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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00614



RNA: CRW_00614
Rfam family: Intron_gpI

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Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((......(((((((.(....).)))))))........))))).(((((.((...((((..........))))...))))))).....((((((.(((.(((.......))).))).))))))...............(((((((.(((((.((((((....)))).....)).)))))..)))))))....(((..((((((((.................))))))))..)))((((((((()))))))))..........(((((.((((......((((((....((((((((.(((((((....))))))).)))).)))).(((.((((((((........)))..................))))).)))........)))))).....)))).)))))......((....))((((...............))))...(((((.(((((((.((........))..)))))))))).))..
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((((((((((.((...)))))..................(((((.((...((((..........))))...))))))).....(.(((....))))...))))))))))..(((((((..........((((((((((((.(((((..(((((....))))).......)))))..)))))))...(((((((....))))))))))))........(((.((((((...(((((((....)))))))..........................[[[[[(((((((((((((((((((((....))))))).)))))))).......))))))....................................)))))).)))..]]]]]......((((((.......((((....))))........))))))....)))))))((((.(((((((...............)))))))))).)...
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((.....((((((((.(....).))))))).)......))))).(((..........(((.........(((((....(((((((.....(((....))).......)))))))....((((((.........((((((((((((.(((((..(((((....))))).......)))))..)))))))...(((((((....))))))))))))............((((((...(((((((....)))))))..(((((........(((((..((.(((((.(((((((((((((.(((((((....))))))).)))........))))))))))..)))))...))..)))))....)))))........)))))).)))))).)))))....((((((.......((((....))))........))))))......)))...(((.(((((((.((........))..)))))))))).))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((.....((((((((.(....).))))))).)......))))).(((........((((..........))))..(((((((((((.....)).)))))).......((((((((...(((((((........((((((((((((.(((((..(((((....))))).......)))))..)))))))...(((((((....))))))))))))............((((((...(((((((....)))))))..(((((........(((((..((.(((((.(((((((((((((.(((((((....))))))).)))........))))))))))..)))))...))..)))))....)))))........)))))))))))))..)))......((....)).))))))))((((.((((...............)))).))))(((.(((((((.((........))..)))))))))).))).
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((((((((((.((((((((((........).))))))))).(((((.((((((((((........))))))))))))))).......((((..))))...))))))))))((((((.(.(.(((..((((((((((.((((((((((((.((.((........)))).)..)))))).)))))((........))..))))))))))(((((((((..))))))))).((.(((((((((..)))))))))))))).))).))))).)))))))...((((((((((((((((((((((((((..))))))))))((((((((((((.((((((((........)))....(((((..))).)).))))).)))..))....((........))))))))).)))))))))).(..((((((.............))))).)..).(..((((......))))..)(...(((..))).)))))))
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....................................................................................................................................................................................................(((((....((.........(......................(.................)........................)...........))...)).))).(.....................)............................(....(.....................(......(..........................................).........)........).....)...............(....((....).)....)
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((......(((((((.(....).)))))))........))))..(((((.((...((((..........))))...)))))))........(......)...................((((((.........((((((((((((.(((((...(((......)))........)))))..)))))))...(((((((....))))))))))))............((((((...(((((((....)))))))..(((((........(((((..((.(((((.(((((((((.....(((((((....))))))).............)))))))))..)))))...))..)))))....)))))........)))))).)))))).................................((((...............)))).........((((((.................))))))........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((...(((((..((........))...)))))..(((((.((...((((..........))))...))))))).......(((....)))....))))))))))..(((((((.((.......((((((((((((.(((((..(((((....))))).......)))))..)))))))...(((((((....))))))))))))....(((.(((.((((((...(((((((....)))))))..(((((........(((((..((.(((((.((((((((..(((((((((((....))))))).))))..)).......))))))..)))))...))..)))))....)))))........)))))).)))....)))......((((((.......((((....))))........)))))).)).))))))).(((.(((((((.((........))..)))))))))).....