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CAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAUGCUUGUCUAUAGGACUAAGCCAUGCAAGUGCAAGUAUGAGUGUAUUAUACAACGAAACUGCGAAUGGCUCUGUAAAACAGCUAUAAUUUCUUCGGUGCUAAAUACUACUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCCUACACAGCGACGCAAGUCGUGGUACAAAUUAGAUACACAAGCCAGCUUUUUUGGUGAUUCUAGAUUUUUUUUCUGAUCGCACAUUGUUGCGACGCACCGUUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUUUGGAUGGUAAGGUAAUGGCUUACCAUGGUUGUGACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGACUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAACUUACCCAAUCCGGACACCGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAGCAAUAGAGGGCCCGAUGGGUUUUCUAAUUGGAAUGAGAACAAGAUAAACAGCUUAUCGAGGAGCCAGCAGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCUGUAAGCGUAUACCAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUCGAAUUUUGGCGUGUGAUUUGGGUCGUUCUCGCGGACGCGCUCAGGUUGUGCGCCUUUGUGGAGAGGGGGUGUGGUGGUGCUUGAGUGCGCUGCCAUGCUGCCGCCACCGUUUACUGUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGAUUGCCCUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACCCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUGUUUGAAUCAGGUAAUGAUUAACAGGGACGGUUGGGGGCAUUCGUAUUCCGGCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUGUCGGAAGACGAACAGCUGCGAAAGCGUCUGCCAAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUAUAAACGAUGAGGACUGGAGAUCGGACAAGACUGAUUUAUGGCUUGUUCGGCAUCCUUCGAGAAAUCAAAGUGUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCAGGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUCUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGGGCGUGCUAGCUAGGCGCCGUUACCAAUUGAGUUUGGUAGCGAGGCGGUGCCUUCCUAGACGGACUGUGGGCGUCUAGCCCACGGAAGCUCCAGGCAAUAACAGGUCUGAGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAACGGCCCAACGAGUGGAGGAUGUGCGAGAGCAUUUCCGAAUCUCCAAAUCCGUUCGUGAUGGGGAUCGACGGUUGCAAUUUUCCGUCGUCAACGAGGAAUACCUUGUAAGCGCGGGUCAUCAUCCCGCGCUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGGUCCGGUGAGGCCUUGGGAGGGCUGGAUGCGCUGUUUUUAUGCAGACAUUUUGGCCUGAACCUGGUCAAACCUUAUCACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAGAA |
| Reference structure (ext) |
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
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(.......(((((((((((..(((((((((((....(((((......(((.(((....)))..(((((.....)))))........((((...(((((((...............(((((((..(((((.....(((((((....))).))))..((((((.(((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))...)))))).....(((((..((((.....((((((.(((((((((((((....(((....)))..)))))))))).........((((.((.(((.((((.(((((..((.(((...))).))..)).))).......((((........))))..)))).))).)).)))).....))))))))).((((...(((((...))))).))))))))..)))))))))).((((((((((...))))))))))....))).))))....(((((.....)))))..)))))))))))..))).((.((((((((.((....))))))...))))))))))))))))))))))...(((((((.......(((..((............((((((..(((((((((((((....))))).))))))))..))))))..((((.((((((.((((((..((((......))))..))))))..((.(((((((((.((((............(((((((..((((....))))..)))))))...((((.....((((((((((((((...))))))))))))))...))))..(((((.....))))).)))))))))).))).))..(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))))(((.(((....))).))).((.((((((.(((.((((((....((....)).....))))))..(((((.(((((((((((..(((((((......((((...(((.(((((((((((((((.((.......))))))))))...((((((.(((((.((((...)))).))))).))))))....((((....))))...((((..((((........(((((((((..((((..((..(((((.(((((.......(((.....)))........(((((((....(((.(((...((..((((((..((((....))))..).)))...))..))..))))))..(((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..)))))))).))))))).(((.((((..(((((((((((((((......)))))).....)))))))))..)))))))..((((((((.....))))))))))))).))))).....))..)))).))))))))).....))))((((((..((.(((...)))))..))))))...))))...(((.((((....)))).)))..)))))))..)))..))))..))))))))))))))....))))...)))))..((((((....)))))).((((((((.......))))))))))).)))))).)))))))).))))...))..)))..(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((((..((....((((......))))....))..))))...)).))))..)))..))))))))).)).))))).....))))))))))....(((((....)))))...)))))))).) |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................................................................................((((((((((((......(((((....)))))))))))))))))............................................