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UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAAUAAAUUUAUAUUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGAUCUACGUGACAUAUUCUUUACUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAAAAAACCCAAACUUACGAAUGGGUGCACUUAUUAGAUAAAGCCAACGCUGGGUAAAACCAGUUUCCCUUGGUGAUUCAUAAUAAUUUAGCGGAUCGCAUGGCCUUGUGCUAGCGACAGUCCACUCGAUUUUCUGCCCUAUCAUGGUUGAGAUUGUAAGAUAGAGGCUUACAAUGCCUACAACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUGCAGGGCCUUUAAGGUCUUGCAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGUCCGUAGUCAAAUUUUAGCCUUUAGAUGAGGUGGCCUGGUCUUCAUUGAUCAAGCUCGCUUUUAUCGAGGCUUUUUUUCUGGUUAUGCUAUGAAUAGCUUCGGUUGUUUAUAGUCUCUAGCCAGAUGAUUACCAUGAGCAAAUCAGAGUGUUUAAAGCAGGCUUUCAAGCUUGAAUGUGUUAGCAUGGAAUAAUGAAAUAUGACUUUAGUCCCUAUUUCGUUGGUUCAGGAACUUAAGUAAUGAUGAAUAGAAACGGUUGGGGACAUUUGUAUUUGGUCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUGACCGAAGACAAACUACUGCGAAAGCAUUUGAUCCAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGGUCUAAAGUUAAGGGAUCGAAGACGAUUAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCACAAACUAUGCCGACUAGAGAUUGGGCUUGUUUAUUAUGACUAGCUCAGCAUCUUAGCGAAAGUAAAGUUUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGGACGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAAAGCUCUUUCUAGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACCUUAUUCUGCUAAAUAGGCAGGUCAACUUUUUAGUUGAUUAAUAGAUUUAUCUAUCUGGCUUCUUAGAGAGACUAUCGGCUUCAAGCCGAAGGAAGUUUUAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUGAAAUCAGCGAGUUUAUAACCUUAGCCGGAAGGUUUGGGUAAACUUUUGAAAUUUCAUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGUAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGUUAUAGUGAGCAUAUGGGAUCAGUAGAAUUAGGUUGGCAACAACCUUUCUCUGCAGAGAACUAUGGCAAACUAGGCUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
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Afold
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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...(((((.......)))))..........................(((((((((.......((((..........))))........)))..))))))....................................(((((..........)))))..........((((((.((((......(((((..(....)..))))))))).))))))......((....(((........)))........))......................((((..(((.....))).))))...................................((((((((.......))))))))...................(((......)))...((((((..((.((((........)))).))...)))..)))...................((((....((((...))))..))))..............(((((((((((((...)))))))))).)))..........................................................................................................................................................................................................(((((((......)))))))....................................................................................(((((((((((((....))).))))))))))...................((((((((.((((((......(((.(((((.((((((((.....................)))))))).)))))....(((....)))...).)).....)))))).))))))))....................................................................(((..(((((((((((......)))))))))))..)))..((....))..........................(((.((....))))).........................((((((..........................................................................................................))))))..........................................................(((((.(((.((((..((((((((((((....................)))))))..)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))......................................................((((((((....(((.......((((((((....))))))))....))).....))))))))......((((.((((((..........))))))....................((((((((.......)))))))).......)))).........................(((((.((...(((((((((.((((((((((..(...((((((((((((((((......))))))))))))))))...)..)))))))))))))))))))..)).)))))...............(((.(((((....))))).)))......... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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...(((((.......)))))..........................(((((((((......((((((((....)))))))).......)))..)))))).......(((....)))...................(((((..........)))))..........((((((..(((......(((((..........))))))))..)))))).....(((((.(((((......))))).....)))))((((...............))))..........................((((((((((((.(((.............((((((((.......)))))))).........)))....)))))))).))))....((((((((.((.((((........)))).)).).)))..))))..................((((...((((......))))))))..............(((((((((((((...)))))))))).)))......((((.......((((((((((..(((((..((((((.......((((.(((.((....)))))....))))))))))((((..........))))...((((.(((((((((...(((((((...((((((..(((((((((((.(((((......))))).)).))))).)))))))))).....((((((((.((((((((((((....))))))))))))...))))))))......(((((............................(((....))).........)))))....................(((((((..