|
|
|
UGUGAAAACGAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUAAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUUGUACGAAGGUAUUUAUCUUUCGAGCUAAAUAUACUGAGUAGCGGACGGGUGAGUAACACGUAAGAAUCUACCUUUUGGAGAGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCUUAUAUUGCUGAGAAGUGAAAAAUGUAAAUUGCCAGAAGAUGAGCUUGCGCCUGAUUAGCUAGUUGGUGUGGUAACUGCAUACCAAGGCAAUGAUCAGUAGCUGUUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGAAGGAUGACGGCCUAUGGGUUGUAAACUUCUUUUCUCAGAAAAGAUUAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUUGUUUAAAAAGUAUUCUGUCAAAAAUUAGGGCUUAACCCUAUACAGGCAGAAUAAACUUUUAAGCUAGAGUUUGGUAGAGGCAGAGGGAAUUCCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUCGGGAGGAACACCAAAGGCGAAGGCACUCUGCUGGGCCAAUACUGACACUGAGAGACGAAAGCGAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUCGCUGUAAACGAUGGAUACUAGGUGUUGGGUGUAUCAAAAACAUUCAGUAUCGUAGCUAACGCAUUAAGUUUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGAACCCGCACAAUUGGUGGGGUACGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGAUUUGACAUGUCAUUUGUUUCUUCAACUUAAUACUUUAAUUUGUUUUAAGUAGAAACAUAAAAAAAUGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUUUUUUGAAUUGCUUGGGGCAUUAUAUGCCUUUUUACAGAGGAAAUUCAAAAGACUGCCGGUGAUAAGCCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUAUAUCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGACGUAACAAAGAGAAGCUACUUCGCGAGAACAAGCUAAUCUCAAAAAUACGUUCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGUUGGAAUCAAUAGUAAUCGCAGGUCAGCCACACUGCGGUGAAUACGUUUCCGGGUUUUGCACACACCGCCCGUCACACCACGGAAAUUGGCUACGCCCUAAAUCAUUACCCUAACCAUUCUGUGGAGGGGGAUGCCUAAGGCGGGGCUGGUAACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
............(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((((((....)))))))))).)))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((.......))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((......(((((((....)))))))....((((((((....)))))))).))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((......(((((((...)))))))(((((...))))))))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((.....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..........(((..((((((..((((((((((......((.(((((((........(((..((((((((((..(((((((((.((..((((...........)))).)).))))))))).((((((.........(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(..((....))..).............)))))))....(((((((((..(((((((..((((((((.......))))))))...........((.((((.(((....)))....)))).)).(((((.(((.....)))))))).((((....))))..)))..((.(((....))).))..((((....))))..((((..(((((.((..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...))....((...(((((((((.((....)))))...))))))...))..))))).))))...))))..))))).))))((((.(.(((.((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))...))).).))))...((((((((..((...((((.........))))))..))))))))..((((....((((((..(((((.((....))...)))))..))))))...((....)).....))))((((((....((((..((((....))))...)))).....(((((.(((....)))..))))))))))).))))))......)))).))))))))).....(((((((.(((((((((....(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))..............((((....(((((((((....)))).))))))))).))))....)))))))))...............((.(((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))...(((((.....))))).))..))))))).((((.....)))))))))))))...))))))))))..(((...(((((....(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))...((((.((((((((((........)))))))....))).))))...)))))..(((((((.....)).))))))))..((((....(((((..((....))..)))))...((((.(((..((..((..((((.((...(((..((((..((((...))))))))..)))..)).))))..))..))..))).))))....)))).......(((((((((....))))))))))))))).)))..)) |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................................(((((((.....................((((((.......))))))....................................((((((.......(((((((..........((((((....))))))........(((((((..............)))))))....))))))).....)))))).............((((((((.......))))))))..............((((...............))))....(((((............))))).............................(((((...(((((....))))).)))))..)))))))........................................................................(((((....................................)))))..........................................((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))......(((((...(((((((....(((((((((...................)))))))))....................)))))))..)))))....................((((((((.......((((.........))))....)))))))).................((((((((((((.......))))))))))))...................................(((((....)))))...................((((((((............((((((((..............................(((((((.............(((((((...((((((..............)))))))))))))....................................................................................................(((((((...)))))))...............................................................................)))))))......)))))))).....(((((((..........................................)))))))...........(((((((........))))))).......................................................))))))))...........................((((((((((((......(((((((((..((((...))))))))))))).....))))))))))))........................((((((((((....))))))))))............. |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((.........)))).((((..(((((.(((((((((....(((......(((..((........((((((....)))))).........)))))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))...............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((.................))))).......(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).))))).)))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((........)))....))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........)))))...)))))))..........(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........