(((((......))))).........................(((((....((((((((.......)))))))))))))........................................((((........))))........................................(((((...)))))......................((((((((((...))))))))))........................................((((((...................................))))))..........................................................................................................................................................................(((((((................)))))))........................(((((((((..................)))))))))...........................((((((((((((((.....................)))))))))))))).......((((((((((.....))))))))))................((((((((.......((((.........))))....))))))))....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((..........((((((((((.....................))))))))))...........((((((((.....))))))))....)))))).....................................................(((((((.........((((((((((((....)))))))).....))))...)))))))..........((((((..........))))))....................((((((((.......))))))))....................................((((((((..(((((((((.................((((((((....((((......))))....)))))))).................))))))))).))))))))..............((((((((((....))))))))))........ |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......))))).........................(((((.((..................................))...)))))................................................................(((((..((((.....((.((........))))))))..)))))............................................((((........))))...........................((.....((((((((.......)))))))).))................(((......)))...((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((........((((....(((.....)))..))))..............(((((((((((((...)))))))))).)))...............................................))))).))))..........................................................................................................................................................................................................................................................(((((((.....................))).))))..((((((((.((((((......(((.((((((((((((((((.(((........))).)).))))))))))))))....(((....)))...))).....)))))).)))))))).......................((((.........))))............................(((..((((((((..............))))))))..)))...((....))..........................(((((....))))).............................................................................................................................................................(((((((((..................)))))))))........(((((.(((.((((..(((((((.(((..................)))..)))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))..................................................(((.((((((((...........((((((((....))))))))..........)))))))))))...((((.((((((..........))))))....................(((((((((.....))))))))).......)))).........................((((((((...(((((((((((((((((.(..(...(((((((((((((((........)))))))))))))))...)..).)))))))))))))))))..))))))))................((.(((((....))))).)).......... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......))))).........................((((((....((....((((((.....))))))......)).....))))))................(((...............((((..(((....)))))))))).......(((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........((((.......))))...............((((((((..((.((((((((((...((.((((((.....((....))...))))))(((((((.......))))))).))...((((((((..........(((...(((((.((((((.((.((((........)))).)).).)))..))........(((((((((.....((....((((...))))..))................(((((((((((((...)))))))))).)))....................................((((((...................................))))))..................................((....))..............(((((((((((((....))))).)))))))))))))))))..........(.(((((((((((((......))))))))))))).)(.(((((((((.((((............(((((((..((((....))))..)))))))............((((((((((((((...))))))))))))))...........((.......))...))))))))))).)).)((.(((((.(((((((((..(((........))).)..)))))))).)))))..))...((((((((((.....))))))))))........................(((((....)))))..............(((.........((((...(((.(((((((((((((((.(........).)))))))))..((((((.(((((.(((.....))).))))).))))))....