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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00594



RNA: CRW_00594
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((..(.......(((.(((..((...(((......))).....))......(((......(((((((...((...(((((((...........((.....((((((....))))))......)).........................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((...))))).))))))...)))))..(((((...)))))....((((((.........)))))).....((((((........((((((................)))))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((.....((...(((((.........................................)))))...)).....(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((....)))))))))...((....)).....)))...))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........)))).......(((((((.....(((((......(((((((.......)))))))....)))))...(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((....))))))......((((.....))))........))))...))))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))))....((((((.........(((.(((((....))))).)))...........))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(..((..((.((((((.((((((..((..((((((..((.(....))).....(((((((...)).)))))..))))))..))..........((..((.(.(((.(((.(((((((..(((..(((((((..((((((....))))))....(((..((((....)))).((.(.((.((((.((((((((........((((.((((..(((((((((.....(((.((((((((.......)))))))))))......((.(((((..(((((....((((((((((((..(((((((........)))))))...)))......((..(((((.......))))))).(((((.(((((.....((.((.(((...((((((((...))))))))..))).))))...))))).)))))))))))))).....)))))..))))))).))))))).))..))))..))))..)))))))))))).)).).)).))).....)))))))))).))))))).))).))).).))..))..))))))..)))))).))....(((........((((.(((......(((.((((((((((..((((((((...(((((((((.................))))....)))))(((((.((((((((((..(((((..((((((((..(((.(((((..((((((((..(.((((((.((..(.((((((((....((((.(((....(((((((.((((((.(((((.((((..(((..((....))...)))..).))).))))).)))))).((((.(((((....)))))..))))...)))))))(((((((.(((((..(((((.....)))))(((((....(((((((..((((....(((....)))......))))..)))..)))).)))))))))).)))))))...))).))))))))))))))).))).))).).((.((((((....)))(((.((......))))).))).))....))))))))...((((....))))..)))).).)))..))))))))...(((((.(.......).)))))...))))))))))).)))).))))).)).))))))..(((((..((((.(((.((((.(((((....))))).))).).)))....((((((((((((....))))))))))))...)))).......)))))..(((((....(((((((((.....)))))))))))))).))))))))))))).......)))))))...(((((.((..((((((((((.(((..(((.(((...(((...)))...))).)))..))).)))))))))).)).)))))..))).........((((((((((....))))))))))...))..))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.......))))))..(((((..(((((....((.......)).(((.(((....)))))).)))))..((((((..((((((((.....((((((.(((((.(((((((((((((((.(((......((((((....))))))......(((((((((....((((((.....(((((.((((((((((.....((((..((((...(((((((...(((((..(((((((.......)))))))))))).......((((((..(((((....((((((((((((..(((((((........)))))))...)))..............(((((....(((((...(((((...))))).)))))....(((((((((((...((((...))))..))))..)).))))).)))))))))))))).....)))))..))))))..)))))))....))))...)))).((((((....))))))))))).)).....))))))))....))))))(((...........))).))))))))).)))..((((((((..(((.(((((((...............))))))))))........(((..((((((((((.................))))....)))))))))((((((((((((...(((((.((((((((((((((((.....((((....(((....((..........)).(((((((((((((((..........))))).(((((((((....)))))))))((((((...((((.......)))))))))).)))))))))).)))..))))....))))..))..))))))))))))).))..)))))))(((((..(((((((............((((((..(((....)))(((((.....(((....)))....)))))......))))))..(((((((((((((((.....))))...)).)))))).))).)))))))..))))).))))).)))))))).)).))))).((((((....)))))).)))))))))))))..((((.....(((((((((...(((....)))..))))).....)))).....))))..))).)))..))))))))((((((...(((((.....(((((((((((((....((....((((((((((((....))))))))))))...))...))....)))))....)))))).(((((((((.....)))))))))...)))))..))))))..........))))))....(((((.((...((((((((..(((..(((.(((((....)))))........)))..)))..))))))))..)).)))))..)))))....(((((((((((((....))))))))))....)))..
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((....((.((((((.((((((..((.(((((((..........(((.(((.(((....)))))).)))...))))))).))...................(((.(((.(((((((..(((..(((((((..((((((....)))))).........((((....)))).(((((....)))))..........((((.(((((((((.((((((((((...((((..((((((((.......)))))))))))).....)))..))))))).))))).......(((((((.(((((((........))))))).).)))..)))((((.((.((((((((.(((.(((.(((((.(((((........((.(((...((((((((...))))))))..))).)).....))))).)))))........))).))).))).))))).)).)))))))).))))...........(((((....)))))...............)))))))))).))))))).))).)))...........))))))..)))))).))...)).........................((.((((((((((.....................................((((((...((((((.(((((.................(((((((((((((((...(((..(.(((((........(...................................((((((..((((((....)))))).))))))(((((((...((((.......))))))))))).........(((.((((.......))))..))).........((....))............................................)........))))).).)))...))))))))))..))))).((...(((..((((.(((((.....................)))))..((....)).............))))..))).))..........((((((....))))))...)))))..)))))).)))))).....((((((........((((.........))))))))))...............((....(((((((...(((..(((.(((((....))))).)))...)))....)))))))......(((.(((((((..........))))))).)))...........))(((((((((.....)))))))))......))))))))))))..................(((((.((..((((((((((.(((..(((.(((((....)))))........)))..))).)))))))))).)).)))))..............((((((((((....)))))))))).........
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DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............(((..[[[[)))..]]]](((((..............(((.[[[[[))).....]]]]]..)))))..((((((........(((((((.((((((((((((((((((((((((........))))))..))).(((.........((((....)))).(((((....)))))....))).......)))))))(((((((((((......(((((..(((((((.......)))))))))))).....(((((..(((((((....)))...))))(((..(((((((........)))))))...)))...........)))))))))))...)))))..)))))))).)))....(((((((((..(((((((...)))))))..((((((.........))))))(((....((((((...(((..(((.(((((((((.(((.......((((((((((.((((....)))))))))).)))).......)))...((((((..((((............))))...))))))....)))).)))))))).)))....((((((((((((((((...((((((.....(((..((((.((((..................))))))))..)))))))))(((...(((....)))...)))..)))).....(((...........((((((((....(((.......((((((((....((((.(((....(((((((.(((((((((((((....))))))))).(((((...((((.......)))))))))))))((((.(((((....)))))..))))...)))))))(((((((.(((((..(((((.....)))))(((((....(((((((..((((....(((....)))......))))..)))..)))).)))))))))).)))))))...))).))))))))))))....))).((((.(((((..(((....)))(((...........))).....((((...(((((((((...(((((((((.....(((((.....))))).....(((((((((...(((....)))..))))).....)))).....))))))))).........(((((((...(((..(((.(((((....))))).)))...)))....)))))))))))))))).))))))))))))))))))))).......)))...)))))).(((((((((.....))))))))).....))))))...))))))..)))....)))))))))...)))).((((((((((.(((..(((.(((...(((...)))...))).)))..))).))))))))))..........))))))....(((((((((((((....))))))))))....)))..
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