(((((.((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((.......((((((.........(((((((....)))))))...((.............))..))))).)...((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((..(((.........)))........))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((..........)))))))...........)))))).............))))).((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..((.......)).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).............. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................((((........((((..(((((.((((((.......(((............(.......(((((((....)))))))........)...................((((((((.((...((((((((((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))..............))))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))......)))........((((...(((((....))))).))))....))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((.................)))))))))...(((((......(((((((((.(......))))...))))))))))).))))).)))).......(((((((......((((...(((((((((((..((((((((((...((((((((.....)))))))).)))))))))..).)))))))....(((((((...(((((((....((((((((((..((........))...))))))))))...........((....)).)))))))..))))).))...))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))...............((((((....((((((..((((((((......((((........))))........(((((((.......((((((.........(((((((....)))))))...((.............))..))))).)...((.(((...((((.(.((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))..........(((((((...((..(((.........)))........))....)))))))..((.(((((.....))))).))...........)))).)..))))....)))))....)))))))......)))))))).....(((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))....)))))))...........(((((((........)))))))..........))))))....(((((((..........)))))))...........))))))...................((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..(((.....))).))).)))).)...))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))).))))......... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................(((((.....)))))...........(((((.......)))))........((((((.......)))))).....................(((((((..............................(((.....((((((....))))))......)))......(((....)))..............(((...((((..((((((((((((((.(((..((((((((.......)))))))))))..((((((..................))))))......(((((.((.......))))))).((((....))))................(((((...(((((....))))).)))))...........((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...)))))))))))................)))))))))).))))))))...))).(((((.(((((((((((((......(((((.....)))))....)))))))))..)))))))))....(((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))....................)))))))..))))).)).................((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).............((..((((((((((((.......)))))))))))))).................(((((......((((.(((((....)))))..))))...........))))).(((((.......))))).(((((.(((...((((........)))).)))....(((((((...(....)(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))......))))......((..((((.((((((.(((((((((((.((....))(((.(((......)))))))))))).....((((((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))((.(((((.....))))).)).)))......))))).).)))))))))...))....))))))).......))))).......(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))...........(((((((........))))))).......((((.........(((((((..........)))))))........))))................))))))).((((.(((..(((((((.((((.((...((((.((((..(((.....))))))).))))..)).)))).)))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....(...((((....(((.......((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((...(((((..................)))))..)))))......(((.......((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))......((....))................)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((.(((....)))....))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(........)....))))))..)...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).)))))))))))))....((((((.....(.((((.(.(((.((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(((.((..((((((((((((.......))))))))))))...((....)).....)).)))))))))).......((((....))))...))))...).......((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((.............(((((((....(((((.((........)).))))).)))))))................((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((((.((.(((((((...)))))))........)).)))))))))..((.(((((.....))))).)))))).........)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))))))....(..((...((((.(((..(((((((.((((......((((.((((..((((...)))).)))))))).....)))).)))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(.((((.((((((...)))))))))).)..((.(((((.......)))))..)).((.((((((.......)))))).))...............(((((((((((............................((((.(((.((((((....)))))).)).).))))....((((....)))).............(((.(.((((..((((((((((((((((((..((((((((.......)))))))))))..((((((........(((....)))))))))......(((((.(((.....)))))))).((((....))))..........((.((((((((...(((((....))))).))))).))).))....((((....(((((((())))))))...)))).(((((((((...(........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...)))))))))))...............))))))))))).)))))))).).))).(((((.(((((((((((((......(((((.....)))))....)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))....((..........((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).....((..((.(((..((((((((((((.......))))))))))))))).))..))........(((((((((...((((.(((((....)))))..))))..)))......))))))(((((.(....))))))(((((((((((..((((........)))))))))...(((((((.((((()))(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))......)))).....(((.(((((.((((((.(((((((((((.((....))(((.(((......)))))))))))).....