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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00599



RNA: CRW_00599
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((.....................)))))......(((......((((((((...(((..(((((.(((....)))..(((((...(((((((.....)))))))....))))).................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((....)))))))...)))))..)))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((...))))).)))))....)))))....((((((((((((((...))))))))))).)))......(((((...........))))).........((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((.((.((((.((((((((.((((((((...)))....)))))))))))))...))))..((....)).....)).....))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((.......))))..)))))).....((((((((.((((..((.(((((....(((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))........(((((((......(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))...))))))).))))))).)))))))..((((((((.....))))))))....)))))...))))).)))...).))))))).....)))))))...)..)))))))))....(((((((.....(((...(((((..((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))).....)))))....((((((((....))))).)))....)))......)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((.(((((.((((((((((((..((((((((((((...(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))).))))))))))))..))))))))))))))))).)))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.....((((((((....((((...(((((((.(.(..(((....((((((((.((((((((...........)))).))))...(((.(((((((((....((((........(((((((..(((((((((((....((((.....((((((((.(((....((((((.((((...(((((((((..((((....))))..(((..(((((((........)).)))))))).......)))))).))).)))).((((((.(((((((.(((.(((((((((((.....((((((((.(...(((((((.............(((.......))).....)))))))..).))))))))(((...(((((((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))))))))))).))))...)))...))))))))))).))).)).)))))......(((((.(((((.((((((((((((((((..((((..((((....((((((........)))..((((((((....))))))))........)))....((((((((....(((((((((((((.......))))))))........)))))....)))..)))))))))..)))))))).((.((((........)))).))..))))))....((((.(((((..((...(((((.(((((((...)))).))).)))))..)).....(((((((((((((((...))))))))))).))))..................((((((.............))))))...))))).))))...))))))........(((((....((((((..(((...((....)))))....))))))..)))))..........(((((.....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))...)))))..(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......)))))))))......)))))..........)))))).....))))))..((((........)))).........(((((((((((((..(..((..(((((((((((((((.((((.(((((..((..((..((((((((((((..(((((.....(((((((((((((.....((((((.((.((....)).)).))))))....((..((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))..)).))).((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))))))..))))..)))))........)))).)))))))))))))))..))..)..)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))......))).))))))))......(((.((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))((((....))))))).))))....))))))..))))).)))))))..((((..(((((....)))))......((.((((((...........)))))).)).)))).))))....)).))))))))))......)))))))).((((((((((..(((......)))..).))))))))))))..).).))))))).((((...((((((((((............((((((((..(((.(((.......))))))(((((((((...........(((.(((....))))))...((((......)))).))))))))).))))))))..(((((...((((((((((((.(((((((((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).)))))).............((.....(((((((((.((((....((((((((....((..(((((((((((....)))))))))))..))(((((........)))))...)))))))))))).))))))))).(((((..((((((((.((((((....)))))).))))))))..)))))....)).)))))))).))).......((((((.((((((((.....))))))))..((((((((((((((.(((((((((..((((...........))))..)))...(.((((((.((((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....)))))....((((((((....))).)))))..)).)))))).))))))))))).))).)..))))))......))))).)))))))))..(((.....((((.(((((.(((.....))).))))).))))..)))...)))))))))).))))))))....(((((.((..(((((((((..(((..(((((((...((.(.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))))))...)))))))..)))..))))))))).)).))))))))))......))))))))))..))))..))))...))))))))..))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((.(................((((....(.....(((.(((.((((.........((((((.((((((.................))))))......))))))(((..(((((.............((((.....((((((....((((.......))))........((((((..((((....))))..))))))((((.((........))))))((((....(((((((((((.(.((((.(((((..(((((((.(((.(((((((((((.....(((((((......(((((((.............(((.......))).....))))))).....)))))))(((...(((((((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))))))))))).))))...)))...))))))))))).))).)).))))).....))))))))).).))))))))))).......)))))))))).....))))...............((((((((....))))))))..)))))..)))((((((.((((.......(.((((((((.......)))))))).).......))))....))))))..........((((((((.((.