RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00610

RNA: CRW_00610
Rfam family: Intron_gpI

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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((((((((((....)(((((..(.(((..........(((((((...((.(.(((..(((((((((.(.((((..))))).))))))))).))).)))...)))))))((.........((((((....)))))).)).))).).))))).(((......(((((..(.....((((((.((.....))..))))))...)..)))))....)))......)))))))))))))).(((((....))))).........
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((............))))).....................................................(.........)............................(...........)..........................................................................................................................(......).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((..(((((((....))))))).......))))....(((.(((....))).)))...(((((((((...(((....)))..))))))))).(((.[[[[.)))....]]]]..((((((((.......[[[[..........))))))))..........]]]].((((....[[[[[[..))))......]]]]]]..(((.[[[[......)))...]]]].(((..[[[))).(((((....))))).....]]].
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((.....(((((...))))).(((((....(((((((....(((.(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).))).)))...)))))))...(((((((.(....)))))))).((((..(((((.....)))))..))))........)))))((((((.((.....))..))))))....(((((.....))))).....)))))))))))))).(((((....))))).........
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((.....(((((...))))).(((((....(((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...)))))))...((((((..(....).))))))..(..............)..((.((....))))...)))))((((((.((.....))..))))))....(((((.....))))).....)))))))))))))).(((((....))))).........
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((.....(((((...))))).(((((....(((((((........((((.(((((((((...((((..))))..))))))))).....))))..))))))).....((((((((((((....))))).........)))))))..................)))))((((((............))))))....((((((...)))))).....)))))))))))))).(((((....))))).........
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((..............((((..(((((...(((.((....))...(((..(((((((((...(((....)))..)))))))))......(((....(((.(((...((((((((((((....)))).........))))))))..))).)))..))).))).))).((((((.((.....))..))))))..)))))..))))[[[[[[.....)))))))))))))).(((((....)))))..]]]]]].
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((.....(((((...))))).(((((....(((((((...(.((.(((..(((((((((..((((....))).)))))))))).))).)))...)))))))...((((((.((....)))))))).(((.....(((.....)))[[.[[))).]]]]...)))))((((((............))))))....((((((...)))))).....)))))))))))))).(((((....))))).........
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((.....(((((...))))).((((((......................(((((...............((((.(((((.((((..........)))).)))))))))....((((((....))))))....(((((.....)))))....)))))..((((............)))).....)))))).....((((((...)))))).....)))))))))))))).(((((....))))).........
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.........(((((((((....)))))))))((((..(((((...(((.((....))...(((..(((((((((...(((....)))..)))))))))......(((....(((.(((...((((((((((((....)))).........))))))))..))).)))..))).))).))).((((((.((.....))..))))))..)))))..)))).)).((..((((......))))..))(((((....))))).........
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(........)..((((((((((..))))))))))(((..((((((((.((((((((..((((...(.(((((((((((...(((..)))..)))))))))))).)).))..))))))))((((...(((..)..)).))))((.(((((..((......))...)..)))))).(..)(..).(((((((..((((..)))))))))).))))))))))))..((((((......))))))(((.((((((((..)))))))))))....
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................................................................((....................))................((.(..).))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((((.(((((....)))))...((((..((((........(((....)))..(((..(((((((((...(((....)))..)))))))))......(((....(((..((...(((((((.((((....))))..........)))))))..))..)))..))).))).))))((((((.((.....))..))))))....(((((.....))))).....)))).))))))))).(((((....))))).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((((((.....(((((...))))).((((........(((....)))..(((..(((((((((...(((....)))..)))))))))......(((....(((..((...((((((((((((....)))).........))))))))..))..)))..))).))).))))((((((.((.....))..))))))....(((((.....))))).....)))))))))))))).(((((....))))).........
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((..(((((((((....))))))))).......((((.......))))........))).(((((((((...............)))))))))......(((........))).(((((((.......))))))).((((..(((((.....)))))..))))...(((.......((((((............))))))....(((((.....)))))...(((......))).))).(((((....))))).........
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((..(((((((((....)))))))))....aaa((((.......))))........))).(((((((((........<<<<<..))))))))).....((((.>>>>>..)))).(((((.((....)))))))..((((..(((((.....)))))..))))((((([[[[..))).......]]]].....{{{{{{.......))AAA..}}}}}}...((((.(((.....))).(((((....)))))....)))).

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