((((((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))((.(((((.....))))).)).)))......))))).).)))))))))..)))))).))))))).......))))))......(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))..)).......(((((((........))))))).....((((((.(.......((((((((.......).)))))))......).)))))).............)))))))).((((.(((..(((((((.((((.((...((((.((((..((((...)))))))).))))..)).)))).)))))))..))).))))....))).....((((((((((((....))))))))))........))... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.............(((((..............)))))..........................((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).)...(((((....))))....).........)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(........)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))...)))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).........((((((((((((....((((((..((((((((((......((........))..........(((((((......((.(((((...........(((....))...........).........)........)))))).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((....(..((...........))........).....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))).((((.(((..((((((.(((((....(.((((..(((..((.......)))))..)))).)...))))).))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((.......))))).((((.((((((.(((((((......(((.(((..(((..((..(..((((((((....))..))))))...)..)))))................(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....))))).............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))....(((((.((.......))))))).((((....))))...)))))).......(((((...(((((....))))).)))))..)))))))..((((....(.((((....)))).)...)))).....(((((...(........)....))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((........)))..))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((....((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((......((((((.((...((...((((...)).))))...((......).)...)).......)))).)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((.....(((......)).)........))...)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).)).)))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....))))))).....((((..(((((((........))))))).....)))).))))))....(((((((..........)))))))...........))))))............)))))))((((.(((..(((((((.((((....(.((((..(((..(((.....))))))..)))).)...)))).)))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....))).............((((((((((((((.(((.(((((.(((.........))).))))).....))).))))))))..))))))................((((((((..............((((..[[[[[[[....))))..((((((....))))))........((((((((((....)))....)))))))....]]]]]]]......((((((((((((((((..((((((((.......)))))))))))..((((((...[[[[[(((....)))))))))......(((((.(((.....)))))))).((((....))))]]]]].....(((....)))(((.(((((....)))))[[[......)))..]]]((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...[[[...........))))))))).....]]]((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]]((((....))))........)))))))))))))..(((((.((((((((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))....................)))))))..))))).)))))).)))..)))))..((((((((.......((((.........))))....))))))))..........((((((..(((((............)))))..))))))(((((....(((((....(((((((((...((((..((((....))))...))))..)))......))))))(((((.......)))))...[[[[.........)))))..]]]]..........(((((((........((((((((((((...((((((..............)))))))))))))......)))))....(((..((((.(((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))...(((..(((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))...(((((.....))))).....))).....)))))...)))))))))...)))...)))))))(((.....))))))))...(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))...........(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].........((((((((((...[[[[...)))))))...))).......]]]]..........))))))))..............((((..(((((....(((..((((..((((...))))))))..)))........)))))........[[[[[[[))))..........(((((((((....)))))))))...]]]]]]].... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....)).(((((..((((((.......((((((.((((.(((((((((((......((((((((.((((....(((((((((.((..((((...........)))).)).)))))))))...)))).........(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(((((....))))).............)))))))...)))))))).((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))..(((((.((((........)))).....(((((.(((.....)))))))).((((....))))))))).((.(((..(((.((......)).)))..))).)).)))).)))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((((((..((((((....(((((...(((.((((((((.((((((((((......(((((.....)))))....))))))))..))))))))))...((((((((...(((((((((..(((((((((..(((........)))...))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))...)))...)))))..((((((((..((...((((.........))))))..)))))))).(((((.(((((((((.((((((.((....))...)))))).))))))...((....)).........(((((((...((((.(((((....)))))..))))..)))......)))).((((.(((.....))))))).))).))))).((((........))))...(((((((.(((((((((....(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))..............((((....(((((((((....)))).))))))))).))))....)))))))))(((.....)))........((((((((((.((((((((((...)))))))......))).).))))))))).((.(((((.....))))).))..))))))).((((.....))))..)))))).)))).))).(((((......((((.((...(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))...))......(((((((........))))))).(((.((((((.........(((((((((.....)).)))))))........)))))).))).))))....))))).((((.((.(((..(((((((.((((.(....(((..((((..((((...))))))))..)))....))))).)))))))..)))))))))..((.......)).(((((((((....))))))))))))))).)).))). |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....))....((..((((((..((((.((((((......<<<<<<.<<....................<<<.....))))))>>>))))..................(((((((...............................((.....((((((....))))))......)).......(((....)))