(((((.(((((...((....)).....)))))...))))).))))))).(((((.((((((((...(((........)))....)))))))).))))).............)))))))...))))))))).)))).....)))))...))))))))))...(((((.........)......))))...(((.(((((.(((...((.(((((((((((.(((......))).)))))))..)))))).....))).))))).)))........(((((((...(((((((.(((((.....................((((.((((.....)))).))))((..................................(((((((((.....((((.....(((((.....(((((.....((..(((.(((((((........))))))).))).))..))))).....))))).....................(((((....(((((.....)))))(((((((....)))))))..(((((....)))))...(((((..........(.((((((...)))))).)))))).............)))))........))))....).))))))))))....((((..(((.(((((((((((.(((((((...(((.((((....)))).)))))))))))))..)))))))))))((((((((((((((.(......).))))))..........))))))))...))))......))))))))))))...))).))))........))))..............((((.((...(((((((((.((((..((.(((((..((.(((((...((((((....))))))...))))).))...)))))))..)))))))))))))..)).))))...............((((((((((....))))))))))........ |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
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...(((((.......)))))............((((.....(....(((((((((.(((..((((((((....))))))))..))..))))..))))))......((((....))))).....))))......(((((((..((....)))))))))........((((((..(((......(((((..(....)..))))))))..)))))).....(((((.(((((......))))).....)))))(((((.(((....)))..)))))......((((((.(..)((((.....((((((((((((((((.......((((.(((((((((.......))))))))..)..))))))))...)))))))).))))....((((((((.((.((((........)))).)).).)))..))))....((....))......((((...(((((...).))))))))(((((.........(((((((((((((...)))))))))).)))....(.((((((.....((((((((((..(((((..((((((.......((((.(((.((....)))))....))))))))))((((..........))))...((((.(((((((((...((((((((((((((((..(((((((((((.(((((......))))).)).))))).))))))))))..((.((((((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))))).))...((((((.....)............((....))(((((())))))..(....))))))......)))...........(((((((..(((((.(((((...(((()))).....)))))...))))).))))))).(((((.((((((((((.((((......))))))..)))))))).))))).....((....)))))))))...))))))))).)))).....)))))...))))))))))..((((((((........)))...)))))(((((.(((((.(((((.((.(((((((((((.(((......))).)))))))..))))))))...))).))))).))).))...(((((((((...(((((((.(((((.((((....(((((((((...((((.((((.....)))).)))).))..)))))))...........((....)).....(((((((((((..(((((((((((((((.....(((((..(..((..(((.(((((((.((())).))))))).))).))).))))).....))))).)))))..............((((((....(((((.....)))))(((((((....)))))))..(((((....)))))..((((((((((.....)).((((((...))))))))))))))............)))))).......))))).))).))))))))......(((((.(((.(((((((((((.(((((((...(((.((((....)))).)))))))))))))..)))))))))))((((((((((((((.((....)).))))))..........))))))))..)))))))))..))))))))))))...))).))))).)...)))))).).......)))))((((.((..((((((((((.((((..((.(((((..((.(((((...((((((....))))))...))))).))...)))))))..)))))))))))))).)).))))...))))..))))))((((((((((....))))))))))........ |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....)))..((((..(((.......(((((........)))))........)))....))))....................................(((((..((....))))))).................((((.....(.((((..........)))))))))((((((......((((....(..........)........))))......)))))).........((((..(((.....))).))))...................................((((((((.......)))))))).........(((.......((((....))))..((((((((..((((((........)))).)).).)))..)))).........((((...((((((...(((((...))))).))))))............(((((((((((((...)))))))))).)))....................................((((((...................................))))))................................................((((((..(((((((((((.((((........)))).)).))))).)))))))))).....((.((....(((((((((.((....)).)))))))))......)).)).......................((((((.................)))))).............(((((((((((((......).))))))))))))..................(((((((..((((((......((((..(((.((((((..((((((......)))).))....)))))).)))......(((....)))..)).)).....))))))..))))))).........((((((....(...((((.........))))...).))))))...........((....(((..(((((((((((......)))))))))))..)))..((....))..........))...........(..((.(((....)))))...)............((((....(((((((((........................................................(((((..................................)))))..)))))))))....)))).....((....((((................))))....))........((((((....((((..(((((((((((((....))))))))................)))))..)))).....((((((((.....))))))))....))))))...................(((...........))).......))))...(((.(((((((.....(((.......(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))..(((((((((((............)))))....(.(((....))).)..((((((((.......))))))))......)))))).................)))(.(.(((((.((...((((((((...(((..((((..(...(((((((((.(((((((....))))))).)))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).)))))..).)..............(((((....)))))............. |
