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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00499



RNA: CRW_00499
Rfam family: -

GGUCAAGUAAGAAAGGGCGUACGGGGGAUGCCCGGGCAUCAGGACGCGAUGAAGGACGUGGCUUUCUGCGAUAAGCAACGGGGAGUUGUAAGCAAGCAUUGAUCCGUUGAUUUCCGAAUGGGGCAACCCUCUUGGUGAAUAACCGAGAACGCAAACGCGAGCAAAGUCGGGGAAUUGAAACAUCUUAGUACCCGGAAUAAAAGAAAAUAAGAAUGAUUCCGUCAGUAGCGGUGAGCGAACGCGGAAGAGCCUAAACCCCUGCCUACGUUACAGAUCUAAUUCGCUGUAGCAGGGGUGUUGUAGGACUGGCAGGAGUAGAUUAGAAUGCUCCACAAAGUUACCAAGCACAAGAUUAGCAGAACGGUAUUGGAAAAGCCGACCAUAGAGGGUGAAAGUCCUGUAAGCGAAAAUUUUGUGCCUUUGGCCAGUAUCCUGAGUACCACGGAACACGUGUAAUUCAGUGGGAAUCUGCGGGGACCACCCCGUAAGGCUAAACAGUACCUGAUGACCGAUAGAGAACAAGUACCGCGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCGGGGGACCGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGUAUGCUUACAAGGUAUCAGAGCCUUUUAAUGGGUGAUGGUGUGCCUUUUGUAGAAUGAGCCGGCGAGUUAUUUUACGUUGCAAGCUUAAGGCAGUGAGAUGCCGUAGGCGAAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUAAAGUAGCGUGGAAUAGACCCGAAGCCUGUCGAGCUAUCCAUGUCCAGGUUGAAGGUGGGGUAAAACUCACUGGAGGACCGAACCCUUUUUCGUUGAAAAGAAUUGGGAUGAGGUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCUAUCAAGGCAGGCGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGGUUUAGGCCUAGCGUCAGUUGUUUAGUUGCGGGGGUAGAGCUCUGAAAGGACUAGGGGGCCCACAAGCUUACCAAACCCUAUCAAACUUCGAAUACCGUAACUCCAAAGACUGGCAGUCAGACUACGGGGGAUAAGCUCCGUGGUCAAAAGGGAAACAGCCCAGACCGUCGUUUAAGGCCCCAAAGUUCAUGCUAAGUGGCAAAGGAUGUGGGGGCGCAUAUACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGCUCCCGCGCCGAAAAUGUAAUCGGGACUAAGCAUGGCGCCGAAGGCACGGAUUCCGUAAGGAGUGGUAGGAGAGCGUUCUUUCUUCCGUUGAAGGCGUACCGUAAGGAGCGCUGGAGGAGUAAGAAAUGAAGAUGCUGGCAUGAGUAGCGUAAAGGGGAGUGAGAUUCUUCCCCACCGAUAGCCUAAGGGUUCCCCGGGAAGGCCAAUCCGCCGGGGGUUAGUCGGCCCCUAAGACGAGGCUAAGAAUGCGUAGUCGAUGGGAAGCAGGUUCAUAUUCCUGCACCGAGUAAAUUGUGCGAUGGAGUGACGCAGGAGGAUAGUUAGUGCGGCUUAUUGGUUGCCGUUGCGAGUAGUAGGCAUUGAGAGUGAUUGGAAAAUCCGUCACUUGAGCUGAGAACUCGCGGGAUCCUAACGAAUGUUAGGCGUAGCUUUCGACUCCAAGCUGCCAAGAAAUAGCUUCUAAGUUUAGGUUUAUUCGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGGCAAGUAGAGAAUACUAAGGUGUUCGAGAUAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAUUACUCCUGUAACUUCGGGAUAAGGGAGACCGGAGAUGCUUUAGCCUGCGGCAAAGAGUAUCGAAGGUGGCACAAAAAUGGGGGUAGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGACUCUGCCAAAUCGGAAGAUGAAGUAUAGGGUCUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUCAAGAGGACGGGUUAGCAGCAAUGCGAAAGCUCGGAAUUUAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUGACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGUGUAACGACUUCCCCACUGUCUCAACGAGAGUCUCGGCGAAAUUGUAGUACCCGUGAAGAUGCGGGUUACCUGCGAUAGGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUAACCUGGCAUUGAACUUUGGUCCUGUAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUAUGAAAUCUGGACGCCAGUCUGGAUGGAGCCGUCGUUGAAAUACCACCCUUACUUGACCCAAGUUCUAACCGAAUGAAACAACAUUCGAGACAAUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGCGCGGACGGAAAUCGCGCCAAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUAACUGUGAGACAGACAAGUCGAGCAGGUACGAAAGUAGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUCGCGUCCAAGAGUCCAUAUCGACGACGCGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCAUCGCAGGCGUUGGAGAUUUGACGGAAUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGAACCUCUGGUGUAUCAGUUGUUUCGCCAGAAGCAACGCUGAGUAGCUAUGUUCGGCAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUAUAAGUGGGAAACCCUUCUGAAGAUAAGAUCUCCCUGGGAGCAAUCCCCUAAAGACCCCAAGAAGAUGACUUGGUUGAUAGGUCACAGAUGCAAGUGUGGUAACACAUUCAGUCGAGUGAUACUAAUCGGUCGUGAGGCUUGACCAU
