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UGGAAAUGACGAGUUUGAUCCUUGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUUGAACGAAAUUACUAGCAAUAGUAAUUUAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUAUGUAAGAAUCUGCGCUUGGGCGAGGAAUAACAGAUGGAAACGUUUGCUAAUGCCUCAUAAUUUACUAGAUCUAUGUGAGUAGCUAGUUAAAGAGAAUUUCGCCUAGGCAUGAGCUUGCAUCUGAUUAGCUUGUUGGUGAGGUAAAGGCUUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGAUUUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGAUUGAGAACGGAACAGACUUCUACGGAAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAAGGAAGACGGCCUUUGGGUUGAAAACCUCUUUUCUCAAAGAAGAAGAAAUGACGGUAUUUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAAUUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGGAGAUGCGAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGAGUUUGUAGGCGGUCAAGUGUGUUUAAUGUUAAAAGUCAAAGCUUAACUUUGGAAGGGCAUUAAAAACUGCUAGACUUGAGUAUGGUAGGGGUGAAGGGAAUUUCCAGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUUGGAAAGAACACCAAUGGCGAAGGCACUUUUCUAGGCCAAUACUGACGCUGAGAAACGAAAGCUGAGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGUAGUCUUGGCCGUAAACUAUGGAUACUAAGUGGUGCUGAAAGUGCACUGCUGUAGUUAACACGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGCUUGCACAAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACACGAAGAACCUUACCAGGAUUUGACAGGAUCUAGGAAGUUUGAAAGAACGCAGUACCUUCGGGUAUCUAGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUUUUUUUAAUUAACGCUUGUCAUUUAGAAAUACUGCUGGUUAUUACCGGAGGAAGGUGAGGACGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUAUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUUAAGACAAUAAGUUGCAAUUUUGUGAAAAUGAGCUAAUCUUAAAACUUAGCCUAAGUUCGGAUUGUAGGCUGAAACUCGCCUACAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCUAUACGGCGGUGAAUACGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGUCGGCUGUGCCCGAAGUUAUUAUCUUGCCUGAAAAGAGGGAAAUACCUAAGGCCUGGCUGGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGUGGCUGGAACAACUCC |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
..........(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((....)))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((...)))......(((((..((........)).))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((.........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))..))))))))..........<<<<<<..((((((((.......))))))))...<<..))>>.....>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((.((((((..((((....))))....((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((....))...)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.........(((((.(.(((.(((.(((.(....).))))))....(((..((((...(.(((...((.(((((((((....))))))))).))(((.((((((((.((...(((((((..((...((((((((((((.....((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))..))))))))))))..)).)))))))..((((..(.(.((((((((.......)))))))).).)..)))).((.(((((((.........))))))).))((.(((.(((((((((..((...((((....))))......(((.((....(((((...(((((....))))).))))).....((.(((.((.........((((((((((....(((((.((((((......).))))).)).)))......(((((.(((....))).)))))((((.(((.(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..))))))))))......(.(((.(((((((...(((((.(((((((((.....((((((.....))))))...))))))))).)).)))..((((((.((((((((((.((.((((..((((((((((..(((((....((.((((.(((((........))))).((....)).....)))).))...))))))))))).)))).....(((.....)))...............)))).)).)))).)))))).....((...((((((..((((.......))))..)).))))...))..))))))...))))))).))).)..))).))))......))))))))))..)).))).))..)).))).((((((..((((((((((((..((((........)))))))))...(((((((.(((..((.(((((...((((....))))...(((((....)))))))))).....(((((((.((((.((((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))....(((((((((((((...((....))...))))))).....(((((....)))))..))))).)..)))))))))).).)))))).))..))).))))))).......))))))).....(((((((....((((..((.(((((...)))))..))....))))...)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........))))))).....))))))))).))).))....))))))))))..(((.((.....(((((.(((((..((((((((.((.((((......(((......))).))))..)).)))))))).))))).)))))...)).))).)))..))).)...))))))).))).))))))) |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((...(((..(((...(((((..(((((((((((((((.....(((((((((..((.(((((((((....))))))))).)).(((((.....................)))))((((((((((((.((..((((((....))))))...))..(((....((((((((..((((....)))))))).)))))))..))))))))))))...)))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))((((((((..((((((....((((((....(((((.................)))))..((((((........((....(((((...(((((....))))).))))).....)).(((........))))))))).))))))...))))))((((((((..................))))))))......)))))))).(((((((...((....)).....))))))).....))))))..(((((..((((((((((..((((((((...(((((((.((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)))).)))...((((((((.(((..((((((..((((((((...(((........)))....)))))))).....))....((....)).)))))))..)))).))))..))))...))))...((((......(((((((((.........))))).(((((((((((..((((((..(((((((((((((.......)))))))).))).))...)))..))).(((((((((((.....(((((....)))))...)))..)))......)))))..((((....))))...((((((((((((..((((........)))))))))...(((((((.........(((((...((((....))))...(((((....))))))))))...(((.(((..((((((((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))...(((....(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).))..)))...))))))....))))))...))))))...))))))).......)))))))...)))))))))))..............)))).......))))..)))).....(((((((((((....))).))))))))....)))))).))))..))))))))))))))..)))))....))).....(((((((..((((...........))))..))))))).((((((((.....(((((((((..(((..((((((((....((((......(((......))).)))).....))))))))))).....((....))....)))))).)))....)))))))).)))..))))). |
