|
|
|
CAUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGUACUACGCUACCCCAAGGACAAAAGCCAUGCAAGCGGACACGAGGUAUGAAGUGGCGGACGGCUCGGUACAACGGUACGAGUCUGACCGGGGGUGAAGGCUAGACGGAUACCGCUGGCAACCCAGCGCCAAGACGAGUGCUCAAGAGCGGGGAAGGAAAGCACGCGAUGGAGCGAAUGCCCGGAUGAGGUUCCGAGGUAUUACCUAGUCGGUAGAGUAGUGGUCUACGGAGGGGAUGAUGCCUGGCGGAGGAUCAGGGUUUGACUCCGGAGAACGGGCCUGAGAGACGGCCCGUACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGUGAAGGCGUGAGGCAGCAACGGGGGAUCCCAUGAAAUGGGAAGACUGGGGGGUAGAUGACCCCAGCACAAGUCGAGGGAAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCAGGCGUCGUACGGCGCUGUUGCAGUUAAAACGUCCGGAGUCGAGACGUCCAGCCGGGAGGAAAGAGGAGCGCUUAAGGCGGGAGUGAGUACGAGAAAGCCCGGGACGGACAUGAAGGUGAAUGGGUAAGGGCAUGUGUAUUGGUGGGGGACGGGUGAAAUAGGAUGAUCCGACCAAGACAGACAAAGGCGUAGGCACUUGCCAAGACCAUAUCAGUCGAACCAGGACGAAGCCCGGGGGCGAGAAGGCGAUUAGACACCACCGUAUUCCCGGGCGUAAACGAUGCCACCGAGAGACUGGCCAGGUCGUCAGGAUCGAAGGGAAACCGAUCAGGGUACGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGGAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUUUGACUCAACGCGAACACCUUACCAGGCCCAGACGUACGGAGGAUCGACGGUUGAGAGGACCUUCGUGAUCGUACGAGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCACAGCCCGUGGCUUGAGCCGUCUGCUUGACUGCGACAACGAGCGAGACCCUAACCUGGAUGGGACCGCCAAUGGUGAAUUGGAGGAAGGUGGGGCGAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACGCCCUGGGCUGCACGCGUACUACACUGUGGGGAUGAAACCACGUCGAGUUGUGAAGCUUGAUGAGAUCAACCCCCACGUGGUUGGGAUCGUGGACUGGAACGUCCUCGUGAACCUGGAAUGUCUAGUAGGCGUAGGUCAUCAAUCUACGCCGGAUACGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGUCUUCUGGCGAGCUCCUGGGAGGGAUGAACCGAACAGGGACGAACCGCGAGGCUUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCAUCG |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((.......(((.(((..((...(((..........)))))......(((......(((((((...((...(((((((...........((.....((((((....))))))......)).........................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((....))))).))))))).)))))..((((((...))))))...((((((.........)))))).....((((((........((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((.....((...(((((.........................................)))))...)).........(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((......)))))))))...((....))......)))...))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........)))).......(((((((.....(((((......(((((((.......)))))))....)))))...(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((.....))......((((.....))))........))))...))))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))))....((((((.........(((((((((....)))))))))........))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((.(((((((((((.....((((((((((......)))))).))))....))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).........
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(((((((.((.(((((..(((((..(((.(((((...........(((((...((....))..)))))...))).))..)))..)))))..))))).))(((((((((((.((....(((((.(((...))))))))....(((((((..((((..((((...((((..((((.....((.((((..(((((((..((((...(((..((((((((((((((((..((.(((((.......))))).)).))).))))))))..)))))..)))))))))).))))...(.(((((((........))))))).)..........((((.(((((.((....(((((..((((......))))..)))))...)).....((((.(((..((......((((((.........))))))..))..))).))))...))))).))))......))))))..)))).))))))))..))))....)))))))...........)).)))))..)).))))...)))))))..(((...(((((((.....(((((.((((((((((....((((((((.((..(((........)))..(((((((((.....(((((.(((...................))).))))).((((((....((....))..(((((...(((............(((((...(((((.(.((((..((((((.((..(.((((((((.......((((.....(((((((.((.((((.((((((.((((.....))))...((....))......))).))).)))).))..((((.(((((....)))))..))))...)))))))..((..((((.......(.(((.(((((.............))))).))))....))))..))..))))...(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..))))))))))).))).)))...)))).)))))).....(((((((((..........))))).)))).....)))))......((.(((((.....))))).))..)))..)))))......)))))).)))))))))..)).)))))))).....)))))).))))..((((.(((.....(((((((((....)))))))))