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UACCUGGUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAGUUAUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAUAUCAGUUAUAGUUUAUUUGAUAGUAUCUUACUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAAAAAUCCCGACUUUAUGGAAGGGAUGUAUUUAUUAGAUAAAAAACCAAUGCCUUCGGGCUUUUUGGUGAUUCAUGAUAACUUCGCGGAUCGCAUGGCCUUGUGCUGGCGAUGAUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGAGGCCUACCAUGGUUUCGACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUCUAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACAGGGCUCUUUUGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAGAUACCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAAUUUAGGGAUUGGUUGCCUGGUCCUCCGAAGUUGUGUGCACUGGCGCAACUGAUCCUUCCCUCCUGGAUUACCGGCUGCCCUUCGCUGGGUGUGCCGGAUAGCCAGGGCAUUUUACUUUGAGAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGUUUGCUCGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAAAAUAGGACAUGUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCAUUGUAAUGAUUAAUAGGGACAGUUGGGGGCAUUAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGAGAUCGGGCGAUGUUUUUUUCUUGACUCGCUCGGCAUCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUCGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGAAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGCCAGAUUAGCUUUUGCUGAUCGCGGGCUUCUUAGAGGGACUGUUGGCAUGAAGCCAAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGACAGAGCCAGCAAGUUCAUUUUCCUUGGCCGAAAGGUCUGGGUAAUCUUGUGAAACUCUGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGCAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUAUGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUUAAUGAGGUCUUCGGACUGGUGAUGGGUUAUUGGCAACGAUAAGCCUAUUACUGGAAAGUUGAUCAAAUUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
...(((((..<<<.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....(((.............((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((....))..)))))....((((((........((((..(((....)))....))))......)))))).........((((.((((.....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...{.((((...(((.......(((((((((((((((((.(((.......)))...))))).))))))))))))....((((((....((((((((((......))))).)))))....)))))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..((((((((.((..........))))))))))..)))...{{..))}}...}}}....}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((........((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))).)))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((....(((((((.(((((((........(((......))).....(((((((.((((((((((((((..((((((.(((.....)))...)))))).....((((((.((.....)).))))))....)))).)))))))))).((((((....((..((.((((((.(((((.....((((..((....))..))))))))).)))))).......(((((.(((....)))...)))))...))..)).....))))))...)))))))....)))))))...(((((...........((((((.((((......((((((((.......)))))))).(((((..((((.....(((.....(((......))).........(((((......(.((.((........)).)).)..)))))..........)))...))))...((..((((((..............(((((((((((((....))))))))).))))...(((((...)))))..))))))..)).)))))..)))))))))).((((((.(((.(((((.((..((((....(((.....)))....))))..)).))))).......((((.(((((((..((((..((..((((.((((..(((((...((((((((......))))))))..(((((.(((((((((...((((((((((......))))).)))))...(((.((((((((((.(((....))).))))))))))......)))....((((((........((((((...(((((((((((((.....)))))))))))))(((...((((((........((((((((..(((((......(((((((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))...((((..((.....(((((....)))))....))..)))).))))))))).....)))))).((((.((..((((((((.(((........)))))))))))..))...(((....))).)))).))))))))))))))).....((((....))))........)))))...)).))).))))))))))..))))..)).)))))))))...............(((....)))....))))))))).......)))))(((.(((..((((....))))..)))..(((((((((((((((.((((((((......((..((....))..)).((......))......))))).).))....(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))).))).((((((((.....))))))))..((((((((((...(((....)))..)).)))))))).....((((.(((....)))..(((.(((((((...(((((........(((.((((....)))).)))....)))))....))))))))))..((((((((((((..........)))))....((.(((....))).)).(((((((((.....))))))))).....)))))))))))..))))).))))))))))...((((.((..((((((((((.(((..((((......(((((((((((((((((....)))).)))))))))))))......))))..))).)))))))))).)).))))...)))..........(((((((((....)))))))))))))))))) |
