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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00456



RNA: CRW_00456
Rfam family: -

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((.........)))................................................................((((.........)))).....(((((((..................................))))))).......(((....)))............................(((....)))..................................((.(((.((....)))))....))........................................................................(((.((((......))))..)))...(((.........(((....)))..........)))............((((((........((((.........)))).....))))))...........((((((...........))))))...........................................(((((((((((((.(((.......)))((((((((.............................................((((((.......((((((............................................................................)))))).......))))))......................................((((((((......))))))))...................(((((((.........)))))))))).))))).))))))))........))))).......((((((..(((.......................................)))..))))))................((((((((((....))))))))))......
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......))))).((((((((...((((((((....(((.(((..((....)).((((.(((....((((((....(((.........)))....))).)))(((....(((..(((......))).)))......))).................))).))))...)))))).......(..((...(((((....))))).)).).)).))))))................(((.....((....)).......)))..........)))))))).....(((.....(.(((...................................((((((((......)))).))))...((((....((..(((....)))..)).....))))...))).)....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(((((((...........))))))).))).(((........((....))......)))........(((((.((((((((..((..((((((.((((((((.....(.((........)).)........(((.(((...........((.((((..((((((.(.(..((..(((((....))).......))..))....((.....))......).).).)))...))))))))....))).))).....)))))))).)...((((......))))..........((.......((((((((......))))))))......)).))))).....(((((((.........)))))))......))..))))))))))).))....(..((.(...((((((..((((.....................................))))..))))))....).))...)....((((((((((....))))))))))......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......)))))........................................(((....)))........((...((((.........))))...))((((((((..........(((.......)))........).))))))).....(.(((....))).).........................((((....)))).....................((((.......(((((((.((....)))))...))))......................)))).............................................((((((((......)))).))))...((((...((((.(((....)))..))))...))))............((((((...(....((((.........))))....)))))))..........(((((((...........)))))))(....)(((.......((....)).....))).....(((..(((((((((((((.(((.......)))((((((((....................................((((((...(((((((....(.(((((((.(((....((......))..................................................)))...))))))).)....)))))))......((........))................(...((((((((......))))))))...)......))))))...(((((((.........)))))))))).))))).))))))))........))))).))(...((((((..((((.....................................))))..))))))....).).........((((((((((....))))))))))......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((.....(((.(((((((((...((((((......(((.(((...........((((.((((((......))).((((.........)))).....((((((((....(((..(((......))).)))......))).)))))...........))).))))...)))))).....((((......(((((....)))))....)))).))))))...(((.((((......((((...(((.....)))..)))))))).)))...)))))))))....)))....(((((((....((((((........((((((..........((((((((......)))).))))...............(((....))))))))).))))))....))))....))).....)))))).(((..[[[...)))..]]]...........................(((..............(((.((((.....(((.......)))..))))....((((((((((((((((((.(((.......)))((((((((...................(((...))).......((((((((((..(((........(((((((........(((....))).......(((((((((.......(((.(((.....))).)))....))).))))))))))))).......((((.......((((......)))).........))))......((((((((......))))))))..))).))).)))))))..(((((((.........)))))))))).))))).)))))))))............)))....((((((..((((..............((((.(((....))).))))...))))..)))))).)))))).......)))(((((((((....))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((..(((.((((((((....(((.(((....)))........((((((((......))).).)))).(((((((((..((..............((((((((....(((..(((......))).)))......))).))))).......(((....))).((((((.(((((.....((((((...........))))))....)))))..........(((((......(((((((.((....)))))...)))).....................))))).....)).))))...((((((........((((((..........((((((((......)))).))))...............(((....))))))))).)))))).((((..(((((.((..((((.....((((.........)))).(((((((.((...............................(((((....))))).((((.((....))............(((..((((((((...((((........((((.((.(((........((........)).........).))))))))(((.....))).))))))))))))..))).......(((....)))......)))).))..))))))).(((........))).)))).)).)))))....)))).((((((((((((.....)).))))).))))).......................((((((((......))))))))...))..))))))).))..)))....))))))))))).....).))))))))...............(((...((.....((((((..((((..............((((.(((....))).))))...))))..))))))......))......))).((((((((....))))))))........
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((.......))))....((((((...))))))............((((....((((((((((((....(((......((((.........)))).....((((((((....(((..(((......))).)))......))).))))).......(((....))).(((....(((((.............(((((....)))))....((((...(((((((.....((((....(((((((.((....)))))...))))(((..............................[[[[))).((((((............(((...)))...((((((((......)))).))))..........((((.(((....)))..)))).))))))....]]]].....((((..((((...)))).)))).))))......))))))).....))))..(((((((.((......))))))))).....((((....................)))).........(((((((((((((.(((.......)))((((((((...................................(((((((.....(((.(((((.................(((....)))........{{{{{{{{.))))).(((.(((.....))).)))....}}}.}}}}}((((.((((((((((((.....)))).))).))))).............))))......(((((((((...).))))))))..))).....)))))))..(((((((.........)))))))))).))))).))))))))........))))).))))).((((((..((((....(((............(((....))).)))....))))..))))))....)))........)))....)))))))..)))))))))......
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((..(((....(((((((((...((((((.(((..(((.(((..((((...(((....)))...))))............................((((((((....((...(((......)))..))......))).)))))......................))))))...............(((((....))))).....))).))))))...(((.(((......((((..................))))))).)))...))))))))).......((.....((((....((((((........................((((((((......)))).))))...............(((....))).......))))))....)))).....((((..((((...)))).))))..))...........)))..)))))))............................(((.((((.......((....)).....))))....((((((((((((((((((..............((((((((....................................((((((................(((((..........(((....))).......(((((((((.......(((.((.......)).)))....))).))))))..)))))...................................................((((((((......))))))))..........))))))....((((((.........)))))).))).))))).))))))))........))))).......((((((.................................................))))))..))))).......))).((((((((....))))))))........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((..(((((..(((((((((((.((((((.((((.(((.(((..((((...(((....)))...))))........((.(((..............((((((((....(((..(((......))).)))......))).)))))..............))).))..))))))...............(((((....)))))....)))).))))))..))....(((.....(((((...(((.....)))..)))))...)))....)))))))))....((.(((....((((....((((((........................((((((((......)))).))))...............(((....))).......))))))....)))).....((((..(((.....))).)))).))).)).....)).)))..))))))).....................(((((((.((.((((.......((....)).....))))....(((((((((.((((((((.....((....)).((((((((...................................(((((((.((..(((......((...((((((.((...(((....))).......(((((((((.......(((.(((.....))).)))....))).)))))).)).))))))....((((.......((((......)))).........))))..))..((((((((......))))))))..)))..)).)))))))..(((((((.........)))))))))).))))).))))))))))).................((((((..((((..............((((.(((....))).))))...))))..)))))).)))))).......)).(((((((((....))))))))))))))))