RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00671

RNA: CRW_00671
Rfam family: Intron_gpI

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DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................(...(((......))....))......................................................................................................................................................................................................................................................................((.....)).....(.((((....))))..........)..
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........(((((....)))))((((.....((((((((....))).))))).(((((((((((...)))))))))))...(((((....(((((((...((((.....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((...............))).))))).....)))))))....(((((.....))))).....))))..)))))))....((((...((((((...))))))..))))))))).....))))....(((..((((((((((.(((((....))))).)))))))))).[[[[[.)))......(((((....)))))......]]]]].
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MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(..((((((..........))))))....((((((((....)))).)))).((((((((((.....))))))))))..((((((((...((((((...((((.....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((.((.........)).))).))))).....)))))))....(((((.....))))).....))))..)))))).....((((...((((((...))))))..))))..((((....))))...)))))))).(((((((.(((((....))))).)))))))..........).((((...(((((....)))))...)))).....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((..........)))))))...((((((((....))).))))).(((((((((((...)))))))))))..((((((((..(((((((...((((..((((((((..(((((.(((((.((((....)))))))))(((..........))).......))))).............))))))))...............))))..)))))))(((...[[[[[[(((((...)))))..)))...................))))))))((((((((.....]]]]]].....))))))))..................(((((....)))))............
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((...eeeeeee))))))){{.{{{{{{(.bbb.((((((aaaa(((((((((((ii.)))))))))))..aaaaaaaaaaaa.(((((..kkk(fffffffffffff(.ddddddd(hhhhhhhhhh...hhhhhh(jj.))))..k(.)))))IIK))JJH.....<<<<<<<<.HHHHHHHHAAAA..<(((...(()HHH.)))HHHHDD...ggg(DD.))))))((((()>>>))>)))>D.>>>>))))..((((AAAAAAAADD)}}}}}}.(((((}}.FFFFFFFFFFFFFKKK.[[[[[))))).BBB))))EEEEEEE.AAAA.GGG.]]]]].
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((..........)))))))..(((((..((((((((........(((((((((((...)))))))))))..((((((((..(((((((...((((.....(((((((...........(((((....)))))..........((((................))))...)))))))....(((((.....))))).....))))..)))))))....((((...((((((...))))))..))))..((((....))))...))))))))..................))))))))..)))))..........((((...(((((....)))))...)))).....
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................(((((.....((((((....(((.........................................................................................................)))...))))))(((................................)))..............)))))(((((((....................)))))))................((((((....))))))...........
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.(((((......)))))....(((((..(((((...).))))(.((((((....(((((((((((((((......)))(((((................((((((((((((((((((((((.(((((..))))))))))...(..)))))))).((..))....(((((...)))))..)))))))))).)))))..))))).)))).....(((((((...(.(((........))))....)))))))..)))...))))))).(((((...)))))))))).(((((((((((...))))))))))).))))).......((((((..))))))............
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((..((((...............((((((((....)))).)))).(..(((((((.....)))))))..)..(((((((....((((((...((((.....((((((((((((.(((((.((((....))))))))).(((.((.........)).))).))))).....)))))))....(((((.....))))).....))))..)))))).....((((...((((((...))))))..))))..................)))))))((((((((.(((((....))))).))))))))..))))..))))....(.(((((....))))).)..))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((..(((((....((((((((..((((((((....))).)))))))))))))..(((((....)))))....((((((((...((((((...((((.....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((.((.........)).))).))))).....)))))))....(((((.....))))).....))))..))))))((...((((...((((((...))))))..))))))...............)))))))).(..((((.(((((....))))).))))..)..)))))..))))......(((((....)))))...)))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((..........))))))....((((((((....))).))))).((((((((((.....))))))))))....((((......))))....((((....(((..((((.....((((((.(((....))))))))).....))))....((((....((((....((....))..)))).(((((.....))))).....)))).)))....((((.((((...(((((.....)))))..))))..((((....))))...))))...))))..(((..((((....))))..))).(((.....)))....((((...(((((....)))))...)))).....
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