...................................((((..(((..((((((((.......)))))))))))....))))...((((.(((....)))....))))....(((((.((.......))))))).((((....)))).................((((...(((((....))))).))))>>..>>>>>>..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))..............(((((((((.((....)))))...))))))...............................................(((((((.(((((((((((......(((((.....)))))....)))))))))..)))))))))....(((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))...........((....)).)))))))..))))).)).....((((........((((((((.......((((.........))))....))))))))..............((.[[[[(({{{{{.......))}}}}}))]]]]...((....)).......(((((((((...((((.(((((....)))))..))))..)))......))))))(((((.......)))))..((((((((...((((........)))).))))...(((((((.........(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))......))))......((.(((((.((((((.(((((((((((.............(((......)))...)))))).........((((((((((.((.(((((((...)))))))........)).))))))))))....(((((.....))))).............))))).)).)))))))..))))....))))))).......))))........(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....))))))))))).......(((((((........))))))).......((((.........(((((((..........)))))))........))))................))))))).((((.(((..(((((((.((((......((((.((((..(((.....))))))).)))).....)))).)))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))).))..... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((.(..((((((((...)).......................................((.(((.((((...((....)))).)....)))).))...................((((((..((.(.((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))......((....)).......((....)))))))))).))).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....))))))))..(((....)))..................((((...(((((....))))).))))...(((((((((.(((....((((((....))))))...))).((((((((((...(........)....))))))))))..))).))))...(((((((((.((....)))))...)))))).........)).........................((((.(.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...))).).)))).....((((((..((...((((.........))))))..))))))..((........((((((.((((((((((((.......))))))))))))....(....).....))))))...(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....)).......(((....)))............((((..((((...(...)))))))))....(((((((.......((((((.....((((...((....)))))).((..(........).........)))))))).................((((((..(((((.((....))...((((......))))..))))).....(((....((((((.(((((...((.......))........)).)))..))))))...((.(((((.....))))).)).....)))))))))......................)))))))....................((((((....((((((((..((((....))))..)))..)))))....)))))).............((((((........)))))).....................(((((((..........))))))).............(((..((....))..)))......(((.(((..(((((((((((((...((((((.((((..(((.....))).))))))))))..)))))))))))))..))).)))................(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((.(..((((((((...))...((..((((.(((((((((..................((.(((((((((((....)....))))).))))).))...................((((((..((..(((((((((((((..((.((((((....)))))).))...))))....((((....)))).............))))))))).)).)))))).((((((.(((..((((((((.(...).)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))..................(((...(((((....))))).)))..(((((((((((.(((....((((((....))))))...)))..(((((((((.................)))))))))...))).))))....((((((((.((....)))))...)))))..........))))...........((((((((.(((((((((.((((((((((((.((((((((((...((((((((.....)))))))).))))))))))..)))))))))..((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)).....(....)..)))))))..))))).)))...((((.....(....)..((((..((...((((.........))))))..))))...(((.......((((((((((((((((((((.......))))))))))))...((....))...))))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....)))........(....)))))..(((((.(.((((..((((...(...))))))))).................(((((.((....(((...(((....))))))...(((.......)).......)..))))).)).).)))))...((((.((((((.((((((.((....))...((((......))))..))))))....(((.(..((((((((.(((...(((.....)))........))).))..))))))...((.(((((.....))))).)))....))))))))))))).))).)))).)))))))))))))....((((..............((((((....((((((((..((((....))))..)))..)))))....)))))).............((((((........)))))).............(((........))))))).)).)))))))))))....)).....((((..((....))..))))....((((.(((..((((((((((((((..(.((((..(((..(((.....))).))).)))).).))))))))))))))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))))))))... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....)).(((((..((((((.(((((.(((((((.(((..((((((((.........)))...))).))..))).)))))))...)))))......(((..((.(((((((((((.((......(.....((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....))))...(((((....))))).............)))))))....((.(((((((((((......((((((((.......))))))))(((..((((((....((......))....)))))))))...(((((.(((.....)))))))).((((....)))).......((.(((....))).))..((((....))))..((((..(((((.(((.((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...((....))...(((((((((.((....)))))...))))))..)))..))))).))))....)))))))))))..)).......))..(((((((.(((((((((((......(((((.....)))))....)))))))))..)))))))))......(((((...(((((((.....((((((((..(((........)))...))))))))(......)....((....)).)))))))..)))))..((((.(((((((......((((((((..((...((((.........))))))..))))))))..........((((((.((((((.((....))...)))))).))))))...((....))........((((((((...((((..((((....))))...))))..)))......))))).(((((.......)))))(((((((((....((((........))))...(((((((.(((((((((....(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))......))......((((....(((((((((....)))).)))))))))...))....)))))))))(((.....)))........((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))).((.(((((.....))))).))..))))))).((((.....))))....((((..........)))).)).)))))))........