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AUUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUUAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACACACGAAUUAAAAGUGAAACCGCAAAAGGCUCAUUAUAUCAGUUAUGGUUCCUUAGAUCGUUAACAGUUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAUUAAAACAUGAACCUUAUGGGACGUGUGCUUUUAUUAGGCUAAAACCAAGCGAUCGCAAGAUCGUUAUAUUGGUUGAACUCUAGAUAACAUGCAGAUCGUAUGGUCUUGUACCGACGACAGAUCUUUCAAAUGUCUGCCCUAUCAACUUUUGAUGGUAGUAUCUAGGACUACCAUGGUUGCAACGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCACUCCCAGCUCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCAUAUCCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUACACUUUAAAUCCUUUAACAAGGACCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCGGUUAAAACGUUCGUAGUUGAACUUGUGCUUCAUACGGGUAGUACAACUUACAAUUGUGGUUAGUACUAUACCUUUAUGUAUGUAAGCGUAUUACCGGUGGAGUUCUUAUAUGUGAUUAAAUACUUGUAUUUUUUCAUAUGUUCCUCCUAUUUAAAAACCUGCAUUAGUGCUCUUAAACGAGUGUUAUUGUGGGCCGGUACUAUUACUUUGAACAAAUUAGAGUGCUUAAAGCAGGCUUCAAAUGCCUGAAUAUUCUGUGCAUGGGAUAAUGAAAUAAGACCUCUGUUCUGCUUUCAUUGGUUUUCAGAUCAAGAGGUAAUGAUUAAUAGAAGCAGUUUGGGGGCAUUAGUAUUACGACGCGAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGUCGUAAGACUAACUUAAGCGAAAGCAUUUGCCAAAGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGAGGUUCGAAGGCGAUCAGAUACCGCCCUAGUUCUAACCAUAAACGAUGCCAGCUAGCAAUUGGGUGUAGCUACUUUUAUGGCUCUCUCAGUCGCUUCCGGGAAACCAAAGCUUUUUGGGCUCCGGGGGAAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCGAACAUAAGUGUGUAAGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAAUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCAAAUAUAUUAAAUAGAUAUCUUCAGGAUUAUGGUGCUGAAGCUUAUGUAGCCUUCAUUCAUGUUGGCAGUAAAAUGCUUAUUGUGUUUGAAUGUGUUUAUGUAAGUGGAGCCGUACCUGUUGGUUUGUCCCAUUAUAAGGACACUAGCUUCUUAAAUGGACAAAUUGCGUCUAGCAAUAAUGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCUGCACGCGCGCUACAAUGAAAGUAUCAACGUGUAUUUCCUAGACCGAGAGGUCCGGGUAAACCGCUGAACCACUUUCAUGCUUGGGAUUGUGAACUGAAACUGUUCACGAUGAACUUGGAAUUCCCAGUAAGUGUGAGUCAUUAACUCGCAUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUUAUUUAGUGAGGUCUCCGGACGUGAUCACUGUGACGCCUUGCGUGUUACGGUUGUUUCGCAAAAGUUGACCGAACUUGAUUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
| Reference structure (ext) |
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Afold
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[ FASTA input ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......))))).......................((((((((((((((..(((((((..((((((.....((..((((((((..((((...(((((..(((((((((((((((((......(.((((((((..(((((((((((.(((((((((((......((.......(((((..((....))..)))))))..((((((((....((((((((((((....))))))....))))))....)))).))))...(((((((.....(((.......)))....)))))...........)).((((((.....)))))))))).))))))).)))))))))))...)))))))).)((((((.(....)))))))...(.((.((((........)))).)).)))))))))))(((.((.(((((((..(((((...(((((......)))))))))).))............((((((.(((......)))..))))))(((((.....(....)......(((((....))))))))))...............))))).)).)))((((.....)).)).)).))))))))))....)))).))))))))...))))))))...........(((((((((((((((((((((((.(((()))))))).))))))..)))....))))).)))))((.((((((.((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..))))..........((((((.((((((((......)))))))).)))))))))))).))....(((.........))))))))))...(((((.......))))).......)))))))))...............((((((..(((((((.(((((((.....(((....)))...))))))).)))))))..))))))..(((((.((((((((((((((......))))))...)))))))).)))))..(((..((((((((((.....)))))))))).))).............(((((((...(...((((.........))))...))))))))............(((((.(((((((((.(.(((((......)))))).)))))..(((((((((...(((((....)))))..))))))))...)....))))..)))))......................((((.((((.....)))).))))....))))).............(((((......((..(((..((((....))))..)))((((.(((.(((((....((((.(((.(((((((.((())).))))))).))))))).))))).))).))))................................(((.......)))...........(((((.((...((((((((((.(..((((((.((..(((((((.....))))))))).)))))).).)))))))))))).)))))((((((((((((((((.(((.((((((.......)))))))))))))))))(((((((..........))))...))).))))))))..(((..((((...........))))..))).....(....((((((((.(((..((((.((.(((.((((....)))).))).))).))))))...)))))))).....).(((((((((.......)))))))))......))..)))))....(((((((((.....)))))))))((((((((((..(.((((..............((((.......)))).............)))).)...))))))))))((((((((((.....))))))))))............(.........)...................................((((((((((....))))))))))........ |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..........................(((((((((.......