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Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((......)))))..........................(((((((((.......((((.........))))........)))..)))))).................................................................(((((..((((.....(((((..(......)..)))))))))..)))))...................................................(((((..(((.....))).)))))..........................((.....((((((((.......)))))))).))...............................((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((........((((....(((.....)))..))))..............(((((((((((((....)))))))))).)))...............................................))))).))))...........................................................................((((((..........................................))))))............................................................................................................................(((((.(((((((.............))))))))))))..((((((((.((((((......(((.((((((((((((..((.(((........))).))...))))))))))))....(((....)))...))).....)))))).))))))))........................((...........)).............................(((..((((((((...............))))))))..)))...((....))..........................(((((....))))).................(((....(((((((((......................................................................................................)))))))))....)))...................................................((((.(((.((((..(((((((((((.......))))).))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))).......................................................((((((((...............((((((((....))))))))............))))))))......(((..((((((..........))))))....................(((((((((.....)))))))))........))).........................(((((.((...(((((((((((((((((((..(...(((((((((((((((((....)))))).)))))))))))...)..)))))))))))))))))))..)).)))))................((.(((((....))))).)).......... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((((.((((((((((..((((....(((..(((.(...(((((..((((((((((...((.((((.........)))))).............((((((...........)))))).........))))))))))..)))))..).))).)))(((((((.........(((((............)))))))....))))).......(((((.(((....)))...))))).......................)))))))....)))))))................(((((((((.....((.(((.(((((((.......)))))))......))).)).....)))......((((((..((.((((((((.((((........)))).))((((((..((((((((((((..((((..((((((...((((.....)))).))))))............(((((((((((((....)))))))))).)))....................................((((((.......((((.....((....)).......))))))))))..)))).........))))))...........................(((((..........)))))....(((((((........)))))))...)))))).((((((....((((((((((......))))).)))))....)))))).....................((((((.....((((..(((.(........(((....)))...((((((((((((((.....))))))))))))))(..((((((((((((.........))).))((((((((((..........))))))))))...........)))))))..)........).)))..))))....)))))).....))))))..............(((....))).((((.((((((((..........((.((((((...........)))))).))....((((((((((((.(((........)))))))))))..)))).(((....)))..)))))))).)))).(((.......((((....))))....)))........(((((.(((((((..((....((((.(((.((((((.................(((....)))....(((((((((((((...(((..((............))..))).....)))))...((.((((..((((((((.(.(((.((((((....)))))).))).)(((((....................(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))).))).((((((((.....)))))))).........)))))))).)))...).))))))).......)))))))))).)))).))).))))(((((((...(((((.(......(((.((((....)))).)))..).)))))....))))))).(((((((...((((((..........)))))).............)))))))((((((((.(....)))))))))......))...)))))))))).))..(.(..((.(..((((.((....((((((((.(((..((((..(...(((((((((((((.............)))))))))))))...)..))))..))).))))))))...)).))))...).))...)..).)))))).))..)))))))))))))))))))). |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((......(((((.........(((..((((...((((((..((((((((((((((....((((......((((((.....(...........).....)))))).....))))...)))).))))))))))..)))))).).))).)))((((((.((((.....(((((..((....))..))))))))).))))))........((((.(((....)))...))))((((((.(((.....))).))))))....((.........))............................((((((((((((((((.......))))))))......................((.......))((((((((.((.((((........)))).)).).)))..))))(((.((.(((((........((((((((((...))))((((((..........((..(((((((((((((....)))))))))).)))..))..............))))))...........)))))...)........))))).)).)))((..(((.....(((.....))).....)))..)).(((((((((....)))).))))).......((((((((((((((((((...(.........)...))))).)))))))))))))...((((((.(..((((((((((......))))).)))))..).))))))...((((.(((....))).))))((((((..((((((())))))).)))))).......(((((((((((((((((((.....))))))))))))))..)))))............((((((((.....((((........(((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))..)))).((((((((((.....))))))))))))))))))....)))))))).((((.((((((((.....(((..((.((((((...........)))))).))...(((..((((((((.(((........)))))))))))..)))........)))