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................(((((((.......................(((((((((....))))))))).....................(((((((.......((((((((((((.......................................................................)))))))))))).....)))))))............((((((((.......))))))))..............(((((((.........)))))))..........................((((....))))................(((((...(((((....))))).)))))..))))))).........................................................................(((((......(((((((................)))))))))))).........................................(((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)))))))))........................((((((((.....................)))))))).......................................................(((((((......(((((.........)))))..)))))))..........(((((((.((((((((.......))))))))...............))))))).............(((((....)))))...................((((((((............((((((((..............................(((((((.........((((((..((((....))))................))))))............................................................................................................(((((....))))).......................................)))))))......)))))))).....(((((((.........................................)))))))...........(((((((........)))))))....................(((((((..........)))))))...........))))))))...........................((((((((((((.......................................))))))))))))........................((((((((((....)))))))))).......... |
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.........)))).((((..(((((.(((((((((....(((......((...((....((((((....))))))....)).))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((((((...(((....))).)))))))............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).))))).)))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))..))))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........(((((.((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((.......(..(((((..((((....))))......((....))..))))).)...((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))).....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....)))....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((..........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((....)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))........... |
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................((((..(((((.((((((.((....(((............(...(((((((....)))))))...)....................(((((((.((...((((((((((((.....((((((....))))))......)))).....(((((((...(((....))).)))))))...........))))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))))..))))))..((((......((((....)))).....)))).(((.(((((..................))))).)))...(((((......(((((((((.........)))...))))))))))).))))).)))).......(((((((......((((...(((((((((((..((((((((((...((((((((.....)))))))).)))))))))..).)))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.((........))....))))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))..))))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))...............((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((......((.((((((..((((....))))......((....))..))))))))..((.(((...((((.(.((((.(((((.(((....)))...(((......)))....)))))..........(((((((...((....))...)))))))...(.(((((....))))).)............)))).)..))))....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((....((((..((..((((....))))..))....))))...))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((..........)))))))...........))))))...................((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..((....)).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))........... |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................((.(((((((((....))))))))).))...................((((((.......(((((((((((......((((((....)))))).................(((((..((((....)))))))))..........))))))))))).....)))))).((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))......................................................(((((...(((((....))))).))))).....................((((((.((((......(((((((((............................(((((.(((....))).))))).......(((((.................((.((((...(((((............................((((.(((((.(((((((((.....((((((.....))))))...))))))))).)).))).))))........................((((((((...(((........)))....))))))))............................((((....................................(((((.........)))))......)))).........((((((((((((((((.......)))))))).)))).............))))