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UACCUGGUUGAUUCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAUUAUACAGCGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUCGUUUAUUUGAUAUUACCUUACUACAUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAAAAAUCCCGACUUCGGAAGGGAUGUGUUUAUUAGAUUAAAAACCAAUGCCCUCCGGGGCUCACUGGUGAUUCAUAAUAACCUCUCGAAUCGCACGGCCUUGCGCCGGCGAUGGUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGACGGCUGGGUCUUGGCCAGCCAUGGUGACAACGGGUAACGGGGAGUUAGGGCUCGACUCCGGAGAAGGAGCCUGAGAAACGGCUACUACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUACUGAUACAGGGCUCUUUUGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGAGGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAACCUUGGGCCCGGCCCUCCGGUCCCCCUCACCGGGUGCACUGGCUCGGCCGGGCCUUUCCUUCUGGAGAACCGCAUGCCCUUCACUGGGCGUGCCGGGGAACCAGGACUUUUACUCUGAACAAAUUAGAUCGCUUAAAGAAGGCCUAUGCUCGAAUAGUCUAGCAUGGAAUAAUGGAAUAGGACGUGUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCGCCGUAAUGAUUAAUAGGGACAGUCGGGGGCAUCAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUAAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAGGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGAUUAGGGAUCGGACGGUGUUAUUUUUUGACCCGUUCGGCACCUUGCGAUAAAUCAAAAUGUUUGGGCUCCUGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACACGAUGAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUCGUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGCCCGCAUCGCUUUGGCGGUGCGCCGGCUUCUUAGAGGGACUAUCGGCUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACAGAGCCAGCGAGUACUCCCUUGGCCGGAAGGCCCGGGUAAUCUUGUUAAACUCUGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGCAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGCUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUCAGUGAGGCUUCCGGACUGGCCCAGGGAGGUCGGCAACGCCAACCCAGGGCCGGAAAGCUAUCCAAACUCGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUCUCCGUUGGUGAACCAGCGGAGGGAUCAUUA |
| Reference structure (ext) |
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
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Carnac(20)
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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|
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..........................(((((((((..((...((((((....))))))...))...)))..))))))...........................(.....((((..(((((....)))))))))).......((((((.((((.....(((((..(....)..))))))))).)))))).......((((..((((....))))....))))...((.............))(((((.((((.....)))))))))(((...............(((((...(((((((((((((((.......))))))....................((((((.((()))))))))((((.((.((((........)))).)).).)))......(((.((.(((((.(..((((((...(((((...).))))))))))...........((((((((((((((....)))))))))).))))..................((((.................)))).......)))))).)).)))..((.....)).....(((((((..........)))))))(((((................))))).((((((((((..(((((.((((.....))).).)))))...))))))))))....((((((....((((((((((......)))))))).))....)))))).......((((.......))))..(((.......)))(((((((.((....)).)))))))((((((((((((((((.....))))))))))))))..))...........))..((((((((...................(((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).))).........((((((((((.....))))))))))))))))))....))))))))))))(((((....)))))....)))..((((((...........))))))...((.....))(((((((.((((.....)))))))))))(..(((((((((...((((.....))))(((((....)))))...)))))))))).............((((((.....((((.((((.....)))).)))).....))))))....................(((((...((((.(((((............((((((((()....))))))))))))).)))))))))......(((((...........(((.........))).............)))))...((((..(((.((((..((((((((((((....))))))))..))))..)))).))).((((((((....))))))))......)))).....((((()))))...((((...........))))(((....)))...(((.(((((((..((((((....(((..((((....)))).)))....))))))...))))))))))..((((((((((((.((....)).))))))...((.((((())))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))...................((.(..((((.((..((((((((((.(((..(((((.....(((((((.(((.(((.(....))))..))).))))))).)))....))..))).)))))))))).)).))))...).))........((((((((((....))))))))))........ |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................(((((((((.......(((((......)))))........)))..)))))).....................................((...((....)).))............((((((.((((.....(((((..(....)..))))))))).))))))........((....................))......................