RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00715

RNA: CRW_00715
Rfam family: -

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....((((((..(((((((....)))))))..........(((((((..(((......(((((((...((((((((((....((((.....((((((...))))))...))))..))))))))))..)))....((((.(((...(((((((((............)))))))))..))))))).)))).(((((........................)))))...))))))))))((((((..((((................)))))))))).))))))((((...((((((((....))))))))((((((............))))))...............))))....))))).....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.........))))...((((((....)))))).............(((......(((((....(((((...((((((((((...(((((.......................))))).)))))))))))))))...)))))..((...(((((((((............)))))))))..))...........(((((...(((.........)))......)))))........)))..((((((..........................))))))..............((((((((....))))))))((((((.((.......)))))))).................................
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................(((((((...(((((...............................................................................)))))(((...((((((..................))))))..)))..........(((((........................)))))......)))))))(((((............................)))))...........................................................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.......((((.((((((((....))))))...........(((((............(((((((((...(((((((((..((.........((((((...)))))).....))..))))))))))))))...))))...(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((........................)))))........)))))....................................................((((((((....)))))))).(((((............)))))............)).)))).....))))).....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.......)))))..(((((((....)))))))..........((((((....((((((....(((((...((((((((((...(((((.....(((((.....)))))...))))).)))))))))))))))...))))))(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......))))).......))))))((((((..(((..................)))))))))..............((((((((....))))))))((((((.(((.....))))))))).................................
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((..(((((((....)))))))..........(((((((..(((((((....((((((...(((((((((...(((((.....((((((...))))))...))))).)))))))))))))))...))))))).(((.(((((((((............)))))))))....)))........(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((..((((....(((....)))..)))))))))).))))))..(((..((((((((....))))))))[[[[[[......)))...]]]]]].................................
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..(((..((((((.((((((....))))))............((((((....(((((....((((((...(((((((((...(((((..((..(((.....)))..))..))))).)))))))))))))))...))))).(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......)))))......)))))).((((((..........................))))))..(((...)))....(((((((....))))))).((((((............))))))...........)).)))))))..))))).....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..((...((((..(((((((....)))))))..........(((((((....(((((....(((((...((((((((((...(((((..((...............))..))))).)))))))))))))))...))))).(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((..((((................))))))))))..............((((((((....))))))))((((((............))))))..............)))).))..))))).....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..(((..(((((..((((((....))))))...(((......((((((...((((((....((((((...(((((((((...(((((.....(((((.....)))))...))))).)))))))))))))))...))))))(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......)))))......)))))).((((((..((((................))))))))))..(((...)))...((((((((....))))))))((((((............)))))).....)))....).)))))))..))))).....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.......((((((((((((........((((((((((....(((((((..(((((((....(((((...((((((((((...................[[[[[[[[[[[.......)))))))))))))))...))))))).....(((((((((............)))))))))..(((...)))....(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((.........]]]]]]]]]]]......))))))..(((...)))...((((((((....))))))))...)))))))))).)))))))))................))).....))))).....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..((.(((((...(((((((....)))))))..........(((((((...((((((....((((((...(((((((((...(((((..((..(((.....)))..))..))))).)))))))))))))))...))))))(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((..........................))))))..))))).(((...((((((((....))))))))((((((............))))))...............))).))..))))).....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..(((..(((((((((((((....)))))))(((((.....(((((((...((((((....((((((...(((((((((...(((((.((..((((((...))))))).)))))).)))))))))))))))...))))))(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((((.(((.........)))..).).)))))......)))))))((((((..((((................))))))))))..(((...)))...((((((((....))))))))((((((.(((.....))))))))).....))))).)).)))))))..))))).....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.......((((..(((((((....)))))))..........(((((((..(((((((....(((((...((((((((((...(((((.....((((((...))))))...))))).)))))))))))))))...))))))).....(((((((((............)))))))))...............(((((........................)))))......)))))))((((((..........................))))))..............((((((((....))))))))((((((............))))))..............)))).....))))).....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..(((..(((((((((((((....))))))).((((..(((((((.((..(((((((....((((((...(((((((((...(((((..((..(((.....)))..))..))))).)))))))))))))))...)))))))..)).))))))).(((.((((.........(((((..((.....)).)))))..((((((.....(((((................(....).....((((((..........................))))))..))))).......((((((((....)))))))).)))))).........)))).))).....))))..)).)))))))..))))).....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.((((((((........(((((((....))))))).((((..(((((((.((..(((((((....((((((...(((((((((...(((((..((..(((.....)))..))..))))).)))))))))))))))...)))))))..)).)))))))...)))).......))))))))...)).(((..((((((((((...(((.........)))......)))))..........((.((((((..........................)))))).))...))))))))((((((((....))))))))((((((............))))))...........((..((.........))..)).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..((((((((...(((((((....)))))))..........(((((((...((((((....((((((...(((((((((...(((((..((..(((.....)))..))..))))).)))))))))))))))...))))))(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((..........................))))))..))))).(((...((((((((....))))))))((((((............))))))...............))))))..))))).....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((((((((((((((..))))))))..((..)).((..))((((..)))).(((((((((((((((((((....))))))..((..))(((((..)))))...(((((..))))).)))))))))))))(..)))))))..((((((((((........))))))))))(((..))).(.(((((((((((...(..............)..).)))))..((..))..((.((((((((..(((.((......)).)))..)))))))).))...))))).)(.((((((..(..)))))))...)(..........))))))))).....(((...)))...(......))))).....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..((..((((...(((((((....)))))))...........((((((.....((((....((((((...(((((((((....((((......(((.......)))....))))..)))))))))))))))...))))..(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((......(.....)...........)))))......)))))).((((((..........................))))))..))))..(((...((((((((....))))))))((((((............))))))...............))).))..))))).....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..((.(((((...(((((((....)))))))..........(((((((...((((((....((((((...(((((((((...(((((..((..(((.....)))..))..))))).)))))))))))))))...))))))(((...(((((((((............)))))))))..)))..........(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((..........................))))))..))))).(((...((((((((....))))))))((((((............))))))...............))).))..))))).....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.......))))...(((((((....)))))))...........(((((....((((((.....)).)))).((((((....)))))).(((((..((((....)))).(((......)))....)))))........(((.(((...(((((((((............)))))))))..)))))).......(((((...((..............))...))))).......))))).((((((..........................))))))......(((.....((((((((....)))))))).(((((............))))).......((((........)))).))).......
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.......)))))..(((((((....)))))))...........(((((....((((.((.....)))))).((((((....)))))).((((......((((....))))...(((......)))))))..........((((.......)))).(((((............(((((....[[[.[[..)))))..]]]]]......))))).....................))))).((((((..........................))))))........(((.((((((((((....))))))).((((((............))))))......{{{{..))))))}}}}...........

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