...))).))))((.(.(((.((((.((((.((((((...(((..........)))...)))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).))).).))......)))))...)))))))..(((((...((((((..((((((((((...((......))...))))..((.....)).))))))..))))))...)))))........((((((((((....))))))))))..))).).) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....((((((..(((((((.((.((((((..........(((((((...((....))..)))))..))..(((.(((((((.(((....))))))).))).)))))))))....((....((....((((((....)))))))).)).)))))))))....)))))).......((((((......)))..)))))))))).((((((((((((((((((..(((.((((.......)))))))..))).))))))))..))))((((.....((((((((((((..(((((((........)))))))...)))..((((((((((.(((((.....(((((...(((((....))))).)))))..((((((..((((((...))))))...))..(((((.....))))).((....(((((((((......((((.......)))).......)))..))))))..)).))))...))))))))))........))))))))))))))..)))).)))..(((((...(((((((.....(((((.((((((((((....((((((((.....(((........)))..(((((((((.....(((((.(((...................))).))))).((((((....((....))..(((((...(((...(((((....(((((.((..(((((((((((....((..........))..)))..)))))))).....(((((((..((((...((((((..((.((((.(((((.........))))).........(((((....))))).)))).))..))))))..))))..))))))).)).(((((((((((((..((((..(((((.((((.....(((...............)))...))))))))).((((((((.((............))))))))))....))))..)))))))))......(((((.((((...)))))))))..((((((((..........))))).)))))))..))))).....((((....))))..))))).....)))..)))))......)))))).))))))))).....)))))))).....)))))).))))((((((..((.....(((((((((....)))))))))...))...))))))..(((.((((.((((.((((((...(((..........)))...)))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........)))))...)))))))..(((((...((((((..((((((((((...((......))...))))..((.....)).))))))..))))))...)))))........((((((((((....))))))))))..))).)). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......))))))..........(((((..((......(((((......................)))))....((((((.(((....)))))))))...)).)))))...............((((((((....)))))).........(((((.................)))))...........((((((((((......)))).))))))((((((((((((..((((....)))).............((((((...((((.....(((((((((((((.(((((((........))))))).).........((((.((.((((((((.(((.(((...((((....)))).................((((((...))))))...((((((.........))))))..........))).))).))).))))).)).))))..(.....)...(.((((.((((((....))))))))))..)........))))))))))))..)))).))))))........((((((......(((((.(((.(((((((...((..(((((((((((..((((..((((((((((((((..(..(((((......(((((...........))))))))))..).............(((....)))...........((((........((.(((((((((((......((..........))......))))))))).....................................(((((.........))))).......((((.((((..((......(((.((((.......))))..)))....................((((.....))))...........................))...))))))))...((((((......(((.((((.....)))).)))....)))))).................................)).....))......))))................((((.((((........((.(((((.....))))).)).))))))))................)))))))))((((..((((....((((....((.(((.((((((.(((...(.(((((((((....))))))))).).)))..)))))))))...))...))))..))))..)))))))))..))))...)))))...(((((((((((.....)))))))))...)))))))).))..))))))).)))..)))))))))))))))))))))))(((((..((((((((((...((......))...)))))............)))))..)))))................))(((((((((....)))))))))(....).... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((.......))))))(((((.(...(((((..........(((((...(((.........)).)...)))))....((((((...........))))))......)))))...)(((((..((...)).)))))...((..((((.....((((((((....(((.............))).............(((((.((....(((((((((...(((..((.(((((.......))))).))))).....)))))..))))......(.(((((((((((((..(((((((........))))))).....((((.......((....))....))))((...(((((....))))).))..(((((......((((((...)))))).(.((((((.........)))))))....((((((........((((.....((....)).......)))))))))).((((((....)))))))))))..........)))))))))))).).).)).))))).........))))))))..))))))....)))))......((((((((...((.....((((.((((.....((((.(((..(((((.(((..(...........)