(((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....))))))))))))))))..(((((((........)))))))...(.((((((.........(((((((((.....)).)))))))........)))))).)...).....)))))))))).((((.(((..(((((((.((((......(((..((((..((((...))))))))..))).....)))).)))))))..))).))))....))).))..))).((((((((....)))))))).)))))).))).)). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............(((.((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((....((.((((....)))).))....))..)))((......(((..((...(((((((.((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....)))).....(((....)))....((......)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..(((((.....((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((....(...)))))...)))))))).....)....(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.((((((..((((((((((....((((..(...).))))...(....(((((((..(...(((((((.........(((((((....)))))))...((.............))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..((...(....)..))........))....)))))))..((.(((((.....)))))))......))))..)))).).)).)..)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).))...((((((........))))))).(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((.......)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))..)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((....(((((((....)))))))....))..)))((......(((......((((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))....((......)).)))))))..))))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...(........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).........(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.((((((..((((((((((....((((..(...).))))........(((((((..(...(((((((.........(((((((....)))))))...((.............))..))))).)))(((.((((.(((((((.((((.((((((.((....))((.((((......)))))))))))).....((((.(((((((...((..(((.........)))........))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))))))..))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((....((((..((..((((....))))..))....))))....)))))))....((((...(((((((........)))))))......)))))))))).)).(((((((..........))))))))..........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((.......)).))))))))))...))))))))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((....((.((((....)))).))....))..)))((......(((..((...(((((((.((...(((((((.((((.(.(.((((((....)))))).)..).)))).....(((....)))....((......)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..((((((((.(((........).)).))))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......).(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))......)...(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((((..((((..(...).)))).))(....(((((((..(...(((((((.........(((((((....)))))))...((.............))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))(((.(((......))))))))))))(...)((((.(((((((.(.((..((...........))........)).)..)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).((((((((........))))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((((..((.......)).))))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((....(((((((....)))))))....))..)))((......(((......((((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))....((......)).)))))))..))))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...(........)....)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).........(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..((((((((((....((((..(...).))))........(((((((..(...(((((((.........(((((((....)))))))...((.............))..))))).)))(((.((((.(((((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((..(((.........)))........))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).)).))))))..))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((....((((.(((..((((....))))..)))...))))....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((.......)).))))))))))...))))))))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).)))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....))...(((..((((((..((((((((((......((.(((((((........(((..((((((((((..(((((((((.((..((((...........)))).)).))))))))).((((((....((((((..(((....(((....((((((....))))))......((((((..(((((....(((......((((...((((.....)).))))))..((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))..((((.(((....)))....))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))).)))))))))))...((((((((((((((....))))..((((..(((((.((..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...))....((...(((((((((.((....)))))...))))))...))..))))).))))......(((((((.....(((((.(((...((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....(((((((((..(((......))).....)))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))....)))..)))))..((((((((..((...((((.........))))))..))))))))..((((....((((((..(((((.((....))...)))))..))))))...((....)).....))))..))))))).((((..((((....))))...))))......)))).)))))))))...)))..)))))).))))))......)))).))))))))).....(((((((.(((((((((....(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))..............((((....(((((((((....)))).))))))))).))))....)))))))))(((.....)))...((..(((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))...(((((.....))))).))..)))))))..(((.....))).)))))))))...))))))))))(((....((((......(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))..((..((((.(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].........((((((((((((.....)).)))))))...)))...))))..))..))))..........((((.((.(((..((..((..((((.((...(((..((((..((((...))))))))..)))..)).))))..))..))..))))))))).)))..........(((((((((....))))))))))))))).))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....)))(((((..((((((((((((((((((((.(((..((((((((.........)))...))).))..))).))))))))..)))))).....