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UAUAAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUUAACGCUGGCGGUAUGCCUAACACAUGCAAGUCGUACGAGAAUUUUAUUCUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGAGAAUCUACCUCUAGGAGGGGGAUAACAGUUGGAAACGAUUGCUAAAACCCCAUAUGCCAUUAUUGGUGAAAAAGAUUUAUCUGCCUGGAGAUGAGCUCGCGGCUGAUUAGCUAGUUGGUAGGGUAAUGGCUUACCAAGGCAACGAUCAGUAGCUGGUCUUAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGAACUGAGAUACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCACAAUGGGCGAAAGCCUGAUGGAGCAAUACCGUGUGAGGGAUGAAGGCCUGUGGGUUGUAAACCUCUUUUUUCAGGAAAGAAACUUUGACGGUACCUGAAGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUCACUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGUUUAUCAAGUCUGCUGUUAAAGCUUGAGGCUUAACCUCAAAAAAGCAGUGGAAACUGAUAGACUAGAGAAUGGUAGGGGCAGAGAGAAUUCUCAGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUUGAGAAGAAUACCGAUAGCGAAGGCGCUCUGCUGGGCCAUUACUGACACUCAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACUAUGGAUACUAGAUGUUGUGUGAGUAAAAUUGUGCAGUAUCGAAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGAAGUACGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGACUUGACAUGUUACUAAUUUCCUUGAAAGAGGAAAGUGCCUUUGGGAAAGUAAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCUUUAGUUACCAUCAUUAAGUUGGGGACUCUAAAGAGACUGCCGGUGAUAAACCGGAGGAAGGUAAGGAUGAGGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUUAGGACAAUAAGUCGCAAAUUCGUGAGAACUAGCUAAUCUUAUAAACCUAAUCUCAGUACGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGACGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUACACAGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGCUGGCCAUGUCCGAAAUCAUUACUCUAACCUUAAUGGAGGAGGAUGCUUAAGGCAGGGCUAGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUUACCUCCUUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.....((((((((((((((((...))))))))).)))....(((((.......))))).((((.(((((...((((((((((((((.(((((((((.((....((((((..((...(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....))))................)))))))..)).))))))...((((((((((((((((((.......))))))))....((((...((.(((((((.........))))))).))..((((.(((.....)))))))..((((....))))((.((..(((((.(((((((.((..((((....))))..(((((.....((((((((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))...))).)))....)))))..(((((.(((.((((.((.((((.((((....)))).))))..)).)))))))......(((((.(..(((((((((((..((..(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).))..)))..).)))))...))).))........)))))..)))).)))))...(((((((((((.......(((((((.(((((((((..(......)..)))))))))...((....))....))))))).(((..(((....(((((....))))).......((((...((((...(((((.......((((..((((.(((......)))))))..)))).....(((((((..((((..((((.((((...(((((((....)))))))..((((.((..........)).))))...(((((((((....)))).))))).)))).))))..))))......(((.....)))....((..(((((((((..(((.(.....).)))..)))....))))))..(((((.....))))).))..)))))))..).))))..)))).......))))...)))..)))...............))))))))))).....)).))....)))).....)))))))))).................((((....(((((((........)))))))..(((((((((.((.((...(((((((((.....)).)))))))...))))))))...)))))))))..)))))))))).).))......(((((((.((.((..((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..)))).))))))).)))))))))))))))))......((((((((((....))))))))))))))..))))..) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((...(((((((((...))))))))).(((((((((.(((.........)))....(((((((.((((((((((((((..................((((((..((...(((((((.((((..((..(((((....)))))..))...))))...(((((....)))))....(((....))).)))))))..)).))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).(((((((.........)))))))..)))))))).))))))...(((((..((((....))))......((((((....))))))..)))))....(((((..(((((..(((((((((.(((.....((((....)))).....)))..(((((((((..................)))))))))..(((((((((...(((((((...((....)).....)))))))..(((.((((...((((...(((..(((((.....(((((...((((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).))..))))...)))))...((((((...((...((((.........))))...)))))))).(((..(((.(((((..((...(((.(((((.....(((((..((((((((...(((((((......(((((((((((.....(((((....)))))...)))..)))......))))).(((((....))).))...)))).)))...))))))))..))))).....))))))))((((((((..(((.....(((((((....))))))).(((((((.....(((....(((((.(((((.((((....))))(((((((((....)))..((((......))))..)))))))).))))))))((((((...((.(((......)))))...))))))..))).(((((.....)))))..)))))))..)))...)))))))).........))..)))))))).(((((..((((((.....(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))..))))))...)))))..)))....)))))...)))...))))..)))).)))...))))))..))).)))).))))).....)))))))))))))))))..))))))..((((.((.(((..(((((((....((..((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..))...)))))))..)))))))))))).((((.....((((((((((....))))))))))..))))))))... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................(((((((.......................(((((...)))))......................((((((.......(((((((..........((((((....)))))).............(((((....)))))...............))))))).....)))))).............((((((((.......))))))))..............(((((((.........)))))))....(((((............))))).............................(((((...(((((....))))).)))))..))))))).........................................................................(((((......(((((((................))))))))))))........................................((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.................))))))))))....................)))))))..))))))..................................