....))).)))))............(....)))).))))....))))....................(((............)))..........))))))..)))))))).....)..((((.((.((((.((((((.((((............((....))))))..))).))).)))).)).(......((((....))))....).....)))).(((((.(((((((..((.(((((((.(((.((((((....((((........))))..........(((((((.((((((......(((.(((.......))).)))....))))))...((.((((..(((((((.....((((...(((((.(.(((..........))).)..))))).....((...((.....))..((.(((((.....))))).))..))..))))....)).)))...).)))))))........))))))))).)))).))).)..(((((((.....(.(.(((((((((....))))))))).).)....))))))).....((...((.((((......)))).))....))....))))))....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....(..((...(((((.....(((((((((.(((...(.(((((...((......))...))))).)...))).)))))))))....)))))....))...)....((((((((((....))))))))))((....)). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......))))))..........(((((..((.(....(((((.((.(((....)...)).))..)))))....((((((.(((....))))))))).).)).)))))...............((((((((....))))))(.....((.(((((.................))))).))...)....((((((((((......)))).))))))((((((((((((..((((....)))).............((((((...((((..(..(((((((((((((.(((((((........))))))).).........((((.((.((((((((.(((.(((...((((....)))).................((((((...))))))...((((((..(.....)))))))..........))).))).))).))))).)).)))).((.....)).(((((((.(((((((()))))))))))).))).......)))))))))))).))))).))))))........((((((......(((((.(((.(((((((...((..(((((((((((..((((..((((((((((((((..((.(((((......(((((...........)))))))))).))(............(((....)))..((((....(((((((....(((((((((((..(((((.((((((.......((((((((......(((((((.....)))))..))...(((((()).)))).....(((((...(....)))))).......((((.((((((((.((...(((.((((.......))))..)))......((.((....)).))...(((.(((((.............))))).)))...)).)))).))))))))...(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..))))))))....))).))).).))))).)))))....)))))..)))))))(........).....((((.((((........((.(((((.....))))).)).))))))))........)))))...)))))))))((((..((((.(..((((....((((((.((((((.(((...(.(((((((((....))))))))).).)))..))))))))).).))...))))).))))..)))))))))..))))...)))))...(((((((((((.....)))))))))...)))))))).))..))))))).)))..)))))))))))))))))))))))(((((..((((((((((...((......))...)))))......(....))))))..)))))................))(((((((((....)))))))))((())).... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......)))))).........((((((............(((((.......[[[...)))))..]]].(((..((((((.(((....)))))))))...)))))))))...(((((.(((...))))))))..(((..............[[[[[....[[[)))..........]]]....]]]]]((((((((((......)))).)))))).(((.[[[[(((((.......)))))..)))...]]]].((((((...((((.....((((((((((((..(((((((........)))))))...)))..((((((((.(((((......(((.(((.((((......))))..(((.....(((....((((((...))))))...))).(((((.....))))).......)))..))).)))))))).)))).(((((((.(((.......))))))).((((((....))))))..))).........)))))))))))))..)))).)))))).......(((((((.....(((((......(((((((..((((((((...........(((.....(((...((((.((((.(((((......(((((...........)))))))))).................)))).))))...)))......[[[..)))..]]]...(((((((((((....................)))..)))))))).....(((((((.......(((......[[[[)))..]]]].........(((.[[[[[...)))(((((....)))))...(((....))).....]]]]].)))))))........(((((((((..(((((((((.............)))))..))))............[[[[....(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..)))))))))..]]]](((((.((((...))))))))).(((.[[[[[.....)))..]]]]]....(((..[[[[....)))....(((((.....)))))....]]]].(((((...(((....)))..)))))........))))))))................(((((((((......(((((((((....)))))))))...((((((.[[[[[.))))))...]]]]]((((((...(((..........)))...)))))).(((((((((.....))))))))).....)))))))))..)))))))...)))))...)))))))..(((((...((((((..((((((((((....[[[[........)))))............)))))..))))))...)))))........((((((((((....)))))))))).]]]].... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((...((((((........)).((((((..((.(....(((((.((.((.........)).))..)))))....((((((.