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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00502



RNA: CRW_00502
Rfam family: -

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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((((((((((((((...((((((((((((((((....))).(((........))).....((((((((((((.......)))))...)))))))...(((....(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........)))))))))........(((((..(((..........))).))))).(((((.((........)).))))).......((.....)).....)))...((((....((((((((....))))))))......((((((((((....((((.......((((((((((.(((...(((((((....))))).))....((((((....).))))).)))...))))))))))))))))))))..))))((...((((((((.........))))))))...)).(((((......)))))..)))).....)).))))))).))))......(((....((....))....)))......(.((((....)))).)........))))....)))))))))))......(((((..((((......))))..))))).(((..(((.(((..((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....))))......))))))))))))))........((((((...(((((((((.((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....)))))))))))((((.........)))).)))))).....))))))))))).)))..(((((....))))).((((((((....(((((((((.....(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)))......)))).)))))..))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((.(((((((((.............(......(...........((((((.(((((....(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))....))).)).)))))).............)......)..(((((((.((((((((((((((((...)))))))))((((.....((.(((((((.((.((...(((((.((....)).))))))).)).))))))))).....))))................((((((.......))))))........(.(...).)..((((((.............))))))......((((.((...(((...(((....)))...)))...))...(((((........)))))..(((((((.((((......((...(((((.........((.(((.(((..(((((..........))))).(((.(((((..(((((((((((.((.....))))))))....)))))..)))))..)))...(((((((........))))))).....))).))))).......)))))..))..)))))))))))))))...(((..(((......)))..)))((((.....)))).....(..(((((....))))).)..................(((((...............))))).((((....((((......))))...)))))))))))....(((((((((((..(((((.....)))))..(((((((((...(((....)))...))..))))))).((((((..(((.((((((..((((..((...(((((..((....))...)))))...))..))))))))))..))).((((((.......))))))...(((..........))).((((((.....)))))).........))))))..)).))))))).))(((((.....)))))))))))).........((((((......))))))...((......))..........(.....)..(....((....((((((((((...((((((((((((..(((.......)))...((((((...((((((((....))))))))))))))...(((((....)))))..))))))))))))........((.((((((.....))))))))...)))))))))).))...)))))))))))).((.(((((((...........))))))).))..(((((((((..(((((((.....))))))).....((((....)))).)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....))).))).((((.(((((..(((((((((((.....(((..((((.............((((((((((..((.(((.(((((((.......(((((.(((((((.((............))))))))).))))).....((((((((((((....)))))))).)))).((((.....))))......(((...(((((...(((....(((((((....))).))))...)))......)))))..)))......((((((.(((.(.((((((.......)))))).((((.(..(((((...((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).)))))..)(((....(((((...........)))))....)))..(((.....)))...)))).((((....))))....).)))))))))..))))))).))).))..)))))))))).)))).)))..)))))))))))..)))))))))..........)))))))))..
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((((((((((((((...((((((((((((((((....))).(((........)))...(.(((((((((((((....).)))))...)))))))).(((.....[[[))).]]]((((((((...).))))))).(((((((((.........)))))))))........(((((..(((..........))).))))).(((((..............)))))...........................(((((((.((((((((....))))))))..))).((((((((((....((((.......((((((((((.(((...(((((((....))))).))....((((((....)).)))).)))...))))))))))))))))))))..))))((.(.((((((((.........))))))))..))).((((((....))))))..)))).....)).))))))).))))......(((................)))........((((....))))..........))))....)))))))))))......(((((..(((((....)))))..))))).((((((((.(((..((((((((..(((((((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....))))......)))))))))))))).)......((((((...(((((((((.((.((((...((((((.(...)))))))....))))...(((.(((((........))))))))....)))))))))))(((((......).)))).)))))).....))))))))))).)))))(((((....)))))(((((((((....(((((((((.....(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)))......)))).)))))..))))))).))(.((((((((((......)))))))))))...(((......)))...((.((((((((............((((((.(((...........((((((.(((((....(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))....))).)).)))))).............))).))))))(((((((.((((((((((((((((...)))))))))((((.....((.(((((((.........(((((..........)))))......))))))))).....))))................(((((((....).)))))).(((...............((((((.............))))))....((((((......(((...(((....)))...)))........(((((........)))))..(((((((.(((((((.....)))(((((.........((.(((.((((((((((((.....)).))))))(((.(((((..(((((((((((.((.....))))))))....)))))..)))))..)))...(((((((((....)))))))))....)))).))))).......)))))......))))))))))))))).))(((..(((......)))..)))((((.....))))..)))((.(((((....)))))))..................(((((.....(((....)))))))).((((....((((......))))...)))))))))))....(((((((((((..(((((.....)))))(.(((((((.....(((....))).......))))))))(((((((.(((.((((((..((((.......((((((.((....)))..))))).......))))))))))..))))((((((.......))))))..((((.((.....))))))((((((.....)))))).........))))))..)).))))))).))(((((.....)))))))))))).........(((((((....)))))))...............................(((...(((...((((((((((...((((((((((((..(((.......)))...((((((...((((((((....))))))))))))))...(((((....)))))..))))))))))))........((.((((((.....))))))))...)))))))))))))..)))))))))))))....(((((((...........))))))).....(((((((((..(((((((.....))))))).....((((....)))).)))))))))..((((..(((.(...))))..)))).(((....))).)))(((((.(((((.((((((((((((.....(((..((((.............((((((((((.....(((.((((((((......(((((.(((((((.((............))))))))).))))).....((((((((((((....)))))))).))))(((((.....))))).....(((.(.(((((..((((.((.(((((((....))).)))))).))).)....))))).))))......((((((.(((...((((((.......)))))).((((....(((((...((((.(((((((((((((....))))))..))))).)))))).)))))...(((....(((((...........)))))....)))..((((...))))...)))).((((....))))......)))))))))).))))))).))).....)))))))))).)))).)))..)))))))))))).)))))))))).........)))))))))..