........((((.(((((....)))))..))))..................((((....))))..........(((((..((((........)))))))))...((.((((((....)))))).))..((((....)))).....(((....)))........................((....))((((((..........(..(((......))).).))))))...........................................(((((....))))).................................................................(((((((....((((..((................))....))))...)))))))...........(((((((........))))))).....)))))..)))).)).(((((((..........))))))).................................................))))).......................))))))))).....)))))))))).................................(((((((((....)))))))))........... |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.........)))).((((........(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((((((....))))))))).)))))......(((......(((((((..((...((((((((((.......((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))....))))))))))..)).)))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).......................((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..............(((((((((.......((..(..((((((...(.........)....))))))..)..))..........(((((.....((....)).......)))))..(((((((((..(((.......((((((.....(.((((.(.(((.(((.(((..((((((((((......(((((.....)))))....)))))))))..).))).)))...((((((((...((.(((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))).))..)))).))))...))))..))))....((((((...((..(((((.........))))).))))))))..........((((((..((((((((.......))))))))...((....)).....))))))))))))))))..)))))))))........)))))))))...(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((.........((((((..((((....))))....((((....))))))))))....((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.(.((....)).).)))))))..((.(((((....))))).)))))).........)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((...((((.(((..((((((((.(((....(.((((.((((.......))))....)))).)...))).))))))))..))).))))....))...)..)..(((((((((....)))))))))......)))). |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................((((.....)))).....((..)).(((((.......)))))..(((..((.(((((((((....))))))))).)))))...............(((((((..((...((((((((((((.....((((((....))))))......)(((.....(.(((((..((((....)))))))))..).)))...)))))))))))..)).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))..........................((((....)))).(..(.....((.((((((((...(((((....))))).))))).))).))..............((((((.((((......(((((((((...((((.......((((((((((....(((((.(((....))).)))))))))).(((((((................((.((((...(((((........(((.......))).....((((((.(((((.(((((((((.....((((((.....))))))...))))))))).)).))).)))).............(((........((((((((...(((........)))....))))))))....))).....................((((((.(((...(((..........)))...........(((((.........)))))))).)))))))).......((((((((((((((((.......)))))))).)))).............))))(.....).((((.(((((....)))))..))))..((((......((((((((((....))))..........(((((..((((........)))))))))(..((.((((((....)))))).)).)((((....))))...(((((....)))))..................((((.((((((.((((((.((....))(((.(((......)))))))))))).....((((((................................(((((....))))).))))))....)))))).....))))....))))))....))))...........(.((......(((((((....((((..((.((((.....))))..))....))))...)))))))...)).)....(((((((........))))))).....)))))..)))).)).(((((((..........)))))))...........(((((............)))))...............))))))).......)))))..))))....))))))))).....))))))))))..)..).(((((.......)))))........((((((((((....)))))))))).......... |
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((............(((((........)))))........................((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).)......((((((..(((......)))))))).)............)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((......))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(..(...)..)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))..))))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........((((((((((((....((((((..((((((((((......((........))..........(((((((......((.(((((...((((....))))....(..(....))...))))))).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.(..(....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))).((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((.((.....)).))).)))).)...))))).))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))).......... |