(((....))))))))).).)).))))))...(((((.(((...))))))))....(((((((..((((..((((...((((..((((.....((.((((..(((((((..((((...(((..((((((((((((((((..((.(((((.......))))).)).))).))))))))..)))))..)))))))))).))))(((..(((((((........)))))))...)))......((((.(((((.((....(((((..((((......))))..)))))...)).....((((((...)))))).((((..(((((.....)))))......)))).........))))).))))......))))))..)))).))))))))..))))....)))))))..)))).....(((((((....)).))))).)))))))).(((...(((((((.....(((((.((((((((((....((((((((.....(((....)))..((..(((((((((.(((.(((((.(((...................))).))))).)))......((((........)))).(((((.((((.(((..(((.((...(((((.(.((((..((((((.((....(((((((((((.(((...(((...(((((((.((..((..(((((......)))))..))...))....((..(((((((....))))))).)).(((.(((((....)))))..)))....))))))))))..)))...((((.....)))).(((((.((((.............................))))))))).((((((((.((............))))))))))...))))).))))))....)).))).)))...)))).))))))...))(((((((((..........))))).))))((((.......)))).((.(((((.....))))).))..)))..)))))))...)))))...)))))))))..)).)))))))).....)))))).))))((((((.(((.....(((((((((....)))))))))...)))..))))))..(((.((((.((((.((((((.(((((..........)).))))))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........)))))...)))))))..(((((...((((((..((((((((((...((......))...))))..((.....)).))))))..))))))...)))))........((((((((((....))))))))))..))).... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.......))))))..........(((((..........(((((......................)))))....((((((.(((....)))))))))......))))).................((((((....))))))...........((((....(((.............)))dddd)))).((((((((((......)))).))))))((((((((((((..((((....)))).............((((((...((((.....((((((((((((..(((((((........))))))).............(((((((((.........(((.....((......))...)))............((((((...))))))...((((((.........)))))).....bbbbbb.............)))....................BBBBBB..(((((....)))))))))))..........))))))))))))..)))).))))))........((((((.....(((((...(((({{{{{{..(((((ccccccccccc..cccc..ccccc(((((((((.....(((((..((..[[...............))]])))))......................................................((((((((.((....((..........))..))...)))))))).....................................((((...((....)))))).....((((((.............(((((....)))))................((((....(((((((((......((aaaaa.aaa..........))...................AAAAAAAA(((((((....<<..(((.......)))))>>....)))))...)))))))))....)))).....))))))..............((((............)))).....................((.(((((.....))))).)).........................))))))))).cc.....))))).........)).....((((((.(((.....(((((((((....)))))))))...)))..))))))........................CC.CCCCC..CCCC...CCCCC.....(((((((((.....))))))))).....CCCCCC.....}}}}}}..)))))))...))))))))))))))))))(((((..(((((.((((...((......))...)))).............)))))..))))).................((((((((((....))))))))))....DDDD. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(.........).............((((((..((......(((((.((.((.........)).))..)))))....((((((.(((....)))))))))...)).))))))...(((((.(((...))))))))....................((((....(((.............)))....)))).((((((((((......)))).)))))).((((((((((((.........)(.......).......((((((...((((....(((((((((((((..(((((((........)))))))....(....).((((.((.((((((((.((.(((..((((......))))..)))............((((((...)))))).((((..(((((.....)))))......)))).......)).))).))))).)).)))).((.....)).((((((((.(((((....)))))))))).))).......)))))))))))).))))).))))))........((((((.....(((((.((((((((((....((((((((.((..(((....))....)..(((((((((.(((.(((((.(((...................))).))))).)))......((((........)))).(((((.((((.(((..(((.((...((((.((.((((..((((((.((....((((((((...((((.(((((.....))))).....((..(((((......)))))..))...)))).(((......)))..((((.((((.(((.((...(((.((((.......))))..)))......((.((....)).))...(((.(((((.............)))))...))).)).)))..))))))))...(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..)))))))).)).))).)))...)))).))))))...))(((((((((..........))))).))))