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((..(((((((((((((((...((((((((((((((((.....((((((.........((.....((((((((((((.......)))))...))))))).....))..((((....))))))))))....(((((.....(((((((((.........))))))))).((..(.((((((..(((..........))).((((..(((((...............(((((......((.....)).....)))))..(((....((((((((....)))))))).....(((((((((((....((((.......((((((((((.(((...(((((((....)))).)))....(((((.......))))).)))...))))))))))))))))))))..))))).....)))............)))))..)))).)))))).)..))...))))))))))........))))))).))))......(((....((....))....))).....((.((((....)))).)).......))))....))))))))))).((((((((((..(((((....)))))..)))).((((((.........((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....))))......))))))))))))))........((((((...(((((((((.((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....)))))))))))((((.........)))).)))))).....)))))))).((((((..(((((....)))))...((........))...)))))).....((((.(((((((...(((((((.....))))).))...)))))))...((.(((((((((((.((((.((...((((..(.((((((((((......))))))))))....(((......)))...((.(((((((((.(.(((.((((...(((..((((....((.((..((((..(...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))....((((.((....)).)))).)))..)..))))..)))).......(((((((......(((.(((((....(((((.(((((((((...)))))))))(((.(((((((.((((..((((((((..((((..((....))(((((((...((((....))))....))))))).....))))....((((((.......))))))...)).)))))).(((...)))..)))).)))).)))......(((....((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((.((((((.((((..((.(....).))...((.(((.((((((((((..........))))))(((.(((((..(((((((((((.((.....))))))))....)))))..)))))..)))...(((((((((....)))))))))....)))).))))).......).))).)))..))))))))))))))).)))....)))..))))).......((((.....))))..))))))))......((((((((.((..(((((((......(((((....(....).....))))).((((....((((......)))).)))).)))).)))..((((((((((..((((((((((..........((((((((....(((....)))......)))))))).(((.(((((...((((((..((((..((...(((((..((....))...)))))...))..))))))))))...))))).)))..))).))))))).........((.........((((((.....)))))).(((.(....))))...))..)))))).)))))).)))))))).)))))))..........((((((......))))))...))))......((((.......))))..)))..))))....((((((((((...((((((((((((..................(((((....((((((((....)))))))).)))))...(((((....)))))..))))))))))))........((.((((((.....))))))))...)))))))))).))).).))))))))))).((.(((((((...........))))))).))...)..)))).)))))).)))))....)))))).)).)))).))))))......)))))).((((..(((......)))..)))).(((....))).((.((((((.((((..(((((((((((.....(((..((((.............((((((((((..((.(((.(((((((...((....((((....((((((..(((...(((.....((..((((((((((((..((((((((((....))))))).)))..(((((.....))))).....)))))....)))))))..)).(((((((....))).)))).))))))..)))))).))))...))...((((((.(((.((((((((.......)))))).((((.(..(((((...((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).)))))..)(((....(((((...........)))))....)))..(((.....)))...)))).((((....))))...)).)))))))))..))))))).))).))..)))))))))).)))).)))..)))))))))))..))))))))))))..))...)))))))))..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....((((((((((((((.....(((((((((((((((.....((((((...........(....((((((((((((.......)))))...)))))))...).....((((....))))))))))....(((((.....(((((((((.........))))))))).((..(.((((((...(............)..((((..(((((......................................................((((((((....)))))))).......(((((((((....((((.......((((((((((.(((...(((((((....))))).))....(((((.......))))).)))...)))))))))))))))))))))..))......................)))))..)))).)))))).)..))...))))))))))........))))))).))).......(((....((....))....))).....((.((((....)))).))........)))....))))))))))).......................................((((.(((..((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....))))......))))))))))))))........((((((...((((((((..((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).)..))))))))((((.........)))).)))))).....))))))))))).))))...................(((((....(((((((((.....(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)))......)))).)))))..))))).......(((((((((........)))))))))................................................................................((...(((.(((((.......))))).))).....(((..........)))...))..........................................................(((((((...)))))))......(((((((.((((..(((((.((..((((..((....))(((((((...((((....))))....))))))).....))))....((((((.......))))))...))..))))).((.....))..)))).)))).))).......................(((.(.(((....))).).))).........((((........))))...(((((....(((...........(.(....).)