((((........)))).)).))))...)))))))))))))).)......((((((((.((((..(((((((...(((..........((..(((((((((((...))))))))))).((((((................(((((((...........)))))))..((.((((.....((....)).......))))))(...((((((........(((.....)))....))))))...).....))))))..(((((.....((((((((((.......((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))......)))))))))))))))...((((...(((((((((.((((((((((.(((((((((......))))))))).....(((.((..........))..))).))))))))))....((((....))))......)))))))))(((..(...(((((....))))))...))).........(((((........)))))........(((((((((((((..((((((((((((((((((((((.(((..(((((((((..((((((((((((((((((((((.(((((.........(((((....((..............)).....)))))....((((((((((((....(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..)))))))))))).....((((((....))))))..)).)))...)))))))))))))))))))))))))))))))........)))..)))))))))))))))))))).)).)))))).....))))))).(((((((((((((....))))))))))))).....((........))...)))).))...(((((...(((((.....(((......)))........)))))...)))))..((.(.(((((((.((....)))))))))..........).))....((((((....(...((((.........))))...).)))))))))...)).)))))...............((((.((((.....))))))))....((.(((((((.((...((....))...)))))))))))..)))))))))))).((((....))))................((((.((((((.((....))((((.(((.((((................(.((....)).)....(((((((......(((((....(((((((....(((.(((((..((((((((((..(((((.....))))).....((((((((...((((((.......))))))..)).))))))...........................((((((...((((((..((((..(((((((((((((((....)))))))))))))))..))))..))))))((((((......(((((((.......((..(((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))..))....))))))).........))))))......))))))))))))))))))))).....))).......))))))).....)))))......)))))))...)))).))).))))(((((((.......(((...(((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....)))))....((((((((....)))).)))).....))).....))))))).....(((((..((((............)))).....................(((((.((.(....))).))))).......)))))))))))))).))))).(..((...(((((.....(((((((((..(((..(((((((...((...((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))).))...)))))))..)))..)))))))))....)))))....))...)..(((((........)))))....).))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(((((((((....(..........)..........((((((((.......(((((((...........)))).)))...((((((.((((.(................(((((..(((((.((((((...((.((((.....((((((..(((((.(((.(((.(((........((((((..((((....))))..))))))....))).))).)))))))).(((((((.(((((((((((.(((((...(((((.(((((((.(((.(((((((((((.....((((((((.....(((((((.............(((.......))).....)))))))....))))))))(((...(((((((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))))))))))).))))...)))...))))))))))).))).)).))))).)...))))))))..).)))))))))))...))).)))))))))).....))))))..))))))..((.((((((((....)))))))))))))))..)))))(((((((((....(((((((((((((.......))))))))........)))))...).))..)))))).....((((((((.((.((((........)))).)).))))...))))(((.((.(((((.....(((((.(((((((...))))).)).)))))...(..((.(((((((((((((((...))))))))))).)))).))..)............((((((..((.......))))))))........))))).)).)))...(.....)(((((....((((((...((...((....)))).....))))))..)))))....(((((.(((((.....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))...((((...(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......)))))))))(((((((..(((((....)))))))))))).....))..(((((........)))))........(((((((((((((..((((((((((((((((((((((.((((.(((((((((..((((((((((((((((((((((.....(((((((((((.(((((..((..((....))....))))))).(((((...((((((((((((..(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))........)))).)))))))))))))))))))).)).)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))......................))....((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))....((((((((((.....)))))))))).................)))))).(((((....))))).....)))))))))).................((((.......))))...((((.(((((...))))))))).(((((((((((((...(((......)))....))))))))).........))))..((((....)))).......................((((.((((.....)))).))))..)))))))).....((..................(((((((.(.((.(((((....((((((((...(((((((((..((((((((((.((((((.....)))(.((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).)))))))))).)....((((((.((.....)).)))))((..((((((..((((..(((((((((((((((....)))))))))))))))..))))..))))))))..........(((((((......(((..(((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))..)))...)))))))................).......))))))))))))))))))...).))).....).))))))).....))))).)))..))))))).((((.((..((((((.....))))...)))).))))((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....)))).......))((((....)))).(((((.((((((((((((((....(...((((((((((((..((....))..)))))......((((()))))(((.(((((.(((.....))).))))).)))..)))))))..................((.(.(((((.((..(((((((((..(((..(((((((...((.(.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))))))...)))))))..)))..))))))))).)).)))))..).)))....))))))))))))))..)))))....)))))))).)..
