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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00739



RNA: CRW_00739
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((......(((...((((((((....((((((((((((...(((((.(((....(((...((((((((.......))))))))((((((((((((((((((((((((((..(((((((...((((((......(((((((..((((((..((((.........)))))))))).(((((......)))))......(((((..((((....)))))))))))))))).......)))))))))))))..........((((....((((((((....))))))))..))))))))))..)))..))))))).)))))..(((((((((.........))))))))).)))))..)))..))).....))))))))))))))))).......))))))))...))).))))).((((((((((((((((.(((((.....(((..((((((((((......))))))))))...)))))))))))))).(((((..............)))))))))))))))...(((((.(((.......)))))))).(((((((((((............)))))))))))..(((((....((((((((((.....))))))))))(((((((((.(((.(((....))).....(((((((((((....((((....)))).....((((((((((....))))))..))))......)))))))))))...))).))))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................(((((((....((((((((((((...(((...............(((((((((.......)))))))))........((((((((((((((((....((((........))))...........((.......))((((.........))))((((((.....))))))...........................................(((((......)))))..............((((....((((((((....))))))))..)))).)))))..))..)))))))).)(((((.(((((((((.........))))))))).)))))...(........)....))))))))))))))).......)))))))...................((((((((((((........((((....))))..((........))))))))))))))...................((((((((................................................(((((((((((.(.........))))))))))))........)))))))).....................((((....(................((.(((((((((((...................(.((((((((((....))))))..)))).)....))))))))))).)).....).......)))).....
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((......))))).(((((((....((((((((((((...(((((.((......))..(((((((((.......))))))))).(((((((((((((((((((((((((..((((........))))....(((((((((.....)))).)))))........((((((((((...)))))))))).................((((.((........)).))))............((((((((....)))))))).(((((.(((((......))))))))))....)))))))..)))..))))))).)).)))))).((((((.........)))))).....((((......)))).....))))))))))))))))).......)))))))((((((..((((.................)))).)))))).((((.((((((((((......))))))))))..)))).......((((..(((....((((((......(((((...((((((.((((...)))).)))))).....))))).(((((((((............))))))))).....(((.((((((((((((((.((...(((((.((((.((((((....)))))).)))).)))))...)))))))))))))).)).))).)))))).((((((((((....))))))..))))((((((.((((.......)))).)))))).))))))).....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....................((((((((....((((((((((((...((((...............((((((((.......))))))))((((((((((((((((((((((((((...(((..........)))...........((.......))......(((((((((((((((((.....))))))))).................((((..............))))..........))))))))..............((....((((((......))))))......)).))))))..)))..))))))).)))))..(((((((((.........))))))))).)))))..((........))..)))))))))))))))).......))))))))...................(((((................[[....((((((((........)))))))))))))]]...................(((((((................................................(((((((((((............)))))))))))........)))))))......................((((........................(((((((((((.....................((((((((((....))))))..))))......)))))))))))................)))).....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(......((...((((((((....((((((((((((...((((..............(((((((((.......)))))))))((((((((((((((((((((((((((..((((........))))....(((((((((.....)))).)))))........((((((((((...)))))))))).................((((.((........)).))))............(((((((......))))))).((((.((((((......))))))))))....)))))))..)))..))))))).))))).))((((((((.........))))))))....))(......).........)))))))))))))))).......))))))))...))..................((((((..(........((((.((((((((((......))))))))))..))))...).)))))).......((((((((...((((((.....((((((.((((...)))).)))))).........(((((((((((............)))))))))))..)))))))))))))).(((((.......((.((((((((....))))))))...)).......)))))............)...............((((((((((....))))))..))))........(((.((((..((.....)).))))..))).....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....................((((((((....((((((((((((...(((((..............((((((((.......))))))))((((((((((((((((((..(((((........(((((((...........(((((((.....))))))).((((((((((((((((((((...))))))))))...((((((...................))))))..[[[[[........))))))))))....(((((...)))))..(((((((((..)))))))))))))))))))))......)))))))).)))))..(((((((((.........))))))))).))))).((((......))))))))))))))))))))).......))))))))..................((((((((((((........((((....))))..............)))))))))))).....((((((........((((((((...(((((((((((((((.............)))))))))........(((((((((((............)))))))))))..)))))))))))))).........))))))....(((((((.(((((..........]]]]]..(((((((((((....(((..))).........((((((((((....))))))..))))......)))))))))))......)))))....)))))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((..(((...((((((((....((((((((((((...(((((..(((...((((......))))...)))..)))))..(((((((((((((((((((((((((...(((((((...((((((..((.(((((((((.....)))).)))))........(((((((((.....)))))))))........)).......((((.((........)).))))........))))))))))))).........(((((....((((((((....))))))))..))))))))))..)))..))))))).)))))..(((((((((.........))))))))).)))))..(((((.....)))))...)))))))))))).......))))))))...))).................((((((.(((((.....((((.((((((((((......))))))))))..))))))))))))))).))))..((((((((...((((((.....((((((.((((...)))).)))))).........(((((((((((............)))))))))))..)))))))))))))).((.[[[[[))..]]]]].(((((((.(((((..(((....)))..((.(((((..((((....((....)).........((((((((((....))))))..))))......))))..))))).))...)))))....)))))))...