((((.((((.....))))))))..................((((.....(((....((((((((.......)))))))))))......))))......((((....))))..(((((((...((((((........)))).))...)))..))))................((((((...(((((...))))).))))))............(((.((((((((......))))))))..)))...................................(((((((...................................)))))))...............................................((((((((((((((((((((........)).).))))).))))))))))))..................((((((......)))))).....................................(((((((.....(((....)))))))))).................(.(((((((.....))))))).).................................((((((...((((((((((((.((((((...(.((((......)))).)....)))))).))).........((((((((((.....)))))))))).................(((((((...(...((((.........))))...)))))))).................(((..((((((((.(.(.......).)))))))))..)))...((....))...........(((((.......(..(((((....)))))...).....)))))..((((....(((((((((.....(((((.....)))).................................)...(((((...(((..(..............)..))).....)))))..)))))))))....)))).........................((......))...........((((((((.(((.((((..((((((((((((....))))))))..))))..)))))))..((((((((....)))))))).....)))..........)))))..)))))))))...)))))).................(((.((((((((..(..((....(((..((((....)))).)))....))..)...)))))))))))..((((((((((((..........)))))).......((....)).....((((((((.......))))))))......))))))....................(.(..((((.((....(((((((..(((..((((..(...(((((((((.(.((.((....))))..).)))))))))...)..))))..)))..)))))))...)).))))...).).......((.(((.(((((....))))).)))...)).... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((.(((((.(((.(..........)..((((...))))..(((((((((.......((....(((.......)))...)))))..))))))........(((......((....((((...(...)......(((....)..(((.....))).........)).(......(((((..(....)..))))).)((((((((((......((((..(((......)))....))))...)).)))))))).....(.((((..(((.....))).)))))..))))...))....)))........(((....((((((((.......)))))))))))....(((((...((((((((....))))...)((((((.((.((((........)))).)).).)))..))((((..((((((((((..((((((...(((((...))))).))))))(((.........(((((((((((........)))))))).)))......((.................))......(.((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))).............((((((((..........(((((..(((.......((((((((..((.((..................)).)..))).))))))...........(.(...((((((((......)))))))).....(......).))...(((((.......((...(((.....)))(((....)))....))......)))))..............((((.((((.((................)))))))))).((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..)))))))))))).(..(..(....(((((((.......((((.........))))....)))))))((((..(...((((((((((..((((((((..............))))))))..)))...((....))..))))....))).(.....)..))))((((....))))..((((..(((.....(((((....((((((((((((((((((((...)))))...(((...))))))((.((...)).))...)))...(((((....((.....(((........))).))......)))))..)))))))))....))))))))))))...).........).).((......))......).)))))..((((((((.((((..(((((.((((((....))))))...)))))..)))))))..((((((((....))))))))....))))))))))))).)))).(((..((((..((.....))))))..)))))))))).(((.((((((((......(.....(((.((((....)))).)))....).......)))))))))))...(((((((((((..........))))))...((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))))))))((....))))))))))(((((((.((...((((((((..(((..((((..(...(((((((((((................)))))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).))))...).))......)))(((((((((....)))))))))))))))).. |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((...))((((((.(((..((((.(((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((.......)))...))(((......(((.......(((.....(((....(((((.............(((....)..(((.....))).........)).((.....((((((((....))))))))))(.((((((((......((((..................))))...)).)))))).).....(.((((...((.....))..))))).)))))...)).)..)))(((.....(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).))))))))))...(..(((((((...((((...))))).))))))).(.....((..(((((((((((((....)))))))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...(((((((((((.....(.(((..(((.........(((...(.(((...(.(((.....)).........)..)).)))))).(...)..........((((.(((((......)))))..)))).............((((((((.......((...((((...))))(((....)))....))......)))))..))).........((((.((((((.................))))))))))(((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))....))(...)((.((((((..((((((((.