....((.(((.((((.(((((..........))))).(((.(((((..(((((((((((.((.....))))))))....)))))..)))))..)))...(((((((((....)))))))))....)))).)))))..................)))...))))).................(((((((.....((((.....))))......((((((....((((((((.((..(((((((......(((((....(....).....))))).((((....((((......)))).)))).)))).)))...((((((((((.((((((((((..........(((((((.....(((....))).......))))))).(((.(((((...((((((..((((..((...(((((..((....))...)))))...))..))))))))))...))))).)))..))).)))))))....................((((((.....)))))).(((.(....))))......))))))).))).)).)))))))).))))))...........))))))).................................(((((.(((((((..((((..((((((((((...((((((((((((..................(((((....((((((((....)))))))).)))))...(((((....)))))..))))))))))))........((.((((((.....))))))))...))))))))))...))))...............(((((((...........))))))).....(((((((((..(((((((.....))))))).....((((....)))).)))))))))...........................(((....)))....................................................))))).)).)))))........................................................................((.(((((((....)))))))..))....................................(((....(((((((....))).))))...))).......................(((((.(((...((((((.......)))))).((((....(((((...((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).)))))...(((....(((((...........)))))....)))..(((.....)))...)))).((((....))))......))))))))............(((...(((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).....)))......)))))))))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((((((((((((((...(((((((((((.((((.....((((((........))).....((((((((((((.......)))))...)))))))...)))...((((....))))((((((......))))))..(((((((((.........)))))))))))))....(((((..(((..........))).))))).(((((.((........)).)))))..(((((..(((........(((((..(((((....(((((((....)))))))))))).....(((((((....((((.......((((((((((.(((...(((((((....)))).)))....(((((.......))))).)))...))))))))))))))))))))).)))))....((((((((.........))))))))......(((((......)))))...)))...)))))))))))).))))......(((....((....))....))).....((.((((....)))).)).......))))....))))))))))).....(..((...((((((..((((((....(((((((.((((.(((..((((((((...((((((..((((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....))))......))))))..))))))........((((((...((((((((..((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).)..))))))))((((.........)))).)))))).....))))))))))).))))...((((((((((..(((((((((....(((((((((.....(((...((((((((...((..(((.....)))...))...))))))))..)))......)))).)))))..))))))).))..(((((((((........)))))))))........(((((((((..((.(((.((((((...........)).)))).)))...((((((((((((..(...(((......((((.(((((.......))))).)))).....((((.((....)).)))).)))..)..)))).(.(((((........(((((((((((...((.(((....((((((((((((((...))))))..(((..(((((...(((((((.((..(...(((((.((....)).))))))..)).))))))).((((..(((((...((....(((...((((((.......))))))((((((.((((((.((((....((((..((((..(((.....)))..)))).((.((...(((...(((....)))...)))...))...(((((........))))).)).))))..((((.((((.((...((..(..(((.(((((((...(((.((((((..........))))))(((((((((..((((((((((.(((.(((((((....((((.(((......))).))))....)))))))...........))).))))))))))(((.......(((((....)))))....((.((((((..(((..(((......)))..)))....(((..((((....(((.(((((....)))))))))))).))).((......(((((.....(((....))))))))(((((....((((......))))...))))).)).....)))))))).))).)))))))))......)))..))).))))...(((....)))........((((((((((.(((((...((((((..((((..((...(((((..((....))...)))))...))..))))))))))...))))).)))........)))))))......)))..)..))..((((((.....))))))..)).)))).))))....))))))))))..(((((.....)))))))))))..........((((((......))))))....)))..))...))).....(((((.(((((((((((((..((((((((((...(((..(((((((..................(((((....((((((((....)))))))).)))))...(((((....)))))..)))))))..)))........((.((((((.....))))))))...))))))))))...)))))....((((((((((.((((((...........))))))((((..(((((((((..(((((((.....))))))).....((((....)))).)))))))))...((((..(((.((..(((((((...(((....)))..))))...)))...)))))..)))).....)))).)))))))..)))...)))))).)).)))))....))..))))))))).)))..))))))))....))).)).))))))).)).))...))))).)..))))))))(((((((....)))))))..))..))))))))).))))..))))))))))))).....(((..(.(((((((....))).)))))..))).)))))).))))))........((((((.(((.((((((((.......)))))).((((.(..(((((...((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).)))))..)(((....(((((...........)))))....)))..(((.....)))...)))).((((....))))...)).)))))))))...))..)((((((((((((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).)).)))))))...)))))))))..