|
|
|
UUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))...
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(..((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...))))))..) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((....((((((((.................(.(((....))).)......)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...))))..... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((..((..((((((.............))))..))))..)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((......((((((.....................................))))))................((((((.........))))))............))))))... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((......((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...)))))))). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..)))))))... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.....((.((((.............)))).)).....)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..)))))))... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((......((((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))(..(((((.....((((((.((....))))))))....)))))..)))))))... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((.....[[[[[)))))))..(((......{{{{{....))).........}}}}}.(((((((((......)))))))))(((((((..]]]]].....)))))))....... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((((....((((((((......((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...)))))))). |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((......((((((........((((....[[[......))))..]]]...)))))).(((((((((......)))))))))..(((((...(((...))))))))))))))... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.((.((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).)))).(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...))))))... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(((((((...((((((((............(....(((((....))))).....))))))).))....((((.....((((((.((....))))))))....))))...))))))))). |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((.......(((.(((.....))).......(((((....)))))........)))........(.....)..((((((.((....))))))))............)))))))). |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.((.((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).)))).(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((........((((((........((((.............))))........)))))).(((((((((......)))))))))(((((((...(((...))))))))))))))... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.....((.((((.............)))).)).....)))))).)).....(((.....((((((.((....))))))))....))).....))))))... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((........((((.............))))........)))))).)).............(..((((.......))))..)............)))))))). |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((......((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....)))))))).)..))))).).)))))))). |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....(((((((((...).((((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...)))))))). |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((......((((((...(.....)...))))..))....)))))).))(..(((((...(.((((((.((....))))))))..).))))).).)))))))). |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....(((((((((...).((((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...)))))))). |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....(((((((((...).((((((.............))))..))....)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...)))))))). |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.((.((((((((.(((....((((.............))))....))).)))))).)))).(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((......((((((........((((.............))))........)))))).(((((((((......)))))))))........(((((...)))))...))))))... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((......((((((...................(((....)))........))))))................((((((.........))))))............))))))... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((....((((((((......((((((.............))))..))....)))))).))...((.((.....(..(((.((....)))))..)....)).))...)))))))). |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...))))))... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((.((.((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).)))).(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))(..(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))..)))))))... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((......)))))))))(((.((((.(.((((((((..((((...)).))..(..).)))).))))))))).)))(((((((((((...(((..))).)))))).)).))). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((((....(((((((.......((((((.............))))..))....)).))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.(((.((.((((.............)))).)).))).)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...))))))... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((..((.((.((((.............)))).)).))..)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((....((((((((.((..((.((((.............)))).))..)).)))))).))...(((((.....(..(((.((....)))))..)....)))))...))))))... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(((....)))((((.((.....)))))).....((((..((((.....((......)).))))(((.....((((((.((....))))))))....))).)))).)))))... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((.....{{{{{)))))))).((((..}}}}}......))))........((((...(((((((((......)))))))))[[[[[[[..))))......]]]]]]]....... |
