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UGCCUGCAGAGAGUUGGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGUACGCAUGCAAUUUGGCUUGCCAGAUUGCGAUGAGUGGCGGACGGGUGAGUAACACGUAAGAACCUACCUUUUGGAGAGGGAUAACCAUUGGAAACGAUGGCUAAUACCUCGUAUUGCUGAGAAGUGAAAGAUGAAAAUCGCCAAUAGAUGGGCUUGCGGCUGAUUAGCUUGUUGGUGAGGUAAUGGCUUACCAAGGCAAUGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGACAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGAAGGAUGAAGGCCUAUGGGUUGUAAACUUCUUUUCUCAGAGAAGAAGCAUUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUAAAAAGUCUCCUGUCAAAGAUCAGGGCUUAACCCUGGGCCGGCAGGAGAAACUCUUAGGCUAGAGUUUGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCGGGAGGAACACCAAAGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCAUAACUGACACUGAGAGACGAAAGCGAGGGGAGCAAAAGGGAUUAGAUACCCCUGUAGUCCUCGCCGUAAACGAUGGAUACUAGAUGUUGGGUAGGUUAAAUCACUCAGUAUCGUAGCUAACGCGUGAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGACUUGACAUGCCACUUUUUCCCUGAAAGGGGAAGUUCCAGAGUGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUUUGAAUUGCCAGUAAUGGGAAAUUCAAAAGACUGCCGGUGACAAGCCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGUCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGCCGGGACAAAGAGAUGCAAACCCGCGAGGGCUAGCCAACCUCAAAAACCCGGUCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGGUCAGCCAUACUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGCUGGCUAUGCCCAAAGUCGUUACCCCAACCUUUUAGGAGGGGGACGCCUAAGGCAGAGCUAGUGACUAGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGGGGGUGGAUCACCUCCUUG |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.....(((..(((.(((((........((..(((((.(((.........))).)))))..))..(((((((((....)))))))))..)))))(((.((((((((.((....((((((..((((.((.((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(..((....))..)..(((....))).)))).)).))))))))))..(((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))....((((((((((((.......((((((.(((((.(((.....))))))))....(((((((..((.((..((.(((....))).))....))....(((..(((((..(((((.((..((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))...))....((...(((((((((.((....)))))...))))))...))..))))).))))......)..))).....)).))))))))))))).......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))))))))))))......((((((((...((((((((((.(..(.(((((.....(((..(((((((((.((....))...(((....((((((((((.((((((......(((((....(((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...((....))....)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...((.(((....)))))....))))).(((((((((((...((((........))))........(((((((......(((((((((((((((....)))))).....))))))).)).(((.(((((.((((((.(((((.((((((.((((...(((.(((.....))).))).)))))))...((((.(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....))))))).)))).)))..))))).).)))))))..))))))...)))))))..))).))))))))...)))))).)).)..)))).)))...(((....)))...)))...........))))))))).((((.((((((((((........)))))))....))).))))))).....))))).((....))...)..))).))....))))))..))))).)))..)))))))))).((((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..((.....))..))))))).))..)))).)))))))..))).))))..)))......)))...)))..)))..))).(((((((...))))))).)) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((.(((....)))..((((((((..((((.((((((.(((((((((((....(((((.........)))))...((.((((((((..(((((..((.(((((...((((..(((....((((((..((...((.((((.((((.((..((((((....))))))...)).))))...(((((....)))))..(((....))).)))).))..)).))))))(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).)))..)))).((......)).))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))).)))))))..(((....)))......)))))..))).))..))))).))))))..((((.......(((....)))......)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))...(((((.(((((.....(((((...(((((((((...(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))..)))))...((((((((...(((((((((..((((((((...(((........)))....)))))))).....))....((....)).)))))))..)))).))))..))))...)))))...((((((...((...((((.........))))...)))))))).((..((((.(((((((.((((((((((..........))))))))))...((....))....))))))).(((((((((((((..(((((...(((....(((.......)))....((((((.((.((((((..((((((((((((..((((........)))))))))...(((((((........(((((((((((((....)))))).....)))))))....(((.(((((.(((((((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))...(((....((((((((..(((....)))...))))))))..((.(((((.....))))).))..)))...))))))....)))))))..))))))...))))))).......))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).))...))..))))...)))..)))))...)))).))))))))).))))..))..))))).((((.((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..(((...)))..))))))).))..)))).)))))))..))))))))).)))))........)))))....)))))))(((((((...)))))))... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................(((((((.........................((((((((((....)))))))))).........................((((((............................................................................................))))))......................................................((((....))))...........(((((............))))).((((....))))................(((((..................)))))..))))))).........................................................................(((((......((((((..................)))))))))))........................................((((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...))))))))).....))))))))............(((((((....((((((((.....................))))))))....................)))))))............................(((((((.......((((.........))))....)))))))..........(((((((.((((((((((..........))))))))))...............))))))).............(((((....)))))...................((((((((............((((((((..............................(((((((..............(((((((....))))))).......................................................................................(((((((((.(((....)))..))))))))).....(((((.....))))).......................................)))))))......)))))))).....(((((((..........................................)))))))........................................................................................))))))))......................................................................................................................(((((((....)))))))................ |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.........)))).