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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(((.((..(((((((((...(((..(((((.((((((.(((((((.((((((.(((.....(((((((....(((......)))....)))))))..((((((..(((....))).((((((.....))))))..(((....))).......))))))........(((((((((.(((((.........................((((.(((((..((((...((((((....((((.((((((((.((((.....((......))..))))))))))))....)))).(((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.((....((((.((....))))))....((.((((......)))).)).))...))))))))))))))))))))..((((((((..((((.....))))..)))))).))...)))))).......(((((((..(((((((((...((((((..((..(((((((.....((....))..(((((........((((....)))).............((((.((((((....)))..))).)))).)))))......(((.((.((.((((((..((((.......(((....((((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))...((....))..((((.....))))......))))))))))))))..)))..((((.(((..(((((((((.((.((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..)))....)))))))))))...))).)))))))).)))))).)).)).))).))))))).))...(((((....))))).)))))))))))))))))))))).....)))).....(((((..((((((............................((.....)).........((((.(((.(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).))).)))))))..))))))..))))).)))))..))))...((.(((((((((((.....(.(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))).).)))))))))))))..........))))))))))).))).))).))))))....(((((....))))).........)))))))..(((((......(((((.((....)).))))))))))................(((((((((((..((.....((((((.(.....)))))))......(((((......((((((((...(((.(((((...((((..(((((..(((...(((...((.......))...)))...)))..(((((........)))))((((......(((((((..(((((......((((((.(((((..(((((.........)))))..(((((....(((.....(((((((.((.....)))))))))..)))....)))))......((((((....))))))..))))).))..))))..((((((.((((.....))))................((((((...((..(((......)))..))..((((.((((((....))))))..((((.((((.(((.(((.....((((......(((((......)))))...((....)).....))))....)))..)))..))))))))...(((.((..........((((((.(..(((((.....)))))..((((((((....(((....)))......))))))))....)))))))..((((((..(((..(((...(((((..(((....)))....)))))...)))..)))))))))....)).)))....)))).))))))....))))))...)))))..((((((.....)))))).))))))).))))....))))).))))..(((((((......((((((((((.(((((((.((((((......))))))...)))))))...((((.......))))........(((((..(((((((((((((((.((((........(((((...(((((..((((.....(((..(((....)))..)))..))))............))))))))))..)))).))))))....((((((......))))))....)))))))))...)))))))).)))))))...(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).))))))))).....)))))))........((((...(((....)))..))))..(((..((((((((((.......)))))))))).))).)))))....)))..))))))))....)))))(((((((((...((.......))...)))))))))..))..))).)))))))).)))))).)))))..)))...))...(((((.(((.((((((((((............(((((((.((..((((((.(((((((....))).))))........((((((.(...(((..(....)..)))......((((((......)).)))).).)))))).)))))))).))))))).((((((((....))))))))...)))))))))).(((((.((((....(((((...........)))))....)))).)))))..........))))))))...)))))))....)))))......((((((.(((((....(((((.(((...((((((....))))))..)))..)))))..)))))))))))...)))))).).)