((((....)))).....................(((((((((............(((((.((((...........................(((((((............((.(((((((((.((..(((((.........((......((..........))......)).....)))))..)).))))).))))..))............)))))))..(..((((..(((((((((((((((......)))))))).....)))))))..)))).)...((((((((.....)))))))).)))).)))))..............)))))))))........(((((((.....((.....))....))))))).........(((.((((....)))).)))...))))))..)))..)))).....))).((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......)))))..)))............))))))))(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((((((((((..((((......)))).))).)))))))...)).))))..)))..))))))))).)).)))))..)))))))))).))(((.(((((....))))).))).)))))))) |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((....((((..((((((((..((((((...........(((.(((..(((...((((((.....))))))................(((.........))).......(((((((.(.....((((((..........))))))...............(((((((.....(((((....)))))...............((((.(((..........((((...((((.......)))).)))).((..((((....(....(((.........))).)..))))..)).((((((((.......)))))))))))))))((((........)))))))))))...).))))))).(.((((........)))).))))..((......))..)))))).....(((.(((...((((.....)))).))))))))))))...........((((((...........(((((((..................(((((((........((...(((((.......((((.....((....)).......)))))))))...))........)))))))(.((((.......................(((((((((((((((((((((....))))).))))))))))))))))...((((....((((((((((((((........)))))))))))).)).)))).....))))...)..)))))))..((((...((((.(((.((((((.....(((....))).................(((.((((..((...(.(((((.......)))))....)..))..)))))))...)))))).)))..(((((((...((((......))))......))))))).........))))((((((((((.....)))))))))).........))))....((((((....(...((((.........))))...).)))))).....((((...(((.(((((((((((((((............))))))))...((((((.(((((.............))))).))))))....((((....)))).....................(((((((((...((((.((..(((((.((((...........................(((((((..(......(..((((((((((((.((..(((((.((..........(((.(((........)))))).......)).)))))..)).))))).)))).)))...).....)..))))))).....((((..(((((((((((((((......)))))....).)))))))))..)))).....((((((((.....)))))))).)))).))))).....)).))))..))))))))).....((.(((((((.....(((...)))....)))))))..)).....(((.((((....)))).)))..)))))))..)))..))))...((((((((((((..........)))))).....((((....))))...((((((((.......))))))))......))))))))))))))))).))).(..((...(((((.....(((((((((..(((..((((..(...(((((((.((..((((......)))).))..)))))))...)..))))..)))..)))))))))....)))))....))...)..(((((........))))).))))...)))))).. |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......)))))............(((.....)))..((((((((.(((....((((((.....))))))......)))))..))))))(((.....)))....((((...............((((..(((....)))))))))))(((((.(((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))...))))).......((((((((..((.((((((((((.((((.((((((....(((....)))..))))))(((((((.......))))))).))).)((((((((...((.....(((((.((((((((((((.((.((((........)))).)).).)))..)))...(...(((((((((...((((...(((((...))))).))))..............(((((((((((((...)))))))))).)))................((((((((........((..((((((.......((((.(((.((....)))))....))))))))))..))........))))))))...(((((((...(((....))).))))))).....(((((((((((((....))))).)))))))))))))))))..)......((.(((((((((((((......))))))))))))).)).(((((((((.((((............(((((((..((((....))))..)))))))....(((.....(((((((((((((((.)))))))))))))))...)))...(((((.....))))).))))))))))).)).(((.(((((.((((((((((.((((......))))))..)))))))).)))))..)))..((((((((((.....))))))))))............(....)......(((((....))))).............((((((.......((((...(((.(((((((((((((((.((.......)))))))))))(.((((((.(((((.((((...)))).))))).)))))))...((((....))))................(((..(((((((((..(((((((...(((((.(((((.......((.......))........(((((((.(......(...((((((((((((.((..(((((..((.....(((.((.((((........)))).)).)))..)).)))))..)).))))).)))).))).....)...)..))))))).(((.((((..(((((((((((((((......))))))).....))))))))..)))))))..((((((((.....))))))))))))).)))))....))..))))).)))))))))....))).((((((((((())))..........))))))).........(((.((((....)))).)))...))))))..)))..))))...))))))((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......))))))))))..........))))))))))(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((((((((((..((((......)))).))).)))))))