(((..........)))........)))..))))))....................................((((..((....))))))...........((((...((((.......(((((...(.....)..)))))))))...))))......((((......................))))......................((((.(((.......)))))))..................................((((((((.......)))))))).......(((((.......((((....))))..(((((((...((((((........)))).))...)))..))))........((((((..((((((...((((.....)))).))))))............(((.(((((((((......)).)))))))..)))....................................((((((...................................))))))...............................................(((((........(((((.((((...........))).).)))).............)..))))).......................................................................((((((((((((......))))))))))))...........................................(((.......))).....................(((((((((((........))).)))))))).....................(((((((...................(((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).))))).......((((((((((.....)))))))))).))))))).........(((((((...(...((((.........))))...))))))))...........((....(((..(((((((.(((((......))))))))))))..)))...((....))...........))..........(((.(((((....)))))..)))...........((((....(((((((((.......(((.....)))..................(....).............(((((..................................)))))..)))))))))....))))............((....))..........................((((((.......((((............((...(.(((..........((....((..(....................................)....).....)).).....))).).)).................................)))).....((((((((.....))))))))................)))))).....((((...........)))).....))))))..(((.(((((((.....(((.....(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))..((((((((((.............))).)......(((....)))....((((((((.......))))))))......)))))).................)))))(..((((.((...((((((((..(((..((((..(...(((((..((((.(((((.....))))).)))....))))))...)..))))..)))..))))))))..)).))))...)............(((.(((((....))))).)))......... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(...)(((((((.(((..((((.(((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((.......)))...))(((......(((.......(((..(...((....(((((.............(((.......(((.....)))...).....)).((.......((((((((......))))))))))(.((((((((.....((((......................)))).....)).)))))).)....(.((((...((.....))..))))).)))))...)).)..))).((...(.(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).))))))))))......(((((((...((((...))))).))))))..(.....((..(((((((((((((......)))).)))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...((((((.((((.....(.(((..(((..........(....(.((.......((.(...)....(....).)).))))...........................................................................................(.(((((((((......)))))).)))).............((((((((.......((...((((...))))(((......))).....)).......)))))..))).........(((((((((((................))))))).))))(((((.......(((((..(....(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((.......((((....(...)))))....)))))))....)))...(((.((((((..((((((((.(((((...)).)))))))))))..)))...((....))..)))......)))..)(((...(((..((((....))))...)))............((((((((((((((.....))))((((.(((((...((..(((.(........((...))((((...((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))...))))))((...))(((((...(((((..((....))..)).((......))...)))))))).(.(((((.(((.((((..((((((((((...(..............................................................................................................))))).))))))..)))))))..((((((((.....))))))))....)))))).......))))....))((((..((.....)))))).)).)))).))).(((.(((((((.....(((.....(((.((((....)))).))).....))).....))))))))))...((((.((((((.........)))))).....(.(((....))).((((((((((((.....)))))))))...)))))))))))))))((....))))))))..(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((.........)))))))))))..))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))).. |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.(((..((((.(((((((..((((........(((((((((.((..........(((...)....))...)))))..))))))(.......(((......((....(((((...........(.((........(((.....))).........)).)........((((((((......))))))))(((((((((((......((((......................))))......).)))))))).)).(.((((...((.....))..))))).)))))...))....))).((.....(((....((((((((.......)))))))))))......((((((....((((....))))..(((((((...((((((........)))).))...)))..)))).((.((....))))...))))))..(((((...))))).))................(((((((((((((......)))).)))))).)))....).