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..............(((((((.((((((.......................................(((((((....((........))....)))))))..........(((....)))(((((((.....)))))))..........................................................................................................((((((((......(((((..........)))))))))))))......((((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.((....((((.........)))).......(((((....)))))....))...)))))))))))))))))))))..))((((...((((.....))))...))))..........((((((....)))))).......................................(({{..)).......((......((ffffffff))................................((((((((..((((......))))..))))..))))..........((((((((....(((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))...((....))..((((.....))))......)))))))))))))........(((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))....(((..(((........)))..)))....)))))))))))((((.....)))).....)))))))....)))))))).........(((((....)))))(((((((((dddd.(((((((.........................(((......)))..........................)))))))......))))).......((((((((((......))))))))))....(((......)))..........................(((((..ee..)))......((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))...)))))))))).((((........))))..EEDDDD.))))))...........(((((....)))))..............(([[(((((......(((((.((....)).))))))))))....))]]............................((((((.......)).))))..............FFFFFFFF...................((...ggggggg))....(((...((hh.....)).HH)))........(((((........)))))...........(((((...(((((...(((((((.............................(((((((....(((.((..(((((((..........))))))))))))....)))))))((.(((.(((((..(((((((..(((((........)))))))).....................(((.......)))..........((......))............((((((....))))))....))))..)))))..))).))..........))))))).)))))............(((...(((((((..(((...)))...)))))))...))).))))).........GG..GGGGG................(((((((((...(((....)))...))..)))))))..............(((((..(((........((((((.(((....)))...))))))........)))))))).......((((((.......))))))..((((..........)))).............................................((...((..................(((((((.(((((((....)))))))...)))))))....(((.......))).........(((((..(((((((((((((((.((((..(((...........(((((((((((.....((((((((....))))))))..)))).)).........)))))..)))..)))).))))))....((((((......))))))....)))))))))...)))))...........((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......))))))......((......))..)))))))))..aaaa))ccc))....CCC..AAAA.(((....))).............((((((((((.......)))))))))).................................(((.((((((((...((.......))...))))))))..))).....................(((((((((((......))))))).)))).<<<<...))>>>>......}}............(((....(((((((....))).))))...)))................................((((((((...............)))))))).......((((((.....bbbbbbb))))))BBBBBBB..............(((((.((((....(((((...........)))))....)))).)))))...........))))))....)))))))........((((.......))))...((...(((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).....)).........))))))))..
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......(((.(.........).)))......(((((.((.(((.....))).)).)))))((.....(((((((....(((......)))....))))))).....))...(((....)))(((((((.....))))))).(((....))).......((.(((.(((((......))))).))).))....................((((((.....((.....))....)))))).(((((..((((((((.((((.....((......))..))))))))))))........((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.((.....(((..(((.....)))))).((.((((......)))).)).))...))))))))))))))))))))).((((((((..((((.....))))..)))))).))......((((((....)))))).)))))........(((.(((((((((((..........((((((.(((..((((.....)))).((((((((((.((....(((((((....(((...........(((..((..((((......))))..))....)))(...(.((...((((((((...((((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))...((....))..((((.....))))......)))))))))))))).......(((((((...(((((((((.((.((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..)))....))))))))))).(((.....)))......)))))))....)))))))).)).).....((((....)))).(((((((((....((((((((.....(.....(((.(((....((.(((......)))..))....))).))).....).....)))))))).....))))))).(...((((((((((......))))))))))....(((......)))...).....................(((((((.(((..........((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))...)))))))))).((((........)))).))).))))))).))...).((.....((((....)))).............(((((((((((......(((((.((....)).)))))))))))..)))))......((((((.......))))))...((((((.(.....))))))).......(((....))).((((((....(.....)..))))))..(..((((.(((...(((...((.......))...)))...)))..(((((........))))).)))).....((((((...(((((...(((((((.............((((((((.((((....)))).)))))))).....((((((.((((...))))))))))..((((((..((.((((((.((((((....)))))).(((((((........)))))))..((((.....)))).......((((.....)))).....((..(((......)))..)).......((((((....))))))........))))))..))...))))))......))))))).)))))............(((...((((((((.(((...)))..))))))))...))).)))))).................)...............(((((((((...(((....)))...))..))))))).......))(((.((((((..(((..(((...((((((.(((....)))...))))))...)))..)))))))))..))).((((((.......))))))...(((..........))).((((((.....)))))).(((((.....)))))........((......(....((((...)))).....((((((((((((((......)))))).).))))))).((((((.......))))...))...(((((..(((((((((((((((.((((..(......((.....(((((..((((.....((((((((....))))))))..))))............)))))..)))..)))).))))).....((((((......))))))...))))))))))...)))))..)....))..((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).)))))))))..((((..(((......)))..))))..((....))..........(...((((((((((.......))))))))))..)..))).....))))))).(((((.......((((((((((((...((.......))...))))))))).))).)))))...(((((((((((((((((((((((......))))))).))))(((((.....))))).....)))....))))))))).((((........)))).)).)))))))))).))).)))).))....(((((((.(((((...))))).....(((.(((((..((.......))..))))).)))..(((((((((((....)))))))..)))).....(((.(((((.((((....(((((...........)))))....)))).))))).))).)))))))..((((....))))(((..((..(((((.......)))))))..)))(((((.(((...((((((....))))))..)))..))))).)).))))))))).))))))))))..
