|
|
|
CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGCGCGCGAGGCAGCGACGGGGAGCGCGCGAGCGAGGCGGGCCCACAGCCCCCGCCGCGGAGCCGAGGGCAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCGAGCGUCGCGCGGCGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCGUCCCGCCGGCCGCCCAGGGAAACCGGGAGGCUCCGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGAAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACUCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCGCGCGAGGACGCGCGGAGCCCCCGCCGUGGCCGGGACCGCGGGCUGGAACGCCCCCGCGCACCAGGAAUGUCUUGUAGGCGCCCGCCCCCACCGCGCGCCGGACGCGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...........)))))......(((......((((..(...((...((((..............((....(((((((....))))))).....))..................................................))))..)).)..))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))..((....))..((((((.........)))))).....(((((((((.....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((............(((((.........................................))))).........((((((....)).)))).............(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..(((.((((((.........)))))).)))...[[..))]]....]]]....]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........)))).......(((((((....(((((.......(((((((.......))))))).....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((...))))))..((((((((....))))))))....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((((.....((((((.((....)).))).)))....))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((.....))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))....((.((((((((....))))))))))........
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(....((..(((((.(((...((((.(..(((((((((..(.((.((((......((((((((...((((..(((((((.(((((((((...((.(((((.......))))).)).))))..)))))....))))).))..))))((((((.....)).))))..)))))))).(((..(((((.((.(((.(((((.(((.(((((.(((((..((((((((((.....((....))....(((((((((((((..(((((....((((((.(........((((.(((((.(((...(((((((........))))))).........(.((((.((.((((((((.(((((((..(((((...))))).(((..((.(((....(((....))).((.((((.....)))))).)))))..)))..))))))).))).))))).)).)))))........(((((((((.((((((....)))))))))).)))))......))).)))))))))((((...((....))...))))....).)))))).)))))...((.(((((.(((((....))))).)))))))))))))))))))).)))))).))))..)))))((((((((((....((((((((((..((((........(((((((....((.((.((((((..((((....))))......((((..((.....))..))))..)))))).))))....)).))))).....))))...))))))))))....))))))).)))...))))).)))..))))).)))..))))))).((....))))).)))).))..)..)))))))))..).).)))..))).....((((..(((...((((((((((((....((((....((((.....))))..)))).......(((((..(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((...(((((((((.((((((((..((.....)))))).))))..)))))))))...)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....)))))...(((((((((.....((...((((((.((.((((....(((...)))....((((((((...(((((...)))))..)))))))).)))).)))))))))))))))))))..((.((..((((((..((....))))))))..)).))..)))))))).)))))))))..)).))))))))))).)))))...)))))))............))))).(((((.((..((((((((((.(((..((((((((......))..))).)))..))).)))))))))).)).)))))..)))....))))....((((((((....)))))))).))))))).) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......))))))..((((...(((((((.((((((...((......((((((...(((((...(((((((..(((((.((....((((((..((((((..(((..((((((...(((((....((((((....))))))....(((((((((((...(((((((((((((((....((..(((.........))).((((((((..((((((((((........((....)).((((((((((((((.(((((....((((((.....(((..(((((((((((((((..(((((((........)))))))...)))..)))..(((((.(((((......((((...(((((...))))).))))((((((.....(((.(((((..((((((.........))))))..(((((((..(((..(((.....)))....))).))))...))).))))))))..))))))...)))))))))).)))))...))))...)))(((..((((...((....))...))))...))))))))).)))))......(((((.(((((....))))).))))).)))))))))))))).)))))).))))