...)))))))).))))...........((((((.............................((((.((((.....)))).)))))))))).....))))).......))))...)))))))))......................(((((((((....)))))))))..(((((((((((((((.((((((((.(.(...((.(((((.......))))).))..)...)..))))).........(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))).))).((((((((.....))))))))..((((((((((...((((()))))..)).)))))))).......)).((((()))))..(((.(((((((...(((((...(((..(((.((((....)))).))).))))))))....))))))))))..((((((((((((.((....)).))))))...((.((((())))).)).(((((((((.....)))))))))......))))))..)...))))).))))))))))...((((.((..((((((((((.(((..((((..(...(((((((((((((((((....))))).))))))))))))...)..))))..))).)))))))))).)).))))...............((((((((((....))))))))))........ |
|
DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................................(((((((.......((((.........))))........).......((((...................................((((..((....))))))........))))...............(((((..(......)..)))))...................((..................))......................((((.(((.......)))))))...........................(((....((((((((.......)))))))))))................((((....))))...((((((...((((((........)))).))...)))..))).................((((((...((((.....)))).))))))............(((.(((((((((....)))))))))..)))....................................((((((.......((((..(...........).....))))))))))................................................(((((((((((((((((.(((.......)))...))))).))))))))))))..............((((((((((......))))).)))))..................................................................))))))..............((((.(((((...................)))))))))..(((((((..((((((..(...((((.((((.((((((..((((((......)))).))....)))))).)))).....(((....)))..))))..)..))))))..))))))).........(((((((...(...((((.........))))...))))))))...........((....(((..((((((((.(............)))))))))..)))...((....))..........))..............(((((....)))))...............(((((....(((((((((......(((((...))))).................(....)..............(((((..................................)))))..)))))))))....)))))........................((......))..............((((((....((((..(((((.((((((....)))))).)..))))..)))).....((((((((.....))))))))....))))))..................((((...........)))).............(((.(((((((.(.....)........(((.((((....)))).))).............))))))))))..(((((((((((............)))))......(((....)))....((((((((.......))))))))......))))))....................(.(.(((((.((...((((((((..(((..((((..(...((((((((.((.(((((....)))))..)).))))))))...)..))))..)))..))))))))..)).)))))..).)..............(((((....)))))............. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((........))))..............((.....))...(((((((((.......((((.........))))........)))..))))))....................................((((..((....))))))............(((....(((.....(((((..(......)..))))))))....))).........((..................))......................((((.((.........))))))...........................(((....((((((((.......)))))))))))......(((.......((((....))))..(((((((...((((((........)))).))...)))..))))((((.(((((......((((((...((((.....))).)))))))............(((.(((((((((....)))))))))..)))...............................................))))).))))..........................................................................(((((((((((((((((.(((.......)))...))))).)))))))))))).....((..(...((..(((((((......))))).))..).)..)..))........................(((((((..((........)).)))))))................((((((((.........))))))))................................((((((...((((((((((((.((((((..((((((......)))).))....)))))).))).........((((((((((.....))))))))))............(....)(((((........((((.........)))).....)))))............((....(((..((((((((.(.(........).)))))))))..)))...((....))..........))..........((..(((((....)))))...))..........(((((....(((((((((.....(((((.....))))................((....)).........)...(((((..................................)))))..)))))))))....)))))........................((......))...........((((((((.(((.((((..(((((.(((((......))))).)..))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))..........))))..)))))))))...)))))).................(((.(((((((...(..((........(((.((((....)))).)))....))..)....))))))))))..(((((((((((............)))))......(((....)))....((((((((.......))))))))......)))))).................)))(.(..((((.((...((((((((..(((..((.(..(...(((((((.(((((((((....))))).)))).)))))))...)..).))..)))..))))))))..)).))))...).)..........(((.(((((....))))).)))......... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................((((......))))...(((..(((....((((((..((((((((((((((..((((((.((((...))))