((((.........)))).....................(((((((.((((((((((((......))))))))))))...............))))))).............(((((....)))))...................((((((((...........((((((((..............................(((((((...............(((((((....)))))))..............................................................................................................................................................................................)))))))......)))))))).....(((((((...............(((....))).................)))))))...........(((((((........)))))))....................(((((((..........)))))))...........))))))))...........................((((((((((((.................((((....))))...........))))))))))))........................((((((((((....))))))))))............. |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((.........)))).((((.((((((.(((((((((....(((......((...((...(((...)))...)).))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....))).................)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........)))))...)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........(((((.((((((....(((((..((((((((......((((........))))........(((((((.......((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)...((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).).))))....(((((((..........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).............. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............(((((.......((((.((((((.((((((.......(((......((...((...(((...)))...)).))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....))).................)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))....))))))..((((......((((....)))).....))))..((((((((..................))))))))....(((((......(((((((((.........)))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((...((((((((.....)))))))).)))))))))..)))))))))....(.(((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))...........((....)).)))))))..)))))..)...))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((.(((((....)))))..))))...........(...((((((....(((((..((((((((......((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).))..((.(((..(((((.(.((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))..........(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).))...........)))).)..)))))...)))))....)))))))......)))))))).....(((((((.....(((.(((..((((....))))..)))...))).....)))))))......(((..(((((((........))))))).....)))..).))))....(((((((..........)))))))...........))))))...............)...((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))......... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........(.(((((((((...))))))))))..........((.......)).............((((.....))))......................((((((.......(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....))))....((((....))))................))))))).....))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(.........)))))).((((....))))......((((((....))))))..(((((....))))).................((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))..............(((((((((.((....)))))...))))))...........................(((.....))).......((((((((((.((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))....................)))))))..))))))....................(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...............)))))))..........(..(((((....)))))...)........................(((.((.....)).))).(((...((((........)))).)))..........................(((((((....)))))))..................................((((....))))((((.............(((......)))...))))............(((((((((.(((.(.....).))).))..)))))))..((.(((((.....))))).))....................................................((((......(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...))))....(((((((........)))))))....((.((((.((......(((((((..........))))))).....))))))....))...................((((.(((..(((((((.((((....(.((((.((((..((.....)).)))))))).)...)))).)))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((.(((((((((..(((.......((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((...))))).)))))......(((.......((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....((((....))))......((....))..)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))..((((((((...(.........)....))))))))....(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).)))))))))))))....((((((.....(.((((...(((.(((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..))))))))).....((((((...(((((((....((((((((...(((......)))......))))))))...........((....)).)))))))..))))))......)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((......))))))))))))...((....)).....)))))))))))))......(((((....)))))..............(((((.(((((((.((..(((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...............(((((((....)))))))((((..........))..))...((.((((..((((((.(....(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((...(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).))..))..........).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).))..(((((((....((((..((.(.(((....))).).))....))))....)))))))......(....(((((((........)))))))....).......))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((...((((.(((..(((((((.((((......((((.((((..((.....)).)))))))).....)))).)))))))..))).))))....))...)..)..(((((((((....))))))))))))))..)))).)) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(.