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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00689



RNA: CRW_00689
Rfam family: -

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((((((........))))))))))...)))(((((((((((((......))))))).))))))..(((((((......((((..((.(((((.((((((....)))))).))))).))..))))((((((((((....))))))))))...........)))))))((((.((((........))))))))..................(((((((....)))))))(((((....)))))........
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((....((((((..........)))))).......))).))..(((((((......)))))))(((((((..(((((((..((.(((((..((.((((..(((((......)))))..)))).))..)))))(((((((((....))))))))).....)).....))))))).....((((........)))).)))))))..............(((((((....)))))))(((((....)))))........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((((((((.....).))))))))))...)))(((((((((((((......))))))).))))))..(((((((.(((.(((((..((.(((((.((((((....)))))).))))).))..))))((((((((((....)))))))))).)..)))....)))))))((((.((((........))))))))..................(((((((....)))))))((((((()))))))........
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((((((((........))))))))))......(((((((((((((......)))).)))))))))..(((((((.((((..(((.....((((..((((((....))))))..)))).....))).((((((((((....))))))))))...))))....)))))))((((.((((........)))))))).)))))....(((((((.(((((((....))))))).((((....)))))))..))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((((((((........))))))))))......(((((((((((((......)))).)))))))))..(((((((.((((.((((..((.((((..((((((....))))))..)))).))..))))((((((((((....))))))))))...))))....))))))).(((.((((........)))))))..))))).....(((.....(((((((.((((((.......)))))))).)))))))).
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((((((((........))))))))))......(((((((((((((......)))).)))))))))..(((((((..(....(((..((.((((..((((((....))))))..)))).))..))).((((((((((....)))))))))).....).....))))))).(((.((((........)))))))..))))).....(((....(((((((....))))))).((((....)))).....))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((((((........))))))))))...)))).....(((((((......)))))))((((((((...((((((.....)))))).........((((((....))))))..((((.....((((((((((((((....))))))))))..........)))).....))))((((........))))))))))))......((((....(((((((....)))))))((((((..))))))....))))
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((((((........))))))))))...)))).....(((((((......)))))))((((((((...((((((.....))))))...(((((.((((((....)))))).))))).....((((((((((((((....))))))))))..........))))..((((....))))...........))))))))......((((....(((((((....)))))))....((((....))))..))))
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UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((((((((........))))))))))......(..((((((((((......)))).))))))..)..(((((((.((((..(((..((.((((..((((((....))))))..)))).))..))).((((((((((....))))))))))...))))....))))))).(((.((((........)))))))..))))).....(((....(((((((....)))))))(((((....)))))....))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((..........)))).(((.....))).))))..((((((((((......)))).)))))).(((((.((((((.....)))))).........((((((....)))))).)))))....((((.((((((((((....)))))))))).............)))).((((.((((........)))))))).((((.............(((((((....))))))).((((....))))...))))..
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((..[[[[[[...)))..]]]]]]...(((((.....))))).((((......)))){{{{{{........((((((.....))))))(((......<<<<<<.)))>>>>>>.(((.....)))...((((((((((....))))))))))..)))))...}}}}}}.(((....)))......((((....)))).........(((....(((((((....))))))).((((....)))).....))).