(((.....(((((((((((.((.....(((..((((((((((((((.((((.(((.((((((....)))))).)).).))))...(((((....)))))..(((....))).)))))))..((((((((((((((((......((((((((.(....)))))))))(((..((((((..................)))))))))...(((((.(((.....)))))))).((((....))))..........(((....)))....(((((....))))).((((..(((((.....((((..(.((((((....)))))))..)))).(((((((((....(((......))).)))))))))(.((([[[.)))).(((((((((.((....)))))...))))))]]]....))))).))))....))))))))))).))).)).)))))))(((((((.(((((((((((....(.(((((.....))))))...)))))))))..))))))))).....((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))....................)))))))..))))).)((((.(((((((......((((((((.......((((.........))))....)))))))).(((......((((((.((((((............)))))).))))))..................(((((((((...((((.(((((....)))))..))))..)))......))))))(((((.......))))){{{{{{{{{))).((((.((...))))))...(((((((.(((((((((.((((((((((((((...((((((..............)))))))))))))......))))).))((((....(((((((((....)))).))))))))).........)))))))))(((.....))).......(((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))...(((((.....))))).....))))))).((((.....))))...(((((..........)))))}}.}}}}}}}........(((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....))))))))))))))))..(((((((.(.....)))))))).(((.((((((.........(((((((((.....)).)))))))........)))))).))))))....)))))))))).((((.(((..(((((((.((((.((...((((.((((..((((...)))))))).))))..).))))).)))))))..))).))))....))).....)))(((((((((....))))))))))))))).))).)). |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((.........(((((....)))))..........)).((......(((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....)))...............)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(.........)))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((.................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((......(((((......((((...(((.(((((((.(((((.(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))...)))...))))....(((((((.......((((.........))))....))))))).....((((.(((((((.((((((((((((.......))))))))))))...((....))....))))))).((((((((((((.((((....)))).....((...........(((....))).((.(((((((.((((((((((......((........))..........(((((((......(((((((..........((((((....))))))....((.............))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((.........................))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........))))))))).))).))))))))).))))......)))))(((.((((.(((..((((((..((((......((((..(((..............))).)))).....))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))))))....)))... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................((((((.((((..((((.((((((.(((((((......(((.(((..................(((((....))))).............((......(((.......(((((((.((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....)))...............)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(.........)))))).((((....)))))).)))))).......(((((...(((((....))))).)))))..)))))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((.................))))).......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(..((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...))))))))..))))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((.(.(((......)))....).)))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((..((((((((.......))))))))..))...((....))....)))))))))))..).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..........((((((....))))))....((.............))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((.........................))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((..........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..(((.....))).))).)))).)...))))..))))))..))).)))).))))..........(((((((((....)))))))))))))))........ |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....))...(((..((((((.(((((((((((((..((.(((((.(((.........))).))))).....))..))))))))..))))).....((((..((.(((((((((((.((.................(((((((.((((..((.((((((....)))))).))...))))...(..((....))..).............)))))))..(((.(((((((((....(((..((((((((.......)))))))))))...((((.((.((((.(((....)))....)))).))....(((((((((.(((((((((.......((((((((.((((((((((...((((.....((((....))))...(((..(((((.((..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...))....((...(((((((((.((....)))))...))))))...))..))))).)))))))..((((((.(((...(((((.(.(((.((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))...........((....)).)))))))..))))).)))...))).).)))))...((.......)).............)))))))))..))))))))))........((((((..(((((..(.....)...)))))..))))))...((....)).....))))))))...((((.((((((((((..(((.....)))....(((((((((.(.((((.(((.....))))))).).))..)))))))........))))....(((((((.(((((((((....(((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))..............((((....(((((((((....)))).))))))))).))))....)))))))))(((.....)))....((.(((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))...(((((.....))))).))..)))))))..(((.....))).))))))))))......)))))).....((((.(......).))))......((((((((..(((....)))..))))..)))).......)))))))))))).)))).))))).)))))))...((((.(((.((((((.........(((((((((.....)).)))))))........)))))).)))))))...)))))))))).((((.(((..((..((..((((.((...(((..((((..((((...))))))))..)))..)).))))..))..))..))).))))....))).))..))))((((((((....)))))))).)))))).))).... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................(.(((.((...((......(((.(.....(...(.(....).).......)..........(((..(.(....(.(.....(.(........).(.....)................)....).).((((((.(((...(((((.(.......).))))).)))...))))))(.((((.(((....)))....))))...)(((((.(((.....))))))))).).))...).....)...))).......((((((....(((....))).).)))))..)).......((((.((((...((...)).))))...)))).