RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - CRW_00820

RNA: CRW_00820
Rfam family: -

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.................................(((....))).(((((((...(((..(((........)))...)))..)))))))...((..((((((((....))))))))..)).((((.(((((..(((((((((((....))))........)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))......(((((......(((.......))).(((((.(.(((((((((((((.(((((((......)))))))))))))..(((((((...((((((((((((((((((((((....)))).)))))))).((....(((...(((((.(((....)))))))).)))...((((.((((.((..((((......))))..)))))).)))).)).))))))))))..)))).)))...(((((((((.........)))))))(((((......)))))....))..))))))).).))))).)))))........)
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................(((.(((.((((.......(((((((...(((..(((........)))...)))..))))))).((((((((((((((....)))))))))))).))......))...)).))))))..((((((.......(((((((..((((.((((((.......)))))))))).((((((((...))))))))..(((((((...((((.........))))...)))))))(((((((((((......)))))))..)))).((((((((...((((((((((((((((((((((....)))).))))))))))))).((((..(((((..(((((((((((((....))))..)))).....)))))..(((((............)))))..))))))))))))))..)))).))))....(((((((.........)))))))(((((......))))).)))))))))))))...(((..((....))..)))...
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................((((((..........((((((.........)))))).))))))...((((((((((((....)))))))))))).............(((((((....................)))))))((((.((((((.......))))))))))(((((((((...))))))))..)((((((...((((.........))))...)))))).....(((((((......)))))))((((((...(....)...))))))((((((((((((((((....)))).)))))))))))).................((((((.........)))))).....(((((...........)))))............((((((..(((.....)))))))))......(((((((.........)))))))(((((......)))))......................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................((((......(((....))).(((((((.........((((((.........)))))))))))))...((((((((((((....))))))))))))))))(((......((((((...(((((......)))))...))))))((((.((((((.......)))))))))).((((((((...))))))))...((((((...((((.........))))...)))))).(((((((((((......)))))))..))))..(((.......))))))((((((((((((.(((....)))..)))))))))))).((((..((((((....((((((.........)))))).....))))))((((......................(((((((..((((...)))))))))..).)..((((((...........))))))(((((......)))))...........................)))).))))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................((((((.........(((((((((....)).)))))))))))))...((((((((((((....)))))))))))).((((........(((((((..(((((.....)).)))..)))))))((((.((((((.......))))))))))(((((((((...))))))))..)((((((...((((.........))))...)))))).....(((((((......)))))))((((((...((()))...))))))((((((((((((((((....)))).)))))))))))).................((((((.........))))))....((((((.((....))..))))))...........((((((..((((...))))))))))))))..(((((((.........)))))))(((((......)))))......................................
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((....))).(((((((...(((..(((........)))...)))..)))))))...((((((((((((....)))))))))))).((((.(((((..(((((((((((....))))........)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))...(((....)))....(((..[[[[.))).....]]]]....(((...(((((((((((......)))))))..))))...[[[[[........((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))))))..]]]]]..(((.[[[[[)))......]]]]].(((.[[[[[[)))........]]]]]]...........((((((..((((...))))))))))......(((((((...[[[[[.)))))))(((((......)))))......]]]]]...........................
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((((((.((.((((((.........(((((((((....)).))))))))))))))).((((((((((((....)))))))))))).(((((((.(((((...(((((((..(((.((((.((((....))))((((.((((((.......)))))))))).((((((((...)))))))).....)))))))....)))))))))))).......(((((((.(((((((......)))))))))))))).(((.......))).((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))).(((...(((((.(((....)))))))).)))...((((.((((.((..((((......))))..)))))).)))).((..(((((...))))))))))))))..(((((((.........)))))))(((((......)))))....(((...((((....))))...)))..))))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................(((((((.........((((((.........)))))))))))))...((((((((((((....)))))))))))).............((((((([[[[................)))))))((((.((((((.......)))))))))).((((((((...))))))))...((((((...((((]]]].....))))...))))))((((.(((((((......)))))))))))...................(((((((((((((((((....)))).)))))))))))))...((...........((((((.........))))))......................................{{{{{..))((.....))..}}}}}......(((((((.........)))))))(((((......)))))......................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................................((((((.((.((((((.........(((((((.........))))))))))))))).((((((((((((....)))))))))))).(((((((......((((((.(((.......)))......)))))).((((.((((((.......)))))))))).((((((((...)))))))).....((((...((((.........))))...))))((((((.(((((((......)))))))))))))....(((.....))).((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))).........(.....((((((.........))))))(((.((((.((..((((......))))..)))))))))...)(..(((((...)))))).)))))))..(((((((.........)))))))(((((......)))))....(((...((((....))))...)))..))))))..