..)))))))).)).(((((..((((..((((.................)))))))).....))))))))))..)))))))))).....(((((...........)))))..((((((((((..((......))......((((((..............))))))..))))).))))).)))))))))))...)))))....))))))..(((((....))))))))..)))))).....((((((.(((((....((....)).....(((..((.......))...)))..)))))))))))))).)))..))..(((((...((((....(((((((.(((((......(((.....))))))))(((((((..((((((((((.(((((.....)))))......((((((((((..(((((((((((............)))).)))...)))).....))))))))))...)))))))))))))))))...(((((((((...(((....)))..))))).....)))))))))))...((((((((...(((((...)))))..)))))))).))))..)))))))))).)))))))..)))))...)))))).((..(((....)))..)).))..)))))).(((((((.((((((...((((((((((..((((..(((((...((....)).(((((((((.......)))).))))).)))))...)))).)))).))))))..)))..))).......)))))))..))..)))))..)))).....(((..((((((((....))))))))...))).... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......)))))).......((((((((((.((.((.((((......((((((((.((((((.((((((((.((((((.(.....((((.....(((.(((((((((((.(((((((.(....).)))))))..........................((((((.(((((((((((((((((((..(((.((((((.(.((((((((((((((((......)))))((((((((.......)))))))))))))))...(((((.......))))).......(((((((.(((((((........))))))).).)))..)))((((.((.((((((((.(((((((...(((((((((((................)))))).......((((((.....)..)))))))))...)...))))))).))).))))).)).))))...............)))).))))))))))))))))))..........))))))).)..)))..))))))..............(((....))).............))).)))))))).))))))).....))))))).).))))))).....)))).)).))))))))((((((((((....(((((((((((((.((.....(..(((((..(((.((.((.((((((..((((....))))......(((((.((.....)).)))))..)))))).))))....))))))))..)..)))))..))))))))))....))))))).))).((((((((((.........))))))))))((.((....))))..)))).))..)).))))))))))...(((.((((.......))))..)))........((((((.....(((((.....)))))...........................(......)..((((.(((((((.((.......((((((............................................................((((((((............)))).)))))))))).((((((((((((((((.....(((((.((((..((.((...((((....(((....)))...)))).....)).))....)))).)))))((....(((((...)))))...)).((((((....))))))......................((((((..........))))))..........))))))).)))))))))..)).)))))))))))..........))))))..................(((((.((..((((((((((.(((..(((.(((...(....)..))).)))..))).)))))))))).)).))))).................((((((((....)))))))).......... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......))))))..((...((((((((((.((.((.((((.......((((....((((((..(((((((.(((...........((........)).((((((((..((.......))..))))))).)...))).......(((((((((((..(((((((((((....)))..((.(((...))).))....))))))))......(((((......)))))((((.((.((((((((((((((.(((((....((((((.(........((((.(((((.(((...(((((((........))))))).............(((((((((((.....(.(((...((((.....)))).))))((((((.....(((....))).((((((.........)))))).....((((((........((((.....((....)).......))))))))))...))))))))).).)))))))...........))).)))))))))((((...((....))...))))....).)))))).)))))......(((((.((((......)))).))))).)))))))))))))).)).)))).....((..((((((((((((....((((((((((..((((.....(((...)))((((....((.((((((((....))((((........................))))...)))))).))......)))).........))))...))))))))))....))))).).)))))).))..))))))))))))))))).)..))).)))....)))).)))).))..)).))))))))))..((((....))))...........))..(((((.(((((((..(.....(((.(((((.(.........).))))).)))((((..((......(((((((.....(((....)))....))))))(((..........)))(((.(((((((.(...(((((......((.((((.(((((.............))))).)).)).)).......)))))((((((((((((((((..(((((....)))))...(((((((((.........(((((.........)))))((.(((.(((.(.(((((((....(((((...)))))...))))))).).)).)...))).)))))))))))..((((...((((((..........))))))..)).))...))))))).)))))))))).))))))).)))))).)))))...)))))))))).))....(..((...(((((.....((((((((((.(((..(((.(((...........))).)))