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UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGCAAGUAUGAACUAAUUCGAACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUGUUUGAUGGUACGUGCUACUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCAACAAACCCCGACUUCCGGGAGGGGCGCAUUUAUUAGAUAAAAGGCUGACGCGGGCUCCGCCCGCUGAUCCGAUGAUUCAUGAUAACUCGACGGAUCGCACGGCCCUCGUGCCGGCGACGCAUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGGGGCCUACCAUGGUGGUGACGGGUGACGGAGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACCGGGCGCUUUAGUGUCUGGUAAUUGGAAUGAGUACAAUCUAAAUCCCUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUUAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGACCUUGGGCGCGGCCGGGCCGGUCCGCCUCACGGCAGGCACCGACCUGCUCGACCCUUCUGCCGGCGAUGCGCUCCUGGCCUUAACUGGCCGGGUUCGUGCCUCCGGCGCCGUUACUUUGAAGAAAUUAGAGUGCUCAAAGCAAGCCAUCGCUCUGGAUACAUUAGCAUGGGAUAACAUCAUAGGAUUCCGGUCCUAUUGUGUUGGCCUUCGGGAUCGGAGUAAUGAUUAAUAGGGACAGUCGGGGGCAUUCGUAUUUCAUAGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUGAAAGACGAACAACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUGGGGGCUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUCUCAACCAUAAACGAUGCCGACCAGGGAUCGGCGGAUGUUGCUUAUAGGACUCCGCCGGCACCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGGGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGCAAGGAUUGACAGACUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAACUAGCUAUGCGGAGCCAUCCCUCCGCAGCUAGCUUCUUAGAGGGACUAUGGCCGUUUAGGCCACGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCGCACGCGCGCUACACUGAUGUAUCCAACGAGUAUAUAGCCUGGUCCGACAGGCCCGGGUAAUCUUGGGAAAUUUCAUCGUGAUGGGGAUAGAUCAUUGCAAUUGUUGGUCUUCAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCGCGAGUCAUCAGCUCGCGUUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAGUGUUCGGAUCGCGGCGACGGGGGCGGUUCGCCGCCCCCGACGUCGCGAGAAGUCCAUUGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUG |
Reference structure (ext) |
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Afold
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[ FASTA input ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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...(((((.......))))).................................................................................................................(((((..........)))))...................((.....(((((...........)))))))...................................................................((((..(((......))).))))..................................((((((((.......))))))))...................((((....))))....(((((..((.((((........)))).))...)))..))....................((((....((((...))))..))))..............(((((((((((((....)))))))))).)))....................................((((((...................................)))))).....................................................................................................................(((((((......)))))))............................................................................................((((((((...................))))))))....(((((...................(((((.((((((((.....................)))))))).))))).......(((((((((.......)))))))))..)))))........................((((.........))))............................(((..((((((((...............))))))))..)))...((....))..........................(((((....)))))........................((((((((........................................................................................................)))))))).........................................................(((((.(((.((((..((((((((((((......)))))))..)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))).................................................((..((((((((....(((.......((((((((....))))))))....))).....)))))))).))..(((((.((((((..........))))))....................(((((((((.....))))))))).......)))))....................(...((((((((...(((((((((((((((((((..(...((((((((((((((((........))))))))))))))))...)..)))))))))))))))))))..))))))))....)..........(((.(((((....))))).)))......... |
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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...(((((.......)))))....(((((((.((...............)).)))))))...(...(((....)))...)...............................................(((((((...(((((((.((....)).))))..)))....)))))))......((((.......)....))).........................((((((...)))))).((((((.(((...........))).)))))).......................................................((((((((.......))))))))......((((((((((((...............((((((((.((.((((........)))).)).).)))..))))........................(((((.....(((((..(((.............(((((((((((((....)))))))))).))).............)))..))))).....)))))........(((((.(((.((((((.((.((((((.....(((((.((((((.(((.....(((............)))......))).)))))).)).)))))))))((((....)))).......)).))))))))).))))).........(((((.(.((((..(((((((......)))))))..)))).).))))).)))))....................................((((((((((((((((....((.((((((.(((((((....))))))).)))))).))................((((((((.((((((..........