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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00691



RNA: CRW_00691
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.(((....)))))))))((((((.((((..(((.(((((((......)))))))..(((((((..(((((((..(((((((....)))))))..)))))))(((((((((......)))))..))))...........))))))).((((((......))))))....)))...))))..(((((((((.....)))))).)))........))))))........
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(......).))))))))))))....................(((((((............(((((((..(((((((....)))))))..)))))))(((.(((((......))))))))..........((((.(((...(((((((......))))))).....))).))))......(((((.....))))))))))))....................
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................................................((((((((.(((((((...(((((......)))))...))))))((((.(((((......))))))))).........).).)))))))(((((((......))))))).............................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((............))))))))))......(((.(((.......(((((((((..(((((((...((((((..(((((((....)))))))..))))))((((.(((((......))))))))).............)))))))(((((((......))))))).............((.(((......)))))...)))))))))...))).))).........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(......).)))))))))))).....(((((......)).(((((((((...........(((((((..(((((((....)))))))..)))))))(((.(((((......))))))))......((.(((((.(((.(((((((((......))))))).))..))).)))))....))((((.....))))))))))))).......))).........
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.(((....)))))))))((((((.((((..(((.(((((((......)))))))..(((((((..(((((((..(((((((....)))))))..)))))))....(((((......))))).(((((.....))))).)))))))(((((((......)))))))...)))...))))..(((((((((.....)))))).)))........))))))........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((....))))).((.((((((..((.((((.(((......)))))))((((........)))).((((((..(((((((....)))))))..)))))).(((((((((......)))))..))))......(((((.(((.(((((((((......)))))).)))..))).))))).(((((((((.....)))))).))).....)).)))))).)).....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((..........))))))))))).....................((((((((..((((((....((((((..(((((((....)))))))..))))))((((.(((((......))))))))).........[[[[.))))))(((((((......))))))).........]]]].......((((.....))))))))))))....................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((.(((((....)))))))).((((((..((..((...((......))..)).((((........))))(((((((..(((((((....)))))))..))))))).((.(((((......)))))...))(.....)(((((.(((..((((((((......))))))).)...))).))))).(((((((((.....)))))).))).....)).))))))........
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((..........)))))))))))).....((((((((((.[[[[.)))))))..(((((((..(((((((..((((((((..))))))))..)))))))(((((((((......)))))..))))...........)))))))(((((((......)))))))...............(((((((((.]]]])))))).)))..........))).........
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((.(((((....)))))))))((((((.((((..(((.(((((((......)))))))..(((((((.((((((((..(((((((....)))))))..))))))((((.(((((......)))))))))..........)).))))))).((((((......))))))....)))...))))..(((((((((.....)))))).)))........))))))........
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((.(((((....)))))))))((((((..........................((((...[[[[.))))(((((((..(((((((....)))))))..)))))))....(((((......)))))............(((((...]]]](((((((......))))))).........))))).(((((((((.....)))))).)))........))))))........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((....)))))....((((((........((((((.((((.......((((........))))(((((((..(((((((....)))))))..)))))))(((((((((......)))))..))))...(((((.........((((((((......))))))))......)))))...............)))).)))))).........))))))........
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.(((....)))))))))((((((.((((.((((.(((((((......)))))))..((((((((.(((((((..(((((((....)))))))..))))))).)..(((((......))))).(((((.....))))).))))))).((((((......))))))....))).).))))..(((((((((.....)))))).)))........))))))........
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((..........))))))))))).(((.....(((((((......)))))))....((.(((.(((((((..(((((((....)))))))..)))))))..((.((((((((..(((.((((((....((((((((.(((.(((((((((......)))))).)))..))).)))))...))).))).)))))).)))))))).))......))).)).)))..
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((....)))))(((.((((((.((((.((((.(((((((......)))))))..((((((((.(((((((..(((((((....)))))))..))))))).)(.(((((......))))))(((((.....))))).)))))))(((((((......)))))))...))).).))))..(((((((((.....)))))).)))........)))))).)))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(......).((((.((((((((.(((((..)))))(((((..)..))))((((((....(((((((((((((((((..(((((((..)))))))..))))))).))((((((((((((((((((((.(((((........))))).)))).))))).)))).))))))))))).).)))......((..))(((......)))))))))...)))))))))))).....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((.(((((....)))))))).((((((.((((..(((.(((((((......)))))))..(((((((...((((((..(((((((....)))))))..)))))).....(((((......))))).................)))))))(((((((......)))))))...)))...))))..(((((((((.....)))))).)))........))))))........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((....))))).((.((((((.((((..(((.(((((((......)))))))..(((((((.((((((((..(((((((....)))))))..))))))((((.(((((......)))))))))..........)).))))))).((((((......))))))....)))...))))..(((((((((.....)))))).)))........)))))).)).....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.(((....)))))))).(((((.......(((.(((......)))))).((((........)))).((((((..(((((((....)))))))..)))))).....(((((......))))).(((((.....)))))...((((.(((((((......)))))))...............(((((((((.....)))))).))).))))....)))))........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.(((....)))))))).(((((.......(((.((([[[...)))))).]]](((.(((((((...((((((..(((((((....)))))))..)))))).....(((((......))))).(((((.....))))).))))))).((((((......))))))..........)))...(((((((((.....)))))).))).........)))))........