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((({{{...{{{{{{{{....{{{{{{{{{{{{...{{{{..............(((((((((.......))))))))).(((((((((((((((((((((((((..((((........))))....(((((((((.....)))).)))))........((((((((((...))))))))))...(((....(((((..<<<<......)))))...>>>>............aaaaaaaa))).AAAAAAAA.((((.((((((......))))))))))....)))))))..)))..))))))).))))).))){{{{{{{...))))..}}}}}}}..........(((......)))..}}}}}}}}}}}}}}}}.......}}}}}}}}(((}}}.................[[[[[[.[[[[[)))..((((.((((((((((......))))))))))..))))]]]]]]]]]]].......((((((((...((((((.(((.((((((.((((...)))).)))))))))......(((((((((((.(.........))))))))))))..))))))))))))))((((((.....(((((((((((((....))))))))..))))).....))))))...........................((((((((((....))))))..))))........((((((((............)))).)))).....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((......))))(((...))).((((....)))).(((((...((((((((((((((((...(((((((..(((..)))..))).))))....))))...((((..)).))(((((.((.(((((((......).)))))).).).)))))(((((((((((((((((..))).(((..(((..)))...)))(.((((((((......)))..)))))..((((((((((((..)))))))((......)).((((..))))((((((((..))))))))(((..(((.(((..(((..)))..))))))..)))..((((((((...........)))))))))))))..(((........))))(.((((((((.((((..(((((...(..........)...)))))((((.(((((((((((.(((..((..))..)))((((((...)))).)).))))))))))).((((((((...((.......))((((.((........))..((......)))))).))))))))...((.......(((((..)).)))(..).)))))))))).)))))))))..(((..)))((..))...))))))))).))))).((((((........)))))).)))))))))).))...)))))...((((.((..)).(((.(((((((..)))))))...)))(..)...))))..(((..))).))))(.(........).)..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((..(((.(.((((((((....((((((((((((...((((................(((((((.......))))))).(((((((((((((((((((((((((((...........((((((..(..(((((..............)))))........(((((((((.....))))))))).........).......((((.((........)).))))........))))))..........................(((((((....)))))))......)))))))..)))..))))))).)))))..((((((((((......).))))))))).)))))................)))))))))))))))).......)))))))).).))).................((((((...........((((.((((((((((......))))))))))..)))).....)))))).))))..((((((((....((((......((((((.((((...)))).)))))).........(((((((((((....(....)..)))))))))))...)))).))))))))..............................................((.(((((..((((....((....)).........((((.(((((....)))))...))))......))))..))))).))......................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((..(((...((((((((....((((((((((((...(((((..((.....(..((.(((((((.......))))))).(((((((((((((((((((((((((...(((((((...((((((..((.((((((.(((.....))).)))..........(((((((((.....)))))))))....))).)).......((((.((........)).))))........))))))))))))).........(((((....((((((((....))))))))..))))))))))..)))..))))))).)))))...((((((((.........))))))))..)))))..))..).....)).))))))))))))))))).......))))))))...))).................((((((.((..(.....((((.((((((((((......))))))))))..)))))..)))))))).))))..((((((((...((((((..............(((((.(((......))).))))).(((((((((((............)))))))))))..)))))))))))))).((..(((...(((..((((((((....))))))))..))).....((.(((((..((((....((....)).........((((((((((....))))))..))))......))))..))))).))..........)))..)).....