((((....).)))))))))))..)))...((....))..))).....))..))).(((((((..((((....))))...))))...((.....(((.(((((((((((.....))))((((.(((((..............((((((....))(((((...(((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))..))))))))...((((((((...(((((..((....))..))(((......)))..)))))))....(((((.(((.((((..(((((((((...........))).))))))..)))))))..((((((((....)))))))).....)))))........))))))))..((((..((.....)))))).)).)))).))).(((.(((((((.....(((.....(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))...((((.((((((..........))))))....(((((....)))..(((((((((((.....)))))))))...)))))))))))))))))).....)).)))..(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((........)))))))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(.(((((.(((.(..........)((((((...)))...(((((((((.......((....(((.......)))...)))))..))))))........(((......((....((((...(...).(....(((....)..(((.....))).........)).((.....(((((..(....)..)))))))((((((((((......((((..(((......)))....))))...)).)))))))).....(.((((..(((.....))).)))))).))))...))....)))........(((....((((((((.......)))))))))))....(((((...((((((((....))))...)((((((.((.((((........)))).)).).)))..))((((..((((((((((..((((((...(((((...))))).))))))(((.........(((((((((((........)))))))).)))......((..(...........)..))......(.((((((((((..(.(((....)))).)))..((.....))..))))))).............((((((((..........(((((..(((......(((((((((..((.((..................)).)..))).)))))))..........(.(...((((((((......)))))))).....(......).))...((.((.......((...((((...))))(((....)))....))......)).))..............((((.((((.(..................))))))))).((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))((.(((.((((.(((((((.......((((.........))))....)))))))(((.((((..((((((((((..((((((((.(...........)))))))))..)))...((....))..))))....)))(((.....((((..((((....))))...))))...)))...(((((....((((((((((((((((((((...)))))...(((...))))))((.((...)).))...)))...(((((...(((......((........))..))).....)))))..)))))))))....)))))...)))).)))......)))))))((......))......)))))))..((((((((.((((..(((((.((((((....))))))...)))))..)))))))..((((((((....))))))))....))))))))))))).)))).(((..((((..((.....))))))..)))))))))).(((.((((((((......(.....(((.((((....)))).)))....).......)))))))))))...(((((((((((..........))))))...((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))))))))((....))))))))))(((((((.((...((((((((..(((..((((..(...(((((((((((................)))))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).)))))....))...))))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((ddd....)))).(((.....(((((((((...)))).)))).)ccccccc))).((((((....)))))).(((....)))...((((((...........((((........))))..bbb((((((..(((....))))))))).....))))))..CCCCCCC.....((((.....<<<<.))))...................((((..((((>>>>))))....))))....................(((((.((((.....)))))))))BBB....................DDD((((((...((((((.(....)))))))..aaaaaaaa.aaaa....))))))(((((((((..((((((.....((((.(.....)))))......)))..)))..((((..((((.((((((((((((.(((((...).))))....................(((((((((((....)))))))))).)....................(.((((...))))).(((((.((((((..(((..((((((.(((((((((.......((((.(((((((..........))))))).))))......................((((((((((..(((((.(((......)))...)))))...))))))))))......((((....((((((((((......)))))))).))....)))){{{{{{...(((((.....)))))..((((.....))))(((((((..........)))))))..((((((((((((((.....))))))))))))))..............(((..((((((((.((((((.((...((((..(((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).)))......(((....)))..))))...)))))))).))))))))...)))..........(((((....))))).....((((((...((((((.((((...))))...........((((((((.((((.....))))))))))))(((((((((((...(((((...)))))(((((....)))))...))))))))).))....)).))))...))))))..((((.((((.....)))).))))......................((((....)).))..........................(((((((((....)))))))))))))))))).))))))..))).))))))))))).))).))))))))).))))...))))......[[[)))).))))).(((.((((..((((((((((((....))))))))..))))..)))).))).((((((((....))))))))..((((((((((.(.(((....))).)))).))))))).]]]..((.(((....)))))..((.(((((((..((((((....(((..((((....)))).)))....))))))...)))))))))(((((((((((((((..........))))))..........))))))))).(((((((((.....)))))))))............AAAA.AAAA...AAAA.........((((.....((((((((((.(((.((((((.....(((((((.(((.((.((....))))..))).))))))).))))).)....))).))))))))))....))))}}}}}}.........((((((((((....))))))))))........ |