((.................))))))....((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))))))))))))))...(((((((.((......(.((...(((..............(............)....((.(.......)(........).........................................................................................(.((((..(((......)))...)))))).)...........(.(((((.......((...((((...))))(((......))).....)).......)))))...)..........(((((((((((................))))))).))))(((((.......(((((..(....(((((((((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..)))))))))))))...)).)....(((((((.......((((.........))))....))))))).....))...((((((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...((....))..)))).....)))..((((..((((..((((....))))...))))...........((((((((((((((.....)(((((((...)))))...(((...))))).(((....)...))....((..(((((....((.....(((........))).))......)))))...))))))....((((((((...(((..(((((.((((.....))))..)))))..))))))))...(((((.(((.((((..(((((.((.(...................................................................................................................)))...)))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))).........))).(((..((((..((.....))))))..)))........(((.(((((((.....(((.....((((((((....)))))))).....))).....))))))))))..((((((((((((.........))))))....((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))))))))((....)))))))))...(((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((.........)))))))))))..))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))).....))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.(((..((((.(((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((.......)))...))(((......(((...(...(((.....(((....(((((.............(((....).((((.....)))...).....)).((.......((((((((......))))))))))(.((((((((.....((((......................)))).....)).)))))).)....(.((((...((.....))..))))).)))))...)).)..)))(((.....(((....((((((((.......)))))))))))......))))..((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).))))))))))......(((((((...((((...))))).))))))..(.....((..(((((((((((((......)))).)))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...(((((((((.......(.(((..(((..........(....(.((.......((...(.........)...)).))))...........................................................................................(.(((.(((((......)))))..)))).............((((((((.......((...((((...))))(((......))).....)).......)))))..))).........((((((((((..................)))))).))))(((((.......(((((..(....(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((.......((((....(...)))))....)))))))..........(((.((((((..((((((((.(((((...)).)))))))))))..)))...((....))..)))......))).))).(((((((..((((....))))...))))...........((((((((((((((.....))))((((.(((((...((.........((((((....))(((((...((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))...)))))))...((((((((...(((((..((....))..))(((......)))..)))))))..(.(((((.(((.((((..((((((((((...(..............................................................................................................))))).))))))..)))))))..((((((((.....))))))))....)))))).......))))))))))((((..((.....)))))).)).)))).))).(((.(((((((.....(((.....(((.((((....)))).))).....))).....))))))))))...((((.((((((.........)))))).....(.(((....))).((((((((((((.....)))))))))...)))))))))))))))((....))))))))..(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((.........)))))))))))..))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((..((((.(((((((..((((........(((((((((.((..........((.........))...)))))..))))))((......(((......((....(((((...........(.(((....)..(((.....))).........)).)(.......((((((((......))))))))).((((((((((.....((((......................)))).....)).))))))))....(.((((...((.....))..))))).)))))...))....))).((.....(((....((((((((.......)))))))))))......((((((....((((....))))..(((((((...((((((........)))).))...)))..)))).((.((....))))...))))))..(((((...))))).))................(((((((((((((......)))).)))))).)))...)).((.................))))))....((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))))))))))))))...(((((((.(((.....(.((...(((..............(............)....((.(.......)(........).........................................................................................(.((((..(((......)))...)))))).)..........((.(((((.......((...((((...))))(((......))).....)).......)))))...)).........(((((((((((................))))))).))))(((((.......(((((..(....(((((((((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..)))))))))))))...)).)