(((((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).)))))....(((....)))(((.....))))))))).))))))))..............(((((((((((((.........))..............................(((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...............)))))))))))....................((((((...........................(((.....)))(((((((.................................)))))))..............(((.(((((.....(((((.........(((.(((((((........))))))).))).....))))).....)))))..)))....................))))))(.((((..((((((((((((......)))))))..)))))..)))).)......(((((.....)))))..................(((....)))...................(((((....)))))...))))))))))))..)))).....((((((.((....)).))))))..............(..((((..(((((((..................))))))))))).)......((((.(((((((((.....))))))))).)))).......................))))))).(((((.((..(((((((((..(((..((((..(...((((((((.(((((((((....))))))))).))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).)))))..............((((((((((....))))))))))........ |
ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))....(((((((.((.((.........)).)).)))))))..(((.((((....)))).)))((..(((((.................)))))))..((((((.....(((((((.(((((((((.((....)).))))..))).)).)))))))))))))(((((.....)....)))).........................((((((...))))))(((((((.(((...........))).)))))))(.((((......)))))........(((((.(((((((..((..((.(((..(.((((((((.......)))))))).).))))).))(((((((......(((((....((((((((.((.((((........)))).)).).)))..)))).....................((.(((((.....(((((..(((.....(...((..(((((((((((((....)))))))))).)))..))...).....)))..))))).....))))).....)).(((((.(((.((((((.((.((((((.....(((((.((((((.(((....(((((.(.......)))))).....))).)))))).)).)))))))))(((((()))))).(....))).))))))))).))))).)))))..((((((.(.((((..(((((((......)))))))..)))).).))))))))))))).....))))))).)))))(.........).....((((((((((((((((...(((.((((((.(((((((....))))))).)))))).)))..(....).......((((((((.((((((.((...(((.(((((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).))))).((.(((....))).)))))..)).)))))).))))))))...((....))..((((((((((((((.........)))....(((..................))).(((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...((....)).....))))))))))).............((....))((((.............((((((........(((.....)))(((((((.............(((.....))).........)))))))............(((((((((((.((..(((((..((.....(((.(((((((.((())).))))))).)))..)).)))))..)).))))).))))))))))))............))))(((.((((..((((((((((((......)))))))..)))))..)))).))).((.(((((.....))))).))(((((((((((....((((()))))...).)))))))).))..((((((....))))).).))))))))))))..))))..((.((((((.((....)).)))))).))........(((((.((((..(((((((.((.((((()))).))).))))))))))))))))((.((((.(((((((((.....))))))))).)))).)).......................((.(.(((((.((..(((((((((..(((..((((..(...((((((((.(((((((((....))))))))).))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).)))))..).))........((((((((((....))))))))))........ |
DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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.................................(((.....)))..(((((.(((.......((((..........))))........)))...)))))..................................(((((..((....))))))).................((((.....(((((..(.....)..))))))))).................................................................((((.((((......))))))))..................................((((((((.......))))))))...................((((....))))...((((((...((((((........)))).))...)))..))).................((((((...((((.....)))).))))))............(((((((((((((....)))))))))).)))....................................((((((...................................))))))................................................(((.((((((((((((((((((......)).)).)))))))))))))))))...(((((.(...((((((((((((......))))))))))))..)..)))))......................(((((((.....(((....))).)))))))........................(((((((((...................)))))))))...........((((((...((((((((((((.((((((..((((((......)))).))....)))))).))).........((((((((((.....)))))))))).........(.......((((((....(...((((.........))))...).))))))..........(((....(((..((((((((.((..........))))))))))..)))...((....))..........))).........(((.(((((....)))))..)))...........((((....(((((((((....(((..((((.................................)))).)))..(((((....(...(..............)...)......)))))..)))))))))....)))).)..............((((((...........................(((((((((.((((..(((((.((((((......))))))..).))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))))......))))))...)))))))))...))))))................(((.(((((((.....(((.......(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))..(((((((((((............)))))....(.(((....))).)..((((((((.......))))))))......))))))...................((.(.(((((.((...((((((((..(((..((((..(...((((((((.(((.(((((....))))).))).))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).)))))..).))........((((.(((((....))))).))))........ |