((...........)).((.(((((.....))))).))..)))..)))))))...)))))...)))))))))..)).)))))))).....)))))).))))((((((.(((.....(((((((((....)))))))))...)))..))))))..(((.((((.((((.((((((.(((((..........))).)))))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........)))))...)))))))))))))))))((((((..((((((((((...((......))...))))............))))))..))))))................((((((((((....))))))))))......... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((.((.(((((..(((((..(((.(((((...........(((((...((....))..)))))...))).))..)))..)))))..))))).))(((((((((((.((....(((((.(((...))))))))....(((((((..((((..((((...((((..((((.....((.((((..(((((((..((((...(((..((((((((((((((((..((.(((((.......))))).)).))).))))))))..)))))..)))))))))).))))(((..(((((((........)))))))...)))......((((.(((((.((....(((((..((((......))))..)))))...)).....((((.(((..((......((((((.........))))))..))..))).))))...))))).))))......))))))..)))).))))))))..))))....)))))))...........)).)))))..)).))))...)))))))).(((...(((((((.....(((((.((((((((((....((((((((.((..(((........)))..(((((((((.....(((((.(((..((............)).))).))))).((((((....((....))..(((((...(((............(((((...(((.(((.((((..((((((.((....(((((((........((((.....(((((((.((.((((.((((((.((((.....))))...((....))......))).))).)))).))..((((.(((((....)))))..))))...)))))))..((((((...((((.....)))).((.((((................)))).)).)))).))..))))...(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))...))))))).)).))).)))...)))).)))))).....(((((((((..........))))).)))).....)))))......((.(((((.....))))).))..)))..)))))......)))))).)))))))))..)).)))))))).....)))))).))))((((((.(((.....(((((((((....)))))))))...)))..))))))..(((.((((.((((.((((((...(((..........)))...)))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........)))))...)))))))..(((((...((((((..((((((((((...((......))...))))..((.....)).))))))..))))))...)))))........((((((((((....))))))))))..))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((..........(((.((.((((((..........(((((......................)))))....((((((.(((....)))))))))......))))))...(((((.(((...))))))))...............)))))((((....(((.............)))....)))).((((((((((......)))).)))))).((((((((((............................((((((...((((....(((((((((((((..(((((((.(.....))))))))...........((((....((((((((...((((..((((......))))..))))...........((((((...)))))).((((..(((((.....)))))......))))..........))).)))))....))))..........(((((((((.(((((....)))))))))).))))......)))))))))))).))))).)))))).......((((((((....(((((.((((((((((....((((((((.....(((....)))......(((((((((.(((.(((((.(((...................))).))))).)))......((((.(.....)))))((((((.((((.(((..(((......((((.((.((((..((((((.......((((((((..(((((.(((((.....))))).........(((((......))))).......)))))(((......)))..((((.((((((((......(((.((((.......))))..))).......................(((((((((.............)))))..))))....)))).))))))))...(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..))))))))....))).)))...)))).)))))).....(((((((((..........))))).))))((((.......))))....(((((.....))))).....)))..)))))))...))))).).))))))))).....)))))))).....)))))).))))((((((.(((.....(((((((((....)))))))))...)))..))))))..(((.((((.((((.((((((.(((((..........))).)))))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........))))).).)))))))))))))))))[[[[[[..[[[[[.[[[[.....)))........]]]].............]]]]]..]]]]]]................((((((((((....))))))))))......... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((..(.(((((.(((((.((((((.(((((.(.(((........(((((...((....))..)))))...(((((...((((((.(((....))))))))).......((((....(((((.(((...)))))))).))))..)))))........((((....(((.............)))....)))).((((((((((......)))).)))))).))).)..))))).)))))).))..)))..))))).).((((.((((.((((.....((((((((((((..(((((((........))))))).........(((.(((((((.(((.(...(((((..((((......))))..)))))..((((.(..((((((...)))))).(.((((((.........)))))))....((((((.....((((((....)))..)))..((.....))..))))))