((((..(((((.(((((((((....(((......((...((.......((((((....))))))........)).))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))...............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).))))).)))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........)))))...)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........(((((.((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((.......((((((.(((((((....)))))))......))))).)...((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((..........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).............. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........(((.........)))..((((.((((((.((((((.(.....(((...........((......(((((((....))))))).......))...................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))...............)))))))..)))))))))((((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))).((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).)))).)..))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((..((((((((((...((((((((.....)))))))).)))))))))..).)))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.((........))....))))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((.(((((....)))))..)))).........(((((.((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((......(((((((.(((((((....)))))))......))))).))..((.(((...((((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))..........(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).))...........)))).).)))))....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((....((((..((..((((....))))..))....))))....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((..........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((((((((....(.((((.((((..((.....)).)))))))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).............. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((.......(((((.....)))))...((......(((((.......)))))........(.((((((((((((....)))))))))).)).).........................................((((.(((.((((((....)))))).).)).)))).....(((....)))....(((....)))..........(((((.((.(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).)).)))))...................(((((.((.......))))))).((((....)))).................((((....((((....))))..))))............((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))..............(((((((((.((....)))))...))))))........))...........................))))))))............(((((((((...(.((((((.....)))))).).)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..)))).))))....)))))))......(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........((((((..((((((((((..........))))))))))................))))))((((((((((((.(((((....)))))..)))).............(((((((((....))))..........(((((..((((........))))))))).......(((((((...((((((((((((((....))))))).....))..........)))))..........(((((((((((.((....)).(..(((......))).).))))))..........(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....))))).))..........)))))))))))).....)))))......))))))))................(((((((.....(((..((.(.(((....))).).))....))).....)))))))...........(((((((........))))))).......((((.((......(((((((..........))))))).....))))))...(((((((......(((((.........(((..(((((((.((((...((.((((.((((..(((...))).)))))))).))..)))).)))))))..))))))))........)))))))................(((((((...)))))))... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.((((((((((((....))))))))).))).)))))......(((.......((((((..((...((.((((.((((.....((((((....))))))......))))......((....))................)))).))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((.....(.((((.(.(((.((((((..(((((((((((...(.((((((.....)))))).).)))))))))..)).))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((..........))))))))))...((....)).....)))))))))).(((......((((....))))....))).(((((..(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((((.(((((....)))))......))))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((((.(((....))).).))))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((...((((.(((..(((((((.((((....(.((((.((((..(((...))).)))))))).)...)))).)))))))..))).))))....))...)..)...(((.((((....))))..)))........))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((..((...((((((...)))))).((((((.((((((((.......)))))....(((((.((((((((((((....)))))))))).)).)).))).....((...................))((.((((.((((.(((.((((((....)))))).).)).))))...(((((....)))))..(((....))).)))).))..(((((.((.(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).)).)))))...................(((((.(((.....)))))))).((((....))))(((.............(((((...(((((....))))).)))))...))))))..((((......(((((()))))).....)))).(((((((((...(.........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))..(...........).......)).)))))))))...........(((((((((...(.((((((.....)))))).).)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((((..((((((((...(((........)))....)))))))).....))....((....)).)))))))..)))).))))....)))))))(((...(((((((..((...((((.........))))))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(.......)))))))))))...((....))....)))))))((((((((((((.(((((....)))))..))))..........((((((((((((....))))......(((((((((..((((........))))))))).......(((((((...((((((((((((((....))))))).(((.....)))...)))))))..........(((((((((((.((....))(((.(((......)))))))))))).....(((..(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....))))).)).)))......)))))))))))).))))))))))...))))))))))................(((((((.....(((.(((.(.(((....))).).))..).))).....))))))).((((......(((((((........))))))).......((((.((.((...(((((((..........)))))))...))))))))((((((((((((((..(((((.........(((..(((((((.((((...((.((((.((((..(((...))).)))))))).))..)))).)))))))..))))))))..)).)).)))))))..))).))))......(((((((...)))))))... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(...((((.(((....))).))))...)..)))))................((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).).(((((((....))))..))).........)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(.........)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........((((((((((((....((((((..((((((((((......((........))