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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00711



RNA: CRW_00711
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ...((((((((.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))).(((((((((...))))))))).(((((.....)))))..(((((((....((((((....(((..........(((.((((((((..(((((((((....))).))))))..(((((((....)))))))....)))....).))))))).(((((((((((.(((...)))))))))))))).)))...))))))(((..(((((....(((((((((((.............................................................................................................................................................................................)))).)))))))..)))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((((((((...................................................................................................................................)))))))))))))))))).......]]]]]]((............................................................................................................................................................................................................................................................................................................)).......
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((...(((((((((((..........(((((((((....)))))))))....(((((((((..............((((((......((((((........))))))..((((.(((........))).)))).)))))).....((((((((((.....((((((.(((((((((....(((((.(((((.((((.(....)..)))).)))))..))))).)))).)))))..)))))).........(((((..(((((.....(((((((((((((.((..(((.(((((((((.....((((.............((((((.....))))))((((((((((.(((((.(((..(((((((((((..((((.....)))).....)))))))).((((((....))))))........)))..))).))))))))))).))))........)))).....)))))))))...)))..)).))))))....))))))).....)))))....)))))..))))))))))..))))))))).)).))))).))))..(((((((((....(((((..((((..(((((....))....((((((((((((....(((((....(((((.........(((((((((....(((...((((((((((......)))))))))).))).)))))))))...........)))))..((((..((((((((((((((((........((((((.((((((((....((((.....(((((....((((((........))))))...)))))(((((((..(((((((.(((.(((((.((((....((((((..(((((((((.....)))))))))....))))))........((((..((((((...(((....)))...))))))..))))...............)))).)))))....(((........)))...))).)))).)))....))))))).))))....)))))))).....((.((((((.(......))))))).)).......)))))).........)))))))))))).))))..).)))..(((((...)))))..)))))........)))))))))).))........)))..))))..((((.....))))..............)))))...............((((.((((...)))).)))).)))))))))...((((((...........(((((...((((((.........((....)).....(((((((((....))).))))))....))))))....)))))(((((((.((((..((...(((......(((((((...((((.((((((((((.((((((...((((.((..((..((((...)))).....((((((..(((.((.((((.((..(((.(((.(((((........))))).))))))..))))))..(((((((((.((.(((((((((...(((.(((..(((...(((.....))).))).))))))....))))))))).......(((((((.((......)))))))))..)).)))))))))............((((((((....((((((((((.......))))))))))......................((((((((((...(((((((((..((((.((((.....))))....))))..)))...)))))).)))).)))))).))))))))...)).)))..))))))..))..)).)))))))))).(((........))).......)))))))))).)))))))))))..))).))..))))))))))).....))))))((((((...((((((.((((((((((......))))))))))............((((((.((((((((((((..((((((......(((.....((((((((.(((((.((((....)))).(((.........)))......)).)))..))))))))...)))....((((((..((((((((....))))))))....))))))....))))))...))))))))).))).)))))).......))))))))))))....))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((............)))))...(((((((((....)))))))))((((((........(((((........))))).......((((((........)))))).....((((((((.............................(.......).((((((........))))))...........))))))))...((((...((((((((((..((((((......(((...(((((.......)))))..(((((((((.................((((((((.............((((((..........((((((.....)))))).....))))))..............((((((((.(..(((.......)))..))))))))).((((((....)))))).(.(((.(((.(((.(.(((((...........................(((((........((((((............(((((........(((((((.(((....)))))))))).................(((........(((((((((...................((((..........((((((((((...((((......(((((..((.....(((((((((.(.((.....(((((((((........))))))))))).).)))))))))....)).....)))))......))))..((((((((((((........(((((..(((((((.....((((..(((((.(((...(((.......((((((....(((.................)))...))))))....)))..)))))))).....(.(((((((..(...(((((((((....)))..............((((...)))).((((((..(((((.......(((........)))......)))))..))))))...........))))))...)..))))))).)......)))).....)))))))........((((((.........))))))...........))))).........))))))))))))..............(((((...)))))...............))))))))))..........))))((((.((((((...............................))))))))))....(((.............))).)))))))))....)))....)))))............))))))...)))))...............(((((((((....))).))))))......)))))..).))).))).))).).................((((..(((((...))))).))))))))))))..(((.(((((....((((...............(((((((((.(((((.....(((((((.....(((((........)))))....)))))))......))))))))..((((......((((.......)))).(((((((((((((.......(((((.(((((((....)))))))..(((((((...........)))))))....(((((..........)))))........))))).((((((((((.......))))))))))........................((((((((...((((((((((.((((.(((.......))...).)))).))))...)))))).))))))))........)))))))))))))......(((((((((((.....(((..(.(.((((((((........)))))))).....).).)))......)))))))))))))))(((((............)))))...))))))((((((((((......))))))))))....)))).........(((((...............................)))))..........((((....)))).(((.........)))......))))).)))...........))))))))).....((((((((....)))))))).)))(((((((...........))))))).......))))))...))))))))))..)))))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................(((((((((....)))))))))............................((((((..(((((((((........)))))).)))..))))))(((((.((((((((.(..((((((..((((((((((.....((((((((((((((((.....((...(((((..(((......))...)..)))))....))..))))).)))).....(((((.......)))))..(((((.....(((((((((((((.(((((.(.(((((((((.....((((.............((((((.(())))))))((((((((((.(((((.((((.(((((((((((.(..(((.......)))..)))))))...((((((....)))))).......))))))))).))))))))))).))))........)))).....)))))))))...)))).)).))))))....))))))).....))))))))))))....)))))))))).)))))).).))))))))..........)))))....(((((.....................)))))..((((((((((.....((......(((((.........(((((((((....(((...((((((((((......)))))))))).))).)))))))))...........)))))......))((((((((((((((((....((((((((((.((((((((....((....((((.((((..((((.......((((((....(((((.............)))))...))))))....)))).))))))))..(((((((((.....))))))))).((((())))).............((((((((.....((((((..((((((.....(((((.....))))).....))))))..)))))).....((..........)).............))))))))))....))))))))........((((((.........))))))(.......).)))))..)))))...)))))))))))).))))....((((.(((((...)))))..)))).........))))))))))................((((((((((.....).....................................((((.((((...)))).)))).(((((.....)))))..)))))))))...........((((((....((......))....((..(((((((((....))).))))))))..))))))(.((((((((((.((((.........(........(((((.(((((...)))))))))))((((.......)))).))))))))..(.......).............((.(((((((((.(((((((.(((.(((((.(....).))))).))))))))))))))..)))))))...)))))).)..................(((((((((((((.((.....((...(((((((....)))))))))(((((((.(........))))))))...(((((((.((((....))))......((((.....((((((((((.......))))))))))......)))).)))))))...(((((((((((.(((((.(.((((.((((.(((.......)))....)))).)))).).)).))).)))))))).))).)).)))))))))))))..((..(((((((((((((...(((.(...((((((((((......)))))))))).....)..)))...)).))))))))))).))((((((............)))))).((((((.((((((((((......))))))))))............((((((.((((((((((((..((..(((((((((((.....((((((((....(((((((....)))).(((.........)))........)))...))))))))...)).....(((((((((((((((((()))))))))).))).))))))))))))))..))))))))))).))).)))))).......)))))).((.......))
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