..))).))))))))))....)))))....))...)....(((.(((((((....))))))))))........ |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......))))))...(((.((((((((((.((.((.((((......((((((((.((((((.((((((((.((((((.(.....((((.....(((.(((((((((((.(((((((.(....).)))))))...(.((((..........))))..)((((((.(((((((((((((((((((..(((.((((((.(.((((((((((((((((......)))))((((((((.((())))))))))))))))))...(((((.......))))).......(((((((.(((((((........))))))).).)))..)))((((.((.((((((((.(((((((...(((((((((((................)))))).......((((((.....)..)))))))))...)...))))))).))).))))).)).))))...............)))).))))))))))))))))))..........))))))).)..)))..)))))).((....))...((((((())))).........))..))).)))))))).))))))).....))))))).).))))))).....)))).)).))))))))((((((((((....(((((((((((((.((.....(..(((((..(((.((.((.((((((..(((((())))))......(((((.((.....)).)))))..)))))).))))....))))))))..)..)))))..))))))))))....))))))).))).((((((((((.((()))..))))))))))((.((....))))..)))).))..)).))))))))))...(((.((((.......))))..)))....((((((((((.....(((((.....)))))..........................(((....))).((((.(((((((.((.......((((((...(....)(((())))((((((((((((.....))))))....))))))(((....)))((((((((..(((...))).)))).)))))))))).(((((((((((((((((.((((((((.((((.(((.((.((((((....((((()))))...)))))..).)).)))...)))).)))))).....(.(((((((.......((.((((((....))))))..)))))))))).))((.((..((((((..((....))))))))..)).))..)))))))).)))))))))..)).)))))))))))((()))....))))))............))))(.(((((.((..((((((((((.(((..(((.(((...((()))..))).)))..))).)))))))))).)).)))))..))))......((...((((((((....)))))))).....))... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((...[[[[)))))).................]]]].............((((((((...((((...((((((.(((((((((......(((((.......)))))....))))..)))))....))))))....))))((((.....[[[[[))))..(((((((((((....)))......(((......)))...)))))))).......((((......))))....]]]]](((((((((((((......(((.((((((.....((((....))))...((((((..(((((((........)))))))...)))..)))......)))))))))..(((((((....(((.[[[[[[......))).......]]]]]]..(((.[[[((((.....))))....)))...]]]..)))))))..(((..[[[[[)))..((((......(((((((((.((((((....)))))))))).)))))......))))..]]]]]........(((.......[[[[[[.........)))...]]]]]]...(((((.(((((....))))).)))))..)))))))))))))...........))))))))...(((((((....((((((((((((((((.....(((...))))))........((((((..((((....))))......((((.............))))..))))))........................)))..))))))))))....))))))).((((((((((((((.........))))))))))((((((...(((((....))))).))))))))))(((.(((((.[[[)))))..)))........]]](((....(((...)))...))).(((((.[[[.........)))))....]]](((((.......((((((.....(((....)))....)))))).(((....))).......[[[[[[[)))))...]]]]]]]((((((((((((....)))(((.[[[[......)))...]]]].......((((.[[[[[[)))).......]]]]]]........((((....[[[[[[[...(((.........)))))))...]]]]]]]((((...[[[[[[[[..........))))....]]]]]]]].....(((.((((..[[[)))))))....]]]...)))))))))..((((..[[[[[..(((((...)))))..))))............]]]]].....(((((((.....[[[[[[...............[[[[[.....[[[[[[[[[[.[[[..[[[.[[[)))))))....]]].]]]..]]].]]]]]]]]]]....]]]]]........]]]]]]...((((((((....)))))))).......... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((((((((((...((((...((((((((((((..((.((((......((((((((.((((((.(((((((..((((((.........(((((...((((((((((((((.(((((((.((...)))))))))..(..((((((.....)).))))..)((((((.(((.(((((((((((((((..(((.((((((.(.((((.(((((.(((((......)))))((((((((.......))))))))((((((((..((....))....)).))))))...((((((..(((((((........)))))))...)))..)))((((.((.((((((((.(((((((..(((((...))))).(((.(((.(((((.((.(((.......))).)).......))))).)))...)))..))))))).))).))))).)).)))).((.....))))))))))).))))))))))))))))))..........)))))))....)))..)))))).((....)).((((((...(((...)))...))))))))).)))))))).))).....)))))))))))...))))))).....)))).)).))))))))((((((((((.(((.(((((((((..