..........(((((((......((.((((..((((((....)))))).......))))..)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((...((...(.)))....)))))))..((.(((((.....))))).))....)))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))).((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............((((((.......((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.....((((((((....))))))))......)))))................((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).)...(((((....))))).............)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(..((.))..)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((........)))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((....((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((......((.((((..((((((....)))))).......))))..)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).))....)))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))))((((.(((..(((((((.((((....(.((((..(((..((.....)).))).)))).)...)))).)))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))))))))........ |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((..(((....))).[[[[[)))..]]]]].......(((.[[[[)))......]]]]...((((.[[[.((((((((((....))))))))))))))...]]]((((((((.......((((((..((((....((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))..(((....))).))))....))))))))))((((((((((((..(((((((.......)))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))(((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......))).......(((((...(((((....))))).)))))((((((.....((((......((((....)))).....)))).[[[[[[[[[......))))))......]]]]]]]]]...(((((......(((((((((...[[[[[[)))...)))))))))))...((((......))))...((((((...))))))....]]]]]].......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((....((((((((...(((......)))......))))))))....................)))))))..)))).))))....)))))))(((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))........[[[....)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..(((.(((....)))..)))]]].....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]......(((((((((..(((((((.((((((....))))))..((((...))))...)))))))...((((....))))[[[[[[(((....))).....)))))))))....]]]]]].....(((..(((((((((.(((....)))..))))))))).[[[.(((((.....))))))))..]]].....((((.....))))....(((......[[[[[[))).........((((...))))]]]]]]...(((.......(((....))).........)))......((((..[[[..))))..(((((((........)))))))]]]..............((((((((((....[[[...)))))))...))).......]]]...........)))))))).((((.(((..(((((((.((((......((((..(((..(((...)))..))))))).....)))).)))))))..))).)))).....(((.[[[[[......)))....((((((.......))))))]]]]] |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((...))))))).((((((.((((.(((((((((((..(((.(((..(((((((.((((((((((((....))))))))).))).)).)).)))..((.....)).((((((..((((.((.((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(((((....)))))..(((....))).)))).)).))))))))))(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).(((....))).....((((....))))....)))).)))))))..((((..((..((((....)))).))..)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))...........((.....)).))))))))).((((....(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((((..((((((((...(((........)))....)))))))).....))....((....)).)))))))..)))).))))....)))))))(((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...((....))....)))))))(((((((((.(((.((((....)))).....((((.....)))).((((((.(((....)))(((..((((.(((......)))))))..)))......(((((((.(((((((((.(((((((((((((((....)))))).....))))))).))((((....(((((((((....)))).))))))))).........)))))))))(((.....))).........(((((((((.(((....))).).))))))))..((.(((((.....)))))))...))))))).((((.....))))....))))))))).)))))))))....(((.(((((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...(((..(((.((((((........))))))........((((.((.((...(((((((..........)))))))...))))))))(((((..((....))..)))))((((.((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..(((...)))..))))))).))..)))).)))))))..))))))))).)))..)))...)))))))).))...))))(((((((...)))))))... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((.........)))).((((.((((((.((((((.(((....................((((((((((((....))))))))).))).......................(((((..(((..((.((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((aa....)))...(((....))).)))).))..)))))))).(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....)))).AA...............(((...(((((....))))).))))))..))))))..((((......((((....)))).....))))(({{{{{{{{.))...............}}}}}}}}...............(((((((((.((....)))))...))))))......)))))))))).....................))))))))).((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..<<<))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..)))).))))........>>>......(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((..........))))))))))...((....))....))))))).((((...((((.(((((....)))))..))))..))..............((((....))))...[[[[[[[((((...((((........)))).))))...(((((((........(((((((((((((....))))))).....))))))..........(((.((((((.(((((((((((.............(((......)))...))))))..........(((((((((.(((....)))..))))))))).....(((((.....))))).............))))).)).)))))))..........))))))))).....]]]]]]].....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...........(((((((........)))))))....................(((((((..........)))))))....................................((((.(((..(((((((.((((...((.((((.((((..((.....)).)))))))).))..)))).)))))))..))).))))...............................(((((((...)))))))... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((.(..((((((((...)).......................................((.(((((.((((((....))))))..))))).))...................((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...)))).....(((....)))....(((....))))))))))).))).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).................((((...(((((....))))).))))..((((((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((...(..(...)..)....)))))))))...))).))))...(((((((((.((....)))))...)))))).........))).........................(((.(.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...))).).)))......((((((..((...((((.........))))))..))))))..((........((((((.((((((((((..((...)).))))))))))