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((...))((((((.(((..((((.(((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((.........)))...))(((......(((.......(((.....(((....(((((............(((....)..(((.....))).........)).((.....((((((((.....))))))))))(.((((((((......((((......................))))...)).)))))).).....(.((((...((......))..))))).)))))...)).)..)))(((.....(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).))))))))))...(..(((((((...((((...))))).))))))).(.....((..(((((((((((((....)))))))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...((((((.((((.....(.(((..(((.........((.........(...(.(.(.....)....(...).).)).)).(......)...........(.(((.(((((......)))))..))))..............((((((((.......((...((((...))))(((....))).....))......)))))..))).........((((((((((.................))))))))))(((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))....))))..(((.((((((..((((((((.(((((...)).)))))))))))..)))...((....))..))).....)))..((((.((.((((((((....))))....................((((((((((((.....))))((((.(((((..............((((((....))(((((...(((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))..))))))))...((((((((...(((((..((....))..))(((......)))..)))))))....(((((.(((.((((..(((((((((...((......))))).))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))........))))))))..((((..((.....)))))))).)))).))).(((.(((((((.....(((.......(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))...((((.((((((..........))))))....(((((....)))..(((((((((((.....)))))))))...))))))))))))))))))))...)).)))).(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((..........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((...))((((((.(((..((((.(((((((...(((........(((((((((.......((....((...........))...)))))..))))))........(((.....((((...((((.......(((((..((....))))))).........((........)).....((((((.........))))))..(.((((((((......((((......................))))...)).)))))).).....(.((((...((......))..)))))..))))...))))..))).((.....(((....((((((((.......)))))))))))......((((..((((((((....))))...))))....((.((((........)))).))..))))......))(.((....)))...((((((...(((((...))))).))))))..(.........(((((((((((((....))))))))).))))....).((.................))))).....((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))))))))))))))...(((((((((......((.((((.((((......((((.....((((.((..................))..).)))))))......(.............((((.((((......))))..)))).......)..........(((((.......((...((((...))))(((....))).....))......)))))..............(((((((((((...............)))))))))))..(((.......(((((......(((((((((.((((((((((.((((......))))))..)))))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))))).)))).....))))..(((((((.......((((.........))))....)))))))......))..(((.((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...((....))..))).....))).))).(((((((..((((....))))...))))...........((((((((((((((.....))))(((.((((((.......(...).....(((....)...))..((((((((((((............(((..(((......)))..))))))))......((.((((.(((((((...(((((..((....))..))(((......)))..))))))))((((((((.(((.((((..(((((...((.......))........)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))..........))))).))))))........))))))))).)))).))).(((.(((((((.....(((.......((((((((....))))))))....)))......))))))))))...(((((((((((..........))))))...((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......))))))))))))((....))))))))..(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((..........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).)))))....)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((...[[[[[[[..((((.((((..(((((((((...((((((((((...........((((((.((((...(((((((((..((((..((((...))))....))))))))))))).....)))).))))))((((((....))).)))((((((.(((((((((.((((......((((...........)))).)))).))))))......(((((..((((((...))))))(((((((.(((((......)).))).)))))))..))))).(((.(((.(((((.(((.((((...((((.(((((..(((((((((((((((((.......))))))))((((((...((((((((((((...(((((.((((((((((...((((((.(.....))))).))...)))..))))((((.(((((...........((((((((.....(((((..(((.............(((((((((((((....)))))))))).))).............)))..))))).....)))))....))).......))))).))))....((((((.(((.(((((((.(((((((..........))))))).((((....))))...)))))))..)))..))))))((((.(((((((((....))).)).)))).)))).)))))))))))(((((....(((..(((((((......)))))))..)))....))))).)))))))))(((.....)))...((((...)))).))))))(((...........)))......((((((.(((((((....))))))).))))))...................((((((((.((((((.((...(((((((((.((((((((((.(((((...).)))).))).))))))).)))))....(((....)))..))))...)))))))).))))))))....))))))))))))))..)))).............((((((....((((.((...((((...........))))....))))))....))))))....((((.((((.(.((((........))))))))).))))...))))))))))))..))))))..)))...)))))).......((((.((((.....)))).))))..)))))))))).............................))))).)))).....))))..))))((((.((......))))))(((((((((((((((.(((.......(((((((((.((((...((((.(((.............))).)))).)).)))))))))))((((((((((((......)))))))..)))))......((((((..(((((.....)))))(((((((((((((((.(.(((....))).)))).))))))).)))))(((((....)))))....((((.(((((...(((.((...((((((..........)))))).)))))....................))))).))))......(((((((...)))))))........((((.(((((((((.....))))))))).)))).)))))))))...))))).))))))))))..(((((.....(((((((((..(((..(((((((...((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))...))))..)))..)))))))))....)))))...........)))).((((((((....))))))))]]]]]]]... |
RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))((((.((((((((((((((........(((((((........)))).....................(((((((((((((...............(((.....))).......(((((..((....))))))).......))))......((((.....(((((...........)))))))))((((((...............(((...)))..........(((....))))))))).........((((...((......))..)))).....)))))...(((((..(((....(((....((((((((.......)))))))))))......)))....(((((((....))))...)))(((...((((((........)))).))...)))..)))))))))..)))......((((((...((((.....)))).))))))............(((((((((((((....))))))))).))))...)))).))))........................(((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))..))))))))))...(((((((.(((((.....(((....)))...................................................................................................................................((((((......(((....)))..)))))).)))))..(((..........(((((...............(((((((...............(((((((..((((((......((((..(((.((((((..((((((......)))).))....)))))).)))......(((....)))..)))).....))))))..)))))))...((....))....))))))).((((.........))))...))))).............(((....(((..((((((((...............))))))))..)))...((....))..........))))))(((.((.((((((((....))))....................(((((((..(((.....(((.(((.((((((.................((.........))..((((((((((..(((((.....((((((..........(((((.(((...(..((((.(....).))))..)...(((..((((((((((.....)))).))))))..)))))))))))(((((((((.((((..(((((......................)))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))))........))))))......))))).)))).)))))))).)))).))).))).(((((((.....(((.......((..((((....))))..))....)))......))))))))))..(((((((((((............)))))...((.(((....))).)).((.(((((.......))))).))......)))))))))))))))))...)).)))(.(..((((.((...((((((((..(((..((((..(...((((((((....((((........))))....))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).))))...).))))))))..((((.(((((....))))).))))........ |
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((.((..(((((((((((((((((((((.((.((.........)).)).)))))))..(((.((((....)))).))).....)))))...))))...........(((((.(((((..(..(((((((((.(((((((....))).))))......(((((((((.((((..(...(((((.....)))).).)..)))).)))))).....((((...((((((((((((((((.((((((.(((...........))).))))))))...((((..(((((((((....(((..((...(((..(((((..(((((((((..(((....(..(((((..(((((.(((((..(((((((((......(((((.(((.((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((..((......(((((((((.....(((((..(((.........((..(((((((((((((....))))))))).))))..)).........)))..))))).....)))))....))).).))..))))).))))....((((((.(...(((((((.(((((((..........))))))).((((....))))...))))))).....).))))))((((.(((((((((....))).)).)))).)))).))))))))...(((((.(..(((..(((((((......)))))))..)))..).))))).)))))))))........((((((((((.......)))....)))))))...))))).)))))...(((((.(((((((....))))))).))))))))))..)..))).......((((((((..(((((..(...((((.((((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))).....(((....)))..))))..)..)))))..))))))))....))))))))))))))..)))...))...)))...((((((....((((......((((.((.....)).))))......))))....))))))..)))))))))....(((....)))...(((.(.((((((.....((((..((((....))))...))))...)))))).).))).)))).......)).)))))))))))))))).......)))..)))).(....).))))).)..)))))))))).)))))..)).((((.((((.((......))))))(((((((((((((((.(((......(((((((..(.((.....((((.(((.....((....))))).))))....)))..)))))))(((((((((((......)))))))..)))).......((((((..(((((.....)))))(((((((((((((((...(((....)))..)).)))))))).))))).((((....)))).....((((.(((((.((((.......(((((......)))))(((((....))))).........)))).....))))).))))..(((.((((((.....))))))....))).((((.(((((((((.....))))))))).)))).)))))))))...))))).))))))))))..(((((.((..(((((((((..(((..((((..(...((((((((.(((((((((....))))))))).))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))).))))......))))(((((((((....)))))))))......... |
RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((...(((((...((.((((..((((.((((....((((.((((.((((.((.....(....((...........)).).))))))...)))).........)))).((((((....((........(((...(((....))).)))...))..))))))....(((.......((((...........))))..)))((((((.((.......((......................))...))...)))))).....((..((((.((((......))))))))......((((.....((((.(((....(((.....(((((((.......))))))).)))......)))...))))......)))).))..(((...((.((((((........)))).))...))...)))))))))))(((((....((((((...(((((...))))).))))))..((.....(((...((((((((((....)))))))))).)))...))....((......((.((((...(.(...)...)..))))...)).)))))))((.(((((((((.((.((.((((......(((...((.(((((....(((((.....(((((.(((.((.......(..(.........(....................).....)..)...))