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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00784



RNA: CRW_00784
Rfam family: -

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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.......))))))..............(((((.......(((....))).......))))).....((((((....(((((.......)))))....))).)))....(((((((((((....((((((((.....(((..((((......................)))))))..........((((..((((....))))))))..((((((((((.....(((((((.........)))))))..........................................................(((((((.......)))))))..(((((((...............)))))))................................(((((((...........((((((........((((.........)))).....))))))...................................)))))))....................................((((((.....((((....................((((........))))........((((((([[........................(((...................)))....(((((((...((((.(((.............)))...)))))))))))))))))).]]...............................(((......(((((((.......))))))).......))).....................................)))).....))))))...................((((((..((((..((((..{{{{.))))...}}}}...........))))..)))))).......)))))))))).))).)))))...))))))))))).
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.(....)))))))..............(((((.......(((....))).......))))).....((((((.((.(((((.......))))).)).))).)))....(((((((((((....((((((((.....(((..((((........(((....)))....)))))))..........((((..((((....))))))))..((((((((((....(((((((((.......))((.((....))))........)))))))..........((.((((((......(((((((((..(((((((.......))))))).((((((((.((........))..)))))))).......................(.(...........).)..........)))))))))....((((.........))))...((((((((((((.........((((((((........((((......))))....(((....)))...........(((..((((((((.............................((.((((........))))))..............(........).......))))))))..))).........)))))))).......(((((((...((((((((.(((.....))).))))..)))))))))))....((((((((((((.....))))).)))).))).....((((...((.(((((((.......))))))).))....)))).(((.......((......)).........)))..))))))...)))))).........))).))).)).((((((..((((.......((((((......))))))..........))))..)))))).......)))))))))).))).)))))...))))))))))).
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((.(((....)))))))..............(((((.((....(((....)))....)).))))).....((((((.((.(((((.......))))).)).))).)))....(((((((((((....((((((((.....(((..((((........(((....)))....)))))))..........(((((..(((....))))))))..((((((((((.....((((((((.......))))))))...(((((.....................((((((..((((...((.((((((((((.(((((((.......))))))).((((((((.((........))..)))))))).............((....)).............)))))).))))....((((((.((.....((((.........))))...))))))))...........................))...)))).(((.......(((....))).....)))....))))))((.((((((.....((((.((((((...(((((((............(((((((((((....(((((((.((((.................((........))...(((.....))).))))..(((((((...((((((((.(((.....))).))))..))))))))))))))))))(((((((((.....))))).)))).....))))))).......(((((((.......)))))))....)).))...((((.....)))))))))))....)))..)))...)))).....))))))))....)))))........((((((..((((.((....((((((......)))))).......)).))))..)))))).......)))))))))).))).)))))...))))))))))).
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..(....).)))))..............(((((.......(((....))).......))))).....((((((.((.(((((.......))))).)).))).)))....(((((((((((....((((((((.....(((..((((........((......))....)))))))..........((((..((((....))))))))..((((((((((.....((((((((.......))))))))....(((........................................(((((((((......................((..((((((.((........))..))))))...))........(.((....)))............................))))))))).....(((.........))).....(((((((((((.........(((((((((.......((((......))))....(((....)))................((((((((.......................((.......((((........))))........................)).......)))))))).............)))))))))......(((..((((.....(((((........))))).......(.((((((((....((((((((((((.....))))).)))).)))..((.((((.(....(((((((.(....)))))))).....).)))).))...)))))))).)......))))...)))...))))))...))))).........))).........((((((..((((.......((((((......))))))..........))))..)))))).......)))))))))).))).)))))...))))))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.(....)))))))..............(((((.((....(((....)))....)).))))).....((((((.((.(((((.......))))).)).))).)))....(((((((((((....((((((((.....(((..((((........(((....)))....)))))))..........(((((..(((....))))))))..((((((((((.....((((((((.......))))))))...(((((.....................((((((..((((...((.((((((((((.(((((((.......))))))).((((((((.((........))..))))))))...........((.(....)))............)))))).))))....((((((.((.....((((.........))))...))))))))...........................))...)))).(((.......(((....))).....)))....))))))(((.(((((......(((....)))..(((((((....((((........))))............(((((....((..(((.(((.(((..((..((((...............(((.(((..(((((((...((((((((.(((.....))).)))..))))))))))))....((((((((((((.....))))).)))).)))..))).)))......(((((((.......))))))).))))..)).....)))))).))).))....))))).......)))))))......))))))))....)))))........((((((..((((.((....((((((......)))))).......)).))))..)))))).......)))))))))).))).)))))...))))))))))).