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............((((((.......((((.((((((.(((((((((....(((.(((...........((((.(........).))))..(((..................((((((..((...((((((((((((.....((((((....))))))......)))).....(((((((..((........)))))))..)).........))))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((.(((((...(.........)....))))).)))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))..))))))))..........(((((((.((((((((((..)).))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((....((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((......((.(((((...((((....))))....(.(.....))...))))))).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((...).)...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((...........))).)))).)...))))..))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))))))))..... |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((......[[[[....)))..]]]]........((((....(((((.[[[[[.)))))..]]]]]...(((((((((....)))))))))...))))((((((((........(((......)))((((((((((((.....((((((....))))))......))))...((((((.........))))))....[[[[...(((...)))))))))))...]]]](((..[[[[[[.[[[[..[[[[[[[)))....]]]]]]]]]]]...]]]]]]..(((((((.........)))))))..(((((...........[[[[....((((....))))....))))).......]]]]....(((((....)))))(((....[[[[[[[)))..(((....(((((....)))))....))).((((((......)))))).....]]]]]]]...(((((.......[[[..)))))..]]]....(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..))))))))))...............(((((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..((((((..[[[.....))))))......]]].......((((((.(((......))).........((((((........[[[[.......))))))...]]]]......))))))..........(((.[[[[)))...............]]]].....))))))))).......((((((..((((((((.......))))))))..........[[[[[[))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..]]]]]]((((((((....((((((..((((((((((((..((((........))))))))....(((((((.....(((.((((((..((((....))))....((((....)))))))))).....((((((..((((.((((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((..............))))))).....(((((....)))))..)))))....))))))))))...))))))...)))...)))))))......)))))))).....(((((((....((((.....(((((...)))))........))))...)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).(((.((((((.............)))))).))).....))))))))........)))))))).......(((...(((((.(((((..((((((((....((((......(((......))).)))).....)))))))).))))).)))))........((((((((((....)))))))))).......))) |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((.(((.(((..((.(((........))))).(((((.......)))))..........(((((((((....))))))))).(((((((.((((((......(((((((..((...((((((((((((.....((((((....)))))).......(((....((((((((..((((....)))))))).)))))))..))))))))))))..)).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))...((.(((.(((((((((.......((((....))))...(((((((......(((((...(((((....))))).))))).((((((((((..(((....(((((....)))))....))).((((((......)))))).))).)))))))...(((((.(((....))).)))))..((((((((((.((......))))((((((((((((((....(((.....(((......((((((.......(((((((((((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..((((((.((....)).)))))).((((.......((((((((...(((........)))....))))))))...)))).(((((.(((((...(((((.(((..........))).))))).....(((.....)))..(((((.........))))).))))).))))).(((..((...((((((((((((.......)))))))).))))...)).))).....((((.....)))).)))))))).)).....)))))).........(((((.(((((((....)))(((..((((.(((......)))))))..)))...((((.((.((.((((((....)))))).))))))))........(((.(((((....((......))..))))).)))..)))).))))).((((((.........(((.(((......))))))))))))....))).....)))...))))))))).))))).......))))))))..(((((.......))))).((.(((.....))).))..((((..........)))).((....))........(((((((....((((..((.(((((...)))))..))....))))...)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))).))))).)).(((((((..........))))))).....))))))))).))).)).))).))).))))))).((.((.....(((((..((((..((((((((.((.((((......(((......))).))))..)).)))))))).))))..)))))...)).)).(((((((((....)))))))))))).)))))). |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................................((......(((((((((....))))))))).....................[[[[[[........((((((((((((.....((((((....))))))......)).........(((((..((((....)))))))))...........))))))))))....))]]]]]]((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))..........................((((....)))).................((((...(((((....))))).))))......................(((((..((((......(((((((((............................(((((.(((....))).)))))................(((.........aaaaaaaaa...aa....)))(((((((.........((((((((((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))....................................((((((((.....................))))))))...........((....)).................................................(((((.........)))))...)))))))))...))))).......((((((((.......))))))))......................)))))))AA...AAAAAAAAA...........................((((((.....(((....(((((((((((...((((........)))).)))....(((((((.........(((((...((((....))))...(((((....))))))))))............(((((...((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((((........((........................<<))....>>...)))))).......))))....)))))............)))))))......)))))))).....(((((((....((((..((................))....))))...))))))).....((((..(((((((........))))))).....))))...))).....(((((((..........)))))))...........)))))).......................................{{....{{.............))))))))).....)))).))))).........}}...}}.................(((((((((....)))))))))........... |