(.(((((((((...)))))))))).)...(((((((.......)))))....))..(.((((.....)))).)((((((.(((..........((((((..((...(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(((((....))))).....((....))..)))))))..)).))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))......(((((((())))))))..(((((....)))))..((.......))....((((......((((....)))).....)))).(((((((((...(.........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...)))))))))))...........(.......)(((((.....)))))...((((((((((((.((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))))...((((((...(((((((.(..((((((((((.(((........)))..)))))))))).....((.........))).)))))))..)))))).......))......((...(((((((..((...((((.........))))))..)))))))))........(((((((.((((((((((((......))))))))))))......(((()))).)))))))..((((...(((.(((((....)))))..))))..)))......(((....)))((((.((.....)).))))((((..((((........))))))))....(((((((.......(.......(((((((....)))))))..((((.((..........)).))))....)...((((....))))((((.((....))(((.(((......))))))))))........(((((((((((((.(((.(.....).))).))..)))))))..((.(((((.....))))).))....))))(((((.......)))))...........)))))))........((((((.....(((((((...(((((..((.(.(((....))).).))....)))))...)))))))..))))))...(((((((........)))))))..(((((((((.((.((...((((((((.......).)))))))...))))))))().))))).......))).))))))((((.(((..(((((((.((((...((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..)))).)))))))..))).))))............((((((((((((....))))))))))........))... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((...........((((...)))).......................((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).)...((((......))))...............)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(..(...)..)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........((((((((((((....(((((..((((((((((......((........))..........(((((((......(((((((...((((((....))))))....((....))..))))).)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).))....)))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))).))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))).((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............((((((.......((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((...((((..).))).)))))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))...............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(..((.))..)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((.(((((....)))))..))))........(((((((((((((....(((((..((((((((((....((((........))))........(((((((......((((((((..((((((....))))))...((......))))))).))).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).))....)))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).).))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..((....))..))).)))).)...))))..))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))))))))........ |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((...))))))))).)))(((.[[[[)))......]]]]...((((...(((((...)))))....))))(((.[[[[[[....)))..........(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))....(((....))).)))))))....]]]]]]((((((((((((..((((((((.......)))))))))))...((((((...))))))........)))))))))...(((((.(((.....)))))))).(((.[[[[[)))......((((((....))))))..(((((....)))))...........]]]]].((((......((((....)))).....)))).((((((((.((((...))))...[[[[[))))))))..(((....)))......]]]]](((.(((.((((....((((.((((....)))).)))).....)))))))......(((((.....((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))....................)))))))..)))))).((((...)))))))))...))).((((......[[[[[[[[....))))..]]]]]]]]............(((((((.((((((((((((......)))))))))))).......[[[[....)))))))..(((....(((.(((((....)))))..)))...)))..(((.(((....)))..)))]]]]...((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]......(((((((((..........(((((((....)))))))(((((.....................))))).((((....))))[[[[[[(((....))).....)))))))))....]]]]]]....((((..[[[[[[[................))))...]]]]]]].....(((((.....)))))......((((((((((.......)))))..[[[[))))).....]]]]......((((((.....(((((((...(((((.......(((....))).........)))))...)))))))..))))))...(((((((........))))))).............(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]...((((.(((..(((((((.((((......((((.(((((.......)))))...)))).....)))).)))))))..))).)))).((((.....[[[[((((((((((....))))))))))))))....]]]]. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.((..(((((.((((((((((.((((((.((((((((((((..((.(((..(((((((.(((((...))))).)).)).)))..))).))....((((((..((...(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....)))).....(((....))).)))))))..)).))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))......((((((....))))))..(((((....))))).))).)).)))))))..((((..((..((((....)))).))..)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))..((((.((((((((..((..((.((((((((.((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).((((...))))..(((...(((((((..((...((((.........))))))..))))))))))...)))))))).))......((.(((((.....(((((..((((((((.....(((((......((((((((..((.((.(((((....)))))..))))..)))......))))).(((((....))).))...)))))......))))))))..))))).....))))))).((((((((((.((((...(((((((....))))))).(((((.((..........)).)))))..(((((((((....)))).))))).)))).))))))))))..((..(((.....)))..)).....(((((((...((.(((......)))))...))))))).))..))))))))...))))(((..((((..(((((.......))))).)))))))...)))))))))).....((((((.....