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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00724



RNA: CRW_00724
Rfam family: -

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((.(((((((((((((...((((.((...(((((((((.(.((((((........((.((.(((((.....(((((........(..(((((((....)))))))..)................((((((.....)))))))))))..(((((........)))))...))))).))..))...)))))).)))))........(((.((....((((.....((((((.......))))))...)))).......)).))).......((((....)))).....((((..........))))........((((((..............))))))......(((((((((.................))))))))).........))))).)).))))....))))))...)))))))...)))))).............((((..........(.((((((.(..((((((((((......)))))))).))..).))).))).).......))..))(((((((((...(.((((..........................))))..)...))))................((((.........(((((......((((.............))))..............(((((.(((.(((((....)))))...))).)))))....))))).............))))(((((((..(((((((((.(((((((((((((((((((((((.....((((......((((..(.(((.......((((.................))))....))).)..))))......)))).......((........))......(((((..(((.((((.....(........).....((((.(((....)))..))))........)))).))).((((.......)))).((((....))))..(((((((....((((...(((....................(((((......((((((..........((((..............)))).......(((........))).....))))))......))))).((((((.....(...((((((.((((((((......)))))))).))))))...)........)))))).........(((((((....(((((..................(..((((((((................))))))))...)...(((((((......((((....((((((......))))))....))))...((((((.....(.((((..(((((((...(...(((.......)))...)...)))))))..)))).)....))).)))........((...(((.((((((((.....(((((((........)))))))...........)))))))))))))..................)))))))......))))).....))))))).)))....))))............(((((((.....((((..((((............))))(((((.((((...(((((.....((((((.......)))...(((((.....)))))..)))...)))))....)))).)))))............))))......)))))))..................))))))).......................((((((.((((.........................................................(((((....)))))..((((....(..((((((.........))))))...).....))))..)))).)))))).............((((.....((((.......((((((((.(((....(((.(.....(((....))).....)...)))...)))...))))))))..)))).......))))......(((((((....).....((((((..........(((((((.......))))))).(((.(.........).)))..)))))))))))))))))............)))))))).....(((((.......)))))..........((((((......(((.............))).....))))))...))))))))))..))))).................((((((.(.....(((.((...(((....))).....))))).....).)))))).................)))))))))........((((((((......((((((.........))))))....(((........)))...))))))))))))))).(((((((((((...))))...(((((((((((((.(((((....)))))...)))))..........(((((((((((....)))))))))))((((....))))))))))))...))))))).....................)))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........(((((...)))))......(((........)))....((((.......))))((((....))).....(..((.....)).)..(((((((....))))))).......((((((((((((((((((.....)))))).(((((.....)))))........((((((((((((....((.......))...)))))....)))))))...(((((...(((((((.......))))))).))))).......(((((...((((.((((....))))...(((((.......((((((..........((((((...(((...)))..)))))).(((....)))...(((......(((((((.(.......))).)))))......))).........))))))...)))))))))....))))).....))))))))))))............(((((((..((((((((((......)))))))).)(((....)))....).))))))).........((((((.(.((((.((.(((((((.....))))))))).))))..).))))))...............)..(((((.((((((...........))))))..........)))))..........(..(((((.(((.(((((....)))))...))).))))).)....((................))((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((.(((((((((......(((((...................((.(((((((..((..(((.(..(((.((((.((........)).)))))))..).)))...))..))))))).)).........((((.(((....)))..)))).((((...))))..(((((((.......)))..((((....))))..........))..))....)))))(((.(((...))).))).....(((..((((........))))..)))..(((.........)))............))))))))).)))).((...(((((..(((....((((((......(((((((((.((((((((......)))))))).)))))))...))......)))))).........(((((((....((((((....................((((((((................)))))))).......((((((((.....((((..((((((((......))))))))..))))...((((((((((...((((..(((((((.....(.((((.....)))).).....)))))))..)))).)))).))).)))...(((..((...(((.((((((((((((.(((((((........))))))).).....))).))))))))))).)).......)))......)))))))).....)))))).....))))))).)))...)))))..))...(((.((((((((.....(((((((((((...(((....))).((((((.(((((..(((((.....((((((.......))))..((((((...))))))...))...)))))...))))).)))))).)))))))...))))......)))))))).)))....)))))))..((((((((....(((((...((.....((.((((((.((((.((((((.((.................................((.(((.((((((.(((((....)))))..)))))).)))))((((((.(....)))))))....))))))))....)))).)))))))).....))....))))).))))))))......((((((((((((....(((.(((((.(((....)))....))))))))...)))..)))))))))....)))).......(...((..((((((.((.(((((......(((.(((.....(((((((.......)))))))....).)).))).....)))))...)).))))))..))....)........))))))))......((((((....(((((.((...(.....((((((.....)))))).....).))..)))))..))))))...)))))))))).).)))).........(((.....((((((.(...(.((.((((..(((....)))....))))))..)..).)))))).............)))...)))))).)))))...((((((((......((((((.........))))))....(((........)))...)))))))))))))))((((((((((((...))))...(((((((((((((((((((....)))))..)))))))(....(((((((((((((((....))))))))))).))))...)....)))))))