((((.......))))).)).))))))..)))..))).......(((..((((((((.......)))))))))))........(((...((((((((((.(((.....((...((((..(((((((..........((((....))))..............(((((((....((((....))))..))))).))..................((((....)))).....(((((((.......)))))))..(((((((........)))))))..((((((((.............((((((((..((..........................((((((((..(((((..(((((((...((((.......((((.(.((((((((((((..((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((.....(((((((((..(((.....)))....)))))))))............((....)).)))))))..))).)))))..)))).).))))...((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).........((((((((((((.(((((...))))).))))...((....))...))))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...........)))).((((.((......)).))))........(.......(....)...((((((.((.(((((...((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))))))).))(((((((((....)))).))))).))))))....).....))))))))))))..)))..)))))..(((((....(((.((.....)).)))......)))))...........))..)))))).))..........))))))))........((((((.........))))))...........................(((..((...(((....)))...))....))).........))))))).))))..(((((((........))))))).))........(((((.((..((((........)))).))))))).))).))))))))))...)))..))))))))).......(((...(((((.(((((..(((.(((..((((..(((....)))))))..))))))..))))).)))))...)))....................(((((((((....))))))))))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................((((((((.......((((((((((...((((...(((((..((((....(((((((....)))))))..)))).....((((.((..((.(((((.(((((..(((..((..((...((.((((((....)))))).))...)).......(((((((((....))))))))).....(((((.......))))).))..)))...((.((((..((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).)).))).)))))...((((....))))..))..))..)))))))))....))))..(((....)))...........(((((((((.........(((((((........)))))))..........)))))))))..(((((((.(((.((((((((..((....))(((((((..(((((((((..(((((..(((((((.(..((((......((((...((((((((((((..((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((..(((.....)))....))))))))))...........((....)).)))))))..))).)))))..))))...))))...((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).........(((((((((((..((((.....))))..)))...((....))...))))))))))))..).((((..((((....))))...))))....((((((((((....)))((((.((......)).))))..)))))))......((.(((...(((((((....(((((...(((((((...(((((((....))))))).((((....)))).))))))))))))...(((((((((....)))).))))).))))))).))).))..))))))))))))..)))..)))))).....))))))).)))))))))))))))).))........)))))))))).)))))))).((.((((((..(((((..........((.(((((....((((.(((((.((....)).......(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))..)))))))))(((((((........))))))).......((((.((.((...(((((((.........)))))))...)))))))).))))).))....((((.(((.((((.....((.......))(((((..(((.(((..((((..(((....)))))))..))))))..))))).....)))).)))))))..))))).......((((((((((....))))))))))..))))))))... |
