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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00673



RNA: CRW_00673
Rfam family: -

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .............................((.(((((((((((.(((((...........((.....))((.....)))))))........((((....))))..))))))).))))))...............(((((((...))))))).............((((((....(((...((.((((((((......(((((((.((....)))))))))....(((.......)))................)))))))).)))))...)))))).((...((((...(((((....)))))..))))..))......(((((.........((((((((((((((...))))))).)))))))......)))))...(((((.((....)).)))))...((((....))))(....)............................
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................................................................................................................((((((.....))))))..((((((((...((((((....(((......((((((((..((..(((((((.((....)))))))))))(((((.......))).)).............))))))))...)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............))))))))((((((..................)))))).................(((.((....)).)))...................................................
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(.......)..............((.(((((((((((.((((((.....((((.((.....)).))))...))))))......(.((((....))))).))))))).))))))...............(((((((...)))))))........(....((((((....(((...((.((((((((..((..(((((((.((....)))))))))))..(((.......)))((....))........)))))))).)))))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))((...(((((........(((((((((((((((...))))))).)))))))).....)))))...(((((.((....)).)))))...(((((())))))(....)...))(((...))).......)......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((............((((.....(((((((((((.((((((.....((((...........))))...))))))........((((....))))..))))))).)))).....))))...((((.....)))))))))..))))((((((((......(((....)))......((((((((((((..((((((((((....)))..))))))).(((.......)))..)))).[[[......))))))))...(((...)))...]]]...((((...(((((....)))))..))))..((((....))))...))))))))(((((((((((((...))))))).))))))........((((...(((((..........)))))...(((((...(((((....))))).)))))...........))))...
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((.................(((.(((((((((((.(((((((....))).)))).((.((((.....)))))).......((.(((....))))).))))))).))))......(((....))).(((((((...)))))))..((((((((....(((((....(((......((((((((((((..(((((((.((....))))))))).((((((.......)))..)))..)))).....))))))))...)))...))))).(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............)))))))).((((((((((((...))))))).)))))............))).(((((.((....)).)))))...(((((...(((((....))))).)))))))))))............
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((...(((......................(((((((((((.((((...........))))...(((((.....)))))..........((((....))))..))))))).)))).................(((((((...)))))))..((((((((...((((((....(((......((((((((......((((((.(((....)))))))))....(((.......)))................))))))))...)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............))))))))(((((((((((((...))))))).))))))...............(((((.((....)).)))))....[[.....((((......)))))))]])))................
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((((...............(((((((((((((((.((((((.............[[[[[[[[......))))))........((((....))))..))))))).)))).................(((((((...)))))))..((((((((..(((((((...(((.......((((((((((((..((((((((((....)))..)))))))..........(((..)))...)))).....))))))))...)))...))))))).....((((...(((((....)))))..)))).................))))))))(((((((((((((...))))))).))))))..........)))).(((((..........))))).))))).....(((((....)))))...]]]]]]]].............
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..((((.....((((.....)))).((.(((((((((((.(((((((....))).)))).(.(((((.....)))))).......(.((((....))))).))))))).))))))....(((....))).(((((((...)))))))..((((((((..(((((((....(((......((((((((.(((..((((((((((....)))..)))))))..)))(.(.(...............)))..))))))))...)))...))))))).....((((...(((((....)))))..))))..((((....))))...))))))))(((((((((((((...))))))).))))))((((..........((((((..........))))).).........[[[[[))))]]]]])))).)))................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((....((((.....((((..(((.((((((((((.((((((.....((((.((.....)).))))...))))))........((((....))))..))))))).))))))...))))........(((((((...)))))))..((((((((...((((((....(((......((((((((((((..(((((((.((....)))))))))..(((((.......))).))....)))).....))))))))...)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............)))))))).((((((((((((...))))))).))))).)))).......(((.(((((.((....)).)))))...((((....))))......))).)))))))))...............
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((.............((((..((.(((((((((((.((((((.....((((.((.....)).))))...))))))........((((....))))..))))))).))))))...))))..(((((.(.((......(((((((..((((((((...((((((....(((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((.......))).))....)))).....))))))))...)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............))))))))(((((((((((((...))))))).)))))).........)))))))((((.((....)).))))))..).))))).(((((....))))))))))))))...............
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(...)))))))))..((((...(((((((((((((((((((((..))))).)))((.(..(..))))((((....).))).((((((..)))))))))))))).)))))..(((((.(..((.(......)))..))))))..((..))(((((((.(...)...((((((((((((((((((.((((((((((.((((..))))))))))))).))))))((((((((((..((....))((((.(((.(((((((.(........)))))).)))))))))))).)))))))......)))))))...(((((.....((((((((((((((((((...))))))).)))))))))))..))))).(((((((((((..)))))))).)))((((....))))...))).)))((((...)))).))))))).))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..((((....................(..((((((((((.((((((.....((((.((.....)).))))...))))))........((((....))))..))))))).))).)................(((((((...)))))))..((((((((...((((((....(((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))...((((.......))).).....)))).....))))))))...)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............))))))))(((((((((((((...))))))).))))))............(..(((((.((....)).)))))...((((....)))).......)..)))).)))................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((....((((.....((((..(((.((((((((((.((((((.....((((.((.....)).))))...))))))........((((....))))..))))))).))))))...))))........(((((((...)))))))..((((((((...((((((....(((......((((((((((((..(((((((.((....)))))))))..(((((.......))).))....)))).....))))))))...)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))............)))))))).((((((((((((...))))))).))))).)))).......(((.(((((.((....)).)))))...((((....))))......))).)))))))))...............
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((..((((....((((.....))))....(((((((((((.(((((((....))).))))...(((((.....)))))..........((((....))))..))))))).)))).....))))...((((.....))))....(((((.....)))))...))).....((((..(((.....)))........(((((((.((....))))))))).....(((..((((....))))..((((....))))...(((((....)))))...)))...((((...(((((....)))))..))))..((((....))))....)))).((((((((((((((.....)))))).)))))))).........(((.((((..((....))..))))...((((....))))......))).(((.....))).............
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((..((((....((((.....))))....(((((((((((.(((((((....))).))))...(((((.....)))))..........((((....))))..))))))).)))).....))))....((((((((((.....)))))).....((((....[[[.............))))...)))).(((..(((((((.((....))))))))).....(((..((((....))))..((((....))))...(((((....)))))]]])))...((((...(((((....)))))..))))..((((....)))).....))).((((((((((((((.....)))))).))))))))........((((.((((..((....))..))))...((((....))))......)))){{{.))).}}}.............