...).)))).).)))))))))).)))......))))))))))))..)))).(((((((((....(((((((.....(((((.((((((((((....((((((((.((..(((........)))..(((((((((.....(((((.(((..((..(......)..)).))).))))).((((((...(..((..((.((..((....((((..........(((((...(((((.(.((((..((((((.((..(.((((((((.......((((.....(((((((.((.((((.((((((.((((.....))))...((....))......))).))).)))).))..((((.(((((....)))))..))))...)))))))..((..((((.......(.(((.(((((.............))))).))))....))))..))..))))...(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..))))))))))).))).)))...)))).)))))).....(((((((((..........))))).)))).....)))))))))..((.(((((.....))))).))..))..)))).))..)..)))))).)))))))))..)).)))))))).....)))))).))))((((((.(((...(.(((((((((....))))))))).).)))..))))))..(((.((((.((((.((((((...(((..(....)..)))...)))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........)))))...))))))).((....)).)))))))))..(..((((...((......))...))))..)...)))).)))).)))).((.(((...((....))....((((((((((....))))))))))..))).)). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................(((((............(((((...((....))..)))))...........(((((..(((....))).)))))......)))))................................................................................................(((((((((((((((..((.(((((.......))))).)).))).))))))))..)))).......................(((((((........)))))))............(((.((.((((.(((.....(((................................((((((...))))))...((((((.........))))))..........))).....)))..)))).)).)))...................................................................................(((((((.....(((((..(((((((((....((((((((.((..(((........)))..(((((((((.....(((((.(((...................))).))))).((((((.....................................(((((...((((..(.((((..((((((.((....(((((((........((((.....(((((((.((.((((.((((((.((((.....))))...((....))......))).))).)))).))..((((.(((((....)))))..))))...)))))))..((..((((.((((.....)))).....(((................)))....))))..))..))))...((((((......(((.(((.......))).)))....))))))...))))))).)).))).)))...)))).).)))).....(((((((((..........))))).)))).....)))))......((.(((((.....))))).))..................)))))).)))))))))..)).)))))))).....)))))).))).((((((.(((...(.(((((((((....))))))))).).)))..))))))..(((.((((.((((.((((((...(((..(....)..)))...)))))).(((((((((.....)))))))))...)))))))).)))...........)))))...)))))))..........................................................................................((((((((((....))))))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((...((((.............((((((............(((((...((....))..)))))......(((.(((((((.(((....))))))).))).)))))))))...(((((.(((...))))))))....(((((((..((((..((((...((((..((((.....((.((((..(((((((..((((...(((..((((((((((((((((..((.(((((.......))))).)).))).))))))))..)))))..)))))))))).))))(((..(((((((........)))))))...)))......((((.(((((.((....(((((..((((......))))..)))))...)).....((((((...)))))).((((..(((((.....)))))......)))).........))))).))))......))))))..)))).))))))))..))))....)))))))..)))).....(((((((....)).))))).)))))))).(((...(((((((......(((((.(((.(((((((...((..(((((((((((..((((((...(((...((((.((((.(((((.(((...................))).))))).....((......))..)))).))))...)))...))......((.((((((.(((((((((.((.....((..((((...((..(((((((((.(((((.....))))).((.((((.((((((.((((.....))))...((....))......))).))).)))).)))))))))))(((....))).))...))))..))........(((((((.(((.((((.(((((((.............)))))..(((...((((((.((.((((((..(.((((((((..(...........)..)))))))).(((..((.((.(..(((((.(((.(((((.((((...))))))))).))))))...))..).))..))..)))...........)..)))).)).(((((.....))))).))))))))..)))....)).))))))).)))))))...)))))))))))...((((..((((((.((((((.(((.....(((((((((....)))))))))...)))..)))))))))..)))...))))........)))))).))..))))...))))).....(((((((((.....))))))))).....)))))).))..))))))).)))..))))))))))))..(((((...((((((..((((((((((...((......))...))))..((.....)).))))))..))))))...)))))........((((((((((....))))))))))..))).... |
