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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00634



RNA: CRW_00634
Rfam family: Intron_gpI

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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((......((((((((.............((((.....))))..(((((..(((((..(((((((....(((((((...)))))))..(((((((...(((((((...((((.....((((((((.((((.((((.(((((....)))))))))..((((((.......))))))...))))......))))))))..........))))..)))))))....(((((.......)))))..................)))))))...................)))))))..))))))))))....((((....)))).................)))))))).)))))..
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.(((((...............))))).....((.((((.....)))))))))((((((....((((((...(((((((((.....))))))..(((((((....((((((...((((..(..((((((((.((((.((((.(((((....)))))))))..((((((.......))))))...))))......))))))))......)...))))..))))))(((..(((((.......)))))..))).............)))))))....)))...)))))).((((((..(((.((((.((((....((((....))))....)))).)))))))..))))))))))))...
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..))..((((((..((((((((........(((.((((((...)))))....(((..(((.((((((((((.((((((((((...)))))))..(((((.((.((((.((((((...((((((((((((((...(((.(((.((((((..)))))))))(.(((((((..(...)))))))).).))..)....))))))).....(((...)))..)))).)))....)))))))))).)))))))..(((((((((((((((........)))))))))))))))))))))))))))).))))))....)))).(((((.(((((..))))))))))...))))))))..))))))
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(...)..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((.................)))).....((.((((.....)))))).........................(((((((...)))))))..(((((((.....(((((...((((.....((((((((.((((.(((((.((((....)))))))))..((((((.......))))))...))))......))))))))..........))))..))))).(((..(((((.......)))))..))).............)))))))..................(((((..(((.((((.((((....((((....))))....)))).)))))))..)))))..........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ................((((((((.((((.....(((.(((.....))))))..(((((.(((..............(((((((...)))))))..(((((.((.((((.(((((.....((((.((((((((.((((.(((((.((((....)))))))))..((((((.......))))))...))))......)))))))).........(((.......))).)))).))))))))).))))))).....))).)))))...))))...(((((((........))))))).......((((.((((....((((....))))....)))).))))....))))))))........
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((........)))))).((((.(((....((((.....)))).((((....))))..)))....((((.((((((.....))))))....(((((.......)))))))))...(((((((((((......(((((.((((....)))))))))..(((((({{{{{..)))))).....}}}}}...))))))).((((....))))..........)))).(((((.......)))))..((((....))))....)))).(((.[[[[[....))).]]]]].....((((........)))).((((....)))).((((.....)))).))).(((.....)))...