...))))))).)............................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((....[[[[)))..]]]].(((((((((.....(((((((...(((((((.............(((((.....(((((.((((......(((((((....))))))).......))))........((((((.....)))))))))))..(((((........)))))...))))).........)))))))..)))).))).....((((.....(((((...(((((((.......))))))).)))))..(((...(((((.......((((....)))).....((((..........))))........((((((...(((...)))..)))))).(((....)))...)))))....((((((((........))).))))).)))..)))).......)))))))))....(((((((......(((......))).........(((((((.(((((((((....((((((((......))))))))..(((....)))......))))))..((((((..((((((...((((....(((((((.....)))))))...))))....))))))(((((((((((.........(((......(((((...(((.(((......((((....)))).....))))))..(((((.(((.(((((....)))))...))).)))))....))))).....))).........((((((((((((.(((((.((((((((((((((((............(((......(((((((..(((......(((((...)))))....))).))))))).....)))...((((((...(((((((((...........(((((...(((((.((((((.....))))))......(((((.((((.(((....)))..))))...)))))((((((((...)))...(((((...((((....)))).(((((.....((((((........(((.(((...))).)))((((((((..((((........))))...(((.(((......((((.(((...(((.(((........))))))......(((((..(((....(((((((((((....((((((.((((((((......)))))))).))))))))))).......)))))).........(((((((....(((((((((((...........((((.........)))).............)))))........((((((((.....((((..((((((((......))))))))..))))...(((..(((((...((((..(((((((.......((((.....)))).......)))))))..)))).)))))....)))...(((.......(((.((((((((.....(((((((........)))))))(((....))).)))))))))))..........)))......)))))))).....)))))).....))))))).)))...)))))..)))......((((((((.....(((((((((((...(((....)))..(((((.(((((..(((((.......((((.......))))..((((((...))))))........)))))...))))).)))))..)))))))...))))......))))))))........)))).....((((((((....(((((.............((((((.((((.((((((.......................................(((.((((((.(((((....)))))..)))))).))).(((((((.......))))))).....))))))....)))).)))))).............))))).)))))))).........))).)))))))))))........)))))).........(((((.....))))))))))......))))))))))...........(((((............((((((...(((....(((((((.......)))))))..................))).)))))).))))))))))((((((.........))))))....)))))..........)))))))))..(((((((....)))).))).....)))))).((((.....)))).))))))))))..))))))....((((.((((....((((((...((((...((((..(((....)))....)))).))))....))))))............))))))))))))).)))))...((((((((......((((((.........))))))...((((........))))..))))))))))))))).((((.....))))))))))))))).(((((((((((((((....)))))..))))))))))..(((((((((((((((....))))))))))).)))).....))))))...........))).)))))))...)))))))............
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((....((((..........................((((...(((((((..........(..(((((.....(((((.((((...(..(((((((....)))))))..)....))))........((((((.....)))))))))))...((((........))))....)))))..)......)))))))..))))..................((((....(((..((.......))..)))..)))).........((((.......((((....))))...............................((((((...(((...)))..)))))).(((....)))...)))).....((((((((........))).)))))..............................))))......)))......................(((((..(((..........((((((((......))))))))..(((....)))............(.((((((..((((((...((((....(((((((.....)))))))...))))....))))))(((((((((((..((.....(((......(((((..............((((((....)))).))..........(((((.(((.(((((....)))))...))).)))))....))))).....))).....))..(((((((.((((.(((((.(((((((((((((((.......................((((((................................))))))...............(((....((((((((...........((((.................................(((((.((((.(((....)))..))))...))))).........................((((....))))...................................((((...((((.(((..((((........))))..))).))))......))))..................................(((((..(((....((((((.........((((((.((((((((......)))))))).))))))............)))))).........(((((((....((((((....................((((((((................)))))))).......((((((((.....((((..(..(((((......)))))..)..))))...((((((((((...((((..(((((((.......((((.....)))).......)))))))..)))).))))).)).)))...(((.......(((.((((((((.(...(((((((........))))))).........).)))))))))))..........)))......)))))))).....)))))).....))))))).)))...))))).......(((.((((((((.....((((((((((................(((((.(((((..(((((.....(.((((.......))))).((((((...))))))........)))))...))))).)))))...))))))...))))......)))))))).))).............((((((((....(((((.............((((((.((((.((((((.......................................(((.((((((.(((((....)))))..)))))).))).(((((((.......))))))).....))))))....)))).)))))).............))))).))))))))......(((((((((...........(((((.(((....)))....)))))...........))))))))).......................((((((...........((((((..........(((((((.......)))))))......................))))))))))))...............................))))..........)))))))).....((((((.....)))))).....)))...................)))))))))..))))))....((((.((((....((((((.......((..(((..(((....)))....))).)).......))))))(....)......))))))))))))).))))....((((((((......((((((.........))))))...((((........))))..))))))))))))))).((((.....))))))))))))))).(((((((((((((((....))))))..)))))))))..(((((((((((((((....))))))))))).)))).....)))))).).........)))..))))).......................
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