RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00660

RNA: CRW_00660
Rfam family: -

			UGCGAAUGGCUAAACCUACCAUGGGCCGUCGACGGUGGACUAGCGAGCUGGGGAGCCAGCUCGCGACAGUACCAAAUUGUGGGGCCUGCACCCGCAGCCAGGGCUCUCCUGGUUCAACGACUACAUGGUACGCGGCCGGAGCGUGAGCGUUCCGGUGAAAAUAUAGUCUCUCCUCGGGGACGCGCCCCCGGGACCGUGGCAUUAUAUCAGU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.....((((.((....)))))).....((((.((((((.((............)))))..))))))).(((((....((((((.......))))))(((((((...)))))))...[.[[[[[...))))).((.((((((((....))))))))))......]]]]]](..(((((((......))))))).....).............
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((............))))))..((((((((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))(((((((...)))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......))))))...(((((((......)))))))))))).)))..........
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................(((((((.((((....))))...(..(((((((((....)))))))))....)........((((((.......))))))(((((((...)))))))..........)))))))....(((((((((....))))))))).........(((..(.(((((((......))))))))....)))...........
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................(((((((((....))))))))).............((((((.......))))))((((((.....)))))).....................((((((..........)))))).......................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.............(((((((((.(((....((.......(((((((((....))))))))).......))....((((((.......))))))(((((((...)))))))...))).)).)))))))(((((((((((((....)))))))).................(((((((......))))))).))))))))..........
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................(((((((((((((())))))(((((.(((((((((....)))))))))...))).))....((((((.......))))))(((((((...)))))))........).)))))))....(((((((((....))))))))).........(((.((.(((((((.(()).))))))))..).)))...........
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((............))))))..((((((((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))....(((((.....)))))..........))))))...(((((((((....))))))))).......))))))...(((((((......)))))))))))).)))..........
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.....)).......((((((((.(((.((.((((.....(((((((((....))))))))).....)))).....(((((.......))))).(((((((...))))))))).))).)).)))))).(((((((((((((....)))))))).................(((((((......))))))).))))).............
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................((((((....((((..(((......(((((((((....)))))))))....[[)))....((((((.......))))))(((((((...)))))))....))))..))))))]]...(((((((((....)))))))))..............(((.(((((......))))))))..................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.....))........(((((..(((....)))..((((.(((((((((....)))))))))....((((((....(((((.......))))).(((((((...)))))))............))))))...(((((((((....)))))))))........))))...((.(((((......)))))))..)))))............
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................(((((((((((..)))))(((((((((((((((....)))))))))....((((((..(((((((.......)))))))((((((...)))))).............))))))...((((((((((..)))))))))).......))))))...(((((((......))))))).))))))............
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((....[[[[[...))))))....]]]]]....(((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))((((((.....)))))).....<<<<<..))))))...(((((((((....))))))))).......>>>>>....(((((((.{{{{.)))))))..}}}}.............
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................((([[[.))).(((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))(((((((...)))))))....]]].....))))))...(((((((((....)))))))))....{{{)))))).(((.(((((......))))))))...........}}}....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...(((((....(((((((....((((..((((.....(((((((((....))))))))).....))))...(((((((.......)))))))...(((((.....)))))..))))..)))))))....(((((((((....))))))))).......)))))....(((((((......)))))))..)))).............
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((((....((......)))))))..(((((.((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))((((((.....))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......)))))....(((((((......)))))))))))).)))..........
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((...((((....((......))...))))(((((.((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))((((((.....))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......)))))....(((((((......)))))))))))).)).((.....)).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((....((......)))))))).((((((((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))((((((.....))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......))))))...(((((((......)))))))))))).)))..........
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.(((((..(((((((((....((((.(..((((((((((((((((....))))))))).((((((((.......)))).)))..(((.......))).....)))))))))))))..)))))))....((((((((((..)))))))))).).)...)))))))..(((((((((..)))))))))(........)......)))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((..............)))....(((((.((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))(((((((...)))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......)))))....(((((((......))))))))))))..............
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((((....((......)))))))..(((((.((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))(((((((...)))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......)))))....(((((((......)))))))))))).)))..........
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.((((.((....))))))..((((....)))).((((.(((((((((....)))))))))....((((((....(((((.......))))).((((((.....))))))............))))))...(((((((((....)))))))))........))))..(((.(((((......)))))))).)))..............
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.((((.((....))))))..((((....)))).((((((((((((((....)))))))))....((((((....(((((.......))))).((((((.....))))))............))))))...(((((((((....))))))))).......)))))..(((.(((((......)))))))).)))..............

---