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((((.((.((((......)))).))....((((....(((((((((.....(((....)))....(((((((...((((((.(((((((((..............(((((((..(((((.((.......(((((....((((((((.(((....((........)).....((((((..((((....))))..))))))...(((((((..(((....(((((((((.(((((((((((...((..((((((..(((((((.(((.(((((((((((.....((((((((.....(((((((.............(((.......))).....)))))))....))))))))(((...(((((((((((((((....(((((((....)))))))....))))))))))).))))...)))...))))))))))).))).)).))))).....)))))).))...)))))))))))...))).)))).))....)))..)))))))......((((.((((((((....))))))))........((((..(((((((((....(((((((((((((.......))))))))........)))))....)))..)))))).)))).(((((((..((((((........)))).))..))))..))).((((.(((((.(((....((((.(((((((...)))).))).))))))).......(((((((((((((((...))))))))))).))))..((((.....))))...((((((.............))))))...))))).))))...((((..((.(((((.((((....((((((........((....)).......))))))..)))))))))))....(((((.....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))...))))...(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......))))))))).((((((..(((((....))))))))))).....)))).(((((........)))))........(((((((((((((..((((((((((((((((((((((.((((.(((((((((..(((((((((((((((((((((((.....((((((((((.(((((..((..((....))....))))))).(((((...((((((((((((..(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))........)))).)))))))))))))))))))).)).)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))......))).))))))))....))))).((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))....((((((((.((....)))))))))).))))))).)))))))...)))))(((((....))))).....))))))))))....))))))).....(((..(((((((((((((.((((.(((((...)))))))))((((((.(((((((...(((......)))....))))))).(((((.((.((.((....((((((..((..........))..))).)))....)).)).)).))))))))))).((.(((((((((...........(((.(((....))))))...((((......)))).))))))))).))...)))).))))).))))..))).)))))))))...)))).(((((((((..((((((.......)))))).))).))))))((((((((.....((........)).((((((.(((.(((((..((((..(((((((((((((((....)))))))))))))))..))))..))))).((((((((....(((((((......(((..(((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))..)))...)))))))...))))....))))...((((((((.....))))))))..((((((((((((((.((((((((...((((...........))))(((....)))((((((.((((((((...((((((...(((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....))))).((((.((((((....))).)))))))...)))))).))))))))))).)))..))))))))......))))).))))))))).(((....)))....(((((.(((.....))).)))))......))).))))))...............((...(((((.((..(((((((((..(((..(((((((.....((.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))).))...)))))))..)))..))))))))).)).)))))....))....)))))))).(((((....)))))....))))).)))).