(((..((((...(...........).))))..)))...(((((......((((((.((.((....))))....)))))))))))........).)...........))((.....((.....(((.(((((((.(.(..((((((......(((((.....)))))....))))).).)...))))))))...((((((((...((..(.(((..(((((((((..(((......))).....))))))))).....))....((....)).)..).))..))))).)))...)))....).)....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((.(((.(((((((((.............)))))))))...............))).)))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......(((...........(..............(..)..............)........).....)).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).)))))))))(...((.(..(((((((...((....(.................)..))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))).)).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((..........)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((......((((...((...(........)...)))))).....))))..))))))..)...))))..))))).....)))(((((((((....)))))))))...).....).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((.(..((((((..((((.(((((.(((((.(((((((.((...(((.(((..((((......(.(...(.(.....).)...).....)....))))...(.((.((((....((((((..((...(((((((..(((.(...((((((....)))))).)....)).).(...(((....))))...((......)).)))))))..)).)))))).((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((.(((....)))....))))...)(((((.(((.....))))))))))))))...)...)))...))).))....((((((....(((....))).).)))))..)))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...(...........).)))))))))...(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).)))))))))).........))))((.....((.....(((.(((((((.(((.(((((((......(((((.....)))))....)))))))...))))))))))...((((((((...(((((((((..(((((((((..(((......))).....))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))...)))....).)....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((.(((.((((((((((((.......))))))))))))...............))).)))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((.((...(((.((..(....(..(.........)..)..................))).).........)).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).))))))))).....((((.(((((((...((....(.................)..))....))))))).(((.(((((.....))))).....)))))))..))))...)))))...))))))))).)))))))...)...)))))))((...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((..........)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((......(((...(((...(........).)))..))).....))))..))))))..)...))))..))))).....)))(((((((((....)))))))))))))))...)))). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....))...(((..((((((.......(((((.(((((.((((((.(((...(((................................((...............)).............................(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....))))...(..((....))..).............)))))))............((((((.((...((((((((.......)))))))).))...)))))).............................(((((.(((.....)))))))).((((....))))......)))................((((....)))).....)))..))))))..((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.................)))))))))...(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).........(((((....(((((((((....((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))......(((((...(((((((....(((((((((...................)))))))))...........((....)).)))))))..)))))..((((.(((((((......((((((((..((...((((.........))))))..))))))))..........((((((..(((((............)))))..))))))....................(((((((...((((..((((....))))...))))..)))......))))........................................................(((((((.((....(((((((((((((...((((((.((........)).)))))))))))))......))))).)........(((.((((((.(((((((((((.((....)).((.(((......))))).)))))).........((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..))))))))))....(((((.....))))).............))))).).)))))))).......)).)))))))...............................((((((((...((....))...))))..))))..........)))))))))))..))))))).)).........(((.(((.((((((.........((((((((.......).)))))))........)))))).))))))......)))))....((((.(((..((..((..((((.((...(((..((((..((((...))))))))..)))..)).))))..))..))..))).))))...............(((((((((....))))))))))))))).))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....))...(((..((((((..((((((((((......((.(((((((.........((..((((((((((..((((((((..((..((((...........)))).))..)))))))).((((((....((((((..(((....(((....((((((....))))))......((((((..(((((....(((......((((...((((.....)).))))))..((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))..((((.(((....)))....))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))).)))))))))))...((((((((((((((....))))..((((..(((((.((..((((....((..((....))..))...)))).(((((((((.................)))))))))...))....((...(((((((((.((....)))))...))))))...))..))))).))))......(..((((.....(((((.(((((.((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((((..(((((((((..(((........)))...))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).))).)).)))..)))))..((((((((..((...((((.........))))))..))))))))..((((....((((((..(((((.((....))...)))))..))))))...((....)).....))))..))))..).((((..((((....))))...))))......)))).)))))))))...)))..)))))).))))))......)))).))))))))......(((((((.(((((((((....(((.(((((((...((((((.((........)).)))))))))))))..............((((....(((((((((....)))).)))))))))..)))....)))))))))(((.....)))....((.(((((((((((.((((((((((...)))))).....)).))..)))))))))))...(((((.....))))).))..)))))))..(((.....))).)))))))))...))))))))))(((....((((......(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))..((..((((.(((((((........)))))))....((((....)))).((((((((((((.....)).)))))))...)))...))))..))..))))..........((((.((.(((..((..((..((((.((...(((..((((..((((...))))))))..)))..)).))))..))..))..))))))))).)))..........(((((((((....))))))))))))))).))).... |