....(((((((.......((((.........))))....)))))))....)))...((((((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...((....))..)))).....)))..((((..((((..((((....))))...))))...........((((((((((((((.....)(((((((...))))....(((...)))...(((....))).)))...((..(((((............(((..(((......)))..))))))))...))))))((..((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))...(((((.(((.((((..(((((....(...................................................................................................................)(...))))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))).........))).))(..((((...(.....).))))..)..........(((.(((((((.....(((.....(((.((((....)))).))).....))).....))))))))))..((((((((((((.........))))))....((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))))))))((....)))))))))...(((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((.........)))))))))))..))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))).....)))))))))).((((((((....)))))))))))))))... |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.(((((((...(((((((((((.(((((.(((....(((..(((((((((..........(((.........))).((((((((..((((....((((..(((((((((((((((((.((.....((((((((..(((((((((((.(((((((((((...............(((((............)))))....((((((((....((((((((((((....))))))....))))))....)))).))))...(((((((((.(((([[[[.))))))))...............))))).(((((((...))))))))))).))))))).)))))))))))...))))))))..((((((.......))))))........((((.(.....)))))...))))))))))))((((.(((((.(((..((((((...((((......)))))))))).)))...............(((ccc...)))CCC(((((.(((((((..((((....))).)..(((((....)))))))))))).)))))..))))).)))).......((((.....)).)).))).))))..))))...)))).)))))))).....(((((....)))))...(((((((((((((((((((((((.((....)))))).)))))..))))....))))).)))))...(((((((((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..)))).)........((((((.((((((((......)))))))).))))))))))))....((((((((.....)))))))).......(((((.......))))).......)))))))))..)))))).))))).((((((..(((((((.(((((((.....(((....)))...))))))).)))))))..))))))..(((((.((((((((((((((.(...)))))))...)))))))).))))).((((..((((((((((.....)))))))))).)))).....(((....)))...((((.(((((((.........))))....))).)))).....((((((......))).))).))))))))))).((((((((.........((((((.(((..(((((....)))))..)))))...))))..((((....))))..........(((.((((.((((((((.((((.....))))((((...))))((((...........................(((..((((....))))..)))..))))...)))))))))))).)))(((((((((((((((.(((.(.((((.(((((((((((((((bbb..)))).))))).BBB)))))))))))......(((((.....)))))((((((..........))))))((((((((..{{{{{.........((((((aaaaaa.))).AAAAAA...)))...))))))))}}}}}....((((((((.((((((.((((.((((((.......))))))))))))))))((((<<<<.)))).....>>>>.......)))))))).((((..((((...........))))..)))).........((((((((.(((.((.((.((.(((.((((....)))).))).)))))).)))...))))))))....((((((((((((.(....))))))))....(((.((....).)))).(((((((((.....)))))))))......))))).)))...))))).))))))))))...((((.....((((((.(((.(((..((((.......((((.(((((((((((.....)))))))))).)..)))).......))))..))).))).))))))....))))..))))))))]]]]...((((((((....)))))))))))))))))) |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..........(((((......((((..(((.............................((((...(((...((((((........................................(((....)))(((.....)))))))))...............(((((..((....))..)))))))).((((((.......((((......................))))........))))))........((((..(((.....))).))))....))))..........................((((((((.......)))))))))))....((((((...(((((((....))))...)))(((...((((((........)))).))...))).(.(((((..((.(((((((....((((...((((.....)))).))))(((.(.............(((((((((......)))).)))))...............................(.((((.......((((((....((((((((.((....)))))..((((.(((.....)))............(((((.(((((((..(.((((..((((.((((....................................................................................................................................................................................((.((............(((.....)))(((......)))..............)).))..((((((..((((((....))))))...))))))....................(((((((..((((((.....((....(((((.((((((.....((((......))))......)))))).)))))....(((....)))....)).....))))))..)))))))...((....))..)))).))))..)))).).....(((((....((((..((.....(...(((....(((..((((((((...............))))))))..)))...((....))...........)))...)..))((((..((((....))))...))))..))))...)))))..((((.((((.....)))).)))).........))))))))))))..)))).....)))))(((((((.......((((((((((((.((..(((((..((.....