((((........(((((((....((.((.((((((..((((....))))......(((((.((.....)).)))))..)))))).))))....)).))))).....))))...))))))))))))..))))))).))).((((((((((.........))))))))))((.((....)).)).)))).))..)).))))))))))...).)))..)))..........))).)))))).(((((((.((......(((.(((((.............))))).))).((((.(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((...(((((((((.(((((((((........).)))).))))..)))))))))...)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....)))))...((((((((((....((..(((.(((..((((...........))))..)))(((((((...(((((...)))))..))))))).....)))..))...).)))))))))..((.((..((((((..((....))))))))..)).))..)))))))).)))))))))..)).)))))))))))..)))).......((((((((((...........(((((.((..((((((((((.(((..((((((((......))..))).)))..))).)))))))))).)).)))))..)).)).))))))...((((((((....)))))))).))))))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......)))))).......((((((((((....((.((((......((((((((.((((((.(((((((..((((((.......(((([[[...((((((((((((((..((((((........))))))......................................(((((((((((((((..(((.((((((...((...(((...(((((......)))))((((((((.......)))))))).....................................(((..(((((((........)))))))...))).....((((....((((((((.(((((((................................((....)).................................))))))).))).)))))....))))..........{{)))..))..)))))))))))))))))....}}....)))))))..........................(((((...((.....))...))))).)))).))))))).))))))).]]]..))))))...))))))).....)))).)).))))))))((((((((((....(((((((((((.((((........(((((..(((.((.((.((((((..((((....))))......(((((.((.....)).)))))..)))))).))))....)))))))).....)))))..))))))))))....)))))))..)))((((((((((.........))))))))))((.((....))))..)))).)).....)))))))))).(((((....))))).....................((((........................................................((((((.<<<<(((....)))....))))))..................aaaaaaaaaaaaa.........((((((((.(((....)))((((((((............)))).))))(((((((((...............((((((bb..)))).........((((((.........................))))))........((((((((...(((dd.....)))..)))))))).......BB.....))....DD.)))))))))..cc))))))))..........CC...................................>>>>...............)))).AAAAA.AAAAAAAA....(((((.((..((((((((((.(((..((((((............))).)))..))).)))))))))).)).))))).................((((((((....)))))))).......... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((.........))))...(((((.(((((((((((..((.((((......((((((((.((((((.(((((((..((((((.........((......((((((((((((((.(((((((.((...))))))))).....((((((.....)).))))...((((((.(((.(((((((((((((((..(((.(((((.((.(((.(((((..(((((......))))).(((((((.......))))))).((((((...................))))))....(((((..(((((((........)))))))...)))..)).((((.((.((((((((.(((((((..(((((...))))).(((.(((.(((((.((.(((.......))).)).......))))).)))...)))..))))))).))).))))).)).)))).((.....)).)))))))).))))))))))))))))))..........)))))))....)))..)))))).((....))..(((((...((.....))...))))).)))).))))))).)))........))))))))...))))))).....)))).)).))))))))((((((((((.((.((((((((((..((((........(((((((....((.((.((((((..((((....))))......(((((.((.....)).)))))..)))))).))))....)).))))).....))))...))))))))))))..))))))).))).((((((((((.........))))))))))((.((....)).)).)))).))..)).)))))))))....(((.((((.......))))..)))...(((((((((((.....(((((.....))))).....(.....).......(((((..(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((...(((((((((.(((((((((........).)))).))))..)))))))))...)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....)))))...((((((((((....((..((((..(..((((...........))))..).((((((((...(((((...)))))..))))))))...))))..))...))).)))))))..((.((..((((((..((....))))))))..)).))..)))))))).)))))))))..)).))))))))))).)))))....))))))............))))).(((((.((..((((((((((.(((..((((((((......))..))).)))..))).)))))))))).)).)))))..))))).....