RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00639

RNA: CRW_00639
Rfam family: -

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.............)))))..(((((....(((....((((((((((((((...((((((...((.((((((.....(((((....)))))((((((((......((((((...))))))........(((((.........((((((.......))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((.(((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))......))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((....(((((((((...)))))))))..))))).(((....)))......))))))))....))))).)))))))))))))).)).(((...(((...((((((....)))))).(((...))).........)))....))).))))))..))))))))))))))...))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.......))))))...................(((((((((((((.((.((((((.(((.((.....((((((((((....)))))((((((..(.....((((((...)))))).......)..)))))).....)))))((((((...))))))....((((......))))....................................(......).....................((((((...(((....((((((....)))...)))..)))..))))))((((..............))))...(((((....((((((((.....))))))))..)))))..........(((((.........((((((((((.....))))))))))......)))))..((.((((((....)))))).))....................)).))).)))))).)))))))))))))))...........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................((((((((.....((((((..(((...(((((.....)))))..)))..))))))))))))))(((((((((....)))))((((((.......(((((.......))))...)......)))))).....)))).((((((...))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))....).))))))))....(((((((......))))))).....)))...))))))((...(((((...(((((((((.....))))))))).)))))...)).............)))))))(((((((((.....))))))))).............(((.((((((....)))))).))................((.(((((((((....)))))))))))............)....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((.......))))))(....).......((....(((((((((((((.((.((((((.(((.(((....((((((((((....)))))((((((..(...(.((((((...)))))).).....)..)))))).....)))))((((((...))))))....((((......))))...((((((....(..............((((((.(((....)))))))))((..(((((.....((((((.(.(((....((((((....)))...)))..)))).))))))((((...((((...))))))))..)))))..))(((((((((.....)))))))))))))))).........(((((........(((((((((((.....))))))))))).....)))))..((.((((((....)))))).))...................))).))).)))))).)))))))))))))))...))......
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....)))))))))))))))))....(((((....))))).......))))))))...(((((....))))).....(((..((((....)))).[[[[[)))..]]]]]..((((((((..(((((((...((((......((((((((.(((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))......))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...(((((((((.....))))))))).))))).(((....)))......)))))))).....((((((.[[[[))))))....(((........)))((((((....))))))......]]]].....((((...(((((((((....))))))))).[[[...))))...]]]..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.(((((.((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....))))))))))))))))).)).(((((....)))))....(((.(((((.((((((...)))))).........(((..........))).((((((...))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((..((..((((((.(((....)))))))))))(((((........))))).............))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...((((((((((...)))))))))).))))).(((....)))......)))))))).((((((((.....)))))))).........)))))))).((((((....)))))).(((...)))...))))).)).(((((((((....))))))))).(((......)))......
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MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........(((..((...........))..))).(((....(((((((((((((.((.((((((.(((.((((((((....(((((....))))).(((((........((((((...))))))..........)))))....)))))).((((((...))))))..((((((((...((((((...((((......((((((((..((..((((((.(((....)))))))))))(((((........))))).............))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))).....(((((...((((((((((...)))))))))).))))).(((....)))......)))))))).((((((((.....))))))))..................((((((....)))))).(((...))).............)).))).)))))).)))))))))))))))...))).....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((([[[[[[.......))))).((((((...........((((((((((((((...((((((.......((((((....(((((....)))))((((((........((((((...))))))..........))))))...)))))).((((((...))))))............((((((((...........(((((...((((((((((...)))).......(((((((.((((....]]]]]])))).......(((((((((.........(((((((......)))))))............((((...............(((((((((...))))))))))))))))))))))))))))).......))))))((((((((.....)))))))).......)))))(((...((((((....)))))).(((...))).........)))))))))))))))))..))))))))))))))..))))))...
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....)))))))))))))))))....(((((....))))).......))))))))..))).....((((((..[[[...((((.......(((((((((((...))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((.(((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))......))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...(((((((((.....))))))))).))))).(((....)))......)))))))).((((((((.....))))))))........)))))..((.((((((....)))))).))...))))..)))))).((.(((((((((....)))))))))))....]]]..........
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.[.[[[[.[[[..)))))..]]].]]]]](((....(((((((((((((.((.((((((.(((...((((((....(((((....)))))((((((.....(((((((((...)))))).....)))..))))))...)))))).((((((...))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((......((((((.(((....)))))))))..(((((........))))).............))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...((((((((((...)))))))))).))))).(((....)))......))))))))(((((((((.....)))))))))...(((...))).(((.((((((....)))))).(((...)))........))).....))).)))))).)))))))))))))))...))).....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....)))))))))))))))))....(((((....))))).......))))))))..))).((((((((((........((((.......(((((((((((...))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))....).))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...(((((((((.....))))))))).))))).(((....)))......)))))))).((((((((.....))))))))........)))))..((.((((((....)))))).))...))))..)))))).((.(((((((((....)))))))))))....)))).........
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((..))(.((((.(((.........))).)))))(((....(((((.(((((((.(((((((((((((((.((((......((((((..))))))(((((.(...)((.((((((...))))))....(..).)))))))..((.(((((((((.(.((((((.((((((((.((...)))))...((((((...................(((((((((((((((.(((((((((.((((((...)))(((((.(((((..((((((.(........)))))))))))))))))(((((.(..(((...))))))))).....)))))))))))))))))).)))))))).))))))).)))).)))).)).)))))((((((((((((((.....)))))))))))))).)))))).))..(((((((..)))))))....)).))))))))...............)))))))))))))))).)))))...))).....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((..((((((((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....)))))))))))))))))....(((((....))))).......))))))))..))......(((((.........((((.......(((((((((((...))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))....).))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((....((((((((.....))))))))..))))).(((....)))......))))))))(((((((((.....))))))))).......)))))..((.((((((....)))))).))...))))...))))).((.(((((((((....))))))))))).................
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....)))))))))))))))))....(((((....))))).......))))))))..))).((((((((((........((((.......(((((((((((...))))))..((((((((..(((((((...((((......((((((((.(((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))......))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...(((((((((.....))))))))).))))).(((....)))......)))))))).((((((((.....))))))))........)))))..(..((((((....))))))..)...))))..)))))).((.(((((((((....)))))))))))....)))).........

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