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RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((...........))).....................((((...((((((..............................((((((...(((((........................................(((....)))(((.....)))))))).......((.....(((((..........)))))...................((.......................((.((................((((..(((.....))).))))...............((((.(((....(((....((((((((.......)))))))))))......)))...))))((((....)))))).)).(((...((((((........)))).))...)))..))..((((.(((((......((((((...((((.....)))).))))))................(((((((((....)))))))))....................................................))))).)))).(((((...((.....)).(((.....))).............))))).........)).))))))..................................................................................................................................(..(((.....)))..)..................)))))).............(((...............(((....................(((((((..((((((............(((.((((((.....((((......))))......)))))).)))......(((....)))...........))))))..))))))).........(((((((.......((((.........))))....)))))))....)))...(((....(((..(((((((................)))))))..)))...((....))..........)))...(((.((.((((...(((((..((.........))...))).))(((((((..(((..((.((((.((.(((((((((....(((((.....(((....)))((((........(((((.((.....((.(((.(....).))).))....)))))))..))))((.((((..((((((.......(..((....))..)..((......))......)))))(((((....(((.((((...(((......................)))...)))))))........................((.....)).......))))))..))))))...)).))).))))))))).))...)))).))(((((((.(.....).....((..((((....))))..)).............))))))))))..(((((((((((............)))))...((.(((....))).))....(((((.......))))).........)))))))))))))))))...)).))))))..((((.((....(((.(((..(((..((.(..(...(((((((.....((((......)))).....)))))))...)..).))..)))..))).)))...)).))))..))))..............(((((....)))))............. |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..........(((((......((((..(((.(((.(((((.............................((((((.(((((................................((((..((....))))))...........((((((.((((.....(((((..((..))..))))))))).))))))..............................)))))...................((((..(((.....))).))))....)))))).....((((.(((....(((....((((((((.......)))))))))))......)))...))))((((....))))...((((((...((((((........)))).))...)))..))))))))))))))((....((((((...(((((...))))).))))))(((.............(((((((((....)))))))))..............................................((((..((((((.(((...(((((((.(((((((.(((.....)))........(((((....((((.........((((.((...((((............................................................................................................................((((((......(((....))).))))))........(((((....(((...(((...............((((((.................(((((((..((((((............(((.((((((.....((((......))))......)))))).)))......(((....)))...........))))))..))))))).........(((((((.......((((.........))))....)))))))..........)))))).(((..((((((((..............))))))))..)))...((....))...))))))..))))))))).)).))))..(....))))).)))))...))))))).)....((((.((((.....)))).))))))))))................(((....)))....)))))))))......(((((..(..((..((....))..)))..)))))......(((((((((.((((((((......((..((....))..)).((......))......))))..(.(((((((((.((((..((((......................))))..)))))))..((((..(......)..))))....))))))).......)))).(((..((((...........))))..)))((......(((.(((((((((.....).....(((.((((....)))).)))............)))))))))))..((((((((((((..........))))))...((.(((....))).)).((((((((.......))))))))......))))))))....))))).)))))))))))))((((.((....(((.(((..(((..((....(...(((((((....(((((......)))))....)))))))...)....))..)))..))).)))...)).))))..))))...)))))......(((((....)))))............. |