...((....))....))))))...(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....))......((((....))))...........((((..((((...(...)))))))))....(((((((.......(((((..(((((((....)))))))..(()).)))).)..................(((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....(((...(((((((.(((((....)).))).)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))))))).......................)))))))....................((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))....)))))).............((((((........)))))).....................(((((((..........))))))).............(((..((....))..))).....((((.(((..(((((((((((((...((((((.((((..(((...))).))))))))))..)))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(..(((.(..((((((((...)))......................................((.((..((((............))))...)).))...................((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))......(......).....(((....))))))))))).))).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...)))).....((((.(((.....)))))))..((((....))))................(((((...(((((....))))).))))).....((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((..((..(...)..))...)))))))))...))).)))....(((((((((.((....)))))...))))))...............................................((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...((((.....(....).(((((..((...((((.........))))))..))))).............((((((.((((((((((((......))))))))))))....(....).....))))))...(((...((((.(((((....)))))..))))..))).......((....)).......))))..........((((..((((...(...)))))))))........((((((((.((((((.....((((....))))..........)))).)).................(((((.((((((.((....))...((((......))))..))))))....((((...(((((((((((((..)))).)))))))))...((.(((((.....))))).)).)...)))))))).))))))))......................................(((((((((....((((((((..((((....))))..)))..)))))....)))))))))...((((.((((((((........)))))))....)))))......((...(((((((..........)))))))...))........(((..((....))..))).....((((.(((..((((((((((((.(..((((((.((((..(((...))).))))))))))..)))))))))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((...))))))).(((((.(((((.(((((((((((..(((.(((..(((((((.((((((((((((....))))))))).))).)).))).))..(.......).((((((..((((.((.((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(((((....)))))..(((....))).)))).)).))))))))))(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).(((....))).....((((....))))....))))).))))))..((((..((..((((....)))).))..)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))...........((.....)).)))))))))..(........(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..)))).))))....))))))).((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))........(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...((....))....)))))))(((((((((.(((.((((....)))).....((((.....)))).((((((((((....)))).(..((((.(((......)))))))..)........(((((((.(((((((((..(((((((.((((((....))))))..((((...))))...)))))))(((((((((....)))).))))).............)))))))))(((.....))).........(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....))))).))..))))))).((((.....))))....))))))))).)))))))))......(.(..((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...((((.((.(((((((........))))))).....)).)))).(.(....(((((((..........)))))))....)).....(((((...(....)...)))))...((((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..(((...)))..))))))).))..)))).)))))))..))).)))).............))..))..........).(((((((...)))))))... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((.((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((..((..((.((((....)))).))...))..)))((......(((..((..((((((((.((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....)))).....(((....)))....((......)).)))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((.........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..(((((.....((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((....(...)))))...)))))))).....)....(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.((((((..((((((((((....((((..(...).))))...(....(((((((..(...(((((((.(((((((....)))))))......))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....)))))))......))))..)))).).)).)..)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).))...((((((........))))))).(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))..)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
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PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((.((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((..((..((.((((....)))).))...))..)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))....((......)).)))))))..)))))))))((((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))).((((((((....)))...)))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((...(.........)....))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((....(...)))))...)))))))).....)....(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((....((((........))))...(....(((((((..(...(((((((.(((((((....)))))))......))))).)))(((.(((..(((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))))...)))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))....)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))...))..)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