|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((...))((((((.(((..((((.(((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((.........)))...))(((......(((.......(((.....(((....(((((..............(((....)..(((.....))).........)).((......((((((((....))))))))))(.((((((((....((((........................))))...)).)))))).).....(.((((...((.....))..))))).)))))...)).)..)))(((......(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).))))))))))...(..(((((((...((((...))))).))))))).(.....((..(((((((((((((...)))))))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...((((((.((((.....(.(((..(((.........((..(...(.(((...(...((.....))....(...).)).)))))).(......).........((((.(((((......)))))..)))).................((((((((.......((...((((...)))).((......)).....))......)))))..))).........(((((((((.(................))))))))))(((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..)).))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))....))))..(((.((((((..(((((((((((......)))))))))))..)))..((....))..))).....)))..((((.((.((((((.((....))))....................((((((((((((.....))))((((.(((((..............((((((....))(((((...(((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))..))))))))...((((((((...(((((..((....))..))(((......)))..)))))))....(((((.(((.((((..(((((((((...((....................))))).))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))........))))))))..((((..((.....)))))).)).)))).))).(((.(((((((.....(((.......(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))...((((.((((((..........))))))....(((((....)))..(((((((((((.....)))))))))...))))))))))))))))))))...)).)))).(((((((.((..(((((((((...(((..((((..(...(((((((((((((((........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((.(...).)))).((((.(((((((..((((........(((((((((.((....(((((........)))))......)))))..))))))((((....(((......((....(((((........(((((..((....))))))).................((((......(((((..........)))))))))((((((((....((((........................))))...)).)))))).......(.((((...((.....))..))))).)))))...))....))).((......(((....((((((((.......)))))))))))......((((((((((((((....))))...))))((..((.((((........)))).))...))........((.((....))))...))))))..(((((...))))).))................(((((((((((((...)))))))))).))).)))).((.................))))))....((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))))))))))))))...(((((((.((......(.((...(((((.....((((..(.((((....(((....(..(.......)).))).))))......))))).............(((.(((((......)))))..))).....................((....).........)(((((.......((......))..))))).........................(((((((((.(................))))))))))..(((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))))....(((....)))..)).))..)..)))))))))))))...)).)....(((((((.......((((.........))))....))))))).....))...((((((((((..(((((((((((......)))))))))))..)))..((....))..))))....)))..((((.((.(((.((.((....)))).....................((((((((((((.((.((((((((...)))))...(((...))))))(((....)...))....))(..(((((............(((..(((......)))..))))))))..)))))))))..((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))...(((((((((.((((..(((((.(......)...................((...)).)))))..)))))))..((((((((.....))))))))....)))))).........)))......((((..((.....)))))).........((..(((.(((((((.....(((.......((((((((....))))))))....)))......))))))))))..((((((((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......))))))))))))..)))...)).))))..((((((.((..(((((((((...(((..((((..(...(((((((((((((((........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).)))))....)))))))))))(((((((((....)))))))))......... |
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PPfold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((.........)))..(((.(((((((.((((...)))...(((((((((.(..(......).((...........))....))))..))))))........(((......((....(((((..............(((....)....(.....)...........))(((......(((((..........)))))))).((((((((....((((........................))))...)).)))))).......(.((((...((.....))..))))).)))))...))....))).((...(..((.....((((((((.......)))))))).))......(((((((((((((......)))...)))).......((((........)))).((....(....)..))..(......).....))))))...((((...))))).))......).........(((.(((((((((...)))))))))..)))......((.................)).........(((((((((....(((....)))..))).(((.....)).))))))).))))))))))....(((((((.........))((....((((.((.....(..((.(((....((.....(..(.......))..)).)))..)))..)..........)......(((..((((......))))...)))....................(((....).........)).......((..((......))............))..................(((((((((.(................))))))))))..(((........((((......((((..(((.(((((((...(((........)))......))))))).)))......(((....)))