((...((((((((....))))))))......)).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.[[[[[.)))))).......((((((((((((..((.((((......((((((((...((((..(((((((.(((((((((...((.(((((.......))))).)).))))..)))))....))))).))..))))((((((.....)).))))..)))))))).(((..(((((.((.(((.(((((.(((.(((((.(((((..((((((((((.....((....))....(((((((((((((..(((((....(((.(((((.......(((..(((((.(((...(((((((........)))))))...........((((.((.((((((((.(((((((..(((((...))))).(((.(((.(((((..(((....))).((....))......))))).)))...)))..))))))).)))).)))).)).)))).........(((((((((.((((((....)))))))))).)))))......))).)))))..)))...)))))....(((..((....)).))).))).)))))...((.(((((.(((((....))))).)))))))))))))))))))).)))))).))))..)))))((((((((((....((((((((((..((((........(((((..(((.((.((.((((((..((((....))))......((((..((.....))..))))..)))))).))))....)))))))).....))))...))))))))))....))))))).)))...))))).)))..))))).)))..))))))).((....))))).)))).))..)).))))))))))..((((....))))....((((..(((...((((((((((((....((((....((((.....))))..)))).......(((((..(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((...(((((((((.((((((((..((.....))))))).)))..)))))))))...)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....)))))...(((((((((.....((...((((((.((.((((....(((...)))....((((((((...(((((...)))))..)))))))).)))).)))))))))))))))))))..((.((..((((((..((....))))))))..)).))..)))))))).)))))))))..)).))))))))))).)))))...)))))))............))))).(((((.((..((((((((((.(((..((((((((......))..)))).))..))).)))))))))).)).)))))..)))....)))).....(((((((....)))))))..]]]]].... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.........)))))..(((((((((((((((((.....((((......((((((((.((((((.(((((((..((((((.................((((((((((((((.(((((((.((...))))))))).....((((((.....)).))))...((((((.(((.(((((((((((((((..(((.((((((.(.(((.((((((.(((((......)))))((((((((.......))))))))((((((......(((.......))))))))){{{((((((..(((((((.(.....))))))))...)))..)))((((....((((((((.(((((((..(((((...))))).(((.(((.(((((....(((.......)))..........))))).)))...)))..))))))).))).)))))....))))..........))))))))).))))))))))))))))))..........))))))).}}})))..))))))..........((((((...(((...)))...)))))))))).))))))).)))..........))))))...))))))).....)))).)).))))))))((((((((((.((.(((((((((((.((((........(((((((....((.((.((((((..((((....))))......(((((...........)))))..)))))).))))....)).))))).....)))))..))))))))))))..))))))).))).((((((((((.........))))))))))...............)))).....)).))))))))))...(((.((((.......))))..)))...((((((((((((<<<.(((((.....)))))....(((...)))......(((((..(((....))).((((.(((((((..........((((((..((((((((((((...(((((((((.(((((((((........).)))).))))..)))))))))...)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....)))))...((((((((((........((((.....((((...........))))....((((((((...(((((...)))))..))))))))...)))).......))).))))))).........((((((..........)))))).........)))))))).))))))))).....))))))))))).)))))...)))))))[[[.........))))).(((((.....((((((((((.(((..((((((............))).)))..))).))))))))))....)))))..))))).]]]......((((((((....))))))))>>>....... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((..(((((.(((...((((.(..(((((((((..(.((.((((......((((((((...((((..(((((((.(((((((((...((.(((((.......))))).)).))))..)))))....))))).))..))))((((((.....)).))))..)))))))).(((..(((((.((.(((.(((((.(((.(((((.(((((..((((((((((.....((....))....(((((((((((((..(((((....((((((.(..((((....))))..(((((((..(((((((........)))))))...)))..((.((((....((((((((.(((((((..(((((...))))).(((.(((.(((((..(((....))).((....))......))))).)))...)))..))))))).))).)))))..((((..(((......(((((((((.((((((....)))))))))).)))))......)))..)))).......))))))....(....).))))..).)))))).)))))...((.(((((.(((((....))))).)))))))))))))))))))).)))))).))))..)))))((((((((((....((((((((((..((((.....(..(((((..(((.((.