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PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((..((..((.((((....)))).))...))..)))((......(((..((...(((((((.((...(((((((.((((.(.(.((((((....)))))).)..).)))).....(((....)))....((......)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((.........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......).(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))......)...(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((((..((((..(...).)))).))(....(((((((..(...(((((((.(((((((....)))))))......))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))(((.(((......))))))))))))(...)((((.(((((((.(.((......)).)..)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...((((((.((...(((....)))...)))...)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).((((((((........))))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((..((..((.((((....)))).))...))..)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))....((......)).)))))))..)))))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((...(.........)....))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).........(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..(((((((((((...((((........)))).).(....(((((((..(...(((((((.(((((((....)))))))......))))).)))(((.(((..(((((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).))))))(...)((((.(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))))...)))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))....)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((.(((.((((((.((((((...))))))....((..(((((.(((.........))).)))))..))...))))))(((.((((...(((((((...((((((.((((((.....(((((.....((..((....)).((((..((.((((((....)))))).))...)))).((((((((....(((...(((....))).((..(((((.((((....(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))))))).)))))...)).........))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))).)))))))).))....(((((....((((....))))..))))).......))))).......(((((((..(((.((((..(((((((((...)))))))))(((((.((((((((((........((((((....((((((.((.((.(((((.......((..((((((....)).))))....))...(((((.....)))))....)))))........(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))((((((......))))))..)).)).)))))).......))))))..(((((.....(((..(((((((((.((....))...(((....(((((((.((.((((((......(((((....(((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...((....))....)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...((.(((....)))))....))))).(((((((((((...((((........))))........(((((((......(((((((((((((((....))))))).....)))))).))..((..((((.((((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).)).))))))))..)).....)))))))..))).))))))))...)))))).))....)))).)))...(((....)))...)))...........))))))))).((((.((((((((((........)))))))....))).))))))).....)))))...))))..)))))))))))..))))..))))))))))...))).))).))))))((((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..((.....))..))))))).))..)))).)))))))..))).))))..)))))))...)))))))...)))..))))(((((((...)))))))... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((...))))))).(((((.(((((.(((((((((((..(((.(((..(((((((.((((((((((((....))))))))).))).)).))).))............((((((..((((....((((.((((.(((.((((((....)))))).)).).))))...(((((....)))))..(((....))).))))....))))))))))(((((((((((..((((((((.(....))))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).(((....)))....(((((....)))))...))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).....................)))))))))...........(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))....................)))))))..)))).))))....)))))))(((...(((((((..(((...(((((...)).))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...............)))))))(((((((((.((((((((....)))))....((((.....)))).((((((((((....))))....((((.(((......)))))))...........(((((((.(((((((((..((((((((((((((....))))))).((((...))))...)))))))(((((((((....)))).))))).............)))))))))(((.....))).........(((((((((.(((....)))..))))))))).....(((((.....))))).....))))))).((((.....))))....))))))))).)))))))))....(((.(((((((.(((((((.....(((.(((...(((....)))...)).)..))).....)))))))...((((.((((((((((........)))))))....))).))))((.((...(((((((..........)))))))...))))....[[[[[.)))).......]]]]]...((((.(((..(((((((.((((......(((..((((..(((...)))..))))))).....)))).)))))))..))).))))...............))))))..........(((((((...)))))))... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((........(((((....))))).........)).((......(((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....)))...............)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(.........)))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((......(((((......((((...(((((((((((.(((((.(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((.......((((.........))))....))))))).....((((.(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....))))))).((((((((((((.((((....)))).....((...........(((....))).((.(((((((.((((((((((......((........))..........(((((((......(((((((..((((((....)))))).......))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........))))))))).))).))))))))).))))......)))))(((.((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((............))).)))).)...))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))))))....)))... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((..((((((.((((..((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((........(((((....))))).........)).((......(((.......(((((((.((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....)))...............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((.(((....))))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((......))))))))))))...((....))....)))))))))))..).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((........(((((..((((((....))))))...(..))))))....(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((......))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..(......)..))).)))).)...))))..))))))..))).)))).))))..........(((((((((....))))))))))))))).))).... |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((.(((.....(((..(((.(((((........((..(((((.(((.........))).)))))..))..(((((((((....)))))))))..)))))(((.((((((((.((....((((((..((((.((.((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(..((....))..)..(((....))).)))).)).))))))))))(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))))..((((((((((((.......((((((.(((((((.........(((((..((((....)))).......((.(((....))).)).)))))....(((..(((((..(((((.((..((((......((((....)))).....)))).(((((((((..................)))))))))...))....((...(((((((((.((....)))))...))))))...))..))))).))))......)..))).......)))).))))))))).......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))))))))))))......((((((((...((((((((((.(..(.(((((.....(((..(((((((((.((....))...(((....(((((((.((.((((((......(((((....(((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...((....))....)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...((.(((....)))))....))))).(((((((((((...