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((((((....(((((.........((((((((.........)))))))))))))...((((((((((((....))))))))))))..........(((((..(((((((.....((((...........))))..(((.(((((......)))))((((((((((((((...))))))))..))))))...)))..)))))))......(((((((((((((.(((((((......))))))))))))))..(((((........((((((((((((((.............)))))))))))))).....))))).....((((((.........))))))....(((((((.....(((((............)))))((((((..((((...))))))))))......(((((((.........)))))))(((((......))))).))))))).))))))...))))).......))))))).
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((....))).(((((((...(((..(((........)))...)))..)))))))...((((((((((((..[[)))))))))))).((((.(((((..(((((((((((....))))........)))))))((((.((((((.......)))))))))).))))))))).......]]((((..{{{{{..)))).....(((((...(((((((((((((.(((((((......))))))))))))).((((((((...((((((((((((((((((((((....)))).)))))))).((....(((...((((.((((....)))))))).)))...((((.((((.((..((((......))))..)))))).)))).)).))))))))))..)))).))))..(((((((((.........)))))))(((((......)))))....))..)))))))...)))))....}}}}}......
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((((((.((.((((((.........(((((((((....)).))))))))))))))).((((((((((((....)))))))))))).(((((((.....((((((((((((.....))))).....)))))))((((.((((((.......)))))))))).((((((((...)))))))).....((((..(((((.........)))).).))))((((((.(((((((.(...))))))))))))))....(((.....))).((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))).......((((....[[[[[[...))))..]]]]]](((.((((.((..((((......))))..))))))))).......(((((...)))))..)))))))..(((((((.........)))))))(((((......)))))....(((...((((....))))...)))..))))))).
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((....))).(((((((...(((..(((........)))...)))..)))))))...((..((((((((....))))))))..)).((((.(((((..(((((((((((....))))........)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))......(((((((...(....)...)))...(((((.(.(((((((((((((.(((((((......))))))))))))).((((((((...((((((((((((((((((((((....)))).)))))))).((....(((...(((((.(((....)))))))).)))...((((.((((.((..((((......))))..)))))).)))).)).))))))))))..)))).))))..(((((((((.........)))))))(((((......)))))....))..))))))).).)))))..)))).........
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((........................(((((..((((((.((..(((((((.((.(((((.............).).))).)))))))))((((..((((((((...))))))))))))..(((((((((((((((((((((((((........)))))))))))))((((.((((((.((..))))))))))))...)))))....(((((((((((.(((((..((((..((((((..)).......((..))))))..)).)).....)))))))))..)).((((.......))))(((((((((((((((((((..))))).))))))))))))))(((((.(((((((((((..)))))....((.(.((.(.(.(((((.............)))))))))).)).))))).).))))).....))))).)))))))..(((((((.........)))))))(((((......))))))).).)))))..)))).)))..((........))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((....))).(((((((.........((........)).........)))))))...((..((((((((....))))))))..)).((((.(((((..(((((((....................)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))......(((((((...(....)...)))...(((((...(((((((((((((.(((((((......))))))))))))).((((((((...((((((((((((((((((((((....)))).)))))))))..................(((....)))...................((.((..(((........)))..))))............)))))))))..)))).))))..(((((((((.........)))))))(((((......)))))....))..)))))))...)))))..)))).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((....))).((((((.........(((((((((....)).)))))))))))))...((..((((((((....))))))))..)).((((.(((((..(((((((((((....))))........)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))......(((((......(((.......))).(((((...(((((((((((((.(((((((......))))))))))))).((((((((...((((((((((((((((((((((....)))).)))))))).((....(((...(((((.(((....)))))))).)))...((((.((((.((..((((......))))..)))))).)))).)).))))))))))..)))).))))..(((((((((.........)))))))(((((......)))))....))..)))))))...))))).))))).........

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