(((.(..((((.(....).))))..).)))..)).)))))..)).))))).))))))).............(.(((((.(((.((((..(((((..............................................................................................................................)))))..)))))))....((((((.....))))))......))))))........))).).))))))))).....)))).)...))))))))))).(((.(((((((.............(((.((((....)))).))).............))))))))))..(((((((((((...........)))))....((.(((....))).)).((((((((.......))))))))......))))))))))))).).......))))))...((((.((....(((((((..(((..((((..(...(((((((...((((((.......))))))...)))..))))...)..))))..)))..)))))))...)).))))..))))...))))).((((.(((((....))))).))))........ |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.(((......((((((((..((((......((((((((((.((((((((((.((..........(((((..((......)).)))))......(((((((((.....))))).)))).)))))))))))).(((((.....(((((((((((((...((.......(((((..((....))..)))))))...)))))).....((((((((((((....))))))....))))))...))))))).....)))))...)))))).))))..(((..((((...........)))).((((...(((((....((((((((.......)))))))))))))....))))..)))((((((.......)))))).)))).(((((........(((((.((........))..((((.(((((.(((..((((((...((((......)))))))))).)))...............(((......)))...(((((.(((((((...(((....)))....(((((....)))))))))))).)))))..))))).))))...))))).((.....)).)))))...))))))))......((((((((..(.....(((((....)))))...((((((.....(((((((..........((((((((((.((((..(((..((((((.(((((....((((((.((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..))))..........((..((.(((..(((......)))..))).))..)))))))).....(((((((.....))))))))))))...(((((.......)))))........)))))))))............((((((((....((((((.((((((....)))))).......((((((((..(((((.(((...((((.((((.((((((((((((((......))))))...)))))))).))))......((....))...)))).))).)))))..)))))))).....))))))))))))))....((((.........)))).)))).)))))))))).(((((.(((((.(((((((((.(.(((((......)))))).))))...((((((.(((..(((((....)))))..)))...))))))...)))))..))))).....((((((....((((...((((.((((.....)))).))))(((..((((..(((((((.((((((((......((((((........(((((((...(((((((.((.((((..(((((.((((((.(((.(((...))).)))..((((.(((((((((((((((.....)))).)))))....))))))))))..............)))))).....((((..((((((......(((((((((((.((((..((((..((((......))))...))))..)))).))...)))))))))...))))))))))...((((((((.(((.((((((.......)))))))))))))))))(((.....)))....)))))..)))).))....)))))))...((((...........)))).....)))))))...((((((((.(((.((.((....((..((((....))))..))...)))).)))...)))))))))))))).(((((((((.......)))))))))..........))))).....))))))))))))))..)))........)))).....))))))...........))))).)))))))..((((((.(((.(((..((((..(....((((.(((((((((((.....))))))))).))..))))....)..))))..))).))).))))))..))))))..)..))))))))))).((((((((....)))))))).))))))... |
|
RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((((....((..............................................................................................................................................................................................................................................................))..(.....(((.((((.((((..((...((.((........))))...))...))))...)))).........)))..((((((....((.........(((...(((....))).)))...))..))))))....((((.......((((............)))).))))((((((((......(((....((((....)))).......)))...)).)))))).....(((.((((.((((.....))))))))......((((...((((((.((((...(((.....(((((((.......))))))).))).....))))...))))))....)))))))..(((...((.((.(((........)))))...))...))).)((((((((..((((...(.(....))..))))....(((...((((((((((....)))))))))).)))......(.((.........(.(((...(.(...)...).)))).)))((((...((..((...(((...(((....(((.(((..(((((.....(((((((((.(......((((.....((((((......((........))....)))))).........)))).)....(((...(....((((((......))))))....)....)))..........)))))))....((((..(((((....(..(((......))).....).....)))))....))))....(...(((((((.(((......))).......)))))))..)(((((((...(((((..(...((((((..((((((((((...((((......))))....))))))))))))....((.....))..)))).)...)))))...)))))))(((.(((......((.(((((....))))).....)).)))...)))..((((((..(...(((.((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))............))).....)))...).......)))))).))..)))))...)))...))....)..))).))).)).....))...)..)))(((((((((....(((((.....(((.....(((.(((((((.(((.......((((((((((((((..((((((((...(((....((((((((......))))))))..))).))))))))..))))).)).))))))).)))...).....(.(((((((.(.((((....((..((((.............))))..))..)))))).(((((((......)))))))....))))))...)....)))))))))..)))...)).))).)))))))))...))))).(((.((((.....(((......((((((.(....)))))))....)))......)))...))))...((((((((((..........)))))....((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......)))))))).((((((....(.(((...(.((((((...((((((((..(((..((((..(..((((.((((((((......)))))))))))..)...)..))))..)))..))))))))..)).)))).).)))).))))))..((((((((....)))))))))))))))... |