..)).)).....)))).)))))))....))......((((((........((((....(...))))).....))))))...........((.((.(((...(((((((.((......)).)))))))...)))..((....))...)).....))....(((((..(((.((..(((..........(.....).......(((....(((((((((((.(((.((((...))))....(((...))))))((.........))....))...(((((............(..........)..........)))))..)))))))))....)))(((...((..................((......))....)))))...(.(((((.(((.((((..((((..(......).................((((...))))))))..)))))))....((((((.....)))))).......)))))...........)......((((...(.....).)))).....))).((..(((.(((((((.....(((.......((((((((....))))))))....)))......))))))))))...((((..(((((..........))))).....(.(((....))).)..((((((((.......)))))))).......)))).))))....)))...)).)))..((.((((.((...((((((((...(((..((((..(...(((((((((((((((........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).)))).....)).))))))))(((((((((....)))))))))......... |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.(((((((.......(((.(((((((.(((((.......(((((((((.(....((((((((....))))))))......))))..))))))..........((((((.....))))))....((((((((((..........)))))))....))).((((((..(((......(((((..........))))))))..)))))).......(((.(((((.(...)))))).....)))(((((((.(((....)))..))))))).(((({{{{{))))..............((((((((.(((.............((((((((.......)))))))).........)))....)))))))).........(((((((...((((((.(.....))))).))...)))..)))).((.((....))))..((((((...(((((...).))))))))))............(((((((((((((...)))))))))).))).................((((((((((..(((((.....(((.......((((((((.((....))))))...)))))))(((((((..........)))))))((((.(((((((((...(((((((((.((((((..(((((((((((.(((((......))))).)).))))).)))))))))).....((((((((.((((((((((((....))))))))))))...))))))))....(((..(((.....)))..))).......((((((....)))))).((((....)))).........)))..........(((((((..(((((.(((((................)))))...))))).))))))).(((((.((((((((((.(((((...).))))))..)))))))).)))))....(((....)))))))))...))))))))).)))).....)))))...)))))))))).....(((((........)))))......(((((.(((((.(((((.(((((..(((((((.(((.(...)))).)))))))..)).)))))...))).))))).))).)).))))).))))))).))).......(((.........(((((...((((((((.((((.....)))).(((...))).(((((((.........((((....)).)).(((((...........)))))..)))))))...))))))))..)))))..[[[[[[[[[[[[[[..........(.(((((((((((((((.....)))).)))))....)))))))(((((((((.(((((.....)))))(((((((....)))))))..(((((....)))))....(((.<<<<<<......((((((...))))))...)))>>>>>>...)))..))))))(((..((((..(((...)))))))..))).........((.(((((((((((.((((((...((((.((((....)))).))))))))))))))..)))))))))(((((((((((((((..........))))))..........)))))))))..[[[[[[[[..)))]]]]]]]]...................]]]]].]]]]]]]]]....((((.....((((((((((.((((..((.(((((.....(((((...((((((....))))))...)))))......)))))))..))))))))))))))....)))).........}}}}}...((((((((....)))))))))))))))))) |
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RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((...........))).....................((((...((((((..................................(((....(((((.........................................(((....)))(((.....))))))))..(((..((......(((((..........)))))....((((((......((((........................))))......))))))...........))...............((((...........................(((....((((((((.......)))))))))))....((((((...(((((((....))))...)))(((...((((((........)))).))...)))......((((.(((((......((((((...((((.....)))).))))))................(((((((((...)))))))))....................................................))))).)))).(((((...((.....)).(((.....))).............))))).........)))))).)))).........................................................................................................................................)))......))).((......))............)))))).............(((...............(((...................(((((((..((((((............(((.((((((.....((((......))))......)))))).)))......(((....)))............))))))..))))))).........(((((((.......((((.........))))....)))))))....)))...(((....(((..(((((((..............)))))))..)))..((....))..........)))...(((.((.((((....(((((..((.........))...))).))(((((((..(((..((.((((.((.(((((((((....(((((.....(((....)))((((........(((((.((.....((.(((.(....).))).))....)))))))..))))((.((((..((((((.......(..((....))..)..((......))......)))))(((((....(((.((((...(((......................................)))...))))))).........................((.....)).......))))))..))))))...)).))).))))))))).))...)))).))(((((((.(.....).......((..((((....))))..)).............))))))))))..(((((((((((............)))))...((.(((....))).))....(((((.......))))).........)))))))))))))))))...)).))))))..((((.((....(((.(((...(((..((.(..(...(((((((.....((((......)))).....)))))))...)..).))..)))..))).)))...)).))))..))))..............(((((....)))))............. |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))......