(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))..))))))...(((((((........))))))).......((((.((.((...(((((((..........)))))))...))))))))(((((..((....))..)))))((((.((..((..(((((((.((.((..((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..)))).)))))))..)).))))))..((.......)).(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.....((bbb(({{{))bbb)).........................................................................(((((.......(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))...............))))))).....)))))(((((((..(((..((((((((.......)))))))))))....))))...((((((aa..aaaa...))))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......((.........[[[))..(((((....)))))..]]]......................((((....)))).....AAAA.(((((((((..................)))))))))..AA.....<<...<<<<<<<<<.<<.)))>>>>>...>>>>>>...>>.........................................(((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)))))))))....((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))...........((....)).)))))))..))))))....................(((((((.......((((.........))))....)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....))))))).............(((((....))))).............................................((((...((((........)))).)))).........................(((((((....)))))))..................................((((....))))(((.(((....)))...(((......)))....)))............(((((((...(((.........))).....))))))).....(((((.....)))))........................................BBB..}}}......((((((.....(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))..))))))...(((((((........))))))).......(((..((......(((((((..........))))))).....)).))).........................((((.(((..(((((((.((((......((((.(((...........)))...)))).....)))).)))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))BBB....))))... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.(..((((((((...)).......................................((.(((((...))))).))...................((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))...(.(........).).....((....))).))))))).))).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....))))))))..(((....)))...................(((...(((((....))))).)))....(((((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((...(......).......)))))))))...))).))))...(((((((((.((....)))))...)))))).........)).........................((((.(.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...))).).)))).....((((((..((...((((.........))))))..))))))..((.......(((((((.((((((((((((......))))))))))))....(....).....)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....)).......(((....)))...........((((..((((...(...))))))))).....((((((......(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)).................(((((.((((((.((....)).(.((((......))))).))))))....(((...(((((((.(((((((.....)))).)))..)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))))))).......................)))))).....................((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))....))))))............(((((((........)))))))....................(((((((..........)))))))............((((..((....))..))))....((((.(((..(((((((((((((...((((((.((((..(((...))).))))))))))..)))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.(..((((((((...)).......................................((.((((.....)))).))....((((((((.(.....((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))...((((((....)))).))..((....)).)))))))).))).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).................((((...(((((....))))).))))..((((((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((..((.........))...)))))))))...))).))))...(((((((((.((....)))))...)))))).........)))........................((((.(.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))...(((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..)))))).)....))).).)))).....((((((..((...((((.........))))))..))))))..((........((((((.((((((((((((......))))))))))))....(....).....))))))...(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....))........((....))....(((((((.((((..((((...(...))))))))).....((((((..(...((((((((..((((((....))))))...(((....))))))))).))).((.((.((((((((.(((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....((((...((((((.(((((((.....))).))))..))))))...((.(((((.....))))).))...).))))))))....)....)))))))))))...))))))........))))))).....(((((((.....(((.(((..((((....))))..)))...))).....)))))))............((((((........)))))).....................(((((((..........)))))))..................((....)))))))))))..(((.(((..((((((((((((...((.((((..(((..((.....)).))).)))).))..))))))))))))..))).)))................(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.((..(((((.((((((((((.((((((.((((((((((((..((.(((..(((((((.(((((...))))).)).))).))..))).))....((((((..((...(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....)))).....(((....))).)))))))..)).))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))......((((((....))))))...((((....))))..))).))).))))))..((((..((..((((....)))).))..)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))..((((.((((((((..(...((.((((((((.((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).((((...))))..(((...(((((((..((...((((.........))))))..))))))))))...)))))))).)).......(.(((((.....(((((..((((((((.....((((.......((((((((..((.((.(((((....)))))..))))..)))......))))).(((((....))).))....))))