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RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((.(((((....((.((((((...(((((((((((...((((((((..(((((((....((((((....)))))).(((....)))...((((((...........(((((......))))).....(((((((..((....))))))))).....))))))..)))))))....(((((..(....)..)))))........(((((((...((((((((((....))))......(((((((.............))))))).(((((.((((((.((((((((((.............(((((...((((((((((((..((((((((....(((((.((((..((((((...(((((((..((.((..(((((((..(((((((........))).........(((((..((((.(((((..((..((((((...((((......))))))))))..((((.....(..(((((((((((....))))))))).))..)...................((((...))))....))))....))..))))).))))..((((..((((......(((..(((((((..........)))))))..))).....)).))..))))..)))))(((((((((..(((((.((((.....))).).)))))...)))))))))..)))))))))))..((((((((((......))))))).))).)).))..)))))))..(((((.....)))))..((((.....))))...))))))....))).).)))))..(((..(((((((((.....)))))))))..)))....)))))))))))))..((((((((..(((((..(...((((..(((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))......(((....)))..))))..)..)))))..))))))))....))))))))))))(((((....))))).)).))))))))....((((((((..............(((..((((((((.((((.....))))))))))))..)))..((((...(((...((((((((..(((((..((((..(((((((.((((...((((...........(....)...........))))..))))))))))).......)))).....(((....))).)))))))))))))...)))..))))..((((..((((....))))..)))).)))))))).)))))).)))))......))))))....)))))))...))))))))(((..........((((((...(((.((((..((((((((((((....))))))))..))))..)))))))..((((((((....)))))))).................))))))(((..((((...........))))..))).)))....(((.(((((((..((((((....(((..((((....)))).)))....))))))...))))))))))...)))))).)))))....))))))))...))))).)))......((((.(((((((((.....))))))))).)))).(((((....((((((((((...((.....))((((.((..((((((((((.((((((((((.....(((((((.(((.((.((....))))..))).))))))).))))).))...))).)))))))))).)).))))...)).)).))))))..((((((((....)))))))))))))..... |
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RSpredict(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((((...(((...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(......)))).........((((..(((.(((.((....((((......)))).......)).)))...))).........)))).((((((....((.........(((...(((....))).)))...))..))))))....((((......((((..........)))).))))..(((.((......((....(......)...)..))).)))...(((.((.......))).))...(((..................)))..........(............)...........(.(..........((((.........)))).))..((..............(((.....(.............((((((((..(((...((((...(.(((......((.(((...(((..((......((((((.......((.....................))...........)))))).))....(....(..((((((......))))))...)...)...................................))).)))....)).....)))......).))))........((((((..)))))...)(((((((...(((((.(...((((((((((((((((.((((((.....)))).))...)))))))))))).....(((....)))..)))).)...)))))...)))))))(((.(((......((.(((((....))))).....)).)))...)))...((.....(...(((.((((((..(((((((..........))))).))..))).............))).....)))...).)).)))...).)))..))))..((((...((.....(.........).)).))))(.(.....(.(((((.((......)))))))).))....(((.((((..(((((.........................)))))..)))))))(.((((((((.....))))))))...)))))...)).......((.(((((((....(((.......((((((((....))))))))....))).....))))))).))......(((((((((..........))))))...((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......)))....((((...(((((.....(((((((..(((((((..((....((((..((...).)))).......).......))...))..).)).))..)))))))..))))).))).)(.((((((....))))))))))))))... |
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RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.....)))))((((((...(.....(((((..((((.((((.((((..(....(((((......)))))...............................................................................................................................................................................................)..))))...)))).........))))...((((.............((...((((.((((....((((((.(...(((((((((((.....((((............)))).))))))))))).).....((((...((((....))))......))))((((...((.........((.((((.((((.....))))))))....)).))..))))((((.((((..(((.....(((((.(.......)))))).))).....))))...)))))))))).))))....)))).))...)))).))))).).)))))).((((((......(((((...((.((.(((..(...(((((...))))).))))........((..((((.(((...))))))).))....................((....(..((((..((.........((.(((..(((.(.(.(....(((.((((((....((...................))...))))))))).........((((..................)))).......)............)...)....))).)))....)).)).)))).((((...((...(((((((((((...............))))))))))).)).))))....)..))......(((((((((((((.(((((.....)).).))...)))))))))))))......))...))..)))))..)))))).......(((((((((....((((.....(((..(..((((...((....(.((((..(((....((.((....(.(((..((((((((..............))))))))..)))...)......))..))...(((...((((...((((..(((((((.((((...((((...((...((.(......)))...))..))))..))))))))))).......))))..).)))....))))))..))))...)...)).))))..)..))).))))..)))))))))..(.((((..((((((.((((((((...(((...........)))))))).(.(((((((((.((((..((((.((.........).)....))))..)))))))(.((((((((.....))))))))...)))))))...).............................(((.((((((((..((.......((((((((....)).)))))).....)).....)))))))))))...(((((((((((..........))))))...((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))......))))).)))...))))).))))))((.((((((.....((.((((..(((.((((...(((((((.(((((..)))))..)))))))...)..).))..)))..))))))...))))).).....))......)(.((((((....))))))).......... |