........(..........(.((((......))))..)................)...))).))).....(((..(((((...(...(((....))).....).....)))))....))).....(...(((.((((.(((......)))........))).)))).)(((((((...(((((.(....(((((((((.(((((((.((((((......)))).))...))))))).)))))....(((....)))..)))).)...)))))...)))))))(((..((......((.(.(((....))).).....)).))....)))..((((((..(...(((.((.(((..((((((((...............))))))))..)))..............)).....)))...).......)))))).))..))))).)))))...)).....)))...)))).......)).))...))).))))))...))))))...)).)))))......)))))))((.(((...((.((((((...(((...((....)).))).))))))(((((((((((((((.((((((((...((((((((((.((((.....))))..))))))))))))))).(.(((((((((.((((..(((((......................)))))..)))))))(.((.((..(.....)..)).))...)))))))...)....(((.((((..((((...........))))...)))).))).(((.((((.(......(((.......(((.(.((....))..))))....))).......).)))))))..(((((((((((............)))))...((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......)))))))))...))))).)))))))))).))((((.((...((((((((..(((..((((..(...((((((((...(.((((......)))).)...))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).))))...))).......))((((((((((....))))))))))........ |
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((..((..........(((((((((...((((((((((.........................(((((((((..((((..((((...))))....)))))))))))))...............(((((((....))).)))).........((((((..(((..........................)))..)))))).............(((((((((((((...((((((.(((...........))).)))))).....((((..(((((((((.....((............((((...(((((((((.(((((((.......))))))).((((((....((((((((......(((((.(((.((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((..((..........(((((.....(((((..(((.........((..(((((((((((((....)))))))))).)))..)).........)))..))))).....)))))..........))..))))).))))....((((((.....((((((..(((((((..........)))))))..((......)).....)))))).......)))))).(((.(((((((((....))).)).)))).)))..))))))))...(((((.(..(((..(((((((......)))))))..)))..).))))).))))))))...............(((.....))).))))))((((((.................((((((.(((((((....))))))).)))))).((....))..))))))..((((((((..(((((..(...(((((((((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).)))))....(((....)))..))))..)..)))))..))))))))....))))))))).)))).............))....((((((....(((.......((((.((.....)).)))).......)))....))))))..)))))))))....(((....))).........((((((......((...((((....))))....))....)))))).......)))).......)).)))))))))))))))))))))((((......(((....)))....)))).))))).))))..........((((....................(((((((((((((((.....((((((.(((((.(((.(((..(((..(((.....................(((((.....((((..((((((((((((......)))))))..)))))..)))).....(..(((((.....)))))..).....)))))........................((.....))...............................((((......((((((.((....)).))))))...)))).........................)))...)))....))).)))))))).))))))...((((.(((((((((.....))))))))).)))).............))))).))))))))))..(((((.((..(((((((((..(((..((((..(...((((((((.(((((((((....))))))))).))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))).)))).......))..((((((((....)))))))).))))))... |
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((((..((((.((((..(((((((((...((((((((((..((((((((.(((....)))....(((((((((..((((..((((...))))....))))))))))))).......))))))))...........((((..(((((((....((((((..(((......((((..(.....)..)))).)))..))))))......((((...(((((((((.((((..(((((((.((((..((((..((((..((..(....)..))..(((((((((....(((..((...(((..(((((..(((((((((.(((((((.......))))))).((((((....((((.(((((.........(((.(((((((...((((((........)))).))...)))..))))(((((.(((............((((((((.....(((((..(((.........((..(((((((((((((....))))))))).))))..)).........)))..))))).....)))))....))).(((((.(((.((((((..((((..((((......((((.(((((((..........))))))).)))).....)).))..))))..((.((((((.(((((...))))))))).)).))..))))))))).)))))...))).)))))..))).(((..(((((((......)))))))..)))..))))).))))..((((((((.....))))))))..........))))))(((((((................(((((..(((((((....)))))))..))))).((....)).)))))))..((((((((.(..(((..(...(((((((((.((((((((((..(((......)))..)).)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..)).)..)))))))))....))))))))))))))..)))...))...)))...((((((....((((......((((.((.....)).))))......))))....))))))..)))))))))....))))..)))).)))).))))))).)))).)))))....))))..))))..........)))))))))))..((((.((((.....)))).))))..))))))))))((((.......((....)).....)))).))))).)))).....))))..)))).........(((((.....(((((((((((((((.(((......(((((((..(.((.....((((.(((.....((....))))).))))....)))..)))))))(((((((((((......)))))))..)))).......((((((...(((((((.(((((((((((((((((((((...(((....)))..)).)))))))).))))).((((....))))..((.((((.(((((..((((......((((((.((....)).))))))...))))........(((....))).))))).)))).)).......))))))..))))......))).(((.(((((((((.....))))))))).)))..)))))))))...))))).))))))))))..(((((.((..(((((((((..(((..((((......((((((((.(((((((((....))))))))).))))))))......))))..)))..))))))))).)).))))).........)))))..((((((((....)))))))))))))))... |