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((dddddddd..............................................((...........))......................................(((((..(((((.(((((.......((((.....(((((<<..........................((((((..((((....))))..))))))((((.aa......aa..))))(((((((.(((((((((((..(((((...((...(((((((.(((.(((((((((((.....((((((((.....(((((((.............(((.......))).....)))))))....))))))))(((...(((((((((((((((....(((((((....)))))))....)))))))))))).)))...)))...))))))))))).))).)).)))))......)))))))....)))))))))))...))).)))).))))).AA..))))AA...))))).....((((((((....))))))))..)))))..))))).((((.((....(((([[((((((((.......))))))))))))....]]))...........))))......(((((((...((((((........)))).))...)))..))))((((.(((((.......(((((.(((((((...)))).))).))))).........(((((((((((((((...))))))))))).))))..................(((((((...........)))))))...))))).))))..............................................................................(((((.....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))..........(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......)))))))))(((((((..(((((....)))))))))))).........(((((........)))))........(((((((((((((....((((((((((((((((((((.((((.(((((((((..((((((((((((((((((((((.....(((((((((((..(((...((..((....))....)).)))..(((((...((((((((((((..(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))........)))).))))))))))))))))))))....)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))...........>>.........))))).((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))....(((((((((.......)))))))))....................((...((........................((((((.............((((.......))))....(((.((((.....)))))))..bb....(((((((...(((......)))....)))))))bbb..bbbbbbb.....((((....))))..........(((((((((((....((((((((........................ccccccccc.......(((....))).((((....((((((((................))))))))......))))..))))))))....)))......{{{{{CC..CCCCCCC.......)))))))).....}}}}}..bbbbb.................((((((((((..((((((..((((..(((((((((((((((....)))))))))))))))..))))..)))))))))).)))))).(((((((......(((..(((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))..)))...)))))))..................((((((((.....)))))))).....))))))......BBBBB.......BBBBBBB))BBB))..BB.............(((.......))).............((.((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).))))......))......((((((((....)))).))))..((((((((((((((......((..(((..(((((..((....))..)))))...............((((.(((((.(((.....))).))))).))))...)))....................ee)).(((((.((...((((((((..(((..(((((((...((...((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))).))...)))))))..)))..))))))))..)).)))))....EE.....))))))))))))))...........DDDDDDDD....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((............((((.((.(((........))))).)))).....(((....)))....(((((((...((((((.(((((((((..............(((((((..(((((..........(((((....((((((((.(((....((((((...........((((((..((((....))))..))))))....((((((....(....(((((((((.(((((((((((...((..((((((..(((((((.(((.(((((((((((.....((((((((.....(((((((.............(((.......))).....)))))))....))))))))(((...(((((((((((((((....(((((((....)))))))....)))))))))))).)))...)))...))))))))))).))).)).))))).....)))))).))...)))))))))))...))).)))).))....)....))))))............((((((((....))))))))........((((..(((((((((....(((((((((((((.......))))))))........)))))....)))..)))))).)))).(((((((..((((((........)))).))..))))..))).((((.(((((.......(((((.(((((((...)))).))).))))).........(((((((((((((((...))))))))))).))))..((((.....))))...((((((.............))))))...))))).))))....(((..((.((((.(((((....((((((........((....)).......))))))..)))))))))))....(((((.....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))...)))....(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......))))))))).((((((..(((((....)))))))))))...)))))).(((((........)))))........(((((((((((((..((.(((((((((((((((((((.((((.(((((((((..((((((((((((((((((((((.....(((((((((((.((((...((..((....))....)).)))).(((((...((((((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).(((((....))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))........)))).)))))))))))))))))))..)).)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))......))).))))))))....))))).((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))....((((((((.((....))))))))))...))))).)))))))...)))))(((((....))))).....))))))))))....)))))))....((.((((((......(((..((((.(((((...)))))))))...))).(((((((.(((((......)))..))))))))).(((((....))))).)))))))).....(((((((............(...((((.((((.....)))).)))).)..((((((((...........((.((((....))))))....(((......)))..))))))))((......)).........(((((((((((((..((((((((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).)))))).......................((((((.((((((..((((..((((..(((((((((((((((....)))))))))))))))..))))..)))).............)))..))).))))))((..(((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))..))...)))))))).))..........((((.((((((((.....))))))))..((((((((((((((.((((((((...((((...........))))(((....)))((.(((.((((((((...((((((...(((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....))))).(((.(((((((....)))).))))))...)))))).)))))))))))..))..))))))))......))))).))))))))).(((....)))....(((((.(((.....))).)))))........)))).......)))).)))))))))...(((((.((..(((((((((..(((..(((((((.....((.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))).))...)))))))..)))..))))))))).)).)))))...........))))))).(((((....)))))...))))))).))).
