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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00374



RNA: CRW_00374
Rfam family: -

AACCUGGUUGAUCUUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAAGUGAAAGUAUAUAUAUAUUUUAUAUGUAGAAACUGCGAACGGCUCAUUAAAACAGUUAUAGUCUACUUGACAUUUUUAUUAUAAGGAUAACUACGGAAAAGCUGUAGCUAAUACUUGCUUUAUUAUCCUUGAUUUUUAUCUUUGGAUAAGUAUUUGUUAGGCCUUAUAAGAAAAAAGUUAUUAACUUAAGGAAUUAUAACAAAGAAGUAACACGUAAUAAAUUUAUUUUAUUUAGUGUGUAUCAAUCGAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUUGAUGUUAGGGUAUUGGCCUAACAUGGCUAUGACGGGUAACGGGGAAUUAGAGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUUCUAAAGAAGAGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUGCAAGGCCAAUUUUUGGUUUUGUAAUUGGAAUGGUGGGAAUUUAAAACCUUCCCAGAGUAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAAUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUUCAAAGAAUCGAUAUUUUAUUGUAACUAUUCUAGGGGAACUAUUUUAGCUUUUGGCUUUAAUACGCUUCCUCUAUUAUUAUGUUCUUUAAAUAACAAAGAUUCUUUUUAAAAUCCCCACUUUUGCUUUUGCUUUUUUGGGGAUUUUGUUACUUUGAGUAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAAACAGUUAAAGCAUUUACUGUGUUUGAAUACUAUAGCAUGGAAUAACAAAAUUGAACAAGCUAAAAUUUUUUGUUCUUUUUUCUUAUUUUGGCUUAGUUACGAUUAAUAGGAGUAGCUUGGGGACAUUCGUAUUCAGAUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUUCUGGAGACGAACAACUGCGAAAGCAUUUGUCUAAAAUACUUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAGUGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAAUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGUGUUGGAUGAAAGUGUUAAAAAUAAAAGUCAUCUUUCGAGGUGACUUUUAGAUUGCUUCCUUCAGUACCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGCGAGUAUUCGCGCAAGCGAGAAAGUUAAAAGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCUUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACUAGUUUAAGACAAGAGUAGGAUUGACAGAUUAAUAGCUCUUUCUUGAUUUCUUGGAUGGUGAUGCAUGGCCGUUUUUAGUUCGUGAAUAUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGAUCUUAACCUGCUAAUUAGCGGCGAGUACACUAUAUUCUUAUUUGAAAUUGAACAUAGGUAACUAUACAUUUAUUCAGUAAUCAAAUUAGGAUAUUUUUAUUAAAAUAUCCUUUUCCCUGUUCUACUAAUAAAUUGUUUUUUACUCUAUUUCUCUCUUCUUUUAAGAAUGUACUUGCUUGAUUGAAAAGCUUCUUAGAGGAACAUUGUGUGUCUAACACAAGGAAGUUUAAGGCAACAACAGGUCUGUGAUGUCCUUAGAUGAACUAGGCUGCACGCGUGCUACACUGAUAUAUAUAACGAGUUUUUAAAAAUAUGCUUAUAUUUGUAUCUUUGAUGCUUAUAUUUUGCAUACUUUUCCUCCGCCGAAAGGCGUAGGUAAUCUUUAUCAAUAUAUAUCGUGAUGGGGAUAGAUUAUUGCAAUUAUUAAUCUUGAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCAUGAUUCAUCAGAUUGUGCUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAAGAUAUGAUGAAUUGUUUGGACAAGAAAAAUUGAAUUAUAUUCUUUUUUUUCUGGAAAAACCGUAAAUCCUAUCUUUUAAAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA
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DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......))))).......(((((((((.(((((((..((((.((((........((((((((.....)))))))).....))))...))))...(((((........(((.....)))..)))))...(((((((((((((((.....)))))).(((........))))))))))))......))))))))))))))))..((((((((((((((.....(((((...)))))......))))))..........(((((.((((((.....))))))...)))))....((((((.......[[[[......))))))..]]]].....))))))))........(((((((...............(((..[[[[)))..]]]]((((((((.............)))..[[[[[[...)))))...((((((.((((.((((.....))))...................((((((((((((((...)))))))))).))))......))))))))))...]]]]]]....(((((((((....(((....(((....)))..)))[[[.((((....(((.....)))....)))).)))))))))........]]]...............((((((((......(((((..(((.....((((((((.((((..((((...))))..))))...)))))))).......))).....)))))....)))))))).(((((((((((.........[[[[[[...))))))))))).......]]]]]].....((((((((((....(((((.(((...)))))))).))))))))))............(((((((...[[[[[[[[[[[[[.)))))))..........]]]]]]]]]].]]]..(((((((.((((((..(((((....(((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))(((.(((....))).))))))))..)))))).)))))))...(((....))).((((((....((((...[[[[..))))...]]]]..........(((..[[[[[)))..]]]]]................((((((((((((....))))))))))))...(((((.((((((.((((...((((........)))).)))).)))))).)))))(((((....)))))...(((((.....)))))....((((.((((.[[[[)))).))))...]]]]..............(((((((..[[[[[[..((((((.((((((...(((((....))))).)))))))))))))))))))..]]]]]]......((((((....((((((...............[[[[[[........))))))......]]]]]]........))))))(((((.....)))))..((((((.((((((.....(((....))).....))))))..)))))).((((((((((....)))))))))).)))))).....................................((((((((((((....[[[((((.......)))))))))))))))).....(((((...)))))]]]..((((((((........[[[[[.......)))))))).....]]]]](((....)))..(((.(((((((((...(((..........(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).....(((.((((....)))).)))....))).....))))))))))))..((((((((((((..........))))))...[[[[[[......((((.(((((((((.....))))))))).)))).))))))...]]]]]].......))))))).(((((.....((((((((((.(((.....((((.......(((((..((((...))))..))))).......)))).....))).))))))))))....)))))............((((((((((((....))))))))..))))....
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