...)).))))..)))..))))))))).)).)))))..)))))))))).))(((.(((((....))))).))).)))))))) |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....)))..(((((((((.(.....(((...........))).......))))..))))))...................................((((..((....))))))............................((((((....)))))).......................................................((((........))))............................(.....((((((((.......)))))))).).......(((.......((((....))))..(((((((...((((((........)))).))...)))..))))((((.(((((......((((((...((((.....)))).))))))............(((.((((((((.....))))))))..)))...............................................))))).))))..........................................................................((((((((((..(((.(((.(((..))).)).).)))))))))))))....(((...(....((..(((((((......)))))))..))....).))).......................(((((((.....(((....))).)))))))...................(((((.......)))))..........................(((((((..................(((((.((((((..((((((......)))).))....)))))).))))).......((((((((((.....)))))))))).)))))))....(....)(((((........((((.........)))).....)))))............((....(((..(((((((((.(........).)))))))))..)))...((....))..........))..............(((((....)))))................((((....(((((((((.....(..((.....))...................................)...(((((..................................)))))..)))))))))....))))...........(((..................)))..............(((((((((.((((..(((((..((((((..........)))))).......)))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))))..................................................(((.(((((((.(.....)....(((.((((....)))).)))...........))))))))))..((((((((((((..........))))))....(.(((....))).)..((((((((.......))))))))......)))))).................)))(.(.(((((.((...((((((((..(((..((.(..(...((((((((.(.((((........)))).).))))))))...)..).))..)))..))))))))..)).)))))..).)..........(((.(((((....))))).)))......... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((...[[[[))))).(((....))).......]]]]......(((((.[[[[[[.)))))..]]]]]].................((((((.........))))))..........((((.......(((((((....))).))))..((((((((((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))..)))))))..............)))).((((((((((..((((((((((.....[[[[.......))))))))))..(((((....)))))..]]]]......((((..[[[((((.....((((.((((......))))))))....)))).))))...]]]......((((.(((((........((((...(((((...))))).))))..............(((((((((((((...))))))))).))))............(((((.....))))).....(((.......)))..))))).))))..((((((............((((((.......((((...(((((((((((..(((((.(((....))).....(((((((((((((((((((((....))))).))))))))))))))))...((((......(((((((((((((......)))))))))))))....))))))))))))))))..........(((((((..((((....))))..)))))))..))))...(((((((((((((((((...))))))))))))).))))..........)))).......)))))).))))))..(((.(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).))))).......[[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]]...(((((...((((..(((....(((((....)))))...)))..))))((((((((..........)))))))).....[[[[[[[[[..))))).....]]]]]]]]]..((((((.(((((.((((...)))).))))).))))))...(((((....)))))...............((((((((((((((((..(((((((....(((((((((.(((..(((.....))).)))............((((((..(((((.......(((((((((....)))))))))(((....)))....((((...(((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))(((((((..(((.((((..(((((((((((((((......)))))).....)))))))))..)))))))..((((((((.....))))))))..(((...))).....)))))))...))))))))).)))))))))))))))......)))))))((((((......(((....(((.((((....)))).)))....))).....)))))))))))((((((((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......))))))))))))............))))).(((((.....(((((((((..(((..((((..(((.((((...(((..((((......)))).)))....))))...)))))))..)))..)))))))))....)))))..))))))))))...(((.(((((....))))).)))......... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((.((...........(((((((...)))).)))..(((((.(((..(((((((.....)))))))..))..))))..))..(((..............................((((((..((((....))))))))..))..))).......((((......((((((....)))))))))).((((((........((((.......))))....).)))))...(((.(.((((((..(()))))))).))))............((((..((((((....((((((((((...)))))))))))))..))).)))).........(((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..)))..(((.(((((..((...(((((...(((((...))))).))))).........