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(.((((((((....((((...(((((((.(.(..(((....((((((((.((((((((...........)))).))))...(((.(((((((((....((((........(((((((..(((((((((((....((((....((((((((((((((((((((.....(((((((..((((((..((((....))))..))))))...(((((((..(((.(..(((((((((.(..(((((((((.((((...((((..(((((((.(((.(((((((((((.....(..(((((.(...(((((((.(....)......(((.......))).....)))))))..).)))))..)(((...(((((((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))))))))))).))))...)))...))))))))))).))).)).))))).....)))))))).)..))))))))..)...))).)))).))..).)))..))))))).....(((((.((((((((....))))))))...((((...((.((((((((((.......(.((((((((.......)))))))).).......))))..)))))).))..(((((..((((((((..((((((........)))).))..))))..))))((((.(((((..((...(((((.(((((((...)))).))).)))))..)).....(((((((((((((((...))))))))))).))))..................((((((.............))))))...))))).)))).).)))).)))).....)))))....).)))))).....)))).))))))))))...(((.((.(((...(((((...(((((.....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))....((((..(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......)))))))))(((((((..(((((....))))))))))))....)))).)))))..))))).((((.........(((((((((((((..(..((..(((((((((((((((.((((.(((((..((..((..((((((((((((..(((((.....(((((((((((((.....((((((.((.((....)).)).))))))....((..((((((((...((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))).))))))))..)).))).((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))))))..))))..)))))........)))).)))))))))))))))..))..)..)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))...............)))).))))))))).((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..)))))).(((((....)))))...))))....))))))..))))).)))))))..((((..(((((....)))))......((.((((((...........)))))).)).)))).))))....)).))))))))))......)))))))).((((((((((..(((......)))..).))))))))))))..).).))))))).((((...((((((((((............((((((((..(((.(((.......))))))(((((((((.........((....))......(((((...........)))))..))))))))).))))))))..(((((...((((((((((((.(((((((((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).)))))).............((.....(((((((((..((((...((((((((....((..(((((((((((....)))))))))))..))(((((........)))))...)))))))).))))))))))))).(((((..((((((((.((((((....)))))).))))))))..)))))....)).)))))))).))).......((((((.((((((((.....))))))))..((((((((((((((.(((((((((..((((...........))))..)))...(.((((((.((((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....)))))....((((((((....))).)))))..)).)))))).))))))))))).))).)..))))))......))))).)))))))))..(((.....((((.(((((.(((.....))).))))).))))..)))...)))))))))).))))))))....(((((.((..(((((((((..(((..(((((((...((.(.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))))))...)))))))..)))..))))))))).)).))))))))))......))))))))))..))))..))))...)))))))).)..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(.((((((((...............................................................(((.....((((....(....................(((((((..(((((((((((....((.......(((...(((((((((((((.....((((((...((((((..((((....))))..))))))...(((((((..(((.(..(((((((((.(..(((((((((.(((....((((..(((((((.(((.(((((((((((.....(..(((((.....(((((((.(....)......(((.......))).....)))))))....)))))..)(((...(((((((((((((((.(..(((((((....)))))))..).)))))))))))).)))...)))...))))))))))).))).)).))))).....)))).))).)..))))))))..)...))).)))).))..).)))..)))))))......((((.((((((((....))))))))...((((...((.((((((((((.......(.((((((((.......)))))))).).......))))..)))))).))..((((....((((((...((((((........)))).))...)))..))).((((.(((((.......(((((.((.((((...))))..)).))))).........(((((((((((((((...))))))))))).))))..................(((((...............)))))...))))).))))...)))).)))).....)))).......)))))).....)))).)))))))))....((...........(((((...(((((.....((((((((((...((..(((((((((((((((((.((((....)))).)))))))))))))))))...)).)))))))))))))))....((((..(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......)))))))))(((((((..(((((....))))))))))))....)))).)))))........((((.........(((((((((((((..(..((..(((((((((((((((.((((.(((((..((..((..((((((((((((..((((.....((((((((((((((......(..((.((.((....)).)).))..).....((..((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))..)).))).