(((((..(((.....)))...((...))........)))))......................((((.((((((...............(((.....))).........(((((..((....))))))).......))))))....((((......(((((..........)))))))))((((((((....((((........................))))...)).)))))).........))))..............(((((..................................((((((((.......)))))))).......((((((..((..((((....))))(((((((((...((((((........)))).))...)))(((...((((.(((((..((..((((((...(((((...))))).))))))............(((((((((((((...)))))))))).)))...........................................))..))))).))))..(((((((((.....((((((((................((((((.(((((((.....(((....)))........................................................................................................................................((((((...((..........))..)))))).))))).)).)))))).....(((((................(((((((..............(((((((....................(((.((((((..((((((......)))).))....)))))).))).........((((((((((......)))))))))).)))))))...((....))....))))))).((((.........))))...)))))..((.....(...(((....(((..((((((((............))))))))..)))..((....))..........)))...).))))))).))).))))..)))))...)))...))))))..))(((((((..(((..((.((((.((.((((((.................(((....))).(((((.(((..(((((..((((..((............))..))))....)))))..))).((.((((((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..)))))))..(.(((((((((.((((..((((......................................))))..)))))))........((.....))..........))))))).......))))....))))))........))))))))))).))...)))).))(((((((.....(((.......(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))..(((((((((((............)))))...((.(((....))).)).((((((((.......))))))))......))))))))))))).........))))))...((((.((...((((((((...(((..((((..(...((((((((.((.((((......)))).)).))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).))))...)))))............(((((....)))))............. |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.(((....((((((........((((.(..(((((((((((((((..((..((((((((....))))))))..))...)))..))))))..............))))))..).))))........)))))).))))))))).))))........(((((....(((......(((((..........)))))))).((((((((....(((((.(((((......))))).....)))))...)).)))))).))))).((((.....(((((((....(((((......((((......(((((......(((....((((((((.......)))))))))))......)))))...((((.((.((((....(((((((...((((((........)))).))...)))..)))).((.((....)))).....))))))))))....))))..(((((((((............(((((((((.....)))))))))...((..((.((((((.....((((((((((..(((((.(((((((.......((((((((.((....))))))...)))))))))))..............(((...((((.(((((((((..(((((.(((((((((((..(((((((((((.(((((......))))).)).))).)))))))))))......((((((((.((((((((((((....))))))))))))...))))))))......(((((.(((.....((((....((((....))))...)))).....)))...))))).....)))))).)))))...(((((((..(((((.(((((...((....)).....)))))...))))).))))))).(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))))....(((....))).........))))))))).))))..))))))))...)))))))))).((..(((((........)))))..))....(((.(((((.(((((.(((((..(((((((.(((......))).)))))))..)).)))))...))).))))).))).....((((((((((...((((((((.((((.........((((((((.(..((((.((((.....)))).)))).).).)))))))((((......(((....)))....(((((((((((..(((((..(.(((((((....(((((.....((..(((.(..((((.(....).))))..).))).))..)))))...((((((((....((((...................((((.((((..((.(((.((((((....))))))...(((((....)))))))).))..))))))))....(((((.....))))).))))...)))))))).....))))))).)...))))).))).))))))))....((((........(((((((((((.((((((...((((.((((....)))).))))))))))))))..))))))).((((((((((((((((.((....)).))))))..........)))))))))).)))).)))).))))))))))))...))).))))..))).)))))).))...)).))))))))).((..((((((((((.((((..((.(((((..((.(((((...((((((....))))))...))))).))...)))))))..)))))))))))))).))........))))).)))))))(((((((((....))))))))).)))).... |
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RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((...(((((.....((((((.(((((((......((((.((((.((((.((....(((((.....................................................................................................................................................................................................................................)))))......))))))...)))).........)))).((((((....((........((((...(((....))).))))..))..)))))).....((((....(((((............)))))(...((((((((......((((...((((....))))......))))...)).)))))).)...(((.((((.((.....)..)))))......((((...((((((.((((((.(((.....(((((((.......))))))).)))...))))))...))))))....))))))).((((...((.((((((........)))).))...))...)))))))))))))))...)..((((...((.(..))).)))).(.................(....))......(.((....((((...(.(...)...)))).).)).....).((....(((((.....(((((((((.((......(.(((.((((((((.......))))....))))..........)))).)).......(.....(((.(((...........).))