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((.(..((((((((...)).......................................((.((.((((((....))))))))..))...................((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))........((.((((.....)))...).))......((....)))))))))).))).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((....))))))))..(((....)))...................(((...(((((....))))).)))...((((((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((...(..(...)..)....)))))))))...))).))))...(((((((((.((....)))))...)))))).........)))........................((((.(.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...))).).)))).....((((((..(....((((.........)))))..))))))..((........((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....))))))...(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....))........((....)).....(((((((.((((..((((...(...)))))))))....(((((((......((.((((((.(((((....))))..)...((....))..)))))))).................(((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....(((....((((((.(((((.)).))).))))))...((.(((((....))))).)).....)))))))).......................))))))).......))))))).....(((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))...)))))))...........(((((((........)))))))....................(((((((..........)))))))............((((..((....))..))))....((((.(((..(((((.(((((((...((((((.((((..(((..))).))))))))))..))))).)))))))..))).))))...............(((((((((....)))))))))))))))))).. |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((.(..((((((((...))...............(((((.......))))).......((.(((((((((....))))))))).))..................(((((((..((...((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))....(..(((((..((((....))))))))).)...........))))))))..)).)))))))..((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...)))).((.((((((((....)))...))))).)).(((((.(((....)))))))).((((....)))).................((((...(((((....))))).))))..((((((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((...(.........)....)))))))))...))).))))...(((((((((.((....)))))...)))))).........))).........................(((.(.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((.(..((((((((((.(((........)))..)))))))))).....).....((....)).)))))))..)))).))))...))).).)))......((((((..(....((((.........)))))..))))))..((.......(((((((.((((((((.......))))))))....(....).....)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....)).............................(.....(((..(((...)))..))))....(((((((.......(..(((((..((((....)))).....(((....))).))))).)....(((((((.((((.((((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....(((((..((((((.((((...).))).))))))...((.(((((....))))).))))...))))))))))))).).)))))).........)))))))...................(((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))...))))))).....((((.((((((((........)))))))....)))))............((((((..........)))))).............((((..((....))..)))).....(((.(((..(((((.((((((.(..((((((.((((..(((..))).))))))))))..))))).)))))))..))).)))................(((((((((....)))))))))))))))))).. |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.((.(((..((.(((........))))).(((((.......)))))..........(((((((((....))))))))).(((((((.((((((......(((((((..((...(((((((((((......((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))...)))))))))))..)).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))...((.(((..((((((((.......((((....))))................(((((...(((((....))))).))))).((((((((((..(((....(((((....)))))....))).((((((......)))))).))).)))))))...(((((.(((....))).))))).........(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..)))))))))).......((((...(((..((..(((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..((((((.((....)).)))))).((((.......((((((((...(((........)))....))))))))...))))...(((..(((......)))..)))..))).)).)))...))))....(((.....)))..(((((.........))))).(((((((((((......((...((((((((((((.......)))))))).))))...)).........((((.....))))...(((........)))...(((............((((((.(((....)))(((..((((.(((......)))))))..)))......(((((((.((((((....)))))).....((((....))))(((.(((((................))))).)))..(((((....)))).)............(..(((......))).)..((((((....................))))))................(((((....))))).....)))))))..(((.....))).....))))))........)))................)))))))))))..((((..((...((.....))....))....))))......(((.....(((((..(((((((........))))))).....)))))...)))....(((((((..........))))))).....))))))))..))).)).))).))).)))))))(((.((.....(((((..((((..((((((((.((.((((......(((......))).))))..)).)))))))).))))..)))))...)).))).((((((((....)))))))).))).)))))). |
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((.((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.(.((.((((....)))).)))..)))((......(((..((..((((((((.((...(((((((.((((.(.(.((((((....)))))).)..).))))...............(((....)))............((...)).)))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((.........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))..))))))))......)...(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.((((((..((((((((((....((((..(...).))))...(....(((((((..(...((..(((((..((((....))))......((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....)))))))......))))..)))).).)).)..)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).))...((((((........))))))).(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))..)))..((.(((((((((....)))))))))((....)).)) |
