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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00681



RNA: CRW_00681
Rfam family: -

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((.(((((.......(((....)))...)))))((((((((((((((((...((.(((.(((.....))).))).))))))))))((....)).)))))))).(((((((((((..((....))...))))))).)))).................))...)))))..................(.((((((....))))........(((.....)))......(((.(((((..............))))).)))............(((((.(((.....))).)))))...........((((((((.....(((((((.((((.....)))).)))))))..))))))))......((((....)))).(((((((......(((((...)))))....))))))))).)...........(((((((((((............))))))))))).......
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....(((((((((.....((((....)))).))))))((((((((((((((((...((.(((.(((.....))).))).))))))))))((....)).)))))))).(((((((((((..((....))...))))))).))))................)))...)))))........(((()))).(((((((((....)))).......((((.....))))....((((.(((((.((....)).....))))).))))...(((...(.(((((.(((.....))).))))))..))).....((((((((.....(((((((.((((.....)))).)))))))..))))))))......((((....)))).(((((((......(((((...)))))....))))))))))))..........(((((((((((............))))))))))).......
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.....((((((.....((((....)))).))))))((((((((((((((((........((((....))))........))))))))((....)).)))))))).(((((((((((..((....))...))))))).)))).......(((..(((((((...((((.....(((((((((((..((((.((((....))))))))...((((......)))).)))).....))))).))..........))))..)))))))))).)))))).((((((((..((((.((....((.((((((((((((((.....(((((((.((((.....)))).)))))))..))))))))((((..((((....))))..)))).(((....(((((...)))))....))).....(((((...............))))).))))))))...)))).))..)))))))).
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.....((((((.....((((....)))).))))))((((((((((((((((........((((....))))........))))))))((....)).)))))))).(((((((((((..((....))...))))))).)))).......(((..(((((((...((((....((.(((((((((..((((.((((....))))))))...((((......)))).)))).....))))).....))......))))..)))))))))).)))))).((((((((..((((.((....((.((((((((((((((.....(((((((.((((.....)))).)))))))..))))))))......((((....)))).(((((((......(((((...)))))....))))))).((((((.............)))))).))))))))...)))).))..)))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((.....(((((..))))).))))))......[[[[[[[[[[..............))))))).......]]]]]]]]]]........((((((..(((((((((((.............))))))).))))..............))))))..))))).((((((((((..)))).....((((....))))(((((..)))))..((((((.........(((((.(((..))).....)))))..............)))))).(((((((.((((((............................)))))).........))))))))))))).......((((...(((((((....)))).(((((((......(((((...)))))....)))))))...))).........(((((((((((............)))))))))))))))...
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.....((((((.....((((....)))).))))))((((((((((((((((........((((....))))........)))))))).........)))))))).(((((((((((.............))))))).)))).......(((..(((((((...((((......((((((((((..((((.((((....))))))))...((((.[[[..)))).)))).....))))).)...........))))..)))))))))).)))))).((((((((.(((((.((....((.((((((((((((((.....(((((((.((((.....)))).)))))))..))))))))......((((....)))).(((((((..]]].(((((...)))))....))))))).((((((.............)))))).))))))))...)))).)).))))))))).
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((..((((((.....((((....)))).)))))).(((..((((((((((........((((....))))........)))))))))).(((((.....((((.(((((((((((..((....))...))))))).)))).......(((...((((((...((((....((.(((((((((..((((.((((....))))))))...((((.....))))..)))).....))))).....))......))))..)))))).)))))))(((((.(((.....))).)))))....)))))..)))...)))))).(((((......((((((.(.((((((((.........((((((..((((....))))..)))).)).....((((.....)))).))))))))).)))))).........(((((((((((............))))))))))).))))).
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.((((((.(((((....(((((((((((.(((((((.(........)((((((((((...)))).((.((((....)))))).)))))))))).))))))).))))))).(((((((((.............))))))).)).(((...(...)..)))(((((((((......))))((((..)))).)).)))(..).))))).))))))))).((((((..(((........)))((((((((((..(((((.(..(((((((....(((..(((..(((.(.(.((((..))))).)))))))..)))...)))))))..)))))))))))))))).))))))((((......((((((((((((((..)))))..((((..))))..)))))).)))(((((....(((((((((((.((((.......))))))))).))))))...)))))((((..))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ............((((((.....((((....)))).))))))......((((((((((............................))))))))))................(((((((((((..((....))...))))))).)))).............((((((...((((.......(((((((((..((((.((((....))))))))...((((.....))))..)))).....))))).............))))..))))))........(((((.(((.....))).)))))...................................((((((.(.((((((((.........((((((..((((....))))..)))).)).....(((((...))))).))))))))).)))))).........(((((((((((............))))))))))).......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((..((((((.....((((....)))).)))))).(((..((((((((((........((((....))))........)))))))))).(((((.....((((.(((((((((((..((....))...))))))).)))).......(((..(((((((...((((.....(((((((((((..((((.((((....))))))))...((((.....))))..)))).....))))).))..........))))..))))))))))))))(((((.(((.....))).)))))....)))))..)))...))))))...(((......((((((.(.((((((((.........((((((..((((....))))..)))).)).....((((.....)))).))))))))).)))))).........(((((((((((............))))))))))).)))...