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GUACGCCGGGGAUAAGUACGACGUGUAAUGUAUAAAUAAUAGGGUAAGAAUCCCUCACACAUGGUUUGCAAGUGUGAAGUGAAAGCCGGGAGCGUUCGGAGUAAUCCGUAGGUUUUAAGUCGGUUGUAGCUUGAUGGUUCCUAAGAUGAGUGAGAGCGAAUAGAUGGUUGAAGCUUCGUAAGGCGUGACCAUAUUUUUAUGGUACUGCAGUUAGGGGUGGGAAGUUUUGUCCCCGUCCACCCGCAAAUCCAAAUAACUGCCGGAGUAGAGUCUGCAUCUAAGGGAACACGAGAAAGUAUUUAUAAGUUAAGCACGGUAAGCCCCAUGUGCACCUGUUUUCGUUUGGUAAACAGGAGGCUAAAGAGUAAUCCAAGGUAUCGCGCAGGGGGUAAAAGACAGCAUAAAAAGCUAAAGCUCACUCUGUAAUGGAGAGGGAUAGGGUCUUAUGGCCGAUCUGAAAGGAUGCUGACUUAUGCAUGGGUGACGGAAUGCUAAUAAUUAAACCUGGUUUUAUAUUAUAUCUAGGUUAUGUUUGGUACUCACUAGAUUAAGUGUAUGACUAAGUAAGGGAUUAAACAUAUCAAUCGCAGUGUGUGUGUAGUAGGUAGGUUAAUACAUACUACUUGUUUAGGGUACCAGUGGUUGGACUGGUCGUAAAGCUUUUAUUACACAUUAUCAGUAUCUUCGGGUCUAGGUAGACGCAUUUGUAUUAAGUCUUCAAGGGGAUAAAUCGGUUCAGGGCGUUAUCAGUAUCUUCAGGGGUACAAUAUAGAUCUCCUCGGACAACAUGAUGAGGAUCUUACGUUGAUAUAAACUGGCUAAGAGCCCGAAAAGAGCUACUUGUCCAUCAAGAAGAAUUAGUAGAGGCAUAUCGUUCGAAAAACAAUGAGGCUGUUGUUAAAAUGCAAUCGCUUAUAACAUACAGCUUUGCAGCAAGGUGUUUGUUUGUUGGUGGUACAUGGAGUUAUAAAAAUUUGUGUUUGCUGCAUGAAACCUACAACAAACAGGUAACUAAAAAUAAAUUGUUAAACAAAAAGAUUGCCCAUCGGCGAAGUCUUGGGAAGGACUGGAUAACACCUGUACCAACCCAAGAUAAGCACGAUGAUAAGUUGCUUGAGCCGUGUGCGUUGAAAGAUGCAUGCACGGUUCUUAGGGGGGGAAAGCCGGUAACCGUACCUAUCCCAAUCAGGCU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
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|
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((.(((((((((...))))............((((((...(((((..((((...((((((((((..((((((((((((((((((((((....)))...........((((.......((((...((((((.(((((............(((((.......((((((.........((((((....))))))...(((((((.((((((((.......)))).............))))...)))))))))))))...))))))))))..)))))).))))........(((((((((....((((..(((((.(((((.(((((((.........)))))))..(((..............)))...))))).)))))..((((((((.......)))....(((.((((.....)))).))).....)))))...))))((((....))))..)))))))))......)))).)))))))..........)))))))))...............(((.....)))..((((.((((..((((.(((............))).))))...))))..)))).....((((((.(((......))).))))))...((((....((((((......))))))..))))..........))).(((((...(((....)))...))))).))))))))))....((((...(((((((.....(((..........))).((((((....)))))).......))))))).))))..)))).))))).))))))..........(((((((.....(((.....((((.(((((((....................((((............(((((((((((((((((((...............))))).)))))))).......(((...(((((((((..(((.((((.((((((((....)))))...))).))))..)))..)))))))))....)))........))))))............)))).((((.....((((((((.........................)))))))).....))))))))))).))))((((((((((((((....)))))..)))))))))....))).....)))))))...))))).)))))).....))). |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((.(((((...............(((.(((.((((((...(((((..((((...((((((((((.....((((((((((((((((...((.((((((..((..(((((((((....(((((((.((((((.......((....))...((((((...((.((((((......(((.(((((....)))))))).(((((((.(((((((..(........)..)))))))...........)))))))))))))....))..)))))).))))))..................))))))).((((..(((((.(((((.(((((((.(.....).)))))))..(((...((....))...)))...))))).)))))..(((((.((.......)).....(((.((((.....)))).))).....)))))...)))).(((....))).))))))))).)))))))).)).)))))))..........)))))))))......(((((((..((((((((((.((.(((((.(((......))))).))).))..))))))))))........((((((((.((((((.(((......))).))))))..((((.(.(.((((((......))))))).).))))......))))))))......(((....))))))))))..))))))))))....((((...(((((((......((.....)).......((((((....)))))).......))))))).))))..)))).))))).)))))).))).)))..(((((((.....(((.....((((.(((((((.(((..............(.((((.(((........(((((((((((((((((((.((.((....)))).))))).))))))))......((.((..(((((((((..(((.((((.((((((((....)))))...))).))))..)))..)))))))))..)).))........)))))).........))))))))....((...((((((((..((((.((......)).)).))..))))))))..))..)))))))))).))))((((((((((((((....)))))..)))))))))....))).....)))))))...))))).)))))).....))). |
|
RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((.(((((.......................((((((...(((((..((((...((((((((((.((((((((((((((((((((...((.((((((..((..(((((((((....(((((((.((((((.(((((.((....))...(((((.......((((((..(((((..((((((....))))))..)))......(((((((..............)))))))..............))..))))))...))))))))))..))))))((......))........))))))).((((..(((((.(((((.(((((((((....)).)))))))..(((...((....))...)))...))))).)))))..(((((.((.......)).....(((.((((.....)))).))).....)))))...)))).(((....))).))))))))).)))))))).)).)))))))..........))))))))).)))).(((((((..(......((((((((((.((((..((((.(((((.......)).))).))))...))))..)))).(((((((((((((((...........))))...((((.(..((((((......))))))).))))....)))))))))))....))))))....)..)))))))..))))))))))....((((...(((((((............((.....)).((((((....)))))).......))))))).))))..)))).))))).))))))..........(((((((.....(((.....((((.(((((((....................((((.(((........(((((((((((((((((((.((.((....)))).))))).))))))))......((.((..(((((((((..(((.((((.((((((((....)))))...))).))))..)))..)))))))))..)).))........)))))).........))))))).((((((...((((((((..((((.((......)).)).))..))))))))..)).))))))))))).))))((((((((((((((....)))))..)))))))))....))).....)))))))...))))).)))))).....))). |