((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))))))..))))..)))))........)))).)))))))))))))))..))..)..)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))...............))))..))..))).(((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))).((((....))))......))....))))))..))))).)))))))........(((((....)))))......)...))))......))).............................((.((((.....)))))).........((((((((..(((......)))..).))))))).............................((((((...................((.((((.....)))).)).....(((((((((...........((..((......)).))..................)))))))))...........(((.....((((((((((((.(((((((((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).)))))).............((......((((((((.........((((((((....((..(((((((((((....)))))))))))..))(((((........)))))...)))))))).....))))))))..(((((..((((((((.((((((....)))))).))))))))..)))))....)).)))))))).)))........(((((.(((((((((...)))))))))..((((((((((((((.(((((((((..((((...........))))..)))...(.((((((.((((((((...((((((...(((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....)))))....((((((((....)))).)))).....)))))).))))))))))).))).)..))))))......))))).)))))))))..........((((.(((((.(((.....))).))))).))))........))))).)))).))))))))....(((((.((..(((((((((..(((..(((((((...((.(.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))))))...)))))))..)))..))))))))).)).)))))..))).......)))))).(((((....)))))...)))))))).)..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((.......(((....(((((..........)))))...(((((....(((....)))....(((((((...(((((.((((((((((..............(((((((..(((((((((((....((((.....((((((((.(((....((((((....(((((..((((((..((((....))))..)))))).(((((((((........(((((((((((..(((.((((((..(((((((((..((((...((((..(.(((((((((.....(..(((((.....(((((((.............(((.......))).....)))))))....)))))..)(((...((((((((..(..((....((..(((....)))..))....))..)..)))).))))...)))...)))))))))(..(((..((((((((((..((((((((.....))).(..(((....)))..)..)))))...)))).))))..))..)))..)((((..((....))..))))....)..))))...))))..)))))).(((((((((((((.......))))))))........))))).)))..))))..)).)))..))))))...((.((((........)))).)).((((....))))......))))).....(((((.(((((((...)))).))).)))))...(((...(((((((((((((((...))))))))))).)))).....(((((...........))))).........))).)))))))))..)))))....((((..((.(((((.((((....((((((..(((...((....)))))....))))))..)))))))))))....(((((.....((((((((((...(((.((((((..((((((((..((((....))))..))))))))..))))))..))).)))))))))))))))...))))...(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((..((.....))..))))))))))))))....((((....))))......))))))))).((((((..(((((....)))))))))))...)))))).(((((........)))))........(((((((((((((..((..((((((((((..((((((.((((.(((((..((..((..((((((((((((..(((((.....((((((((((.(((((..((..((....))....))))))).(((((...((..((((((((...(((..(((((..(((..(((....)))..)))..)))))..))).))))))))..))))))).(((((....))))).)))))))))))))))..))))))))))))..))))..)))))........)))).))))))..)))))))).))..)).)))))).....))))))).(((((((((((((....)))))))))))))......))).))))))))......(((.((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))((((....))))))).))))....))))))..))))).)))))))...)))))(((((....))))).....))))))))))....)))))))..))))).)))..((((((.....(((((...(((((((((((((.((((((.(((((((..(..(((....)).)..)))))))).(((((.((.((.((....((((((..((..........))..))).)))....)).)).)).)))))))))))))))(((((((((...........(((.(((....))))))...((((......)))).)))))))))...))))))))).......((((((((((((.(((((((((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).)))))).............((.....(((((((((.((((....((((((((....((..(((((((((((....)))))))))))..))(((((........)))))...)))))))))))).))))))))).(((((..((((((((.((((((....)))))).))))))))..)))))....)).)))))))).))).......((((((.((((((((.....))))))))..((((((((((((((.(((((((((..((((...........))))..))).....((((((.((((((((...((((((.(((((((((((.(((..((((((..((((((....))))))..))))))..))).)))).....)))))....((((((((....))).)))))..)).)))))).))))))))))).)))....))))))......))))).)))))))))..(((.....((((.(((((.(((.....))).))))).))))..)))...)))))))))).))))))))....(((((.((..(((((((((..(((..(((((((...((...((((((((..((((..(((((....)))))..))))..)))))))).))...)))))))..)))..))))))))).)).))))).)).))).....)))))).(((((....)))))...)))))))).)).