......))))))))..))))).....))))))..((((((((((.((((...(((((((....))))))).(((((.((..........)).)))))..(((((((((....)))).))))).)))).))))))))))......(((.....))).........(((((((...((.(((......)))))...)))))))..)..))))))))...)))).((..((((..(((((.......))))).))))))....)))))))))).....((((((.....(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))..))))))...(((((((........))))))).......((((.((.((...((((((((.......).)))))))...))))))))(((((..((....))..))))).(((.((..((..(((((((.((.((..(..((((.((((..((.....)).))))))))..)..)))).)))))))..)).)))))...............(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........(((.((((((.(((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.(((((...))))).)))((......(((..((..((((((((.((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....)))).....(((....)))......((......)).)))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((.........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))......)...(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....))))))))))))))).(((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.(((((..((((((((((....((((..(...).))))...(....(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..(((....)))))....)))))))..((.(((((.....)))))))......))))..)))).).)).)..)))))))))...))))))))..)).))))))))((...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))....)))))))...))((((..(((((((.(.....)))))))).....)))).).)))).))...((((((........))))))).(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))..)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((((...(.....((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.(.(((...))).).)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))......((......)).)))))))..))))))))).((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...(.........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).))....(.(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))).))......((((....)))).))))))((((((..(((((((((((((.((.(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......)))))))))))).....((((((((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).))....)))))..)))).).))))...))))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....)))))).)))).)(.(((((((..........)))))))....)..)...)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))..((....))..((((((((((((....))))))))).....))))))))) |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........((((((((((.(((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.(((((...))))).)))((......(((..((...(((((((.((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....)))).....(((....)))......((......)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((.........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))......)...(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....))))))))))))))).(((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.(((((..((((((((((((..((((..(...).)))).))(....(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))(((.(((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....)))))).)))).)).((((((((........))))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((((..((.....((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.(.(((...))).).)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))......((......)).)))))))..))))))))).((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...(.........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).))....(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))).....((((....)))).))))))((((((..(((((((((((((.((.(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.(((..(((((((.((((((((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((((((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).))....))))).))))).).)))))...)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....)))))).)))).)).(((((((..........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))..((....))..((((((((((((....))))))))).....))))))))) |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((...(((((((((...))))))))).((.((((((.(((.........)))....((((((((...........(((((.(((.(((((......((((((..((...(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....))))................)))))))..)).))))))....((((((..(((((((.((...(((((..(((((((....(((.((.(((((((.........))))))).)).((((.((((.....)))))))).(((.(((((...((....((((((....))))))...((((....))))......))....))))).))).)))....)))).))).........((..(((((((((..................)))))))))..))....)))))...)).))))))).(((.((((.((.((((.((((....)))).))))..)).)))))))......((((((((((.(((((((((..((..(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...))))))))).(((...((.(((((((.......((((((((((.(((......)))....)))))))))).......(((.((....(((((((((.((((.....((((((((((((.(((...(((((((..((...((((.........))))))..))))))).(((......(((((((.(((((((..(((......)))..)))))))...((....))....)))))))((((((.......(((((....)))))...((((((((......(((....)))..((((((((..((((.(((......)))))))..)))).....(((....))).))))............(((((((....)))))))...))))))))..........)))))).)))..(((((....)))))))).)).)))).)))))).....)))).)))..))))))...(((..((((((.((.((.............((.(((....))).)).(((((.....))))).)).)).))))))..)))....)).))).))))))).....)).((.(((((..((((((.....(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))..))))))...))))).))....))).))))))....)))).....))))))..))))).))).)))))....(((.(((....))))))..))))))))