...)))))).....((((((...........))))))....)))).))))))))))..))))))...))).)))((((((.(((((.....((((............))))))))).)))))).......(((((.(((....)))...))))).....((((.......[[[[[...(((.(((.......))).)))..)))).......]]]]].((((..[[[[[[[[[[[[[[[))))...]]]]]]].....]]]].]]]]............(((.[[[..)))..]]](((.[[[[.................))).....]]]]..((((((..........((((((((..(((...[[[[[[)))...........(((((((((((((....))))))))).))))..................]]]]]].....((((..[[[[[[[(((....(((....)))..))).......))))..]]]]]]]...........((((((((((((((....)))).)))))..))))).)))))))).))))))((((((((.((((((((......))))))))..(((((.(((((((((...((((((((((......))))).)))))...(((.((((((((((.(((....))).))))))))))......)))....(((((((.......((((((...(((((((((((((.....)))))))))))))((((.....(((........((((((((..(((((......(((((((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....)))....(((((....))))).......)))........)))).....)))))).(((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))..(((....))).))))))))))))))))))))(((.(((((....)))))..)))..))))).....))).))))).....(((....[[[[[)))...(((((((((.........(((....)))....(((((...........)))))..))))))))).]]]]].............((((((((..(((..((((........)))).............[[[[[...))).....(((((..........(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))).))).((((((((.....))))))))..)))))]]]]].......(((((....[[[[.))))).....]]]].(((....)))..(((.(((((((...(((((........(((.((((....)))).)))....)))))....))))))))))..((((((((((((..........)))))....[[[[[[......((((.(((((((((.....))))))))).)))))))))))...]]]]]]...)))))))).........(((......[[[[[[[.....)))((((...(((((((((((((((((....)))).))))))))))))).((((.(((((....)))))))))....))))...]]]]]]].....((((((((((((....))))))))..)))).... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((((((((((....(((((....(((..(((....((((((..((((((((((((((..((((((.((((...))))...)))))).((..((((((.((.....)).))))))..)))))).))))))))))..))))))...))).)))((((((.(((((.....((((..((....))..))))))))).)))))).......(((((.(((....)))...)))))(((((.(((.....))).))))))))))......)))))))).(((.....)))....((((.(((((((........))))))).)))).(((......)))..(((((((...(((.....((((((....((((......)))).(((((((.(((((((((((((((.((..((((.(((((..((..((((((...((((......))))))))))....((..((..(((((((((((((....))))))))).))))..))..)).(((((......((((...))))...)))))....))..))))).)))).(((((.((..((((....(((.....)))....))))..)).)))))((((....)))).(((((((((((((((((((.(((((.(((((((.((((((...((((.(((((......(((((.........))))).((((((((((......))))).)))))...))))).))))...))))))......((((.((((((..(((((....))))).)))))).))))...((((((((((((((((((.....))))))))))))).))))).)))))))..)))))..........((((((((((..........))))))))))........))))))))))))))..........)))))...((((((((((.....))))))))))....((((((((.((.........(((((....))))).....(((((((((((((.((((((..(.(((((((...(((.(((((.((......)).))))))))..)))))))(((.(((....)))))).((((((...)))))).)..))))))...)))))))..............))))))...(((.((((.....)))).))).((..(((((((((.........((((....)).)).(((((..((...))..)))))..))))))))).)))).)))))))).)).))))).)))))....))))))))))))..(((...((...(((((.((......)))))))...))...)))........((((..((((.(((((((....)))))))...))))..))))((((((.((((((.....))))))((((((((((((((...(((....)))..)).)))))))).)))).(((((....)).))).....(((((((...(((((...(((..(((.((((....)))).))).))))))))....))))))).((((((((((((((((..........))))))..........))))))))))(((((((((.....)))))))))......))))))))))))........)))))))))).((((.((..((((((((((.(((..((((......(((((((((((((((((....)))).)))))))))))))......))))..))).)))))))))).)).)))).................((((((((....)))))))).))))))))) |
|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(.((((((((((...........((((((((...)))).))))....((.(((...((((((.....))))))...))..)))....((((((................................(((((((..((....))))))))).....)))))).....(((.....(((((..((....))..)))))))).(((((((.(.....(((((.(((....)))...)))))..).).))))))......(.((((((..(((...))).)))))).)..............(((((..((((((....(((((((((.....)))))))))))))..)).)))))....................((((((...((((((........)))).))...)))..)))..................(((((...(((((...))))).))))).........((.((((((((((((((....)))))))))).)))).))...............................(((((((.((..(.(((....)))).))...((.....))..)))))))........................................(((....((((((..((((((((((((.((....)))).).)))))).)))..)))))))).)..(((((((.((((((((((......))))).))))).)))))))...........((((.....)))).(((((((.((((......)))))))))))....((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))(((.(((.(((........((((((((.((((((.((...((((.((((.((((((((((.((((......)))).))).))))))).))))....((((....)))).))))..)).)))))).))))))))