((((........))))........(((((((......(((((((((((((((....)))))).....))))))).))..((..((((.((((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))))))))..)).....)))))))..))).))))))))...)))))).))....)))).)))...(((....)))...)))...........))))))))).((((.((((((((((........)))))))....))).))))))).....))))).((....))...)..))).))....))))))..))))).)))..)))))))))).((((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..((.....))..))))))).))..)))).)))))))..))).))))..)))......)))...)))..)))..))))(((((((...)))))))... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................(.(.(..((.((...((......(((.(.........(.(....).)..................((..((.(....(.(.(...(.(........)........................).)..).).((((((.(((...(((((.(.......).))))).)))...))))))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....))))))))).)).)...).....)...))).......((((((....(((....))).).)))))..)).......((((.((((...((...)).))))...)))).(((..((((...(.(....).....).))))..)))...(((((......((((((.((.((....))))....)))))))))))........).)...........))((.....((.....((((((((((..(.(((.(((((...(.((((((.....)))))).).))))).)))...).))))))...(((.((((...((..(..((..((((((((...(((......)))......)))))))).....))....((....))..)...))..))))..)))..))))....).)....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((((((.(((((((((((.......).))))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......((...((....((((....))))............)).)).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).)))))))))(...((.(..(((((((...((......))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))).)).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(....).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((......((((..(.(..((.....))..).))))).....))))..))))))..)...))))..))))).....)))(.((.((((....)))).)).).........)).). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((.(...(((((..((((.((((.((((((.(((((((.((...(((.(((..((((.....((.......................))...))))...(.((.((((....((((((..((...((.((((.(.((.(...((((((....)))))).)....)).).(.....(.....).)...((......)).)))).))..)).)))))).((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....))))))))))))))...)...)))...))).))....((((((....(((....))).).)))))..)))))))..((((.((((...((...)).))))...)))).(((..((((...(............).)))).).))...(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).)))))))))).........))))((.....((((...((((((((((..(.(((((((((...(.((((((.....)))))).).)))))))))...).))))))...(((.((((...(((((((((..((((((((...(((......)))......)))))))).....))....((....)).)))))))..))))..)))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((((((.((((((((((.(......).))))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......(....(((((((.((....)).)))).......).))..).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.(((......)))))))))))).....((((.(((((((...((.......))...))))))).(((.(((((.....))))).....)))))))..))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(....).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((......((((...((..((.....))..)).)))).....))))..))))))..)...))))..))))).....)))(.((.((((....)))).)).))))))....)))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((((.((.....................((.(((((((((....)))))))))..))...................................((..(((.((((..((.((((((....)))))).))...))))......((....)).....(((....))).)))..))...........(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))))............................(((((.(((.....)))))))).((((....)))).........................((((....))))......))..)))))).............................((((((((.....))))))))........................................(((.(......))))..................................................................(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..............................................................(((((((((.((....))...(((....((((((..((.(((((......................(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))..........(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))...((....))....)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))............................(((((((((((...((((........))))........(((((((......((((((((.((((((....))))))......)))))).)).......(((.((((((.(((((((((((.((....)).(..(((......))).).)))))).....(((...((((((((.(((....)))..))))))))...(..(((((.....)))))..)......))).))))).).))))))))..........)))))))..))).))))))))....))))).)).....))).)))...(((....)))...)))...........)))))))))..(((.((((((((((........)))))))....))).))).....................................................................((((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..(((...)))..))))))).))..)))).)))))))..))).))))...............................(((((((...)))))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((..(((..((((..(.(((((((((.((((.(((((((((((..(((.(((..(((((((.((((((((((((....))))))))).))).)).)).)))..(((.......((((((..((((.((.((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(..((....))..)..(((....))).)))).)).))))))))))(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).(((....))).....((((....))))....)))).)))))))......((((....(((....(..((...(((((((((...))))))))).....))..).....)))......)))).((...(((((((((.((....)))))...))))))...)).))))))))))....))))..)).))..))).)))))))))((((.......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((((..((((((((...(((......)))......)))))))).....))....((....)).)))))))..)))).))))....)))))))......(((((((..(((...(((........))).)))..))))))).....((((((((((((.(((..(((((.(((...))))))))..)))...((....))....)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((.((.((((.((.(((((((((((...((((........))))........(((((((......(((((((((((((((....)))))).....))))))).)).(((.(((((.((((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((((.(((....)))..)))))))))..((.(((((.....)))))))......))))..)))).)).))))))..))))))...)))))))..))).)))))))).))..(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...((((.((((((((((........)))))))....))).)))))))).)).(((((((..........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..(((((((.((((...((.(((..((((..((.....))..))))))).))..)))).)))))))..))).))))..)))))........))))............(((((((...)))))))... |