|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............................((((.(((...)))..))))..(((((((....((((((....)))))).(((....)))...((((((............(((........)))......(((((....((....))..))))).....))))))..)))))))....(((((..(....)..)))))........................((((....)))).......((((((......((((......((((.((((.....)))))))).(((((............((((((...(((..(...((((((.......)))))).((....))..........)..)))))))))....(((((((...((.(((........))).........(((((..((((.(((((..((..((((((....(((.....)))..))))))..((((.....(..(((((((((((....)))))))))).)..)...................(((.....)))....))))....))..))))).))))..((((..((((......(((..(((((((..........)))))))..))).....)).))..))))..)))))(((((((((..(((((..(((.....)))...)))))...)))))))))...)).)))))))..((((((((((......)))))))).)).)))))..(((((((((.(((..........................(((((((.((....)).)))))))..(((..(((((((((.....)))))))))..)))...................((((((((..(((((..(...((((..(((.((((((((((.((((......)))).)).)))))))).)))......(((....)))..))))..)..)))))..))))))))................(((((....)))))............((((((.(((((.((((((.......(((..((((((((.((((.....))))))))))))..)))...............((((((((...((((..((((..........................................((((.....))))..................)))).....(((....))).)))).))))))))...............(((..(((......)))..)))..)))))).))))).....(((((((..(((((((((((((((.((((.((......))))))................((..((((..((((((((((((....))))))))..))))..))))..)).((((((((....))))))))............................((((...........)))).................(((((((..((((((....(((..((((....)))).)))....))))))...)))))))...........((((((..........)))))).....................(((((((.......))))))).................................)))))).)))))))))))))))).....))))))......(((((((.(((.((.((....))))..))).))))))).......................))).....)))))))))......))))(((((((((....)))))))))))))))... |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.......)))))..(((...(((((.((((((((((..((...(((((((....((((((....)))))).(((....)))...((((((...........(((((......))))).....(((((((..((....))))))))).....))))))..))))))).......(((....)))...(((((.((((......................(((((((((((((((((((((.............))))))).(((((.((((((.((((((((((.............(((((...((((((((((((..((((((((....(((((.((((..((((((.(((((((((..((.((..(((((((..(((((((........))).........(((((..((((.(((((..((..((((((...((((......))))))))))..((((.....(..(((((((((((....))))))))).))..)...................((((...))))....))))....))..))))).))))..((((..((((......(((..(((((((..........)))))))..))).....)).))..))))..)))))(((((((((..(((((..(((.....)))...)))))...)))))))))..)))))))))))..((((((((((......))))))).))).)).))..))))....))))).............((((.....))))...))))))....))).).)))))..(((..(((((((((.....)))))))))..)))....)))))))))))))..((((((((.(..(((..(...((((..(((.((((((((((..(((......)))..)).)))))))).)))......(((....)))..))))..)..)).)..)))))))))....))))))))))))(((((....))))).)).)))))))).......((((...((((((......(((..((((((((.((((.....))))))))))))..)))..((((...(((...((((((((..(((((..((((..((((....))))...........(((((((.....((((.((((.....)))).)))).....))))))).)))).....(((....))).)))))))))))))...)))..))))..((((..((((....))))..)))))))))))))))))))).)))))...((((((((((((((((.(((((.((......))))))).((((..........(((.((((..((((((((((((....))))))))..))))..)))))))..((((((((....))))))))..((((((((((...(((....)))..)).)))))))))))).(((((((....))).((((..(((((((..((((((....(((..((((....)))).)))....))))))...)))))))..((.((((((((((((..........))))))...((.(((....))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))))....))))......)))).))))).)))))))))))......))))))).)).)))))(((((((.(((.((.((....))))..))).))))))).)))))))))...))..))).))).)))))))))................(((((((((....))))))))).)))..... |