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(((.cccc..)))CCCC.....(((((....(((.....)))....))))).......(((((((.((.(((......)))))..)))))))..........(((....)))(((((((.....))))))).(((....)))..........(((.(((((......))))).))).......................((((((..................)))))).(((((.(((((((((.(((((..............).)))))))))))).)......((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((........(((..(((.....))))))....(((((....))))).........))))))))))))))))))))).(((((((((.((((.....))))).)))))).)).....(((((((....))))))))))))........(((.(((((((((((..........((((((.(((..((((.....)))).((((((((((.......(((((((....((((..............(((..((((......))))..))).(((....(((.(((..((((((((..(((((((((((((((..(((((.((((......)))).))))).............((((.....))))......)))))))))))))).).....(((((((...(((((((((.((.((((...((((((.(...)))))))....))))...(((...(((........)))..)))....)))))))))))((((.....)))).....)))))))....))))))))))).)))..(((((.<<<)))))..(((((((bbbbb(((((((.....(((...(((.((([[[....(((......)))........))).)))...))).....)))))))......))))))).(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).)))...aaa............]]]...((((....)))).....(((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))...)))))))))))((((........))))...BBBBB.............)))..(((((....)))))....{{{.....(((((((((((......(((((..........)))))))))))..)))))......((((((.(....)))))))...((((((.((...)))))))).......(((....))).((((((.............)))))).(((.((((.(((...(((.................)))...)))..(((((........))))).)))).))).((((((..((((((...(((((((.............((((((((.((((....)))).)))))))).....((((((.((((...))))))))))..((((((.....((((((.((((((....)))))).(((((((........)))))))..((((.....)))).......((((.....)))).(((.....(((......)))......)))..((((((....))))))........)))))).......))))))......))))))).))))))...........(((...((((((((.(((...)))..))))))))...))).)))))).................((((.....)))).(.(((((((.....(((....))).......))))))))........(((.((((((..(((..(((...((((((.(((....)))...))))))...)))..)))))))))..))).((((((....AAA))))))..((((.((.....))))))((((((.....)))))).(((((.....))))).....................((((...))))(((..(((((((((((((((....))))))).).)))))))(((((((.......))))...)))..(((((..(((((((((((((((.((((..(((...........(((((((((((.....((((((((....))))))))..)))).)).........)))))..)))..)))).))))).....((((((......))))))...))))))))))...))))).)).).........(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....)))....>>>.(((..((((((((((.......)))))))))).))))))).....))))))).(((((.......((((((((((((.....(((......)))))))))))).))).)))))...((((((((((((((((((((((((...).))))))).))))(((((..}}}))))).....)))....))))))))).((((........))))....)))))))))).))).)))).))....(((((((((((((...)))))..(.((((.(((((...............))))).)))))(((((((((((....)))))))..)))).....(((.(((((.((((....((((((........).)))))....)))).))))).)))))))))))..((((....))))(((......(((((.......)))))....)))(((((.((((..((((((....))))))).)))..))))).)).))))))))).))))))))))..
