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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00451



RNA: CRW_00451
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......))))))).....((((((((.............))))))))..(((((....)))))..(((((((...(((......)))...)))).)))....(((((((((((..(((((((((.....((((((((((.............((((....(((((((.......((((((.((...(((.(((((((...(((((((((.......((((((((.......))))))))..(((((..(((..(((((......)))))...)))))).))...)))))))))...............((((((((........(((..(((......)))....((((..............))))...))))))))))).....))))))).))))).)))))).((((...))))...........)))..))))...))))...((((((((((((.......)))))))....)))))......))))....(((((..........(((..(((((((((((((..((.......)).((((((((....((((........)))).........((((((..((..(((..((........(((........)))...(((....))).))...)))..))((.....((..((((........((((..(((((((((((((.............)))))))))))))...)))).......))))...(((((((........)))))))....))..((((((....))))))..))..)))))).......))))).))).)))))))........)))))).)))...((((((..(((......(((((................))))).......)))..)))))).)))))......))))))))).))))))..)))))))))))......
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......))))))).................................((((((((....)))))..............................)))..................................................(((....)))............................(((....)))......................((((((((.......))))))))................................................((((..................(((((((......(((((...(........)....)))))........................)))))))............))))....((((((........((((.........)))).....))))))...........(((((((.......)))))))...............((((....))))...............(((((((.................................((((........))))..................................))))))).....................((((........)))).........(((....))).......((((((((((((((.(..(.....)).))))))))))))))(((((....((....(....(((((((........)))))))....).....)).)))))...............((((((.................))))))...................((((((..(((.....((((((................))))))......)))..))))))................((((((((((....)))))))))).......
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......)))))))((((((((..(((((((.(...(((.(((.......(((((....)))))...((((((...(((......)))...)))).))........(((..(((....))).))).......(((((..............)))))......))))))........((((...(((((....))))).))))).).))))))....(((((........(((.....((....)).......)))..))))).)).))))))......(((.......((((...(((.........................(((((..(((......)))...)))))..............(.((....)))...........)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..................................))).(((......((((....))))....)))........(((((.(((((((...((..((((((.((((((((.(...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((.(.(.(((..(((((....))).......))..)))...((((....))))..).).).)))...))))))))....)))))))...).)))))))).)...((((.....))))....(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))....(..((.(...((((((..(((.....((((((................))))))......)))..))))))....).))...)....((((((((((....)))))))))).......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......)))))))......(((((((.......)......))))))((((((((....)))))......(((...(((......)))...))))))......(((((((..(......)........(....).))))))).....(((....)))..................(((((....((((....))))..)))))..............((((((((.......))))))))...()((........((((......)))).......)).........(((((...((............(((((((((.....((((((.(((......)))..)))))).......................))))))))).....))....)))))...((((((...(....((((.........))))....)))))))..........((((((((.......)))))))).....(((......((((....))))....)))........((((((((................(((((...........((((........))))...........))))).................)))))))).............((....))((((........))))....(((..(((....)))...))).((((((((((((((.(..(.....)).))))))))))))))(((((...((((...(....(((((((........)))))))....)....)))))))))...............((((((.((...........)).))))))............((.(...((((((..(((.....((((((................))))))......)))..))))))....).))........((((((((((....)))))))))).......
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......))))))).....((((((((.............))))))))..(((((....)))))...((((((...(((......)))...)))).)).....(((((((((((..(((((((((.....(((((((.(((.(.((.......((((....(((((((.......((((((.((...(((.((((((((((.((((((((.......((((((((.......))))))))..(((((.......(((((......)))))......)).)))...))))))))))).............(((((((((.....((((((.(((......)))..)))))).......................))))))))).....))))))).))))).)))))).((((...))))...........)))..))))...))))...((((((((((((.......)))))))....)))))......((((....))))...........(((..(((((((((((((..((.......)).((((((((.((.((((........)))).........((((((((((.((.((..(((......(((........)))............((((........))))....(((..(((....)))...))).((((((((((((((...((.....)).))))))))))))))....(((.........))).(((((((........)))))))...)))..)).)).))))............))))))....)).)))).)))).)))))))........)))))).)))...((((((..(((.....((((((..((........))..))))))......)))..))))))....)).)))))))))))))).))))))..)))))))))))......
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......))))))).....((((((((.............))))))))..(((((....)))))...((((((...(((......)))...)))).))......((((((((((..(((((((((.....(((((((..........((......))...................((((....((((....))))..))))...............((((((((.......))))))))...............(((........))).........................................(((((((......((((((.(((......)))..))))))................((....)))))))))....................((((((........((((.........)))).....))))))...........(((((((.......)))))))................((([[..)))................]]...........................((.((......((((........)))).....................................((........)).............((((........))))..........................((((((((((((((.............))))))))))))))....................(((((((........))))))).....................((((((......{{{))))))...))..))........}}}...................((((((..(((.....((((((................))))))......)))..))))))...........)))))))))).))))))..)))))))))).......
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.......))))))).....((((((((.............))))))))..(((((....)))))...((((((...(((......)))...)))).)).....(((((((((((..(((((((((.....(((((((.(((.(.((.......((((....(((.(((.......((((((......(((.((((((((((.((((((((.......((((((((.......))))))))..(((((.......(((((......)))))......))).))...))))))))))).............(((((((((.....((((((.(((......)))..)))))).................(....)))))))))).....))))))).)))...)))))).(((.....)))...........)))...)))...))))...((((((((((((.......))))))).(......)......((((....))))......)))))(((..(((((((((((((..((.......)).((((((((....((((........)))).........((((((...........((((......(((........)))............((((........)))).........(((....)))..)))).((((((((((((((...((.....)).))))))))))))))....................(((((((.(.....))))))))..............................)))))).......)))).)))).))))))))........))))).)))...((((((..(((.....((((((..((........))..))))))......)))..))))))....)).)))))))))))))).))))))..)))))))))))......
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UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((..(.(((((((.........((((((((.............))))))))..(((((....)))))...)))......(((......)))....)))).)..))..((((((((((..(((((((((.....(((((((................((((....(((((((.......((((((.((...(((.(((((((...(((((((((.......((((((((.......))))))))..(((((.......(((((......)))))......)).)))...)))))))))...............((((((((......((((((.(((......)))..))))))................((....)))))))))).....))))))).))))).)))))).(((.....)))...........)))..))))...))))...((((((...................(((......)))....((((....)))).....))))))((((((((((((........((.(((.((((((((..((.....((((........)))).....((.(((((((.((....((..((((......(((........)))...(((((....((((........))))..((((....)))).....)))))...))))..))..)).)))))))))...))..))))..........)))).............(((((((.(.....))))))))...))).))........................((((((...((........))..)))))).....))))))).......((((((..(((.....((((((..((........))..))))))......)))..))))))..)))))....)))))))))).))))))..)))))))))).......