((.((((((((((((((...)))))))))).)))).)).......................................))..))))).)))..))).)))..((((((((..((.....)).............(((((.(((((((...(((.(.(.(((.....((((((((((..(((((((.((..)).))).))))..)))))))))).(((((.((((((((((((((...((......))..)).))))))...............................((((((.((((......)))).))))))......(((((..(((((((((((((.....)))))))))))))...................((((((((.((((((.((...(((((((((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).)))))....(((....)))..))))..)).)))))).))))))))..(((....))).....((((....))))............................)))))...((((((..(((((((((.(((.....))))))))))))..)))...((....))..))).......................(((....)))...............).))))))))))..)))).).)))..(((((...)))))..))))))))))))..))))...))))............................((..((((....))))..)).....(((((((((((((.(((.((((...((((.((((((((((.....)))).)))))).))))))))..(.(((((((((.((((..(((((((((((((..........)))))....).)))))))..)))))).).((((((((.....))))))))....))))))).................((((..(((...))))))).............(((.((((((((..(.((((.(.((((((((....)))))))).)).))))..)))))))))))..((((((((((((.((....)).))))))...((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......)))))))))...))))).)))))))).....((((.((..((((((((((.(((..(((((.((..((((((((((.((((((....)))))))).))))))))...)))))))..))).)))))))))).)).)))).............))..((((((((....)))))))))))))))).. |
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Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((..(((.....((((((...((((((((...)))).))))..(((....))).((((((.....))))))..............((((..((.....))))))...................))))))..))).))))........((((((.(((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))...)))))).......(((((((...(..(((((((((..((((((((((....((......))..))))))))))..((((......))))........(((((((...(((((((((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((......(.((((...(((((...))))).))))).............(((((((((((((...)))))))))).)))............(((((.....))))).....(((.......)))..))))).)))).))).))))))).......((...................))...((((((......))).)))..........(((((((((((((((((((((....))))).))))))))))))))))..((((.((((((.((((((((((((......)))))))))))).(((.(((((((((.((((.......((((.(((((((..((((....))))..))))))).)))).(((((.((((((((((((((...)))))))))))))).)))))...(((((.....))))).))))))))))).)).)))..((((.(((((((((..((((......)))).)..)))))))).))))........((((((((((.....))))))))))......(....((....)).....)((((....))))...........................((((...(((.((((((.((((((((.((.......))))))))))...((((((.(((((.((((...)))).))))).))))))....((((....))))................((((.(((((((((..(((((.((..(((((.((((........(((.....)))........(((((((............((((((((((((.((..(((((.((........((((....(........)))))........)).)))))..)).))))).)))))))((((....)))).))))))).(((.((((..(((((((((((((((......)))))).....)))))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).)))).))))).....)).))))).)))))))))...)))).(((((((..((.(((...)))))..))))))).........(((.((((....)))).)))...))))))..)))..))))...(((((.((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......)))))))).......))))).)))))).))))..))))))))).(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((((((((....((((......))))....))))))))...)).))))..)))..))))))))).)).)))))..)))))))))..)..((.(((((....))))).))..))))))). |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((...))((((((.(((..(((((((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((........)))...))(((......(((.......(((..(...((....(((((............(((.......(((.....)))...).....)).((.....((.(((......)))))))(.((((((((.......((((.......))))...)).)))))).).....(.((((........))))).)))))...)).)..))).((...(.(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).)))))))))).(((..(((((((...((((...))))).))))))).).....((..(((((((((((((...)))))))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...((((((.((((.....(.(((..(((...(.....(((..(((((......))....)((.(.(......))))))))).(...)....).....((((.(((((.......)))))..)))).............((((((((.......((...((((...))))(((....))).....))......)))))..))).........(((((((((.................))))).))))(((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((.......((((....(...)))))....)))))))....))(...)((.((((((..((((((((.((((...)..)))))))))))..)))...((....))..))).....))..))(((.(((((..