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(((.((..(((((((.((((((..((((((.(((((((.((((((.((((((.(((.....(((((((....(((......)))....))))))).(..((((..(((....))).((((((.....))))))..(((....))).......))))..).......(((((((((.(((((.........................((((.(((((..((((...((((((....((((.((((((((.((((.....((......))..))))))))))))....))))((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.((....((((.((....))))))....((.(((((....))))).)).))...))))))))))))))))))))).((((((((..((((.....))))..)))))).))...)))))).......(((((((..(((((((((...((((((..((..(((((((.....((....))(((((((........((((....)))).............((((.((((((....)))..))).)))).)))))))....(((.((.((.((((((..((((.......(((....((((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))...((....))..((((.....))))......))))))))))))))..)))..((((.(((..(((((((((.((.((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..)))....)))))))))))...))).)))))))).)))))).)).)).))).))))))).))...(((((....))))).)))))))))))))))))))))).....)))).....(((((..((((((............................((.....)).........((((.(((.(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).))).)))))))..))))))..))))).)))))..))))...((.(((((((((((.....(.(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))).).)))))))))))))..........))))))))))).))).))).))))))....(((((....))))).........)))))).(((((((......(((((.((....)).))))))))))))..............(((((((((((..((.....((((((.(.....)))))))......(((((..(...((((((((...(((.(((((.......(((.((((.(((...(((.(.((.......)).).)))...)))..(((((........))))).)))).)))..((.(((((((..(.((((((((....((((...((.((((((((.((((....)))).)))))))).....(((((((.((.....)))))))))..))....))))(((.((((((((................((((((((((((((((((((...............(((..((((((((((..((((..(((.....(((((.((((..(.......)..))))...)))))(((((...((((((((.(((......((......(((((....(....).....)))))(((...((((((((.(((...)))..))))))))...))).)).......(((((.(((.(((((((.............((((((((....(((....)))......)))))))).((..(((((...((((((..(((..(((...((((((.(((....)))...))))))...)))..)))))))))...)))))..))......))))))))))..((.(((..(((((..((((((.....))))))..)...))))..))).)).....)))))...))).))))))))))))))))..(((((((.((((((......))))))...)))))))...))))...))....))))))))..)))....(((((((((((((((.((((........(((((...(((((..((((.....(((..(((....)))..)))..))))............))))))))))..)))).))))))....((((((......))))))....)))))))))..)))))))))...(((((....))))).....))))..)))))))((((..(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....))))))).))).))))).))).)))))))).).....))))))).)).)))))....)))..))))))))...))))))(((((((((...((.......))...)))))))))..))..))).))))))))))))))).)))))).(((..(((..(((((..(..(((((((((((............(((((((.((..((((((.(((((((....))).)))).(((....((((.((....)).)))).....)))....((((((((..((.(....).)).)))))))).)))))))).))))))).((((((((....))))))))...)))))))))))..)....)))))....)))...)))....(((.((....)))))................))))))....)))))))....)))))......((((((.(((((....(((((.(((...((((((....))))))..)))..)))))..)))))))))))...))))))))..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(((.((..(((((((((...(((.((((((.(((((((.(((..(((((((((.((.....(((((((....(((......)))....))))))).....))...((((.((((((((((((.....))))))...((..((((........((.(((.(((((......))))).))).))........................(((((((..(((((((...((((((....(((..((((((((.((((.....((......))..))))))))))))........((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.((....((((.((....))))))....((.((((......)))).)).))...)))))))))))))))))))))...((((((..((((.....))))..)))))).)))..))))))(((....(((((((..(((((((((...((((((..............................(((........((((....))))...........)))...................((...((..((((......))))..)).....))...........((((((((...((((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))...((....))..((((.....))))......)))))))))))))).......(((((((...((((((((..((.((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..)))..).)..)))))))).((.......))......)))))))....)))))))).........(((((....))))).))))))))))))))))))))))....((.(((....)))))......)))....)))))))....(((((((...........((((..((....((((.(((.(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).))).)))))))..(((..........(((((.(((.........(((((((((((.......(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))...)))))))))))((((........)))).))).)))))...)))..))..))))..(((....))).))))))).......((((((((((......(((((.((....)).)))))))))))..))))........))))))).......))))...((((((.(.....))))))).......))...)))))))))).))))))))).)))(((((((((......))))).....((((.((((...