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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00434



RNA: CRW_00434
Rfam family: -

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......)))))))..((((((..............(((.(((..((....))......(((....((((((....(((......)))....))).)))(((....(((..(((...))).)))......))).........)))...((....)).....)))))).......(..((...(((((....))))).)).)..............(((((........(((.....((....)).......)))..)))))..))))))........(((.....(.((((.........................(.....((((((..((........))...))))))......).......((....))..................))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(((((..............))))))))).(((.......(((....))).....)))........(((((.(((((((...((..((((((.((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((.(((..((..(((((....))).......))..))....((......))......))).).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))).)...((((.....))))..((((.(...(((((((........)))))))...).))))))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))....(..((.(...((((((..(((.....................................)))..))))))....).))...)....((((((((((....)))))))))).......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......)))))))(((((((...))))).)).................(((.....)))......((((((.((.((((....)))).)).))).)))(((....((((((.....))).)))......)))......((.....(((....))))).........................((((....))))..........(((((..((.((((((((......((((((.((....)))))...))))))))))).)).)))))...(((((.(.....))))))......................(((((.....))))).......................................................................((((((...(....((((.........))))....)))))))..........(((((..............))))).....(((.......(((....))).....)))....(((..((((((((((((...(((((()))((.(...........((((........)))).........).))....((..................................(((....)))...........))........((((((........))))))...(((((((.(((((.............))))).)))))))((.......))....(((.(...(((((((........)))))))...).)))((((.......(((((((.........))))))))))).)))...)))))))........))))).)))...((((((..(((.....................................)))..))))))................((((((((((....)))))))))).......
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......)))))))..(((([[[[[))))............((...(((.................((((((....((((....))))....))).)))..............((((((((((((((..................................((....................((((....))))....................(((((((..........(((.........))).......)))))))..............((..........))..................................((((...................)))).................................................<<<<<.........((((.........))))....))>>>>>.................................................(((....)))................(((((((.................................((((........))))........aaaaaaa...................)))))))............((......)).....................((((((........))))))................AAAAAAA......))))))))))))))......................(((((((........)))))))...{{))).....))....(((((((.........)))))))....(((((...................))))).....((}}.....................................................)).......]]]]].....(((((((((....)))))))))........
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((......))(.((((.(.(.((((((((...))))).)))...((..))((...(.((...........))).)).((((((((((......))))))))))))))))...(((((((((((((((((((((((..(((((((.(((....(..((((..)))..)..)...))))))..(......(((..)))((((((((((((((..((((((((..(((((((..((.(((((.(.((((.(.(((((((.((((((........))..((((((((.((......)).))))....(((..)))))))..((..(((((.....))))).)).)))))))))).).)))).)).))))).)))))))))(((..)))))))))))((.((((((.((..))(((((...((.(.((((.(((..))))))).).)))))))..((((..))))))))))))))))...............))))))))))(((.(((((((.......((.......))((.(((...)))).)((((..)))))).))))))))...)..(((((((...)))))))...((((((((((....((((..(....(((((((.((((((..........).)))))).).)))))...).((..))((((((........)))))).(..).))))...))))))))))))))..)))))))))))))).........((..))((((((((..))).((........)).(((((......))))).))))).((((((......).))))).((...(((((..(((.((..)).).))..))))).))..((((((((((((.(.((.(((.((.((......)))).).).).)))))))))))))))..((...(((...(...)....)))....)))))))))))....)..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((.((((...((((((((...))))).)))...(((.(((..............................((.((((....)))).))...((((.(((....((((((.....))).)))......)))..))))......................))))))...........)))).((((....))))))))))))).((((((.....(((((((.........))))))).....................................((((.................................((((((...))))))..))))...............................((....))....))))))..((((.(((((.....((((..(((.....))).)))).....(((.((((((((.........((((.(((((.........................)))))))))..((.(((((..........(((..((((((((((((...(((..(((..((((..(((((((.((((........))))....(((.(((((((..(((.................((........))....(((....)))..........)))........((((((........))))))................)))))))..(((.....((((.(((((((....((((...)))).....(((((((........)))))))...))))))).)))).....)))))).)))))))))))..)))....)))...)))))))........))))).)))...((((((........................((((((........))))))...)))))).))))).)).......)))))))).)))...))))).))))......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((.((((...((((((((...))))).)))...(((.(((......(((.....))).......((((.....((((....))))......((((((((....((((((.....))).)))......))).)))))..............))))....))))))...........)))).((((....)))))))))))))......((((..((((((((.......))))))))......(((.(((((((..............(((...(((.((...(((((((.((.......((..........((((((((((........(((((..((((..(((((((.............((....))..........................((((((........((((.........)))).....))))))..............)))))))........((.((((((.(((.......(((....)))..........(((((..(((.(((...)))...(((....))).))).)))))...((((........))))....)))..(((((.(((((..(((............((........))....(((....))).......))))))))......((((((........))))))...)))))..........)))))).)).....)))).....((((.....))))....)))))..(((((((........)))))))....)))).))))))....(((((((.........))))))).....))....)).)))))))..)).)))...)))...((((((..((......))............((((((........))))))...))))))...)))))))....)))(((((((((....))))))))).))))...