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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00446



RNA: CRW_00446
Rfam family: -

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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (...(((((((((...((..(((((((((...)))))))))...(((.(((..((((((.(......(((.....((((((...((((....))))....)))).)).(((.((((((((........)).)))..))).)))...........)))......))))))).))))))...........))...((((....)))))))))))))............((((((((.......))))))))...(((((............(((((((...........((((.....((((((...((......))....(((((((.........(((.(((......)))..)))..................((....)))))))))...........))))))...((((((.((.....((((.........))))...))))))))..........((((((...........)))))))))).((((......(((....)))....))))....)))))))..(((((((....(((((((..((((..(((((((((((((........))))....((..(((((((..(((.....)))...((((((...((((..(((....(((....)))...((((((.......))))))............)))))))...))))))......)))))))..))(((((.....))))).....)))))))))))))........((((.(......).))))))))))).((..(((((....(((((((.........)))))))..)))))..)).)))))))......)))))..(((...((((((..((....)).......................((.((((....)))).)).))))))................((((((((((....))))))))))))).........)
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......)))))))((((((((.....((((.((..(((.(((..((....))......(((....((((((....((((....)))).....))).)))(((....(((..((......)).)))......)))..((...)))))...((....)).....)))))).......(..((...(((((....))))).)).)...)).))))....(((((........(((.....((....)).......)))..)))))..))))))))......(((......(((((...(((............((((((..........(((.(((......)))..)))................(.((....))))))))).....)))....)))))...((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((...........)))))).))).(((.......(((....))).....)))........(((((.(((((((...((..((((((.((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((.(.(........(((....)))...((((((.......))))))..........).).).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))).)...(((((...)))))........(...((((((..........))))))...).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))....(..((.(...((((((..(((....((((...(((((.......)))))....))))......)))..))))))....).))...)....((((((((((....))))))))))..(........).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((..((.(((((..((((..((((((....(..(((.(((..(((((((((((........)))))((((...((((....))))....)))).((((((.((((((.(........)..)))..))).)))).)).................)))))).))))))).....)))))))..)))..))))))).))))))))).....(((...(((((((((.......)))))))).).())))....(.((((((....)))))).)....(((........)))...............................((((((((((((.......((((((((.............(((.......)))...........))))...........((((((.((.....((((.........))))...))))))))..........((((((...........)))))).....))))......))).))))))))).........(((..((((((((((((...(((((.......(..(((((((((((((........)))).................((............................))....(((....)))...((((((.......))))))...(........).......((((((((((((((.............))))))))))))))....)))))))))).........((((((.(......).))))))))))).((.(((((.....(((((((.........)))))))...))))).))))))))........)))))).)))...((((((..(((....((((...(((((.......)))))....))))......)))..))))))................((((((((((....)))))))))).............
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((..(((.((((..(((...((((((....((((((.(((..(((((((((((........)))))((((...((((....))))....)))).((((((.((((((((........)).)))..))).)))).)).................)))))).)))))).)))..))))))...)))..))))))).)))))))))........(((.((((((((.......))))))))..(((.((......((((((....))))))......)).)))....((.(((((..((...((((........))))....(((((((((((((((....((((((((.....((((....(((.......)))..)))).....))))...........((((((.((.....((((.........))))...))))))))..........((((((...........)))))).....))))..))).))).))))))))).........(((..(((((((((((....((((((...((((..(((((((((.(((........)))......((.(((((((.((....((((.(((....(((((........))....(((....)))...((((((.......))))))((((........)))))))..)))))))...)).))))))))).((((((.....))))))....))))))))))))).(((........)))....(((....))).)))))).((((((.....))))))......(.(((((((...))))))).).)))))........)))))).)))...((((((..(((....((((...(((((.......)))))....))))......)))..)))))).....)).)))))..)).((((((((....)))))))))))............
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((..((.(((((..(((...((((((.......(((.(((..((((((((((..........))))((((...((((....))))....)))).((((((.((((((((........)).)))..))).)))).)).................)))))).))))))......))))))...)))..))))))).)))))))))............((((((((.......))))))))...........(((((((((....))))).....(((((........))))).........((((........))))....(((((((((((((((....((((.................(((.......)))..........(((((....)).))).((((((.((.....((((.........))))...))))))))..........((((((...........)))))).....))))..))).))).))))))))).........(((..((((((((((((...((((((...(((...((((((((.((((........))))........(((((((..(....((((.(((.......((........))....(((....)))...((((((.......)))))).(((........)))......)))))))...)..))))))).....((((.....)))).......)))))))).))).(((........)))....(((....))).)))))).((((....)))).............(((((((...)))))))..)))))))........))))).)))...((((((..(((......((((.(((((.......)))))....))))......)))..)))))).....))))........(((((((((....)))))))))..............
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((...((..(((((((((...)))))))))...(((.(((..((((((.(......(((.....((((((...((((....))))....)))).)).(((.((((((((........)).)))..))).)))...........)))......))))))).))))))...........))...((((....)))))))))))))............((((((((.......))))))))...(((((............(((((((...........((((.....((((((...((......))....(((((((.......(.(((.(((......)))..))).)................((....)))))))))...........))))))...((((((.((.....((((.........))))...))))))))..........((((((...........)))))))))).((((......(((....)))....))))....)))))))..(((((((....((((((((((.((((((((.....((((........))))....((..(((((((..((((.(((.(((((......((........))....(((....)))...((((((.......))))))..............)))))....)))))))....)))))))..)).)))))))).....(((((...)))))..))))).....((((((.(......).))))))))))).((..(((((....(((((((.........)))))))..)))))..)).)))))))......)))))..(((...((((((..(((......((((.(((((.......)))))....))))......)))..))))))................((((((((((....)))))))))))))..........
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((...((..(((((((((...)))))))))...(((.(((..((((((................((((((...(((......)))....)))).))((((.((((((((........)).)))..))).))))....................)))))).))))))...........))...((((....)))))))))))))............((((((((.......)))))))).....................((((((...........((((................................................(((......))).......................((....))...........................((((((.((.....((((.........))))...))))))))...........(((((...........))))).)))).((((......(((....)))....))))....))))))...((((((((...((((((..........(((((((.((((........))))........(((((((..(((.................................(((....)))...((((((.......))))))...........................)))....))))))).........................))))))).............((((..........)))).)))))).............................((((((.....))))))..))))))))...................((((((.....................................((......)).....))))))................((((((((((....)))))))))).............
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((...((..((((((((.....))))))))...(((.(((..((((((........((((..(((...(((....))).)))..))))..(((...((((.((((((((........)).)))..))).))))..)))...............)))))).))))))...........))...((((....)))))))))))))............((((((((.......))))))))...(((((............(((((((...........((((.....((((((........((((........)))).......(((((((((......)))..((((....((....)).....((....))............))))...........((((((.((.....((((.........))))...))))))))...........))))))....))).))).....)))).((((......(((....)))....))))....)))))))..(((((((....(((((((......(((((((((((((((........))))....((..(((((((..(((.....)))...((((((...((((..(((....(((....)))...((((((.......))))))............)))))))...))))))......)))))))..))...((((........)))).))))))))......(((........)))......)))..))))))).((..(((((....(((((((.........)))))))..)))))..)).)))))))......)))))..(((...((((((..(((......((((.(((((.......)))))....))))......)))..))))))................((((((((((....)))))))))))))..........