..)))))).))..((((..((..(((((((.((.((..((.((((.(((((.......)))))...)))).))..)))).)))))))..))..))))..........((..((((((((((....))))))))))..))..))))... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.((..(((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....(((..(((((((.(((((...))))).)).))).))..))).......((((((..((.(.(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))....(((....))).))))))).))).))))))(((((((.(((..((((((((.(....))))))))))))...))))))).(((((((((....)).)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))......((((((....))))))..(((((....))))).))).))).))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((((((...)))).......)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))(((((.((((((((.........((((((((.((((((((((.((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.(((.(.....))))..))))))))))....................)))))))..)))))).((((...))))..(((...(((((((.......((((.........))))....))))))))))...)))))))).........((.((((((....(((((..((((((((...(((((((....(.((((((((..((.((.(((((....)))))..))))..)))......))))))(((((....))).))...))))).))...))))))))..)))))...).))))))).((((((((((.((((...(((((((....))))))).(((((................)))))..(((((((((....)))).))))).)))).))))))))))......(((.....))).........(((((((...((.(((......)))))...))))))).....))))))))...)))))....((((..(((((.......))))).))))......)))))))))))....((((((.....(((((((...(((((.......(((....))).........)))))...)))))))..)))))).(.(((((((.(.....)))))))))......((((.((.((...(((((((((.....)).)))))))...))))))))(((((............)))))((((.((.(((..(((((((.((.((.....((((.((((............)))))))).....)))).)))))))..)))))))))..............(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((...(((...)))...)).((......(((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....))).................)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(.........)))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((......(((((......((((...(((((((((((.(((((.(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((.......((((.........))))....))))))).....((((.(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....))))))).((((((((((((.((((....)))).....((...........(((....))).((.((((((.((((((((((......((........))..........(((((((......(((((((...((((((....))))))....((....))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))).)))).)).(((((((..........))))))))).))).))))))))).))))......)))))(((.((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((............))).)))).)...))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))))))....)))... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((((.......((((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((...(((...)))...)).((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....))).................)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))..).))))..((((....)))).)))))).(((((..(((((((((((((.((.(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((........(((((...((((((....))))))....((....))..)))))....(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....)))))).)))).)).(((((((..........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...))))..))))))..))).))))............((((((((((((....))))))))).....)))))))). |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.(((((((((((...))))))))).)).(((.(((((.......)))))..))).(((((...((((((((((((((.(((((((((.((......(((((.....(((((((..((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....))))...............(((..(.(((..((.((((((((.........((((((((.......))))))))((((.((.....((((((((((((((((.....(((((.(((.((..((...(((((((.....((((....))))...((.((((((....))))))...((((....))))......))...)))))))..))........)).))))))))....))))..((((((((..................)))))))).)))).))))))))....))))))..))))))))))....((((.((((....)))).))))..))).)..)))......(((((.(..(((((((((((..((..(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).))..)))..).)))))....))))))).....((((((((((...........(((((((((((.......(((((((.(((((((((..(......)..)))))))))...((....))....))))))).(((..(((....(((((....))))).......((((...((((...(((((.......((((..((((.(((......)))))))..)))).....(((((((..((((..((((.((((...(((((((....)))))))..((((.((..........)).))))...(((((((((....)))).))))).)))).))))..))))......(((.....)))....((..(((((((((..(((.(.....).)))..)))....))))))..(((((.....))))).))..)))))))..).))))..)))).......))))...)))..)))...............))))))))))).............(((....)))....))))))))))........)))))((((....(((((((........)))))))..(((((((((.((.((...(((((((((.....)).)))))))...))))))))...)))))))))..)))))))))).).))......(((((((.((.((..((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..)))).))))))).)))))))))))))))))..((..((((((((((....))))))))))..))..))))... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............................................................................................((.(.(....((..........(.(.((.(..(........((..((....(.(..(.(....(.(..(...(.((.....))).........................)....).).((.(((.(((...(((((((.......))))))).)))...))).))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....)))))))))..).)...)....))....)).......((((((....(((....))).).))))).....)..)..((((.((((...((...)).))))...)))).((((.((((...(.(....).....).)))).))))...(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).)).).).................((.....((.....(((((((((((.(.((..(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...))))))))