...((....))..((.(((((....))))).....))))).)))....)))......))))))..((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...((....))..)))......................((((....)))).............................(((.....)))..(((...))).................(((....))).............................(((..((((....))))..)))..(((((((((((((((.(((.((((...((((.((((((((((.....)))).)))))).))))))))..(.((((((.((.((((..(((((((((((((..)))))))..))))))..))))))...((((((((.....))))))))....)))))))........(((((((((..((..(((((((((.................(((.((((((((.((((((((.....(((((((((....))))))))).))))))))..)))))))))))...)))))..))))..)).))))))))).....((((((....)))))).(((((((((.....)))))))))............)))...))))).))))))))))...((((.((..((((((((((.(((..((((..(...(((((((((((((((((....))))).))))))))))))...)..))))..))).)))))))))).)).)))).............)))..(((((((....))))))).)))))))..) |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((...))(((((.(((..((((.(((((((.((((...))))...(((.(((........((....(((........)))...))(((......(((.......(((..(...((....(((((.............(((.......(((.....)))...).....)).((.....((((((((......))))))))))(.((((((((......((((................))))...)).)))))).).....(.((((...((.....))..))))).)))))...)).)..))).((...(.(((....((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).((.((((........)))).)).(.((....)).))))))))))...(..(((((((...((((...))))).))))))).(.....((..(((((((((((((....)))))))))).)))..))).((..(...........)..))..(...).((((((((((..(.(((....)))).))).(((.....)).)))))))))))))))))))...((((((..(((.....(.(((..(((............(.((((((...(.(((.....))...(....).)..)).))))).(((....)))(.....)(((.(((((......)))).)..)))).............((((((((.(.....((...((((...))))(((....)))....))).....)))))..))).........(((((.((((((...............)))))))))))(((((.......(((((..(...(((((((((.((((((((((((((......)))).))..)))))))).)))))....(((....)))..))))..)..))))))))))))))..)).)....(((((((.......((((....(...)))))....)))))))....)))...(((.((((((..((((((((.(((((...)).)))))))))))..)))...((....))..))).....)))..((((.(((((..((((....))))...)))...........((.((((((((((((.....))))(((.((((((....(..(((.(.....(((....)))((((...(((..(((((.....((...((((..((....))..))).))).)))))..)))))))((...))(((((...(((((..((....))..)).((......))...)))))))).(.(((((.(((.((((..(((((((((...((....))))).))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))))).......))))....).((((..((.....)))))).)).)))).))).(((.(((((((.....(((........(((.((((....)))).)))....)))......))))))))))...((((.((((((..........))))))....(((((....)))..(((((((((((.....)))))))))...)))))))))))))))))).....)).)))).(((((((.((..(((((((((..(((..((((..(...(((((((((((((((........)))).)))))))))))...)..))))..)))..))))))))).)).))))...).)))))))))))(((((((((....)))))))))))))).... |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((((.(((((((........(((......))).....(((((((.((((((((((((((....((((.(((..((((((..(.(((.........))).)..))))))..)))))))...)))).)))))))))).((((((....((..(((((((((.(((((.....((((..((....))..))))))))).)))))).......(((((.(((....)))...)))))..)))..)).....))))))...)))))))....)))))))...(((((...........((((((.((((......((((((((.......)))))))).(((((..((((....(((......(((......)))(((...((((((........)))).))...))).......((.((....))))......)))...))))...((..((((((..........((..(((((((((((((....))))))))).))))..))..............))))))..)).)))))..)))))))))).((((((.(((...((((((((...(((((.((((...........(((((...(((((((((....)))).)))))....)))))((..(((.(((((..(((((...((((((((......))))))))..(((((.(((((((((...(((((..(((......)))...)))))...(((.(..(((((((.(((....))).)))))))..)......)))....((((((........((((((...(((((((((((((.....)))))))))))))(((...((((((........((((((((.(..(((......(((((((((.((((((.(((..(((......)))..)))..)))))).)))))....(((....)))..)))).....)).)..)))))))))...((((..((.....(((((....)))))....))..)))).))))))))).....)))))).((((.((..((((((((.(((........)))))))))))..))...(((....))).)))).))))))))))))))).....((((....))))........)))))...)).))).)))))))))).))))))))).))))))))................(((....)))....))))))))).......)))))(((..((..((((....))))..))...(((((((((((((((....(((....((..((..((....))..))..)).....))).....((((..........(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))))))..(..(((((.....)))))..)..((((((((((...(((....)))..)).)))))))))))).((((.(((....)))..(((.(((((((...(((((........((..((((....))))..))....)))))....))))))))))..((((((((((((..........)))))....((.(((....))).)).(((((((((.....))))))))).....)))))))))))..))))).))))))))))...((((.((..(((((((((..(((..((((......(..((((((((((((((....)))).))))))))))..)......))))..)))..))))))))).)).))))...)))..........(((((((((....)))))))))))))))).. |