((.((((((..((((....))))......((((..((.....))..))))..)))))).))))....))))))))..)..))))...))))))))))....))))))).)))...))))).)))..))))).)))..))))))).((....))))).)))).))..)..)))))))))..).).)))..))).....((((..(((...((((((((((((....((((....((((.....))))..)))).......(((((..(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((.(.(((((((((.((((((((..((.....)))))).))))..))))))))).).)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....)))))...(((((((((........(.((((((.((.((((....(((...)))....((((((((...(((((...)))))..)))))))).)))).)))))))).))))))))))..((.((..((((((..((....))))))))..)).))..)))))))).)))))))))..)).))))))))))).)))))...)))))))............))))).(((((.((..(..(((((((.(((..((((((((......))..))).)))..))).)))))))..).)).)))))..)))....))))....((((((((....)))))))).))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((.........(((((((((((((((..(.((.((((......((((((((....(((..((((.(..(((((((((...((.(((((.......))))).)).))))..)))))..).))))......))).....................))))))))......(((((.((.(((.(((((.(((.(((((.(((((..(((..((........))..........(((((((((((((..(((((....((((.................(((((..(((..(((((((........)))))))...))).....((((.((.((((((((.(((((((...((((...))))..(((............(((....))).((.((((.....))))))........)))..))))))).))).))))).)).)))).........(((((((((.((((((....)))))))))).)))))..........)))))..................................)))).)))))...((.(((((.(((((....))))).)))))))))))))))))))).........)))..)))))((((((((((....((((((((((..((((.....(..(((((((....((.((.((((((..((((....))))......((((..((.....))..))))..)))))).))))....)).)))))..)..))))...))))))))))....))))))).)))...))))).)))..))))).)))..))))))).((....))....)))).))..)..))))))))))..((((....))))................(((..(((((((....((((....((((.....))))..))))..............(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((.(.(((((((((.((((((((..((.....)))))).))))..))))))))).).)))))))....)))))....)))))).(((((((((((((((((.(((((....))))).....................(((((.........)))))..............((((((....((((.....))))...))))))..................................................................)))))))).)))))))))..)).))))))))))).........)))))))..............))).(((((.((..(..(((((((.(((..((((((............))).)))..))).)))))))..).)).)))))..)))))..........((((((((....)))))))).))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((..(((((.(((.....(((((((((((((((..(.((.((((......((((((((...((((..(((((((.(((((((((...((.(..((.......))..).)).))))..)))))....))))).))..))))((((((.....)).))))..)))))))).(((..(((((.((.(((.(((((.(((.(((((.(((((..((((((((((.....((....))....((((((((((((((.(((((....((((((.((.......((((.(((((.(((...(((((((........)))))))...........((((.((.((((((((.(((((((...((((...))))..(((..((.(((....(((....))).((.((((.....)))))).)))))..)))..))))))).))).))))).)).)))).........(((((((((.((((((....)))))))))).)))))......))).)))))))))((((...((....))...))))....)))))))).)))))......(((((.(((((....))))).))))).)))))))))))))).)))))).))))..)))))((((((((((....((((((((((..((((........(((((((....((.((.((((((..((((....))))......((((..((.....))..))))..)))))).))))....)).))))).....))))...))))))))))....))))))).)))...))))).)))..))))).)))..))))))).((....))))).)))).))..)..))))))))))..((((....)))).......((.(((..(((((.(((((((....((((....((((.....))))..)))).......(((((..(((....))).((((.(((((((.((.......((((((..((((((((((((...(((((((((.((((((((..((.....)))))).))))..)))))))))...)))))))....)))))....)))))).(((((((((((..(((..(((((....)))))...(((((((((.....((...((((((.((.((((....(((...)))....((((((((...(((((...)))))..)))))))).)))).)))))))))))))))))))..((.((..((((((..((....))))))))..)).))...)))..)).)))))))))..)).))))))))))).)))))...)))))))))).))....)))..)).(((((.((..(..(((((((.(((..((((((((......))..))).)))..))).)))))))..).)).)))))..))))).....)))..((((((((....)))))))).))))))).. |