...((.(((((...((.((((.(..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....).....((....)).)))).))..)))))..))..))))....).)....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((.(((((((((.(((((((.((((......)))).)))))))...............)))))))..(((....(((..((((....))))...)))...)))...(((((((((((((....(((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......((..(((...(................)............)))...)).(((.((((..(((((..(.((.((((((.........(((.((((...)))).)))))))))(...((.(..(((((((...((...(......).))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))).)).))).)...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...)).((...(((((((........)))))))......))..).)))).((.(((((((..........)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((.(....(((..(.((...(......).)).).))).)...))))..))))))..)...))))..)).)).....)))(((((((((....))))))))).).).....)).)) |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................(((((.(..(......(((.((..........(((.......))).............(.(..(.(....(.(..(........................................)....).).((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....)))))))))..).)...)....))...))).......((((((....(((....))).).)))))..)).......((((.((((...((...)).))))...)))).(((((((((...(.........)....)))))))))...(((((.......(((((.((.((....))))....))))).)))))........)))...........))((.....((((...(((((((((((.(.((((.((((.....((((((.....))))))...)))).))))...))))))))...((.(((((...((.((((.(..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....).....((....)).)))).))..)))))..))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((.(((((((((.((((((((((((......))))))))))))...............)))))))..(((....(((..((((....))))...)))...)))...(((((((((((((....(((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......((..((....((((((....))))))...............))...)).(((.((((..(((((..(.((.((((((.........(((.((((...)))).))))))))).....((((.(((((((...((...(......).))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))))))..)).)...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...)).((...(((((((........)))))))......))..).)))).((.(((((((..........)))))))....)).....))))))............)))))))((((..((..((((((..((((.(....(((....((...((....)).))...))).)...))))..))))))..))..))))..)).)).....)))(((((((((....))))))))).............. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((....((((((((...)))))))).........................................((((..(....((..((((((((...................(((((((..((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....))))...............(((..(.(((..((.((((((((..........(((((((.......))))))).((((.((.....(((((((((((.((((.....(((((.(((......................((((....))))((....((((((....))))))...((((....))))......)).........................))))))))....)))).(((((((((..................))))))))).))).))))))))....))))))..))))))))))....((((..(((....)))..))))..))).)..)))......(((((.(..(((((((((((..((..(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...)))))))).....((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).....)))..).)))))....)))))))..........................(((((((((((.......(((((((.((((.(((..((......))..))).))))...((....))....))))))).(((..(((....(((((....)))))..................................................................................................(((((((....)))))))............................................((((((.((....)).(...............).))))))....................................................(((((.....)))))........................................)))..)))...............)))))))))))..((((..((...(((....)))...))....))))..............((((....(((((((........))))))).............(......(((((((..........))))))).....).............))))....))))))))...))..((..(((((((.((.((.....((((.((((..((.....)).)))))))).....)))).)))))))..)).)..))))............((((((((((....))))))))))......))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((.(((((((((((...))))))))).)).(((.(((((.......)))))..))).(((((...(((((..(((((((..((((((((.(((.((((((.....((.(((((((..((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....))))...............(((..(.(((..((.((((((((.........((((((((.......))))))))((((.((.....((((((((((((((((.....(((((.(((.((..((...(((((((.....((((....))))...((.(((((......)))))...((((....))))......))...)))))))..))........)).))))))))....)))).(((((((((..................))))))))))))).))))))))....))))))..))))))))))....((((..(((....)))..))))..))).)..)))......(((((...((((((((((((..((..(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))...........((....)).)))))))..)))))).))..))))...)))))....)))))))))....((((.........))))(((((((...((((.......(((((((.(((..(((..((......))..)))..)))...((....))....)))))))..(((..((.((.(((((....)))))..))))..))).....))))((((.(((....))).((.(((((.(((((..((((........))))))))).......((((((((..........(((((((....))))))).(((((((.....(((....(((((.(((((..(((....))).(((((((((....)))...(((......)))...)))))))).))))))))((((((...((.(((......)))))...))))))..))).(((((.....)))))..)))))))........))))))))..))))).))....)))).))))))).)))))).)))...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...((((....(((((((........)))))))..(((((((((.((.((...(((((((((.....)).)))))))...))))))))...)))))))))....))))))))...))......(((((((.((.((..((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..)))).))))))).)))))..))))))))))..((..((((((((((....))))))))))..))..))))... |
