RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00716

RNA: CRW_00716
Rfam family: -

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((.......(((((.......))))).((((((((((((....(((...(((........)))..)))......(((((((.((((..(((((..(((..((((((.....((((((..............))))))...(((((((..((((((((((..((((((((.......))))))))....))))))))..))...))).))))......))))))))).((((...(((((((....)))))))...)))).............))))).)))).))))))).))))))))))))..))))))))..((((((((..((((((.(((..((((((....((..((.(((((((((((((((..........((........)).................))))).....))))))))))))))...))))))((((((............)))))).))).(((((((....((..(((((((...)))))))))..))))))).....(((((..(((((..((((.......))))..))))))))))..)))))).))))))))(((((((...............))))))).........
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................(((((((((....(...(((((((((((((.........(((((((((...(((((((...((((.((((((.((((...............((((......((((((.(((.....)))..))))))...............((((((...((((((((.......)))))))).....)))))).......................))))..............))))...)))))).))))......)))))))....)))))))))...........)))))))))))))...).....)))))))))................(((((...........((((((((((......................................................)))))))))).......)))))(((((((............)))))))....(((((((....(((.((((((.....)))))).))))))))))......((((..(((((..((((.......))))..)))))))))..................(((((((...............))))))).........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........(((((.((.((((((((....((...(((((((((((((.....((((......(((((............))))).........))))......(((((((((.......((((((..............))))))......((((......(((.....((((((((.......))))))))....)))......))))............................................)))))))))(((((..................))))).........)))))))))))))...))......((((((....))))))......((((((...........(((((((((((((((.......................................))))....).)))))))))).......))))))((((((............))))))...((.((((((.........((......))..........)))))).........))..(((((..(((.........)))..)))))...)))))))).)).))..)))(((((((...............))))))).........
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((.......((((((.....)))))).((((((((((((....(((((..((....))..))))).........(((((((.((((...((((((.......(((((((((((((((.((((...))))..)))))).(((....)))...((((((((..((((((((.......))))))))....))))))))...............................((((...(((((((....)))))))...)))).)))))))))..)))))).)))).))))))).))))))))))))..))))))))..((((((((.(((((....)))))(((((....(((....(((((((((((((((.......................................))))).....)))))))))).)))...)))))(((((((............)))))))....(((((((....(((.(((((((...))))))).))))))))))((((.(((((..(((((..((((.......))))..))))))))))..))))...)))))))).((((((...............))))))..........
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................(((((((((...((...(((((((((((((.........(((((((((...((((((....((((.((((((..((..........................((((((.((.......))..))))))..............(((((((...((((((((.......)))))))).....))))))).......................[[................))]]..)))))).)))).......))))))....)))))))))...........)))))))))))))...))....)))))))))................(((((.............((((((..........................................................)))))).........)))))(((((((............)))))))....((((((.........((((((.....)))))).....))))))......((((..(((((..((((.......))))..)))))))))..................(((((((...............))))))).........
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((.......((((((.....))))))(((((((((((((......((..............))...........(((((((.((((.(((((.........((........((((((.((((...))))..)))))).....(...((...((((((((..((((((((.......))))))))....))))))))...)...))...............))............(((((((....)))))))....................))))).)))).))))))).))))))))))))).))))))))..((((((((...............(((((....(((....(((((((((((((((.......................................))))).....)))))))))).)))...)))))(((((((............)))))))....(((((((....(((.(((((((...))))))).))))))))))((((.(((((..(((((..((((.......))))..))))))))))..))))...)))))))).((((((...............))))))..........
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((.......((((((.....))))))(((((((((((((.........(((((((((...(((((((.....((((((.......................(((((((...((((((..............))))))..............((((((((..((((((((.......))))))))....))))))))..)))))))....................))))))...(((((((....)))))))........)))))))....)))))))))...........))))))))))))).))))))))..((((((((..(((((((......(((((...........(((((((((((((((.......................................))))).....)))))))))).......)))))(((((((............)))))))....(((((((........(((((((...)))))))....)))))))............(((((...................)))))))))))).......))))))))(((((((...............))))))).........
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((....(((((((((...(((..(((((((((((((....(((((..((....))..))))).........(((((((.((((.(((((...(((..((((((.....((((((.((((...))))..))))))...((((..(((..((((((((..((((((((.......))))))))....))))))))..)))..))))..........)))))))))........(((((((....)))))))....................))))).)))).))))))).)))))))))))))....)))..)))))))))..........(((..((((((....(((....(((((((((((((((.......................................))))).....)))))))))).)))...))))))((((((............)))))).))).[[[[[[[))))))..(((((((...)))))))....]]]]]]]((((.(((((..(((((..((((.......))))..))))))))))..))))....((((...(((((((...............))))))))))).....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((.......((((((..[[[))))))(((((((((((((....(((((............))))).........(((((((.((((.((((((((................((((((.((((...))))..))))))...((((.......((((((((.(((((((((.......))))))))...))))))))).......))))....................((((...(((((((....)))))))...))))...))).......))))).)))).))))))).))))))))))))).))))))))..((((((((..((((....)))).(((((....(((....(((((((((((((((...............................]]].....))))).....)))))))))).)))...)))))(((((((............)))))))....(((((((....(((.(((((((...))))))).))))))))))((((.(((((..(((((..((((.......))))..))))))))))..))))...))))))))(((((((...............))))))).........
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..............((((((((((((((....(((((((((((((...)))))))))))))..((..)).)).)))))))))(((((((((((((((.....(((..(.((((...)))))..((((...)))).....((..(((.(..........).)))..))(((((((.(...).))))))))))..)))))))))))))))(((..(((((((((((((....(((.(((((((((((......))))....(((((((((..((.((((..)))).)).(((((((((..(..((((((((((.(..)..((((((((.(((((((..((........))...))))))).((.(((.((.((.............)).)).))).))))))).)))..(((.((((..)))).))).))))))))))...)..)))))))))((((((((......))))))))...(((((((..)))))))(((((...))))).))))).))))..))))))).).))(((((((((((((..)).))))))))))).)))))).)))))))..).)).(((((((((..........)).))))))).)))..)))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((.(((......((((((((.(((((((.(((((((((((((...................................(((((((.((((.((((.........((((((.....((((((.((((...))))..))))))..............((((((((..((((((((.......))))))))....)))))))).....................)))))).....(((...(((((((....)))))))...)))...............)))).)))).))))))).)))))))))))))......(((((((..(((((((....(((........))).....)))))))..)))))))..............................))))))).........((((((((((((((..(((((........(((((((............)))))))....(((((((....(((.(((((((...))))))).))))))))))................)))))..)))))).))))))))......)))))))).....))).))(((((((...............))))))).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((....((((((((((((((((.(((((((((((((....(((((..((....))..))))).........(((((((.((((.(((((...(((..((((((.....((((((.((((...))))..))))))...((((..(((..((((((((..((((((((.......))))))))....))))))))..)))..))))..........)))))))))........(((((((....)))))))....................))))).)))).))))))).)))))))))))))......(((((((..(((((((.((.(((........)))..)).)))))))..)))))))..............................))))))))........((((((((((((((..(((((........(((((((............)))))))....(((((((....(((.(((((((...))))))).))))))))))................)))))..)))))).))))))))......))))))))....))..))))((((((...............))))))..........

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