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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00720



RNA: CRW_00720
Rfam family: -

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................((((.((..((((((.......))))))...)).))))........(((((..(((.....)))..)))))..(((((.....(((((.(....).)))))......(((.........))).................(((((((((((.......................((.....(((((((((...((.....)).....)))).))))).....))....................(((((((.......))))))).................((((((....)))))).......................................((((((((((((...((.((..((((((............((.(((((((((((..(((((((((..............(................)..))))).))))..))))))))))).))..........((...................))..................)))))).)).))..))))))))))..))..................)))))))))))...........................((..............)))))))......
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................((((.((..((((((.......))))))...)).))))........(((((..(((.....)))..))))).(((((((..(((((((.(....).))))).))))((((.........))))....(.........)(((((((((((((............((......))(((....(((((((((...((.....)).....)))).)))))....)))....................(((((((.......)))))))...(.............((((((....))))))...............)..........((((....))))(((((((((((((.(.((.((..((((((............((.(((((((((((..(((((((((......(......(((.((((....)))).))))))))).))))..))))))))))).)).........((((.................)))).................)))))).)).)).)))))))))))..)))................)))))))))))))....(..........).........(((.(((......))).)))))))).....
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................((((.((..((((((.......))))))...)).)))).........((((..(((....)))...))))..(((((((....(((((........))))).....................................((((((((((((.......................(((....(((((((((.....{{..........))))).))))....)))....................(((((((.......)))))))................}}(((((....))))).......................................(((((((((((((......((..((((((...............((((((((((..[[[.(((.(((..((((......(((.(((......))).)))))))..))).))).)))))))))).....(((....)))..........]]]..........................)))))).)).....))))))))))..))).................))))))))))))...........................................))))))).....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((.........((((((.((..((((((.......))))))...)).))).)))))))).((((..((((...))))..))))..(((((((..((((((.((((.((((((((((((.((((((((((((((.((((.((....))..(((.....))).(((....((..((((((......))))))..))......)))..))))................(((.....))).............)))))))))))))).....(((.........))).)))))..))))))))))).(((((.................))))).....................((((((((((......((..((((((............((.((((((((((.....(((..(((..((((......(((.((((....)))).)))))))..)))..))))))))))))).))..(((....)))...(((........(......).......))).......)))))).)).....)))))))))).......((((.(((.((((((((..((...........))..)))))))).))).)))).........))))))..))))))).....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((.........((((.......((((((.......))))))..[[[[[[[)))))))))(((((...((((..))))..))))).(((((((....(((((........)))))...(((((......(((((.......)))))(((((.(((((((((((((........((((((((((.(((((.......(((((((...]]]]]]].......)))))))..((((((((((((((((((..........(((((((.......))))))).......)))))....(((((((....))))...............))).............(((((((............)))))))..(((((((.((((((.............))))))......)))))))(((...)))...))))))))))))).........((((..))))..........................)))))...............))))...........................))))))..............................)))))))))))))...............))))).................))))).))))))).....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...............((((((((((..(((((.((((....(((....)))..))))......(((((...(((....)))..)))))..)))))..)))(((((........)))))..))))))).....[[[[[))))...]]]]]...((((((...(((((((.(((....((((((......))))))........((((.(((((((..............((((.....))))....(((((.((..((...(((((((.......)))))))))..)).)))))...))))))).))))...))).))).))))..............((((((..(((((.....((((((((((...((.((..((((((...............((((((.....((((((((.(((..((((....((.(((((......))))))).))))..)))...............((((.(((....)))..))))))))))))....))))))....((....))...)))))).)).))..)))))))))).(((((((...........)))))))..)))))..))))))))))))....((((...((((..(((....)))..)))).))))....
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((.........((((((((((..(((((.((((....(((....)))..))))......(((((...(((....)))..)))))..)))))..)))(((((.(....).)))))..))))))).....)))))))))...........((((((...(((((((.(((....((((((......))))))........((((.(((((((..............((((.....))))....(((((.((..(((((...((((.......)))))))))..)).)))))...))))))).))))...))).)).)))))..............((((((..(((((.....((((((((((...((.((..((((((...............((((((.....((((((((.(((..((((....((.(((((......))))))).))))..)))...............((((.(((....)))..))))))))))))....))))))....((....))...)))))).)).))..)))))))))).(((((((...........)))))))..)))))..))))))))))))....((((...((((..(((....)))..)))).))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((..((((....))))))).(((((((..))))))).(((((((.((((((((..)((((((((((.(.((((..))))).)))))..))))(((...(((((.((..)).)))))..))).((..((..(((((.......)))))..))((....)))))((((((.((((((((((........)))))))))..).))))))).))))))......((((..)))).((((((((((((((.((.(((((((...((((((.(...).))))))..((((.((.(.(...(((((((((..)))))))..))....)).)).))))))).))).)((((((((((..........))))))))))(((((((((..((.((((.............)))))))))))))))((..)).)).))))))))))))))..(((((.(.((((..))))).)))((((((((.(((...((((.((...((((((((((.((((...).))))))))))))..)....).).)).)).)))...)))))))))))))))))..))).)(((((((..((...........))..))))))).((((...((((.((........).))))).))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((((.........((((((((((..(((((.((((....(((....)))..))))......(((((...............)))))..)))))..)))(((((.(....).)))))..))))))).....))))).))).((.((..(((...(((((((((((((.........((((........))))..........(((.((((((................................(((((.((..((.....(((((.......)))))..))..)).)))))....)))))).))).................................................(((((((((......((..((((((...............((((((.....(((((((..(((..((((.......((((........))))...))))..)))...............((((.(((....)))..)))).)))))))....))))))....((....))...)))))).)).....)))))))))......................)))))))))))))....))).)).)).....(((...((((..(((....)))..)))).))).....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((((.........((((((((((..(((((.((((....(((....)))..))))......(((((..((((...))))..)))))..)))))..)))(((((........)))))..))))))).....)))))))))..(((((....((((((...(((((((.(((....((((((......))))))........((((.(((((((..............((((.....))))....(((((.((..(((((...((((.......)))))))))..)).)))))...))))))).))))...))).)).)))))..............((((((..(((((.....((((((((((...((.((..((((((...............((((((.....((((((((.(((..((((......((((((......))))))..))))..)))...............((((.(((....)))..))))))))))))....))))))....((....))...)))))).)).))..)))))))))).(((((((...........)))))))..)))))..))))))))))))...........((((..(...)..))))....))))).....