...)))........)....))))))).....(((...((((....((.(((......)))............))...)))).)))..(...((((((((..((......))........)))))))).)(((((((...(((((..........((((...(((.((.((((((......)))).))...))))))))).....)))))...)))))))((.(((.....((.(((((....))))).....)).)))...))...((((((..(...(((.((((((..((((((((...............))))))))..))).............))).....)))...).......)))))).))..))))).)).....................................................))))).....)))))......))))))).(.(((......((((((....((...((....)).)).))))))(.(((((.((.(..(((((..........................)))))..))))))(.((((((((.....))))))))...))).............(((((((..((((...((...)).))))....)))))))((((((.....(((......((((((((....))))))))....)))......)))))).......(((((((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......)))))....................)..(((((((...((((((((..(((..(((..(.((((((((((((.........))))))))))))...)..).))..)))..))))))))..)))))).)..))).......)(.((((((....))))))).......... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((.(((...(((((...((((.((.....))..))))...(((..((..((((((((....))))))))..))...)))...)))))..........(((((((.....(((((...............................................(((.......(((............))).))).............((((..(((((......)))))........(((((((.(((....)))..))))))).))))...((((..((.....(((.........................................................................................(((...((((((........)))).))...)))..))).....))..))))..............(((.....)))....................(((((((((((((...)))))))))).)))......(((((.......(((((((((..(((((....................................................................................((((((........(((((..(((((((((((.(((((......))))).)).))))).)))))))))......((((((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))))).))))))..............................................................................................................(((.((...((((............((((.((((((((....(((......))).....)))))))).)))).....(((....))).............))))...)).)))..)))))...)))))))))................................(((.(((((.(((((.((.((..(((((((.(((......))).)))))))..))..))))...))).))))).)))........(((((((...((((((..(((((.........(((((((.....((((.((((.....)))).)))).....)))))))((((......(((....)))....(((((((.(((..(((((..(.((((((...................(((.(..((((........))))..).)))..............................................................(..(((((((....)))))))...(((......)))...).................((((((...))))))......................)))))).)...))))).)))..)))))))......(((((.....(((((((((((.((((((...((((.((((....)))).))))))))))))))..))))))).((((((((((((((((.((....)).))))))..........))))))))))))))).)))).))))).))))))...))).)))).......))))).........)))))((((.((..((((((((((.((((..((.(((((..((.(((((...((((((....))))))...))))).))...)))))))..)))))))))))))).)).))))....)))))))..))).((((((((....)))))))).))))))... |
|
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.(((....((((((........((((....(((((((((((((((..((..((((((((....))))))))..))...)))..))))))..............))))))....))))........)))))).))))))))).))))........(((((.............(((((..........)))))....((((((((....(((((.(((((......))))).....)))))...)).)))))).))))).((((.....(((((((....(((((......((((......(((((......(((....((((((((.......)))))))))))......)))))...((((.((.((((....(((((((...((((((........)))).))...)))..)))).((.((....)))).....))))))))))....))))..(((((((((............(((((((((.....)))))))))...((..((.((((((.....((((((((((..(((((.(((((((.......((((((((.((....))))))...)))))))))))..............(((...((((.(((((((((..(((((.(((((((((((..(((((((((((.(((((......))))).)).))).)))))))))))......((((((((.((((((((((((....))))))))))))...))))))))..(((.(((((((((.....((((....((((....))))...)))).....))))..))))))))..)))))).)))))...(((((((..(((((.(((((...((....)).....)))))...))))).))))))).(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))))....(((....))).........))))))))).))))..))))))))...)))))))))).((..(((((........)))))..))....(((.(((((.(((((.(((((..(((((((.(((......))).)))))))..)).)))))...))).))))).))).....((((((((((...((((((((.((((.........(((((((.....((((.((((.....)))).)))).....)))))))((((......(((....)))....(((((((((((..(((((...((((((((....(((((.....((..(((.(..((((........))))..).))).))..))))))))))))).((......))........((.((((((..((((.((((..((.(((.((((((....))))))...(((((....)))))))).))..)))))))).(..(((((.....)))))..).................)))))))).....))))).))).))))))))....((((........((((((((....((((((...(((..((((....))))..))))))))).....)))))))).((((((((((((((((.((....)).))))))..........)))))))))).)))).)))).))))))))))))...))).))))..))).)))))).))...)).))))))))).((..((((((((...((((..((.(((((..((.(((((...((((((....))))))...))))).))...)))))))..))))..)))))))).))........))))).)))))))(((((((((....))))))))).)))).... |