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..((((((((.((((((.(((((((((.(..(((.(((....(..((.(.((.((((....)))).)))..)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...............(((....)))............((...)).)))))))..)))))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).((((((((....)))...)))))))).(((((.(((....)))))))).((((....)))))).))))))..).....(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((.....(((((....)))))....))))((((((((((...(.........)....))))))))))..(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))..........((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((.......((((.........))))...)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((..(...((..(((((..((((....))))......((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......)))))))))))).....((((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))...))).)))..((.(((((((((....)))))))))((....)).)) |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((.((((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.(.((.((((....)))).)))..)))((......(((..((...(((((((.((...(((((((.((((((.(.((((((....)))))).)..))))))...............(((....)))............((...)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((.........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......).(((((......((((...(((((((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))..))))))))......)...(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....))))))))))))))).(((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((((..((((..(...).)))).))(....(((((((..(...((..(((((..((((....))))......((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))(((.(((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).((((((((........))))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))..((.(((((((((....)))))))))((....)).)) |
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((((..(((.(((....(..((.(.((.((((....)))).)))..)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...............(((....)))............((...)).)))))))..)))))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).((((((((....))))...))))))).(((((.(((....)))))))).((((....)))))).))))))..))....(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...(.........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).........(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))..))))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((..(...((..(((((..((((....))))......((....))..))))).)))(((.((..(((((((((((((.(((((((((....)))((.(((......))))).))))))......(((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....)))))))))....)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))...))).)))..((.(((((((((....)))))))))((....)).)) |
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((.(((.(((..(((...(((((..(((((((((..(((((.(((((((((.(((....(((((((((....))))))))).(((((..(((.((((((...(((((((..((...((((((((((((.....((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))..))))))))))))..)).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))....(((((((((((..(((......((((....)))).((((((((.((.((((((((....((((....))))..))))).))).))((((.((((((((.((((((((((((....(((((.((((((......)).)))).)).)))......(((((.(((....))).)))))((((.(((.(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..))))))))))........(((.(((((((...(((((.(((((((((.....((((((.....))))))...))))))))).)).)))..((((((.((((((((((.((.((((..((((((((((..(((((....((.((((.(((((........))))).((....)).....)))).))...))))))))))).)))).....(((.....)))...............)))).)).))))).))))).....((...((((((..((((.......))))..)).))))...))..))))))...))))))).)))....))).))))......))))))))))...((((((.((((.((((.....(((..((((.(((......)))))))..))).....((((..((.((((((....)))))).))..((((....))))...(((((....)))))........)))).))))..)))).))))))(((((((((....)))...(((......)))...))))))....)).)))))))).....))))..............)))))))).......)))..((...((((.(((........))).)))).)).)))).)))))))))).))).))))))))..............))).)))))....)))).......(((((.........))))).)))))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))))))..)))))....))).....(((((((..((((((....)))...)))..))))))).((((((((.....(((((((((.((((..((((((((.((.((((......(((......))).))))..)).)))))))).))))...((....))....)))))).)))....)))))))).))).)))))). |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.((.(((.(((.(((........))))))(((((.<<<<<.)))))..>>>>>...(((((((((....))))))))).(((((((.((((((......(((((((..((.(.((((((((((((.....((((((....)))))).......(((....((((((((..((((....))))))))).))))))..)))))))))))).))).)))))))((((((.(((..((((((((.(....))))))))))))...))))))..(((((((.(......))))))))......(((.(((((((((.......((((....))))...(((((((......(((((...(((((....))))).)))))(((((((((((..(((....(((((....)))))....))).((((((......)))))).))).))))))).).(((((.(((....))).))))).........(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..)))))))))).......(((....((((.((..((((.(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..((((((..........)))))).((((.......