|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.(((.................................................................................................((((((((.........((((((((..((((..(((((.(((((((...................(((((..((....))..)))))................((((((((((((....))))))....))))))..................................................................((((.....)))).......))))))).)))))..))))...))))))))..((((((.......))))))........((((........))))......)))))))).((((.(((((.(((..((((((...((((......)))))))))).)))...............((........))...(((((.(((((((...(((....)))....(((((....)))))))))))).)))))..))))).)))).......................................................................................................(((((((((.((((.......((((((.(((((....((((((.((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..))))..........((..((.(((..(((......)))..))).))..)))))))).....(((((((.....))))))))))))...(((((.......)))))........))))))...............((((((((....((.....((((((....))))))...))..((((((((..(((((.......(((.(((((.((((((((((((((......))))))...)))))))).))))).....((....))....))).....)))))..))))))))...((....))))))))))....((((.........)))).)))).)))))))))...................((((.(.(((((......)))))).))))..........(((..((((......))))..))).....................................................................(((..((((...(((((..((((((((..............................(((((......((((..((((.................................((((((((((.((((.....))))..))))....)))))).............................((((..(((((.......(((((..((...((((..(((...((((......))))....)))..))))......))..)))))....))))))))).....(((((..(((.((((((.......))))))))).)))))..................))))..)))).........)))))...((((...........))))...............((((((((.(((.((.((....((..((((....))))..))...)))).)))...))))))))........((((((((.......))))))))...........))))).....))).))))).))))..))).................................................((((((.(((.(((..((((..(....((((.(((((((((((.....)))))))))).)..))))....)..))))..))).))).)))))).....................))).((((((((....)))))))).))))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.((.((((......)))).))............(((((((.((((((((((.((..........(((((..((......)).)))))......(((((((((.....))))).)))).)))))))))))).((((......(((((((((((((...((.......(((((..((....))..)))))))...)))))).....((((((((((((....))))))....))))))...)))))))......))))...)))))))(((((..((((..(((((.........)))))......(((((....((((((((.......)))))))))))))..((((((..((((((((((.(((((.(((((((.((((((((((((((...((((...((((((((.....(((((.(((((((..(((((((.(((((......)))))..((((((.....((..(((((((((.(((......)))..))))).))))..))..)).)))).....(((((....))))).....(((((..((((((((....)))((((..(((.......(((..(((((((..........)))))))..))).......)))..)))).)))))..)))))...)))))))...........((((((((((.((((..(((..((((((.(((((....((((((.((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..))))..........((..((.(((..(((......)))..))).))..)))))))).....(((((((.....))))))))))))...(((((.......)))))........)))))))))............((((((((....((((((.((((((....)))))).......((((((((..(((((.(((...(((((((((.((((((((((((((......))))))...)))))))).))))).....((....))...))))..))))))))..)))))))).....))))))))))))))....((((.........)))).)))).))))))))))))).)))).))).))..))))))))))))..))))).))))))))).(((.(((((((((..(((((....)))))..))).....((((..((((....))))...))))...........)))))))))....)).))))).))))).(((..((((..(((((((.((((((((......((((((........(((((((...((((((..((.((((..(((((((.(((.(..((((........))))..).)))))).(((((..((((((((((......))..........((((.(((((((((.(((.((.(((.((((((.((....)).))))))..))).))(((..((....))..)))..........))).)))))))))..(((((..(((((.(((..(...(((....)))..)..))))))))..))))).....))))....))))))))..).))))........))))..)))).)).....))))))...((((...........)))).....)))))))...((((((((.(((.((.((....((..((((....))))..))...)))).)))...)))))))))))))).(((((((((.......)))))))))..........))))).....))))))))))))))..)))..))))....)))))).....((....))..))))))...((((.((..((((((.((..(((..((((.......((((.(((((((((((.....)))))))))).)..)))).......))))..)))..)).)))))).)).))))...))))..)))))..(((((((((....)))))))))))))))... |