((((....))))...)))...........((.((((((((((((.....))))((((.(((((...((..(((.(..(...)(....)..((((...(((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))..)))))))((...))(((((...(((((..((....))..)).((......))...)))))))).(.(((((.(((.((((..(((((((((...((...............))))).))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))).......))))....))((((..((.....)))))).)).)))).))).(((.(((((((.....(((....(((.((((....)))).)))....)))....))))))))))...((((.((((((..........))))))....(((((....)))..(((((((((((.....)))))))))...)))))))))))))))))).....)).)))..(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................((((((((((..............................((((((.....))))))............................................................(......)........((((((.(((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))...))))))...................................(((((......(......)....))))).........................................((((((.(((........(((.....((((........))))......)))......((((.(((((........((((...(((((...))))).)))).................(((((.((((...)))).)))))................(((((.....)))))....................))))).)))).))).))))))................)))))))))).....................................(((((..((((((((((((((....))))).)))))))))..)))))....((....((.(((((((..((((......))))..))))))).))..)).......................(((((((..((((....))))..)))))))............((((((((((((((...)))))))))))))).......................................((((..((((.(((((((.......................))))))).)))).(((.(((....))).)))....((((((.(((..(((((....((....)).....)))))..(((((......(((((((..((((.........((((...(((.(((((((((((((((.((.......))))))))))...((((.(.(((((.((((...)))).))))).).))))....((((....))))...((((..............(((((((((..((((......(((((.((((........(((.....)))........(((((((........(((...((..((...(..(((......)))..).......))..))..)))......((((...(((..(((((.((((.....))))..)))))..)))))))..))))))).(((.((((..(((((((((((((((......)))))).....)))))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).)))).))))).........)))).))))))))).........((((((..((.(((...)))))..))))))...))))...(((.((((....)))).)))..)))))))..)))..)))).....)))))))))))............))))).((((((....))))))..(((((((.......))))))).))).))))))..))))....................(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((((..((....((((......))))....))..))))...)).))))..)))..))))))))).)).)))))................((.(((((....))))).)).......... |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((.(((....((((((((..(((((((.....))).))))......((..(..((((((.....))))))..((((.......((((((.........))))))......)))))..))..)))))))).))))))))........((((((((((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))..)))))))......((((((((..((.((((((((((..((((((((((....(((....)))..))))))))))..(((((....)))))........(((((((...(((((((((.(((.....((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((..((...(((((...(((((...))))).)))))............((..((((..((((...))))..))))........................((((......))))..)).....))..))))).)))).))).))))))....))).(((.....))).....((((((((((((((((......))).)))).).)))))))).(((((....((((.......((((((((..((.((((((...(((((....))))).((..(((..((((......))))..)))..))(((.(((((((...((((............(((((((..((((....))))..)))))))...((((.....((((((((((((((...))))))))))))))...))))..(((((.....))))).))))..))))).)).)))..((((.((((((((...((((......))))....)))))))).))))))))))..))..))))))))...((((((.(((.((((((....((....)).....)))))).((((((.(((((((((((..((((...((((..((((...(((.(((((((((((((((.((.......))))))))))...(((..(.(((((.((((...)))).))))).)..)))....((((....))))...((((..((((........(((((((((..((((..((..(((((..((((.......(((.....)))........(((((((....(((.(((...((..((((((..((((....))))..).)))...))..))..))))))..(((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..)))))))).))))))).(((.((((..(((((((((((((((......)))))).....)))))))))..)))))))..((((((((.....))))))))))))..))))).....))..)))).))))))))).....))))((((((..((.(((...)))))..))))))...))))...(((..(((....)))..)))..)))))))..)))..)))).)))))))))))))))....))))...)))))).((((((....)))))).((((((((.......))))))))))).))))))..))))....)))))...))))))).(((((.((..(((((((((..(((..((((..((..((((..((....((((......))))....))..))))...)).))))..)))..))))))))).)).)))))..)))))))))).))(((.(((((....))))).))).)))))))) |