((((((((...(((........)))....))))))))...))))..........................)))).))))))....)))....(((.....)))..(((((.........))))).............(((.......((((((((((((.......)))))))).))))......))).....((((.....))))...(((((aaaa))))).........(((....((([[[[[.(((....)))(((..((((.(((......)))))))..)))......[[[[[...((((((....)))))).....((((....))))(((.(((((.......{{{......))))).)))...[[[[.)))]]]].............(((.(((......))))))(((((((....................))))))).....}}}.......(((((....))))).......]]]]]..(((.....))).....]]]]].....)))............AAAA......(((((((....((((((((.(((((...)))))..)).)).))))...)))))))....(((((..(((((((.((...))))))))).....))))).))))).)).(((((((..........))))))).....))))))))).)))....))).))).)))))))(((......(.(((((.(((((..((((((((....((((......(((......))).)))).....)))))))).))))).)))))).....)))(((((((((....)))))))))))).)))))). |
RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((.....(((((....))))).....)).((......(((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).................(((....)))....................)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(........)))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((..................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((......(((((......((((...(((((((((((.(((((.(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((.......((((.........))))...))))))).....((((.(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....))))))).((((((((((((.((((....)))).....((...........(((....))).((.(((((((.((((((((((......((........))..........(((((((......((..(((((..((((....))))......((....))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........))))))))).))).))))))))).))))......)))))(((.((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((...........))).)))).)...))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))))))....))) |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((.......((((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((..............(((((....))))).....(((((...(((.((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((((.....(((....)))...)))))............)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).))))).)))((((....)))).....))))).(((((.(((....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).(((.(((((..................))))).)))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..(....((((.........)))))..)))))))..........(((((((.(((((((((.....)))))))))...((....))....)))))))))))..).))))..((((....)))).))))))...(((..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((.........((((((..((((....))))......((....))..))))))...(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((....))...)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..((....)).))).)))).)...))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))).......))) |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((..((((((((.(((.(....).))))).(((((.......)))))..((...((.(((((((((....))))))))).)).))...(((((.(((...(((((((..((...((((((((((((.....((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))..))))))))))))..)).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).))))).))))))..((((((((((((((((....((((.(((...((((....))))(((((((((....((((((.((...((((....))))........((((((((((..(((....(((((....)))))....))).((((((......)))))).))).)))))))...(((((.(((....))).)))))..((((...(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..))))))))))....((.(((..((((((((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..((((((.((....)).))))))......((((..((((((((((..(((((....((.((((.(((((........))))).((....)).....)))).))...))))))))))).)))).....(((.....)))...............)))).....)))))))))...)))..))).))...)))))).)))))).))))))))).)))....))))....)))))..(..(.((((.(((((....)))))..))))...((...(((((((((((((....((((((..((((((((((((..((((........)))))))))...(((((((.(((..((.(((((...((((....))))...(((((....)))))))))).....(((((((.((((.((((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))....(((((((((((((...((....))...))))))).....(((((....)))))..))))).)..)))))))))).).)))))).))..))).))))))).......))))))).....(((((((....((((..((.((((.....))))..))....))))...)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).(((.((((((.((........)))))))).))).....)))))).((....))...))))))).(((.((.....(((((.(((((..((((((((.((.((((......(((......))).))))..)).)))))))).))))).)))))...)).)))..))...)..)..)))))))))))...))))). |