(((((.((((((((((..............................(((((............((((((..............................((((((....(((.....((((((..(((...))).))))))..)))....))))))..(.(((.(((((..((((...(((((((........)))))))......................((((.....)))).....((..(((......)))..)).......((((((....))))))....))))..)))))..))).)...........))))))..............((....))...((((((((.(((...)))..)))))))).......)))))..................................(((((((.....(((....))).......))))))).............................((((((((((((........................................((((((.......))))))....................((((((.....))))))......................................................(((((...(((((......))))).....)))))...........................(((((..(((((((((((((((.((((................(((((..((((.....(((..(((....)))..)))..))))............))))).......)))).))))))....((((((......))))))....)))))))))...)))))..............(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).)))))))))...........................(((....)))..............(((((..((.......))..)))))..................................))))))).))))).....))).))))))).)))))..))))...))))....))))))))))).)))))).)))...)).(.(((((.(((.(((((((.((............(((((((.((..((((((.(((((((....))).)))).(((....((((.((....)).)))).....)))....((..((((.....(....)....))))..)).)))))))).))))))).((((((((....))))))))...)).))))))).(((((.((((....(((((...........)))))....)))).)))))..........)))))))).).)))))))....)))))......((((((.(((((....(((((.(((...((((((....))))))..)))..)))))..)))))))))))...))))))))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(((.((..(((((((((...(((..(((((.((((((.(((((((.((((((.(((.....(((((((....(((......)))....))))))).(..((((..(((....)))(((((((.....))))))).(((....))).......))))..).......(((((((((.(((((.........................((((.(((((..((((...((((((....((((.((((((((.((((.....((......))..))))))))))))........((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.((....((((.((....))))))....((.((((......)))).)).))...)))))))))))))))))))))...((((((..((((.....))))..))))))))))..)))))).......(((((((..(((((((((...(((((((((.((............((....))(((((((........((((....)))).............((((.((((((....)))..))).)))).))))))).)).)))...(((..((((((((.(((..((((((((...(((((..(((((((..(((((.((((......)))).)))))...((....))..((((.....))))......)))))))..))))).......(((((((...((((((((..((.((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..)))..).)..)))))))).(((.....)))......)))))))....))))))))))).))))..))))....)))...)))))))))))))))))))))).....)))).....(((((..((((((............................((.....)).........((((.(((.(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).))).)))))))..))))))..))))).)))))..))))...((.(((((((((((.......(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))...)))))))))))))..........))))))))))).))).))).))))))....(((((....))))).........)))))))(((((((......((((..((....))..)))))))))))..............(((((((((((..((.....((((((.(.....)))))))......(((((......((((((((...(((.(((((...((((..(((((..(((...(((...((.......))...)))...)))..(((((........)))))..........(((((((..(((((..(((...(((((...((((((((((........((((((((((((....(((.....(((((((.((.....)))))))))..)))....))))))(((..((((((....))))))((.((((((((.......(((((...(((..(((((........)))))..)))..((((.((....(((.......((((((.......((((((....))))))((((....))))..(((((..(((..........(((((......)))))...((....)).)))...))))))))))).......(((((((.(((((.............(((((.......))))).........((((((((....(((....)))......))))))))..)))))...)))))))....))).....))))))....)))))....))))))))))..........)))....)))))))))))).)))).....)))))......)))..)))))..((((((.....)))))).))))))).........))))).)))).((((((((.((...((((((((((.(((((((.((((((......))))))...))))))).((((((.......))))...))...(((((..(((((((((((((((.((((........(((((...(((((..((((.....(((..(((....)))..)))..))))............))))))))))..)))).))))))....((((((......))))))....)))))))))...)))))))).)))))))((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).)))))))))...)))))))))).......((((...(((....)))..))))..(((..((((((..((.......))..)))))).))).)))))....)))..))))))))....))))).((((((((...((.......))...))))))))...))..))).)))))))).)))))).)))))..)))...))...(((((.(((.((((((..((............(((((((..((((((..((((..(((....)))..(((.(((....((((.((....)).)))).....))).)))))))..))))))...(((((..((.......))..))))).))))))).((((((((....))))))))...))..)))))).(((((.((((....(((((...........)))))....)))).)))))..........))))))))...)))))))....)))))......((((((.(((((....(((((.(((...((((((....))))))..)))..)))))..)))))))))))...))))))))..