RSpredict(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................................................................................................(.(.....(.(..((....((.((.......(...((...............))....(.....((........(..((....((....((..))................)).....))..).....((.(((.(((...(((((.(.......).))))).)))...))).))(.((((((((....))))...))))...)(((...(((....)))..)))).)......)....)........))....((((((....(((....))).).)))))...........((.(...((...((...)).)).....).)).(((..((((...(.(....).....).)))).).))...(((((......((((((.((.((....))))....)))))))))))..)..)..))..............((.....(((....(((((((.(((.....(.(((((.....((((((.....))))))...)))))...)....))).)))...(((.((((...((.((((((..((((((((.(.(((......)))....).)))))))).....))....((....)).)))).))..))))..)))..))))...).))....))((((.(......((((.........)))))...))))(((....((.(((((((((.((((((((.......))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((.......(...........................................)..(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).)))))))))(...((.(..(((((((...((....))...))))))).(((.(..(.......).).....)))).)).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(....).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((...(((.(....(((...((..(.......)..))..))).)...)))...))))))..)...))))..)).)).....)))(((((((((....)))))))))).)......)) |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................(((((...((...(..(.(((.......(.(((....)))..).....(.(..((.....(.((........((....(...(................)..................)....))........)).).((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((((((....)))...)))))...)(((...(((....)))..)))..)).)...)...)))...)..)......((((((....(((....))).).)))))..)).......((.(...((...((...)).)).....).)).(((((((((......(.........).)))))))))...(((((......((((((.((.((....))))....)))))))))))........)))...........))((.....((((...(((((((.(((..(.((.(((((.....((((((.....))))))...)))))..))...)))).)))...(((.((((...((.((((((..((((((((.(.(((......)))....).)))))))).....))....((....)).)))).))..))))..)))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))))...))))(((....((.(((((((((.((((((((.......))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((.......(.(((........(........)..........)).......).)..(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).))))))))).....((((.(((((((...((....))...))))))).(((.(..(.......).).....)))))))..))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(....).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((...(((.(....(((..(((...((....)).)))..))).)...)))...))))))..)...))))..)).)).....)))(((((((((....)))))))))........... |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((.............((.(....).))...............................(((((((((....))))))))).....................(((((((..((...(((((((((((......((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))...)))))))))))..)).))))))).............(((((((.......)))))))................................................................((((....)))).........................((((....))))..................................................................................(((((.(((....))).))))).........(((.(((((((.(((..((((....))))..)))..))))))))))............................(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))........................................(((((...((((.....((.((((...(((........)))...((....)).....)))).))....)))).))))).....................................................................((..((((.......))))..)).........................(....((((.(((((....)))))..))))...).............................((((((((((((..((((........)))))))))...(((((((.(((.....(((((...((((....))))...(((((....)))))))))).....(((((((.((((.((((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((..((((((...((....))...))))))......(((((....)))))...))))....)))))))))).).)))))).....))).))))))).......)))))))................................................................(((((..(((((((........))))))).....))))).........................................................................................((((..((((((((....(((.......(((......)))..))).....)))))))).))))............................................)))). |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((....(((((.((((((((.(((..((((((.((.........((((((..((((((((((((((....)))))))))..((((((..((.(((((...(((((((..((...(((((((((((......((((((....)))))).......(((.......(((((..((((....)))))))))....)))...)))))))))))..)).)))))))..((((((((..((((((((.......))))))...(((((.....((.(((((((.........))))))).))...(((((....((((.......((((....))))(((((((((........((((....((((....))))..))))..((((((((((..(((....(..((....))..)....))).((((((......)))))).))).)))))))...(((((.(((....))).)))))....((((((((.(..((((.(((..((((....))))..)))..))))..)))).......(((..((((((((((((....((((((((......((((((.....))))))....))))))))..((((((.((....)).))))))......((((..((((((((((..(((((....((.((((((((((........))))..((....))...)))))).))...))))))))))).)))).....(((.....)))...............)))).....)))))))))...)))..))).........)))))......)))))))))........))))....))))).(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..(((((......((((....))))((.((((((((((((..((((........)))))))))...(((((((.(((..((.(((((...((((....))))...(((((....)))))))))).....(((((((.((((.((((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((((((((((...((....))...))))))).....(((((....)))))..)))))....)))))))))).).)))))).))..))).))))))).......))))))).))...)))))........)))))...........))..)))))))).....))))).))....(((((..(((((((........))))))).....))))).))))))...(((((((..........))))))).....)))))......)))))))).)))))))))))).)).)))....(((((..((((..(((((..(.((.((((......(((......))).))))..)).)..))))).))))..)))))...)))))(((((..(((....)))..)))))....))))). |